MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_008309	TGTT	2	8	1578114	1578121	0 %	75 %	25 %	0 %	113461524
29503	NC_008309	TAATG	2	10	1578237	1578246	40 %	40 %	20 %	0 %	113461524
29504	NC_008309	TCA	2	6	1578257	1578262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461524
29505	NC_008309	T	6	6	1578314	1578319	0 %	100 %	0 %	0 %	113461524
29506	NC_008309	TCT	2	6	1578409	1578414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113461524
29507	NC_008309	CT	3	6	1578439	1578444	0 %	50 %	0 %	50 %	113461524
29508	NC_008309	AGT	2	6	1578512	1578517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113461524
29509	NC_008309	GCTT	2	8	1578556	1578563	0 %	50 %	25 %	25 %	113461524
29510	NC_008309	T	6	6	1578575	1578580	0 %	100 %	0 %	0 %	113461524
29511	NC_008309	CTG	2	6	1578629	1578634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113461524
29512	NC_008309	TTG	2	6	1578639	1578644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461524
29513	NC_008309	TTG	2	6	1578771	1578776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461524
29514	NC_008309	TCA	2	6	1578967	1578972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461524
29515	NC_008309	T	6	6	1578999	1579004	0 %	100 %	0 %	0 %	113461524
29516	NC_008309	TAA	2	6	1579135	1579140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461524
29517	NC_008309	ATTT	2	8	1579262	1579269	25 %	75 %	0 %	0 %	113461524
29518	NC_008309	ACC	2	6	1579290	1579295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113461524
29519	NC_008309	ACC	2	6	1579302	1579307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113461524
29520	NC_008309	TTG	2	6	1579372	1579377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461524
29521	NC_008309	CTG	2	6	1579383	1579388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113461524
29522	NC_008309	CTTG	2	8	1579390	1579397	0 %	50 %	25 %	25 %	113461524
29523	NC_008309	TCA	2	6	1579432	1579437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461524
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29529	NC_008309	TGT	2	6	1579701	1579706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461524
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29533	NC_008309	TCT	2	6	1579891	1579896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113461524
29534	NC_008309	TAAA	2	8	1579943	1579950	75 %	25 %	0 %	0 %	113461524
29535	NC_008309	A	7	7	1580022	1580028	100 %	0 %	0 %	0 %	113461524
29536	NC_008309	GTCCTC	2	12	1580105	1580116	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113461524
29537	NC_008309	T	7	7	1580152	1580158	0 %	100 %	0 %	0 %	113461524
29538	NC_008309	TTC	2	6	1580172	1580177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113461524
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29543	NC_008309	AAT	2	6	1581202	1581207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461527
29544	NC_008309	GTT	3	9	1581245	1581253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461527
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29546	NC_008309	TGCT	2	8	1581295	1581302	0 %	50 %	25 %	25 %	113461527
29547	NC_008309	TCA	2	6	1581349	1581354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461527
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29549	NC_008309	TGT	2	6	1581379	1581384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461527
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29552	NC_008309	GCATG	2	10	1581455	1581464	20 %	20 %	40 %	20 %	113461527
29553	NC_008309	TGT	2	6	1581508	1581513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461527
29554	NC_008309	TGCATT	2	12	1581520	1581531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113461527
29555	NC_008309	CTG	2	6	1581585	1581590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113461527
29556	NC_008309	AAT	2	6	1581732	1581737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461527
29557	NC_008309	CAA	2	6	1581762	1581767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113461527
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29560	NC_008309	ATATT	2	10	1581832	1581841	40 %	60 %	0 %	0 %	113461527
29561	NC_008309	CGG	2	6	1581850	1581855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113461527
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29587	NC_008309	CAT	2	6	1583487	1583492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461528
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29601	NC_008309	GTT	2	6	1584330	1584335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461528
29602	NC_008309	TCA	2	6	1584344	1584349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461528
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29604	NC_008309	TCA	2	6	1584380	1584385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461528
29605	NC_008309	CTT	2	6	1584438	1584443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113461528
29606	NC_008309	TTC	2	6	1584557	1584562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113461528
29607	NC_008309	GAAA	2	8	1584584	1584591	75 %	0 %	25 %	0 %	113461528
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29609	NC_008309	CA	3	6	1584748	1584753	50 %	0 %	0 %	50 %	113461528
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29611	NC_008309	AC	4	8	1584822	1584829	50 %	0 %	0 %	50 %	113461528
29612	NC_008309	T	6	6	1584895	1584900	0 %	100 %	0 %	0 %	113461528
29613	NC_008309	ATG	2	6	1584963	1584968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113461529
29614	NC_008309	CGAC	2	8	1585105	1585112	25 %	0 %	25 %	50 %	113461529
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