MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_008309	GTA	2	6	1121357	1121362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113461160
21003	NC_008309	ATT	2	6	1121389	1121394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461160
21004	NC_008309	T	6	6	1121483	1121488	0 %	100 %	0 %	0 %	113461160
21005	NC_008309	CT	3	6	1121545	1121550	0 %	50 %	0 %	50 %	113461160
21006	NC_008309	CGG	2	6	1121800	1121805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113461160
21007	NC_008309	ATT	2	6	1121806	1121811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461160
21008	NC_008309	GGATT	2	10	1121879	1121888	20 %	40 %	40 %	0 %	113461160
21009	NC_008309	ATT	2	6	1121913	1121918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461161
21010	NC_008309	TAT	3	9	1121922	1121930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461161
21011	NC_008309	T	7	7	1121963	1121969	0 %	100 %	0 %	0 %	113461161
21012	NC_008309	T	6	6	1121975	1121980	0 %	100 %	0 %	0 %	113461161
21013	NC_008309	CCGAT	2	10	1122005	1122014	20 %	20 %	20 %	40 %	113461161
21014	NC_008309	ATT	2	6	1122159	1122164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461161
21015	NC_008309	GATTT	2	10	1122197	1122206	20 %	60 %	20 %	0 %	113461161
21016	NC_008309	ATT	2	6	1122210	1122215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461161
21017	NC_008309	GGC	2	6	1122253	1122258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113461161
21018	NC_008309	TA	3	6	1122355	1122360	50 %	50 %	0 %	0 %	113461161
21019	NC_008309	ATT	3	9	1122383	1122391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461161
21020	NC_008309	TCA	2	6	1122394	1122399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461161
21021	NC_008309	A	6	6	1122496	1122501	100 %	0 %	0 %	0 %	113461161
21022	NC_008309	AATA	2	8	1122633	1122640	75 %	25 %	0 %	0 %	113461162
21023	NC_008309	AAG	2	6	1122767	1122772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113461162
21024	NC_008309	ATT	2	6	1122807	1122812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461162
21025	NC_008309	AAT	2	6	1122822	1122827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461162
21026	NC_008309	ATA	2	6	1122851	1122856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461162
21027	NC_008309	ACT	2	6	1122879	1122884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461162
21028	NC_008309	T	6	6	1122888	1122893	0 %	100 %	0 %	0 %	113461162
21029	NC_008309	TTG	2	6	1122953	1122958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461162
21030	NC_008309	CATA	2	8	1123025	1123032	50 %	25 %	0 %	25 %	113461162
21031	NC_008309	AT	3	6	1123048	1123053	50 %	50 %	0 %	0 %	113461162
21032	NC_008309	CCA	2	6	1123057	1123062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113461162
21033	NC_008309	ATTGA	2	10	1123219	1123228	40 %	40 %	20 %	0 %	113461162
21034	NC_008309	CAA	2	6	1123271	1123276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113461162
21035	NC_008309	AAT	2	6	1123362	1123367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461162
21036	NC_008309	CAG	2	6	1123370	1123375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113461162
21037	NC_008309	TGT	2	6	1123380	1123385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461162
21038	NC_008309	ATAA	2	8	1123453	1123460	75 %	25 %	0 %	0 %	113461162
21039	NC_008309	CGC	2	6	1123530	1123535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113461162
21040	NC_008309	AAGC	2	8	1123539	1123546	50 %	0 %	25 %	25 %	113461162
21041	NC_008309	TAA	2	6	1123562	1123567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461162
21042	NC_008309	A	6	6	1123574	1123579	100 %	0 %	0 %	0 %	113461162
21043	NC_008309	TAA	2	6	1123584	1123589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461162
21044	NC_008309	A	6	6	1123680	1123685	100 %	0 %	0 %	0 %	113461162
21045	NC_008309	TAAA	2	8	1123694	1123701	75 %	25 %	0 %	0 %	113461162
21046	NC_008309	AAT	3	9	1123713	1123721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461162
21047	NC_008309	CCTG	2	8	1123747	1123754	0 %	25 %	25 %	50 %	113461162
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21049	NC_008309	T	8	8	1123826	1123833	0 %	100 %	0 %	0 %	113461162
21050	NC_008309	GATT	2	8	1123843	1123850	25 %	50 %	25 %	0 %	113461162
21051	NC_008309	TTG	2	6	1123854	1123859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461162
21052	NC_008309	TTG	2	6	1123866	1123871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461162
21053	NC_008309	TTG	2	6	1123878	1123883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461162
21054	NC_008309	TTG	2	6	1123890	1123895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461162
21055	NC_008309	TTTC	2	8	1123898	1123905	0 %	75 %	0 %	25 %	113461162
21056	NC_008309	TGAT	2	8	1124743	1124750	25 %	50 %	25 %	0 %	113461163
21057	NC_008309	AAT	2	6	1124755	1124760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461163
21058	NC_008309	CAA	2	6	1124762	1124767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113461163
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21060	NC_008309	A	6	6	1124889	1124894	100 %	0 %	0 %	0 %	113461163
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21062	NC_008309	CAA	2	6	1125009	1125014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113461163
21063	NC_008309	AAATC	2	10	1125015	1125024	60 %	20 %	0 %	20 %	113461163
21064	NC_008309	AAC	2	6	1125104	1125109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113461163
21065	NC_008309	TTCTG	2	10	1125113	1125122	0 %	60 %	20 %	20 %	113461163
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21072	NC_008309	AATT	2	8	1125418	1125425	50 %	50 %	0 %	0 %	113461163
21073	NC_008309	TCA	2	6	1125497	1125502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461163
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21077	NC_008309	T	7	7	1125770	1125776	0 %	100 %	0 %	0 %	113461163
21078	NC_008309	T	6	6	1125797	1125802	0 %	100 %	0 %	0 %	113461163
21079	NC_008309	ACGTAA	2	12	1125823	1125834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113461163
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21087	NC_008309	TCAA	2	8	1126280	1126287	50 %	25 %	0 %	25 %	113461163
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21089	NC_008309	GCA	2	6	1126358	1126363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113461163
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21091	NC_008309	AACT	2	8	1126450	1126457	50 %	25 %	0 %	25 %	113461163
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21102	NC_008309	GTT	2	6	1126887	1126892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113461163
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21105	NC_008309	CT	4	8	1127013	1127020	0 %	50 %	0 %	50 %	113461164
21106	NC_008309	TAA	2	6	1127203	1127208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113461164
21107	NC_008309	ACGCTG	2	12	1127227	1127238	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113461164
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21110	NC_008309	CAT	2	6	1127508	1127513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113461164
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21112	NC_008309	TAT	2	6	1127607	1127612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113461164
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21118	NC_008309	AGCA	2	8	1127812	1127819	50 %	0 %	25 %	25 %	113461164
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21348	NC_008309	A	6	6	1139179	1139184	100 %	0 %	0 %	0 %	113461175
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21351	NC_008309	AT	3	6	1139337	1139342	50 %	50 %	0 %	0 %	113461175
21352	NC_008309	TGAT	2	8	1139357	1139364	25 %	50 %	25 %	0 %	113461175
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