MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008309	TAA	2	6	51314	51319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460196
1002	NC_008309	GCC	2	6	51360	51365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113460196
1003	NC_008309	TTC	2	6	51416	51421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460196
1004	NC_008309	TTA	2	6	51462	51467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460196
1005	NC_008309	TTA	2	6	51501	51506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460196
1006	NC_008309	TGG	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460196
1007	NC_008309	GGTT	2	8	51557	51564	0 %	50 %	50 %	0 %	113460196
1008	NC_008309	TCG	2	6	51569	51574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460196
1009	NC_008309	TGA	2	6	51587	51592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460196
1010	NC_008309	A	6	6	51630	51635	100 %	0 %	0 %	0 %	113460196
1011	NC_008309	TTA	2	6	51711	51716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460196
1012	NC_008309	TTG	2	6	51758	51763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460196
1013	NC_008309	ATG	2	6	51802	51807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460196
1014	NC_008309	GGC	2	6	51884	51889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460196
1015	NC_008309	AGGA	2	8	51940	51947	50 %	0 %	50 %	0 %	113460196
1016	NC_008309	A	7	7	51990	51996	100 %	0 %	0 %	0 %	113460196
1017	NC_008309	CAG	2	6	51997	52002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460196
1018	NC_008309	TTGCC	2	10	52182	52191	0 %	40 %	20 %	40 %	113460197
1019	NC_008309	TTG	2	6	52200	52205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460197
1020	NC_008309	TAA	2	6	52215	52220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460197
1021	NC_008309	TTG	2	6	52260	52265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460197
1022	NC_008309	TTC	2	6	52425	52430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460197
1023	NC_008309	AAT	2	6	52572	52577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460197
1024	NC_008309	TCA	2	6	52645	52650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460197
1025	NC_008309	CA	3	6	52707	52712	50 %	0 %	0 %	50 %	113460197
1026	NC_008309	TTC	2	6	52818	52823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460197
1027	NC_008309	T	7	7	52827	52833	0 %	100 %	0 %	0 %	113460197
1028	NC_008309	CAT	2	6	52898	52903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460197
1029	NC_008309	GAT	2	6	52910	52915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460197
1030	NC_008309	AAT	2	6	52929	52934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460197
1031	NC_008309	GTA	2	6	52942	52947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460197
1032	NC_008309	A	6	6	52993	52998	100 %	0 %	0 %	0 %	113460197
1033	NC_008309	AGTCC	2	10	53013	53022	20 %	20 %	20 %	40 %	113460197
1034	NC_008309	T	6	6	53078	53083	0 %	100 %	0 %	0 %	113460197
1035	NC_008309	ATTT	2	8	53489	53496	25 %	75 %	0 %	0 %	113460198
1036	NC_008309	TGC	2	6	53552	53557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460198
1037	NC_008309	TGT	2	6	53624	53629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460198
1038	NC_008309	CTT	2	6	53724	53729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460198
1039	NC_008309	TAC	2	6	53731	53736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460198
1040	NC_008309	AAC	2	6	53746	53751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460198
1041	NC_008309	CAC	2	6	53799	53804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460198
1042	NC_008309	TGC	2	6	53881	53886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460198
1043	NC_008309	TAA	2	6	53949	53954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460198
1044	NC_008309	ATG	2	6	53955	53960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460198
1045	NC_008309	CAT	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460198
1046	NC_008309	TCT	2	6	54101	54106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460198
1047	NC_008309	AAG	2	6	54149	54154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460198
1048	NC_008309	TCC	2	6	54265	54270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460198
1049	NC_008309	AAT	2	6	54271	54276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460198
1050	NC_008309	AGC	2	6	54277	54282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460198
1051	NC_008309	CAC	3	9	54330	54338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460198
1052	NC_008309	CAA	3	9	54339	54347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460198
1053	NC_008309	AG	3	6	54580	54585	50 %	0 %	50 %	0 %	113460198
1054	NC_008309	TGA	2	6	54614	54619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460198
1055	NC_008309	GGA	2	6	54670	54675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460198
1056	NC_008309	TTG	2	6	54685	54690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460198
1057	NC_008309	CTT	2	6	54729	54734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460198
1058	NC_008309	CTT	2	6	54870	54875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460198
1059	NC_008309	AAGC	2	8	54884	54891	50 %	0 %	25 %	25 %	113460198
1060	NC_008309	GATTT	2	10	54979	54988	20 %	60 %	20 %	0 %	113460198
1061	NC_008309	TAC	2	6	55017	55022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460198
1062	NC_008309	ACT	2	6	55102	55107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460199
1063	NC_008309	GTGC	2	8	55120	55127	0 %	25 %	50 %	25 %	113460199
1064	NC_008309	T	6	6	55130	55135	0 %	100 %	0 %	0 %	113460199
1065	NC_008309	AAT	2	6	55179	55184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460199
1066	NC_008309	CAC	2	6	55202	55207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460199
1067	NC_008309	AAT	2	6	55218	55223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460199
1068	NC_008309	GTT	2	6	55364	55369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460199
1069	NC_008309	TGA	2	6	55376	55381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460199
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1072	NC_008309	ATA	2	6	55471	55476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460199
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1075	NC_008309	CTA	2	6	55564	55569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460199
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1080	NC_008309	AC	3	6	55793	55798	50 %	0 %	0 %	50 %	113460199
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1092	NC_008309	GA	3	6	56741	56746	50 %	0 %	50 %	0 %	113460200
1093	NC_008309	ATCA	2	8	56952	56959	50 %	25 %	0 %	25 %	113460200
1094	NC_008309	CGA	2	6	56960	56965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460200
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1101	NC_008309	TGA	2	6	57395	57400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460200
1102	NC_008309	GTAC	2	8	57474	57481	25 %	25 %	25 %	25 %	113460200
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1108	NC_008309	CAAA	2	8	57623	57630	75 %	0 %	0 %	25 %	113460200
1109	NC_008309	GTT	2	6	57641	57646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460200
1110	NC_008309	GGA	2	6	57662	57667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460200
1111	NC_008309	ACG	2	6	57703	57708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460200
1112	NC_008309	ATA	2	6	57751	57756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460200
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1121	NC_008309	TA	3	6	58164	58169	50 %	50 %	0 %	0 %	113460201
1122	NC_008309	TGG	2	6	58192	58197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460201
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1124	NC_008309	AGA	2	6	58240	58245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460201
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1244	NC_008309	ACT	2	6	65174	65179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460211
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1247	NC_008309	GTT	2	6	65255	65260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460211
1248	NC_008309	CAG	2	6	65358	65363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460211
1249	NC_008309	AATCC	2	10	65371	65380	40 %	20 %	0 %	40 %	113460211
1250	NC_008309	GGTT	2	8	65434	65441	0 %	50 %	50 %	0 %	113460211
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