MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008309	ATCA	2	8	315137	315144	50 %	25 %	0 %	25 %	113460462
6002	NC_008309	TACA	2	8	315146	315153	50 %	25 %	0 %	25 %	113460462
6003	NC_008309	TGT	2	6	315159	315164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460462
6004	NC_008309	TAC	2	6	315206	315211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460462
6005	NC_008309	TCA	2	6	315297	315302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460462
6006	NC_008309	TTG	2	6	315341	315346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460462
6007	NC_008309	TTG	2	6	315353	315358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460462
6008	NC_008309	TAA	2	6	315385	315390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460462
6009	NC_008309	AGT	2	6	315392	315397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460462
6010	NC_008309	CAT	2	6	315588	315593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460463
6011	NC_008309	CAA	2	6	315652	315657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460463
6012	NC_008309	GTCA	2	8	315703	315710	25 %	25 %	25 %	25 %	113460463
6013	NC_008309	AAAC	2	8	315772	315779	75 %	0 %	0 %	25 %	113460464
6014	NC_008309	CCAG	2	8	315795	315802	25 %	0 %	25 %	50 %	113460464
6015	NC_008309	CTT	2	6	315828	315833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460464
6016	NC_008309	ATAA	2	8	315889	315896	75 %	25 %	0 %	0 %	113460464
6017	NC_008309	T	6	6	315939	315944	0 %	100 %	0 %	0 %	113460464
6018	NC_008309	CAT	2	6	315969	315974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460464
6019	NC_008309	TA	3	6	315997	316002	50 %	50 %	0 %	0 %	113460464
6020	NC_008309	GTA	2	6	316045	316050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460464
6021	NC_008309	TCT	2	6	316058	316063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460464
6022	NC_008309	T	6	6	316129	316134	0 %	100 %	0 %	0 %	113460464
6023	NC_008309	AAC	2	6	316174	316179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460464
6024	NC_008309	TTA	2	6	316199	316204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460464
6025	NC_008309	TGAT	2	8	316272	316279	25 %	50 %	25 %	0 %	113460464
6026	NC_008309	TTC	2	6	316357	316362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460464
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6028	NC_008309	AAT	2	6	316390	316395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460464
6029	NC_008309	ATC	3	9	316426	316434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460464
6030	NC_008309	T	6	6	316463	316468	0 %	100 %	0 %	0 %	113460464
6031	NC_008309	CA	3	6	316546	316551	50 %	0 %	0 %	50 %	113460464
6032	NC_008309	CAT	2	6	316554	316559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460464
6033	NC_008309	TTG	2	6	316606	316611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460464
6034	NC_008309	TTTAAA	2	12	316613	316624	50 %	50 %	0 %	0 %	113460464
6035	NC_008309	TCA	2	6	316667	316672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460464
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6037	NC_008309	TCA	2	6	316737	316742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460464
6038	NC_008309	GCA	2	6	316787	316792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460464
6039	NC_008309	T	7	7	316923	316929	0 %	100 %	0 %	0 %	113460464
6040	NC_008309	AAT	2	6	317195	317200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460465
6041	NC_008309	ATT	2	6	317252	317257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460465
6042	NC_008309	TGC	2	6	317306	317311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460465
6043	NC_008309	ATT	3	9	317321	317329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460465
6044	NC_008309	T	6	6	317366	317371	0 %	100 %	0 %	0 %	113460465
6045	NC_008309	AAT	2	6	317401	317406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460465
6046	NC_008309	T	6	6	317406	317411	0 %	100 %	0 %	0 %	113460465
6047	NC_008309	TAGCT	2	10	317492	317501	20 %	40 %	20 %	20 %	113460465
6048	NC_008309	T	6	6	317519	317524	0 %	100 %	0 %	0 %	113460465
6049	NC_008309	TTTG	2	8	317588	317595	0 %	75 %	25 %	0 %	113460465
6050	NC_008309	ATTT	2	8	317643	317650	25 %	75 %	0 %	0 %	113460466
6051	NC_008309	TCC	2	6	317732	317737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460466
6052	NC_008309	TAAAGG	2	12	317747	317758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	113460466
6053	NC_008309	TACCA	2	10	317786	317795	40 %	20 %	0 %	40 %	113460466
6054	NC_008309	CAC	2	6	317836	317841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460466
6055	NC_008309	CAA	2	6	317896	317901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460466
6056	NC_008309	AGAT	2	8	317907	317914	50 %	25 %	25 %	0 %	113460466
6057	NC_008309	TTC	2	6	317948	317953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460466
6058	NC_008309	C	7	7	318044	318050	0 %	0 %	0 %	100 %	113460466
6059	NC_008309	AGC	2	6	318182	318187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460466
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6061	NC_008309	CTA	2	6	318298	318303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460466
6062	NC_008309	TAT	2	6	318317	318322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460466
6063	NC_008309	TAA	3	9	318323	318331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460466
6064	NC_008309	TTG	2	6	318475	318480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460466
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6090	NC_008309	TAT	2	6	319956	319961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460467
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6094	NC_008309	CGA	2	6	320276	320281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460467
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6103	NC_008309	GA	3	6	320649	320654	50 %	0 %	50 %	0 %	113460467
6104	NC_008309	T	7	7	320659	320665	0 %	100 %	0 %	0 %	113460467
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6109	NC_008309	T	6	6	321021	321026	0 %	100 %	0 %	0 %	113460468
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6111	NC_008309	CTC	2	6	321092	321097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460468
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6114	NC_008309	CAATC	2	10	321256	321265	40 %	20 %	0 %	40 %	113460469
6115	NC_008309	CT	3	6	321279	321284	0 %	50 %	0 %	50 %	113460469
6116	NC_008309	GCTT	2	8	321306	321313	0 %	50 %	25 %	25 %	113460469
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6119	NC_008309	ATC	2	6	321443	321448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460469
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6121	NC_008309	T	6	6	321729	321734	0 %	100 %	0 %	0 %	113460470
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6494	NC_008309	ATT	2	6	342965	342970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460487
6495	NC_008309	GAT	2	6	342974	342979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460487
6496	NC_008309	T	6	6	343037	343042	0 %	100 %	0 %	0 %	113460487
6497	NC_008309	A	7	7	343082	343088	100 %	0 %	0 %	0 %	113460487
6498	NC_008309	TTC	2	6	343156	343161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460487
6499	NC_008309	TCA	2	6	343180	343185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460487
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