MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 36808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008309	ATG	2	6	264886	264891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460414
5002	NC_008309	ATT	2	6	264946	264951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5003	NC_008309	A	6	6	265009	265014	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5004	NC_008309	GTT	2	6	265016	265021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460414
5005	NC_008309	ATT	2	6	265153	265158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5006	NC_008309	AT	3	6	265241	265246	50 %	50 %	0 %	0 %	113460414
5007	NC_008309	T	6	6	265334	265339	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5008	NC_008309	AAAG	2	8	265356	265363	75 %	0 %	25 %	0 %	113460414
5009	NC_008309	GGA	2	6	265376	265381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460414
5010	NC_008309	T	6	6	265391	265396	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5011	NC_008309	ATC	2	6	265399	265404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460414
5012	NC_008309	ATTCG	2	10	265479	265488	20 %	40 %	20 %	20 %	113460414
5013	NC_008309	CAA	2	6	265506	265511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460414
5014	NC_008309	GGCA	2	8	265534	265541	25 %	0 %	50 %	25 %	113460414
5015	NC_008309	GA	3	6	265548	265553	50 %	0 %	50 %	0 %	113460414
5016	NC_008309	GAA	2	6	265578	265583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460414
5017	NC_008309	TGA	2	6	265613	265618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460414
5018	NC_008309	TTA	2	6	265663	265668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5019	NC_008309	GAA	2	6	265725	265730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460414
5020	NC_008309	T	7	7	265754	265760	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5021	NC_008309	GCA	2	6	265784	265789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460414
5022	NC_008309	AAC	2	6	265796	265801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460414
5023	NC_008309	CAA	2	6	265827	265832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460414
5024	NC_008309	TTG	2	6	265900	265905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460414
5025	NC_008309	GTG	2	6	265998	266003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460414
5026	NC_008309	ATGA	2	8	266016	266023	50 %	25 %	25 %	0 %	113460414
5027	NC_008309	CAA	2	6	266040	266045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460414
5028	NC_008309	ATC	2	6	266074	266079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460414
5029	NC_008309	A	6	6	266082	266087	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5030	NC_008309	GAT	3	9	266106	266114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460414
5031	NC_008309	TATT	2	8	266118	266125	25 %	75 %	0 %	0 %	113460414
5032	NC_008309	TAT	2	6	266183	266188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5033	NC_008309	TGA	2	6	266189	266194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460414
5034	NC_008309	TTG	2	6	266229	266234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460414
5035	NC_008309	TA	3	6	266238	266243	50 %	50 %	0 %	0 %	113460414
5036	NC_008309	A	6	6	266292	266297	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5037	NC_008309	CAA	2	6	266307	266312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460414
5038	NC_008309	T	7	7	266363	266369	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5039	NC_008309	A	6	6	266394	266399	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5040	NC_008309	T	6	6	266420	266425	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5041	NC_008309	T	7	7	266507	266513	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5042	NC_008309	T	7	7	266530	266536	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5043	NC_008309	AGA	2	6	266609	266614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460414
5044	NC_008309	TTAT	2	8	266617	266624	25 %	75 %	0 %	0 %	113460414
5045	NC_008309	T	6	6	266649	266654	0 %	100 %	0 %	0 %	113460414
5046	NC_008309	A	6	6	266713	266718	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5047	NC_008309	A	6	6	266720	266725	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5048	NC_008309	ATC	2	6	266854	266859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460414
5049	NC_008309	A	6	6	266860	266865	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5050	NC_008309	CTG	2	6	266890	266895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460414
5051	NC_008309	TAT	2	6	266928	266933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5052	NC_008309	TTA	2	6	266934	266939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5053	NC_008309	TTGG	2	8	266946	266953	0 %	50 %	50 %	0 %	113460414
5054	NC_008309	CAG	2	6	266990	266995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460414
5055	NC_008309	CTTT	2	8	266997	267004	0 %	75 %	0 %	25 %	113460414
5056	NC_008309	A	6	6	267007	267012	100 %	0 %	0 %	0 %	113460414
5057	NC_008309	TTA	2	6	267084	267089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460414
5058	NC_008309	TAA	2	6	267143	267148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460414
5059	NC_008309	AG	3	6	267221	267226	50 %	0 %	50 %	0 %	113460414
5060	NC_008309	CAAA	2	8	267273	267280	75 %	0 %	0 %	25 %	113460414
5061	NC_008309	TTAATG	2	12	267336	267347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	113460414
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5064	NC_008309	TGAA	2	8	267727	267734	50 %	25 %	25 %	0 %	113460415
5065	NC_008309	AAG	2	6	267754	267759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460415
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5072	NC_008309	AT	3	6	268119	268124	50 %	50 %	0 %	0 %	113460416
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5074	NC_008309	AG	3	6	268180	268185	50 %	0 %	50 %	0 %	113460416
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5093	NC_008309	TATT	2	8	269212	269219	25 %	75 %	0 %	0 %	113460417
5094	NC_008309	CA	4	8	269237	269244	50 %	0 %	0 %	50 %	113460417
5095	NC_008309	AATAA	2	10	269313	269322	80 %	20 %	0 %	0 %	113460417
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5102	NC_008309	AAT	2	6	269669	269674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460417
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5105	NC_008309	A	6	6	270110	270115	100 %	0 %	0 %	0 %	113460417
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5107	NC_008309	T	7	7	270306	270312	0 %	100 %	0 %	0 %	113460417
5108	NC_008309	ATA	2	6	270391	270396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460417
5109	NC_008309	AAT	2	6	270407	270412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460417
5110	NC_008309	TCA	2	6	270413	270418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460417
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5113	NC_008309	GTT	2	6	270538	270543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460418
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5116	NC_008309	TG	3	6	270756	270761	0 %	50 %	50 %	0 %	113460418
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5122	NC_008309	CAAT	2	8	271080	271087	50 %	25 %	0 %	25 %	113460418
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5124	NC_008309	TGA	2	6	271143	271148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460418
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