MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba plasmid pHac1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008230	A	6	6	239	244	100 %	0 %	0 %	0 %	109948254
2	NC_008230	AAAGT	2	10	310	319	60 %	20 %	20 %	0 %	109948254
3	NC_008230	AAGA	2	8	372	379	75 %	0 %	25 %	0 %	109948254
4	NC_008230	AT	3	6	398	403	50 %	50 %	0 %	0 %	109948254
5	NC_008230	ATG	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948254
6	NC_008230	A	7	7	419	425	100 %	0 %	0 %	0 %	109948254
7	NC_008230	TTA	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948254
8	NC_008230	A	6	6	541	546	100 %	0 %	0 %	0 %	109948255
9	NC_008230	A	6	6	565	570	100 %	0 %	0 %	0 %	109948255
10	NC_008230	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	109948255
11	NC_008230	AG	3	6	695	700	50 %	0 %	50 %	0 %	109948255
12	NC_008230	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948255
13	NC_008230	CTA	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109948256
14	NC_008230	AGCG	2	8	1053	1060	25 %	0 %	50 %	25 %	109948256
15	NC_008230	CAA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948256
16	NC_008230	GC	4	8	1339	1346	0 %	0 %	50 %	50 %	109948257
17	NC_008230	CTT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
18	NC_008230	CTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
19	NC_008230	CTT	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
20	NC_008230	CTT	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
21	NC_008230	AGG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109948258
22	NC_008230	ATT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948259
23	NC_008230	AGA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948259
24	NC_008230	AC	3	6	1927	1932	50 %	0 %	0 %	50 %	109948259
25	NC_008230	ACAAAA	2	12	1958	1969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109948259
26	NC_008230	A	6	6	1966	1971	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
27	NC_008230	A	6	6	2042	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
28	NC_008230	CAC	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109948259
29	NC_008230	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948259
30	NC_008230	TAA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109948259
31	NC_008230	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948259
32	NC_008230	ATTGA	2	10	2451	2460	40 %	40 %	20 %	0 %	109948259
33	NC_008230	CAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948259
34	NC_008230	CTT	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948259
35	NC_008230	AAGA	2	8	2781	2788	75 %	0 %	25 %	0 %	109948259
36	NC_008230	AAACAA	2	12	2865	2876	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109948259
37	NC_008230	CT	3	6	3002	3007	0 %	50 %	0 %	50 %	109948259
38	NC_008230	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
39	NC_008230	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948259
40	NC_008230	GGA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109948259
41	NC_008230	A	6	6	3180	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
42	NC_008230	CAAATC	2	12	3366	3377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	109948259
43	NC_008230	TC	4	8	3376	3383	0 %	50 %	0 %	50 %	109948259
44	NC_008230	GAA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948259

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.