MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 28924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_008229	GCGT	2	8	1528370	1528377	0 %	25 %	50 %	25 %	109948220
28503	NC_008229	TAT	2	6	1528413	1528418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948220
28504	NC_008229	T	6	6	1528435	1528440	0 %	100 %	0 %	0 %	109948220
28505	NC_008229	TTA	2	6	1528491	1528496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948220
28506	NC_008229	CA	3	6	1528528	1528533	50 %	0 %	0 %	50 %	109948220
28507	NC_008229	CTT	2	6	1528621	1528626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948220
28508	NC_008229	TGA	2	6	1528628	1528633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948220
28509	NC_008229	GGT	2	6	1528781	1528786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109948220
28510	NC_008229	TAT	2	6	1528842	1528847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948220
28511	NC_008229	ATG	2	6	1528897	1528902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948220
28512	NC_008229	CT	3	6	1528913	1528918	0 %	50 %	0 %	50 %	109948220
28513	NC_008229	AGA	2	6	1528922	1528927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948220
28514	NC_008229	A	6	6	1528951	1528956	100 %	0 %	0 %	0 %	109948220
28515	NC_008229	A	6	6	1528965	1528970	100 %	0 %	0 %	0 %	109948221
28516	NC_008229	ATT	2	6	1528993	1528998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948221
28517	NC_008229	T	6	6	1529000	1529005	0 %	100 %	0 %	0 %	109948221
28518	NC_008229	CTC	2	6	1529081	1529086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109948221
28519	NC_008229	A	6	6	1529099	1529104	100 %	0 %	0 %	0 %	109948221
28520	NC_008229	T	6	6	1529265	1529270	0 %	100 %	0 %	0 %	109948221
28521	NC_008229	AGA	2	6	1529339	1529344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948221
28522	NC_008229	T	6	6	1529514	1529519	0 %	100 %	0 %	0 %	109948221
28523	NC_008229	AAAC	2	8	1529554	1529561	75 %	0 %	0 %	25 %	109948221
28524	NC_008229	CA	3	6	1529584	1529589	50 %	0 %	0 %	50 %	109948221
28525	NC_008229	A	6	6	1529604	1529609	100 %	0 %	0 %	0 %	109948221
28526	NC_008229	CAA	2	6	1529670	1529675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948221
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28528	NC_008229	ACTC	2	8	1529780	1529787	25 %	25 %	0 %	50 %	109948221
28529	NC_008229	TTA	2	6	1529814	1529819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948221
28530	NC_008229	CA	4	8	1529890	1529897	50 %	0 %	0 %	50 %	109948221
28531	NC_008229	CAA	2	6	1529910	1529915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948221
28532	NC_008229	A	6	6	1529938	1529943	100 %	0 %	0 %	0 %	109948221
28533	NC_008229	GTT	2	6	1530013	1530018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948221
28534	NC_008229	ATC	2	6	1530030	1530035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109948221
28535	NC_008229	GAA	2	6	1530066	1530071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948221
28536	NC_008229	ATT	2	6	1530075	1530080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948221
28537	NC_008229	A	7	7	1530137	1530143	100 %	0 %	0 %	0 %	109948221
28538	NC_008229	T	8	8	1530241	1530248	0 %	100 %	0 %	0 %	109948221
28539	NC_008229	ATT	2	6	1530271	1530276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948221
28540	NC_008229	T	6	6	1530344	1530349	0 %	100 %	0 %	0 %	109948222
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28543	NC_008229	T	6	6	1530599	1530604	0 %	100 %	0 %	0 %	109948222
28544	NC_008229	AGA	2	6	1530605	1530610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948222
28545	NC_008229	TGA	2	6	1530629	1530634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948222
28546	NC_008229	TGA	2	6	1530673	1530678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948222
28547	NC_008229	A	6	6	1530814	1530819	100 %	0 %	0 %	0 %	109948222
28548	NC_008229	CAAT	2	8	1530931	1530938	50 %	25 %	0 %	25 %	109948222
28549	NC_008229	TAC	2	6	1531011	1531016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109948222
28550	NC_008229	C	6	6	1531054	1531059	0 %	0 %	0 %	100 %	109948222
28551	NC_008229	A	6	6	1531140	1531145	100 %	0 %	0 %	0 %	109948222
28552	NC_008229	AAG	2	6	1531198	1531203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948222
28553	NC_008229	TTA	2	6	1531321	1531326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948223
28554	NC_008229	GA	3	6	1531327	1531332	50 %	0 %	50 %	0 %	109948223
28555	NC_008229	A	7	7	1531361	1531367	100 %	0 %	0 %	0 %	109948223
28556	NC_008229	A	7	7	1531459	1531465	100 %	0 %	0 %	0 %	109948223
28557	NC_008229	A	7	7	1531528	1531534	100 %	0 %	0 %	0 %	109948223
28558	NC_008229	CT	3	6	1531662	1531667	0 %	50 %	0 %	50 %	109948223
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28560	NC_008229	TCTT	2	8	1531953	1531960	0 %	75 %	0 %	25 %	109948224
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28592	NC_008229	AG	3	6	1533749	1533754	50 %	0 %	50 %	0 %	109948226
28593	NC_008229	TTA	2	6	1533756	1533761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948226
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28605	NC_008229	CAC	2	6	1534716	1534721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109948227
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28616	NC_008229	T	7	7	1535319	1535325	0 %	100 %	0 %	0 %	109948227
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.