MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 30245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	CTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
2	NC_008086	ATGC	2	8	589	596	25 %	25 %	25 %	25 %	108562425
3	NC_008086	CAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562425
4	NC_008086	CGC	2	6	819	824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562425
5	NC_008086	T	6	6	856	861	0 %	100 %	0 %	0 %	108562425
6	NC_008086	TTTC	2	8	881	888	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
7	NC_008086	CTT	2	6	890	895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
8	NC_008086	CAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
9	NC_008086	TTC	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
10	NC_008086	CTT	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
11	NC_008086	TGTTC	2	10	941	950	0 %	60 %	20 %	20 %	108562425
12	NC_008086	TTG	2	6	973	978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562425
13	NC_008086	CA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	0 %	50 %	108562425
14	NC_008086	TTCT	2	8	1094	1101	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
15	NC_008086	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
16	NC_008086	T	6	6	1169	1174	0 %	100 %	0 %	0 %	108562425
17	NC_008086	CAAA	2	8	1202	1209	75 %	0 %	0 %	25 %	108562425
18	NC_008086	GAGC	2	8	1546	1553	25 %	0 %	50 %	25 %	108562426
19	NC_008086	CATT	2	8	1632	1639	25 %	50 %	0 %	25 %	108562426
20	NC_008086	GAT	3	9	1640	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562426
21	NC_008086	TTCT	2	8	1777	1784	0 %	75 %	0 %	25 %	108562426
22	NC_008086	GTT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562426
23	NC_008086	T	7	7	1836	1842	0 %	100 %	0 %	0 %	108562426
24	NC_008086	T	7	7	1864	1870	0 %	100 %	0 %	0 %	108562426
25	NC_008086	TTC	2	6	1874	1879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562426
26	NC_008086	ACA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562426
27	NC_008086	C	6	6	1918	1923	0 %	0 %	0 %	100 %	108562426
28	NC_008086	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562427
29	NC_008086	C	6	6	2160	2165	0 %	0 %	0 %	100 %	108562427
30	NC_008086	CT	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	108562427
31	NC_008086	CTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562427
32	NC_008086	TCTG	2	8	2328	2335	0 %	50 %	25 %	25 %	108562427
33	NC_008086	TGA	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562427
34	NC_008086	TTGCAA	2	12	2385	2396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	108562427
35	NC_008086	AAAT	2	8	2430	2437	75 %	25 %	0 %	0 %	108562428
36	NC_008086	TCA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
37	NC_008086	CCG	4	12	2561	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
38	NC_008086	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562428
39	NC_008086	GCT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562428
40	NC_008086	CA	3	6	2744	2749	50 %	0 %	0 %	50 %	108562428
41	NC_008086	T	6	6	2761	2766	0 %	100 %	0 %	0 %	108562428
42	NC_008086	CTA	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
43	NC_008086	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	108562428
44	NC_008086	ATA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562428
45	NC_008086	GGC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562428
46	NC_008086	GCC	2	6	2965	2970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
47	NC_008086	GCTT	2	8	2973	2980	0 %	50 %	25 %	25 %	108562428
48	NC_008086	CT	3	6	3079	3084	0 %	50 %	0 %	50 %	108562428
49	NC_008086	TAAAA	2	10	3119	3128	80 %	20 %	0 %	0 %	108562428
50	NC_008086	GTT	2	6	3141	3146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562428
51	NC_008086	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562428
52	NC_008086	G	6	6	3231	3236	0 %	0 %	100 %	0 %	108562428
53	NC_008086	TTC	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
54	NC_008086	A	7	7	3295	3301	100 %	0 %	0 %	0 %	108562429
55	NC_008086	ATTATA	2	12	3313	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	108562429
56	NC_008086	CCTG	2	8	3328	3335	0 %	25 %	25 %	50 %	108562429
57	NC_008086	CCAA	2	8	3352	3359	50 %	0 %	0 %	50 %	108562429
58	NC_008086	TGAA	2	8	3392	3399	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
59	NC_008086	GTT	2	6	3415	3420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562429
60	NC_008086	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	108562429
61	NC_008086	CTT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
62	NC_008086	TGG	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562429
63	NC_008086	TCA	3	9	3569	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562429
64	NC_008086	TGAA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
65	NC_008086	AAT	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562429
66	NC_008086	TAG	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562429
67	NC_008086	G	6	6	3707	3712	0 %	0 %	100 %	0 %	108562429
68	NC_008086	GATTA	2	10	3766	3775	40 %	40 %	20 %	0 %	108562429
69	NC_008086	TTTG	2	8	3822	3829	0 %	75 %	25 %	0 %	108562429
70	NC_008086	ATTC	2	8	3867	3874	25 %	50 %	0 %	25 %	108562429
71	NC_008086	A	8	8	4060	4067	100 %	0 %	0 %	0 %	108562430
72	NC_008086	TCTT	2	8	4076	4083	0 %	75 %	0 %	25 %	108562430
73	NC_008086	T	7	7	4156	4162	0 %	100 %	0 %	0 %	108562430
74	NC_008086	T	7	7	4198	4204	0 %	100 %	0 %	0 %	108562430
75	NC_008086	AGC	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562430
76	NC_008086	GC	3	6	4309	4314	0 %	0 %	50 %	50 %	108562430
77	NC_008086	A	6	6	4347	4352	100 %	0 %	0 %	0 %	108562430
78	NC_008086	AG	3	6	4466	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	108562430
79	NC_008086	GTG	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562430
80	NC_008086	AGA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562430
81	NC_008086	GCC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562430
82	NC_008086	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562431
83	NC_008086	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562431
84	NC_008086	GAAA	2	8	4841	4848	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
85	NC_008086	TG	3	6	4948	4953	0 %	50 %	50 %	0 %	108562431
86	NC_008086	GTT	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562431
87	NC_008086	ATC	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562431
88	NC_008086	AGAA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
89	NC_008086	CAAG	2	8	5342	5349	50 %	0 %	25 %	25 %	108562431
90	NC_008086	A	6	6	5385	5390	100 %	0 %	0 %	0 %	108562431
91	NC_008086	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562431
92	NC_008086	GGC	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562431
93	NC_008086	AAT	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562433
94	NC_008086	GAAAC	2	10	6175	6184	60 %	0 %	20 %	20 %	108562433
95	NC_008086	TAAA	2	8	6214	6221	75 %	25 %	0 %	0 %	108562433
96	NC_008086	A	7	7	6219	6225	100 %	0 %	0 %	0 %	108562433
97	NC_008086	T	8	8	6289	6296	0 %	100 %	0 %	0 %	108562433
98	NC_008086	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
99	NC_008086	TGC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562434
100	NC_008086	TCGC	2	8	6734	6741	0 %	25 %	25 %	50 %	108562434
101	NC_008086	T	6	6	6742	6747	0 %	100 %	0 %	0 %	108562434
102	NC_008086	CATT	2	8	6807	6814	25 %	50 %	0 %	25 %	108562434
103	NC_008086	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
104	NC_008086	C	6	6	6892	6897	0 %	0 %	0 %	100 %	108562434
105	NC_008086	TGG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
106	NC_008086	A	6	6	7039	7044	100 %	0 %	0 %	0 %	108562434
107	NC_008086	TCT	2	6	7066	7071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562434
108	NC_008086	T	6	6	7071	7076	0 %	100 %	0 %	0 %	108562434
109	NC_008086	A	6	6	7081	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	108562434
110	NC_008086	GTT	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
111	NC_008086	TAA	2	6	7198	7203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562434
112	NC_008086	TTA	2	6	7256	7261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
113	NC_008086	GTG	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
114	NC_008086	GTT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
115	NC_008086	GC	3	6	7387	7392	0 %	0 %	50 %	50 %	108562434
116	NC_008086	TGT	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
117	NC_008086	GGT	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
118	NC_008086	C	6	6	7491	7496	0 %	0 %	0 %	100 %	108562434
119	NC_008086	T	6	6	7597	7602	0 %	100 %	0 %	0 %	108562434
120	NC_008086	GCTTGC	2	12	7631	7642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562434
121	NC_008086	CAG	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562434
122	NC_008086	GTT	2	6	7729	7734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
123	NC_008086	AC	3	6	7816	7821	50 %	0 %	0 %	50 %	108562434
124	NC_008086	CTT	2	6	7923	7928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562434
125	NC_008086	GTT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
126	NC_008086	AGT	5	15	7951	7965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
127	NC_008086	GTT	2	6	7994	7999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
128	NC_008086	TTG	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
129	NC_008086	GTT	2	6	8134	8139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
130	NC_008086	CTGG	2	8	8181	8188	0 %	25 %	50 %	25 %	108562434
131	NC_008086	TTG	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
132	NC_008086	CCG	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562434
133	NC_008086	T	6	6	8316	8321	0 %	100 %	0 %	0 %	108562434
134	NC_008086	ATCG	2	8	8356	8363	25 %	25 %	25 %	25 %	108562434
135	NC_008086	CGTT	2	8	8391	8398	0 %	50 %	25 %	25 %	108562434
136	NC_008086	GTT	2	6	8413	8418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562434
137	NC_008086	T	6	6	8464	8469	0 %	100 %	0 %	0 %	108562434
138	NC_008086	CAT	2	6	8917	8922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562435
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