MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006397	GCC	2	6	169428	169433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380246
2502	NC_006397	AGCCG	2	10	169438	169447	20 %	0 %	40 %	40 %	55380246
2503	NC_006397	GCAC	2	8	169475	169482	25 %	0 %	25 %	50 %	55380246
2504	NC_006397	CCG	2	6	169516	169521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380246
2505	NC_006397	GTG	2	6	169526	169531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380246
2506	NC_006397	TCT	2	6	169549	169554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380246
2507	NC_006397	GA	3	6	169569	169574	50 %	0 %	50 %	0 %	55380246
2508	NC_006397	CG	3	6	169602	169607	0 %	0 %	50 %	50 %	55380246
2509	NC_006397	TGCAC	2	10	169632	169641	20 %	20 %	20 %	40 %	55380246
2510	NC_006397	CAG	2	6	169705	169710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380246
2511	NC_006397	GTC	2	6	169727	169732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380246
2512	NC_006397	CGC	2	6	169756	169761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380246
2513	NC_006397	GTT	2	6	169777	169782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380246
2514	NC_006397	TCG	2	6	169818	169823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380246
2515	NC_006397	CTGG	2	8	169825	169832	0 %	25 %	50 %	25 %	55380246
2516	NC_006397	CGG	2	6	169873	169878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380246
2517	NC_006397	CT	3	6	169943	169948	0 %	50 %	0 %	50 %	55380246
2518	NC_006397	TTG	2	6	169965	169970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380246
2519	NC_006397	TGC	2	6	170135	170140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380246
2520	NC_006397	GTC	2	6	170421	170426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380247
2521	NC_006397	GCC	2	6	170476	170481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380247
2522	NC_006397	CCGC	2	8	170540	170547	0 %	0 %	25 %	75 %	55380247
2523	NC_006397	GCC	2	6	170584	170589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380247
2524	NC_006397	GCA	2	6	170614	170619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380247
2525	NC_006397	CTG	2	6	170628	170633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380247
2526	NC_006397	GTCC	2	8	170777	170784	0 %	25 %	25 %	50 %	55380247
2527	NC_006397	ATATCC	2	12	170794	170805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380247
2528	NC_006397	GAT	2	6	170865	170870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380247
2529	NC_006397	CTC	3	9	170973	170981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380247
2530	NC_006397	GTT	2	6	171024	171029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380247
2531	NC_006397	CAG	2	6	171084	171089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380247
2532	NC_006397	GGC	2	6	171112	171117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380247
2533	NC_006397	TCC	2	6	171139	171144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380247
2534	NC_006397	GAG	2	6	171148	171153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380247
2535	NC_006397	TGA	2	6	171234	171239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380247
2536	NC_006397	AAT	2	6	171255	171260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380247
2537	NC_006397	CCA	2	6	171268	171273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380247
2538	NC_006397	CAC	2	6	171290	171295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380247
2539	NC_006397	CTG	2	6	171389	171394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380247
2540	NC_006397	ACCC	2	8	171425	171432	25 %	0 %	0 %	75 %	55380247
2541	NC_006397	ACT	2	6	171471	171476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380247
2542	NC_006397	ACC	2	6	171477	171482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380247
2543	NC_006397	ATT	2	6	172110	172115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380248
2544	NC_006397	CGG	2	6	172120	172125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380248
2545	NC_006397	GAA	2	6	172824	172829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380249
2546	NC_006397	GGT	2	6	172869	172874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380249
2547	NC_006397	AGCG	2	8	173094	173101	25 %	0 %	50 %	25 %	55380249
2548	NC_006397	CAG	2	6	173130	173135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380249
2549	NC_006397	CTG	2	6	173260	173265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
2550	NC_006397	GCCG	2	8	173266	173273	0 %	0 %	50 %	50 %	55380249
2551	NC_006397	GAG	2	6	173313	173318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380249
2552	NC_006397	GATCC	2	10	173328	173337	20 %	20 %	20 %	40 %	55380249
2553	NC_006397	CCGG	2	8	173435	173442	0 %	0 %	50 %	50 %	55380249
2554	NC_006397	ATC	2	6	173445	173450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
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2556	NC_006397	CGT	2	6	173519	173524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
2557	NC_006397	CCT	2	6	173530	173535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380249
2558	NC_006397	GTC	2	6	173619	173624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
2559	NC_006397	CTC	2	6	173640	173645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380249
2560	NC_006397	CGA	2	6	173708	173713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380249
2561	NC_006397	CAT	2	6	173720	173725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
2562	NC_006397	AC	3	6	173740	173745	50 %	0 %	0 %	50 %	55380249
2563	NC_006397	CA	3	6	173797	173802	50 %	0 %	0 %	50 %	55380249
2564	NC_006397	GGC	2	6	173816	173821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380249
2565	NC_006397	CGCAG	2	10	173870	173879	20 %	0 %	40 %	40 %	55380249
2566	NC_006397	GTC	2	6	173958	173963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
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2569	NC_006397	CTA	2	6	174047	174052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
2570	NC_006397	GTG	2	6	174058	174063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380249
2571	NC_006397	GATGG	2	10	174074	174083	20 %	20 %	60 %	0 %	55380249
2572	NC_006397	ACG	2	6	174114	174119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380249
2573	NC_006397	ATC	2	6	174129	174134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380249
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2576	NC_006397	GAG	2	6	174264	174269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380249
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2578	NC_006397	CTG	2	6	174358	174363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380249
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2581	NC_006397	ACG	2	6	174571	174576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
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2584	NC_006397	GACG	2	8	174669	174676	25 %	0 %	50 %	25 %	55380250
2585	NC_006397	CGA	3	9	174702	174710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
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2587	NC_006397	GAC	2	6	174777	174782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
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2589	NC_006397	CTG	2	6	174805	174810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380250
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2592	NC_006397	GAC	2	6	174898	174903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
2593	NC_006397	CGC	2	6	174947	174952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380250
2594	NC_006397	CA	3	6	174953	174958	50 %	0 %	0 %	50 %	55380250
2595	NC_006397	GAAC	2	8	174981	174988	50 %	0 %	25 %	25 %	55380250
2596	NC_006397	TCCG	2	8	175085	175092	0 %	25 %	25 %	50 %	55380250
2597	NC_006397	CAT	2	6	175146	175151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380250
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2599	NC_006397	CGA	2	6	175260	175265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
2600	NC_006397	GAC	2	6	175267	175272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
2601	NC_006397	CAGC	2	8	175275	175282	25 %	0 %	25 %	50 %	55380250
2602	NC_006397	CGA	2	6	175310	175315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
2603	NC_006397	GCC	2	6	175324	175329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380250
2604	NC_006397	CGA	2	6	175374	175379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380250
2605	NC_006397	GAG	2	6	175495	175500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380250
2606	NC_006397	GGAA	2	8	175656	175663	50 %	0 %	50 %	0 %	55380251
2607	NC_006397	GAA	2	6	175690	175695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380251
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2609	NC_006397	CTG	2	6	175777	175782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380251
2610	NC_006397	CGA	2	6	175935	175940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380251
2611	NC_006397	GGA	2	6	176049	176054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380251
2612	NC_006397	GCG	2	6	176149	176154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380251
2613	NC_006397	CG	3	6	176172	176177	0 %	0 %	50 %	50 %	55380251
2614	NC_006397	AGGC	2	8	176234	176241	25 %	0 %	50 %	25 %	55380251
2615	NC_006397	AGA	2	6	176246	176251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380251
2616	NC_006397	AG	3	6	176256	176261	50 %	0 %	50 %	0 %	55380251
2617	NC_006397	GCCAG	2	10	176263	176272	20 %	0 %	40 %	40 %	55380251
2618	NC_006397	CGAC	2	8	176393	176400	25 %	0 %	25 %	50 %	55380251
2619	NC_006397	GAT	2	6	176403	176408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380251
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2621	NC_006397	TAC	2	6	176473	176478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380251
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2623	NC_006397	CGAC	2	8	176582	176589	25 %	0 %	25 %	50 %	55380251
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2988	NC_006397	CGT	2	6	196274	196279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380267
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2991	NC_006397	GTC	2	6	196598	196603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380269
2992	NC_006397	TCG	2	6	196608	196613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380269
2993	NC_006397	CGA	2	6	196630	196635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380269
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2995	NC_006397	CGT	2	6	196759	196764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380269
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2999	NC_006397	TGCG	2	8	196921	196928	0 %	25 %	50 %	25 %	55380269
3000	NC_006397	GTC	2	6	196933	196938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380268

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