MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006397	CGA	2	6	107921	107926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380187
1502	NC_006397	CGA	2	6	107933	107938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380187
1503	NC_006397	GTCG	2	8	108000	108007	0 %	25 %	50 %	25 %	55380188
1504	NC_006397	CGA	2	6	108063	108068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380188
1505	NC_006397	CGC	2	6	108108	108113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380188
1506	NC_006397	TGA	2	6	108249	108254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380188
1507	NC_006397	TGCCC	2	10	108261	108270	0 %	20 %	20 %	60 %	55380188
1508	NC_006397	AGAC	2	8	108352	108359	50 %	0 %	25 %	25 %	55380188
1509	NC_006397	CGG	2	6	108421	108426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380188
1510	NC_006397	GTT	2	6	108435	108440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380188
1511	NC_006397	CAC	2	6	108721	108726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380189
1512	NC_006397	CTG	2	6	108744	108749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380189
1513	NC_006397	AGG	2	6	108767	108772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380189
1514	NC_006397	CAC	2	6	108774	108779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380189
1515	NC_006397	GGA	2	6	108819	108824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380189
1516	NC_006397	AGT	2	6	108965	108970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380189
1517	NC_006397	A	6	6	108991	108996	100 %	0 %	0 %	0 %	55380189
1518	NC_006397	TGGC	2	8	109023	109030	0 %	25 %	50 %	25 %	55380189
1519	NC_006397	TGAG	2	8	109065	109072	25 %	25 %	50 %	0 %	55380189
1520	NC_006397	CAT	2	6	109628	109633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380190
1521	NC_006397	GTG	2	6	109674	109679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380190
1522	NC_006397	CTG	2	6	109698	109703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380190
1523	NC_006397	GCA	2	6	109709	109714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380190
1524	NC_006397	TAC	2	6	109719	109724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380190
1525	NC_006397	CT	3	6	109785	109790	0 %	50 %	0 %	50 %	55380190
1526	NC_006397	CGA	2	6	109818	109823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380190
1527	NC_006397	TTTG	2	8	109883	109890	0 %	75 %	25 %	0 %	55380190
1528	NC_006397	CCT	2	6	109901	109906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380190
1529	NC_006397	GCCCT	2	10	110066	110075	0 %	20 %	20 %	60 %	55380191
1530	NC_006397	CAT	2	6	110082	110087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380191
1531	NC_006397	ACC	2	6	110144	110149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380191
1532	NC_006397	AGC	2	6	110210	110215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380191
1533	NC_006397	TCG	2	6	110232	110237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380191
1534	NC_006397	ACT	2	6	110304	110309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380191
1535	NC_006397	CGG	2	6	110327	110332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380191
1536	NC_006397	CAG	2	6	110397	110402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380191
1537	NC_006397	GTC	2	6	111784	111789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380192
1538	NC_006397	CGA	2	6	111822	111827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380192
1539	NC_006397	CGG	2	6	111882	111887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380192
1540	NC_006397	TCAA	2	8	111892	111899	50 %	25 %	0 %	25 %	55380192
1541	NC_006397	GAC	2	6	111919	111924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380192
1542	NC_006397	CAC	2	6	111926	111931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380192
1543	NC_006397	GCT	2	6	112002	112007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380192
1544	NC_006397	CTA	2	6	112075	112080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380192
1545	NC_006397	TGA	2	6	112084	112089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380192
1546	NC_006397	CTC	2	6	112111	112116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380193
1547	NC_006397	AAC	2	6	112132	112137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380193
1548	NC_006397	TACG	2	8	112164	112171	25 %	25 %	25 %	25 %	55380193
1549	NC_006397	CAA	2	6	112178	112183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380193
1550	NC_006397	ACC	2	6	112224	112229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380193
1551	NC_006397	TTGA	2	8	112297	112304	25 %	50 %	25 %	0 %	55380193
1552	NC_006397	AAAC	2	8	112394	112401	75 %	0 %	0 %	25 %	55380194
1553	NC_006397	CAG	2	6	112482	112487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380194
1554	NC_006397	ACG	2	6	112495	112500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380194
1555	NC_006397	CGC	2	6	112526	112531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380194
1556	NC_006397	GGC	2	6	112727	112732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380194
1557	NC_006397	G	6	6	112743	112748	0 %	0 %	100 %	0 %	55380194
1558	NC_006397	CGC	2	6	112749	112754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380194
1559	NC_006397	GAC	2	6	112854	112859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380194
1560	NC_006397	TTC	2	6	112863	112868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380194
1561	NC_006397	TC	3	6	113186	113191	0 %	50 %	0 %	50 %	55380195
1562	NC_006397	TGA	2	6	113192	113197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380195
1563	NC_006397	GAG	2	6	113214	113219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380195
1564	NC_006397	TGA	2	6	113288	113293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380195
1565	NC_006397	GC	3	6	113308	113313	0 %	0 %	50 %	50 %	55380195
1566	NC_006397	GAC	2	6	113341	113346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1567	NC_006397	CCG	2	6	113378	113383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380195
1568	NC_006397	ACG	2	6	113454	113459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1569	NC_006397	GGA	2	6	113495	113500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380195
1570	NC_006397	ACG	2	6	113512	113517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1571	NC_006397	GAT	2	6	113523	113528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380195
1572	NC_006397	CGT	2	6	113621	113626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1573	NC_006397	ACG	3	9	113638	113646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1574	NC_006397	CGA	2	6	113648	113653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1575	NC_006397	GAG	2	6	113685	113690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380195
1576	NC_006397	GTT	2	6	113744	113749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380195
1577	NC_006397	AAC	2	6	113793	113798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380195
1578	NC_006397	CTA	2	6	113817	113822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380195
1579	NC_006397	CTG	2	6	113841	113846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1580	NC_006397	GTT	2	6	113858	113863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380195
1581	NC_006397	CGA	2	6	113885	113890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380195
1582	NC_006397	CCG	2	6	113904	113909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380195
1583	NC_006397	GCG	2	6	113919	113924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380195
1584	NC_006397	TCC	2	6	113950	113955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380195
1585	NC_006397	CCA	2	6	113985	113990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380195
1586	NC_006397	AGA	2	6	114022	114027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380195
1587	NC_006397	CCA	2	6	114029	114034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380195
1588	NC_006397	CGCT	2	8	114058	114065	0 %	25 %	25 %	50 %	55380195
1589	NC_006397	TG	3	6	114676	114681	0 %	50 %	50 %	0 %	55380196
1590	NC_006397	GGA	2	6	114696	114701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380196
1591	NC_006397	ACC	2	6	114762	114767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380196
1592	NC_006397	AT	3	6	114786	114791	50 %	50 %	0 %	0 %	55380196
1593	NC_006397	CTG	2	6	114858	114863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380196
1594	NC_006397	TC	3	6	114879	114884	0 %	50 %	0 %	50 %	55380196
1595	NC_006397	AT	3	6	115315	115320	50 %	50 %	0 %	0 %	55380197
1596	NC_006397	TGG	2	6	115342	115347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380197
1597	NC_006397	CA	3	6	115556	115561	50 %	0 %	0 %	50 %	55380197
1598	NC_006397	CGA	2	6	115564	115569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380197
1599	NC_006397	ACG	2	6	115596	115601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380197
1600	NC_006397	GAG	2	6	115626	115631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380197
1601	NC_006397	GGT	2	6	116224	116229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380198
1602	NC_006397	AGG	3	9	116297	116305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380198
1603	NC_006397	GAGT	2	8	116319	116326	25 %	25 %	50 %	0 %	55380198
1604	NC_006397	GTGG	2	8	116378	116385	0 %	25 %	75 %	0 %	55380198
1605	NC_006397	CGAG	2	8	116399	116406	25 %	0 %	50 %	25 %	55380198
1606	NC_006397	CGGG	2	8	116416	116423	0 %	0 %	75 %	25 %	55380198
1607	NC_006397	GAA	2	6	116446	116451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380198
1608	NC_006397	GAT	2	6	116460	116465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380198
1609	NC_006397	ACTG	2	8	116632	116639	25 %	25 %	25 %	25 %	55380199
1610	NC_006397	TG	3	6	116684	116689	0 %	50 %	50 %	0 %	55380199
1611	NC_006397	ATG	2	6	116697	116702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380199
1612	NC_006397	GAC	3	9	116756	116764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380199
1613	NC_006397	GTTC	2	8	116777	116784	0 %	50 %	25 %	25 %	55380200
1614	NC_006397	GTC	2	6	116846	116851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380200
1615	NC_006397	GTC	3	9	116929	116937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380200
1616	NC_006397	GCG	2	6	116999	117004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380200
1617	NC_006397	CCT	2	6	117033	117038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380200
1618	NC_006397	GCTGG	2	10	117061	117070	0 %	20 %	60 %	20 %	55380200
1619	NC_006397	TGG	2	6	117088	117093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380200
1620	NC_006397	ATG	2	6	117134	117139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380200
1621	NC_006397	AGT	2	6	117245	117250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380201
1622	NC_006397	CCG	2	6	117501	117506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380201
1623	NC_006397	ATC	2	6	117587	117592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380201
1624	NC_006397	TAC	2	6	117641	117646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380201
1625	NC_006397	TCC	2	6	118097	118102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380202
1626	NC_006397	GCA	2	6	118195	118200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380202
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1632	NC_006397	TGG	2	6	118803	118808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380202
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1645	NC_006397	TCAAT	2	10	119622	119631	40 %	40 %	0 %	20 %	55380202
1646	NC_006397	GAA	2	6	119677	119682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380202
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1653	NC_006397	ATCA	2	8	120262	120269	50 %	25 %	0 %	25 %	55380202
1654	NC_006397	CCT	2	6	120306	120311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380202
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1656	NC_006397	ACG	2	6	120392	120397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380202
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1661	NC_006397	AGC	2	6	120817	120822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380202
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1742	NC_006397	CGT	2	6	125607	125612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380209
1743	NC_006397	CGAT	2	8	126273	126280	25 %	25 %	25 %	25 %	55380210
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1746	NC_006397	CAT	2	6	126396	126401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380210
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1865	NC_006397	AC	3	6	132617	132622	50 %	0 %	0 %	50 %	55380212
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1988	NC_006397	CGA	2	6	141420	141425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1989	NC_006397	TGC	2	6	141455	141460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1990	NC_006397	GTC	2	6	141497	141502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1991	NC_006397	CCA	2	6	141540	141545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380223
1992	NC_006397	GC	3	6	141551	141556	0 %	0 %	50 %	50 %	55380223
1993	NC_006397	TCG	2	6	141572	141577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1994	NC_006397	TGT	2	6	141624	141629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380223
1995	NC_006397	GCT	2	6	141669	141674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1996	NC_006397	CGA	2	6	141699	141704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1997	NC_006397	CAG	2	6	141706	141711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380223
1998	NC_006397	CGC	2	6	141777	141782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380223
1999	NC_006397	CCA	2	6	141871	141876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380223
2000	NC_006397	TCTCG	2	10	141906	141915	0 %	40 %	20 %	40 %	55380223

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