MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006397	TCG	2	6	269950	269955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380337
4502	NC_006397	ACG	2	6	269962	269967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380337
4503	NC_006397	TCG	2	6	270082	270087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380337
4504	NC_006397	GAT	2	6	270147	270152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380337
4505	NC_006397	GCTGC	2	10	270258	270267	0 %	20 %	40 %	40 %	55380337
4506	NC_006397	TGT	2	6	270341	270346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380337
4507	NC_006397	GCC	2	6	270374	270379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380337
4508	NC_006397	ACA	2	6	270382	270387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380337
4509	NC_006397	CTT	2	6	270404	270409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380337
4510	NC_006397	ATT	2	6	270418	270423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55380337
4511	NC_006397	GATC	2	8	270449	270456	25 %	25 %	25 %	25 %	55380337
4512	NC_006397	CAT	2	6	270554	270559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380337
4513	NC_006397	ATC	2	6	270646	270651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380338
4514	NC_006397	GGTC	2	8	270682	270689	0 %	25 %	50 %	25 %	55380338
4515	NC_006397	CCG	2	6	270727	270732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380338
4516	NC_006397	TGTC	2	8	270793	270800	0 %	50 %	25 %	25 %	55380338
4517	NC_006397	ATC	2	6	270936	270941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380338
4518	NC_006397	C	6	6	270963	270968	0 %	0 %	0 %	100 %	55380338
4519	NC_006397	GTCCG	2	10	270981	270990	0 %	20 %	40 %	40 %	55380338
4520	NC_006397	TGG	2	6	270994	270999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380338
4521	NC_006397	GTT	2	6	271013	271018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380338
4522	NC_006397	AGTG	2	8	271022	271029	25 %	25 %	50 %	0 %	55380338
4523	NC_006397	GCTC	2	8	271095	271102	0 %	25 %	25 %	50 %	55380338
4524	NC_006397	CCAGC	2	10	271120	271129	20 %	0 %	20 %	60 %	55380338
4525	NC_006397	GC	3	6	271131	271136	0 %	0 %	50 %	50 %	55380338
4526	NC_006397	GATA	2	8	271197	271204	50 %	25 %	25 %	0 %	55380338
4527	NC_006397	GCT	2	6	271209	271214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380338
4528	NC_006397	TCA	2	6	271236	271241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380338
4529	NC_006397	CTG	2	6	271242	271247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380338
4530	NC_006397	CAAT	2	8	271248	271255	50 %	25 %	0 %	25 %	55380338
4531	NC_006397	TC	3	6	271285	271290	0 %	50 %	0 %	50 %	55380338
4532	NC_006397	CTGT	2	8	271345	271352	0 %	50 %	25 %	25 %	55380338
4533	NC_006397	CGG	2	6	271360	271365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380338
4534	NC_006397	CAC	2	6	271384	271389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380338
4535	NC_006397	TACCG	2	10	271394	271403	20 %	20 %	20 %	40 %	55380338
4536	NC_006397	TGA	2	6	271574	271579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380339
4537	NC_006397	CAG	2	6	271635	271640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4538	NC_006397	CTGTC	2	10	271734	271743	0 %	40 %	20 %	40 %	55380339
4539	NC_006397	GTC	2	6	271768	271773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4540	NC_006397	CAG	2	6	271847	271852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4541	NC_006397	GCT	2	6	271902	271907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4542	NC_006397	ACTG	2	8	272010	272017	25 %	25 %	25 %	25 %	55380339
4543	NC_006397	GAT	2	6	272040	272045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380339
4544	NC_006397	CGC	2	6	272067	272072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380339
4545	NC_006397	GTT	2	6	272118	272123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380339
4546	NC_006397	GCCCG	2	10	272128	272137	0 %	0 %	40 %	60 %	55380339
4547	NC_006397	GCC	2	6	272172	272177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380339
4548	NC_006397	GAA	2	6	272178	272183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380339
4549	NC_006397	CCG	2	6	272314	272319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380339
4550	NC_006397	AAT	2	6	272346	272351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380339
4551	NC_006397	GAC	2	6	272437	272442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4552	NC_006397	AAT	2	6	272451	272456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380339
4553	NC_006397	TGT	2	6	272526	272531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380339
4554	NC_006397	TCG	2	6	272560	272565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4555	NC_006397	AGT	2	6	272641	272646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380339
4556	NC_006397	GA	3	6	272658	272663	50 %	0 %	50 %	0 %	55380339
4557	NC_006397	CTG	2	6	272711	272716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4558	NC_006397	AGC	2	6	272746	272751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380339
4559	NC_006397	GTA	2	6	272780	272785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380339
4560	NC_006397	ATCTT	2	10	272857	272866	20 %	60 %	0 %	20 %	55380339
4561	NC_006397	CGA	2	6	273195	273200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4562	NC_006397	GCA	2	6	273231	273236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4563	NC_006397	CGG	2	6	273284	273289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380340
4564	NC_006397	GAA	2	6	273437	273442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380340
4565	NC_006397	GGA	2	6	273446	273451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380340
4566	NC_006397	CGG	2	6	273559	273564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380340
4567	NC_006397	ACA	2	6	273595	273600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380340
4568	NC_006397	TGGC	2	8	273795	273802	0 %	25 %	50 %	25 %	55380340
4569	NC_006397	GCAG	2	8	273806	273813	25 %	0 %	50 %	25 %	55380340
4570	NC_006397	ACG	2	6	273817	273822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4571	NC_006397	CTC	2	6	273827	273832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380340
4572	NC_006397	CGG	2	6	273962	273967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380340
4573	NC_006397	ACG	2	6	273997	274002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4574	NC_006397	ACG	2	6	274006	274011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4575	NC_006397	CG	3	6	274039	274044	0 %	0 %	50 %	50 %	55380340
4576	NC_006397	ACA	2	6	274057	274062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380340
4577	NC_006397	CGA	2	6	274069	274074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4578	NC_006397	ACG	2	6	274110	274115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380340
4579	NC_006397	AGG	2	6	274153	274158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380340
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4581	NC_006397	CGACTA	2	12	274178	274189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55380340
4582	NC_006397	GGT	2	6	274218	274223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380340
4583	NC_006397	GATT	2	8	274241	274248	25 %	50 %	25 %	0 %	55380340
4584	NC_006397	ATC	2	6	274266	274271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380340
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4586	NC_006397	ACA	2	6	274312	274317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380340
4587	NC_006397	AAG	2	6	274327	274332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55380340
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4589	NC_006397	A	6	6	274366	274371	100 %	0 %	0 %	0 %	55380341
4590	NC_006397	TCGT	2	8	274474	274481	0 %	50 %	25 %	25 %	55380341
4591	NC_006397	GGCG	2	8	274509	274516	0 %	0 %	75 %	25 %	55380341
4592	NC_006397	CGG	2	6	274686	274691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380341
4593	NC_006397	GGA	2	6	274703	274708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380341
4594	NC_006397	GC	3	6	274715	274720	0 %	0 %	50 %	50 %	55380341
4595	NC_006397	AAC	2	6	274761	274766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380341
4596	NC_006397	CGG	2	6	274784	274789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380341
4597	NC_006397	CGA	2	6	274858	274863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380341
4598	NC_006397	GC	3	6	274864	274869	0 %	0 %	50 %	50 %	55380341
4599	NC_006397	ATC	3	9	274938	274946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380341
4600	NC_006397	GAC	2	6	275034	275039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380341
4601	NC_006397	CGG	2	6	275072	275077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55380341
4602	NC_006397	TGA	2	6	275129	275134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380341
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4604	NC_006397	TCT	2	6	275217	275222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380342
4605	NC_006397	ACA	2	6	275223	275228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380342
4606	NC_006397	TTG	2	6	275261	275266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380342
4607	NC_006397	TTC	2	6	275267	275272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380342
4608	NC_006397	TCA	2	6	275343	275348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380342
4609	NC_006397	ACC	2	6	275359	275364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380342
4610	NC_006397	CTC	2	6	275390	275395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380342
4611	NC_006397	TCG	2	6	275406	275411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380342
4612	NC_006397	TGA	2	6	275421	275426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380342
4613	NC_006397	CAT	2	6	275449	275454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380342
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4615	NC_006397	GTCG	2	8	275516	275523	0 %	25 %	50 %	25 %	55380342
4616	NC_006397	CGCT	2	8	275543	275550	0 %	25 %	25 %	50 %	55380342
4617	NC_006397	TTG	2	6	275562	275567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380342
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4623	NC_006397	TCG	2	6	275772	275777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380342
4624	NC_006397	GTC	2	6	275822	275827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380342
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4741	NC_006397	CGTG	2	8	282795	282802	0 %	25 %	50 %	25 %	55380348
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