MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 65341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006396	CGT	2	6	212997	213002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377150
4502	NC_006396	ACC	2	6	213025	213030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377150
4503	NC_006396	CGGTGA	2	12	213047	213058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55377150
4504	NC_006396	CT	3	6	213067	213072	0 %	50 %	0 %	50 %	55377150
4505	NC_006396	CGA	2	6	213084	213089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377150
4506	NC_006396	CAC	2	6	213090	213095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377150
4507	NC_006396	CTGG	2	8	213111	213118	0 %	25 %	50 %	25 %	55377150
4508	NC_006396	TGC	2	6	213219	213224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4509	NC_006396	CGC	2	6	213341	213346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377151
4510	NC_006396	CCATCG	2	12	213375	213386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55377151
4511	NC_006396	CGA	2	6	213412	213417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4512	NC_006396	GTC	2	6	213527	213532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4513	NC_006396	CGA	2	6	213568	213573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4514	NC_006396	GGC	2	6	213596	213601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377151
4515	NC_006396	TCCC	2	8	213605	213612	0 %	25 %	0 %	75 %	55377151
4516	NC_006396	ACGT	2	8	213633	213640	25 %	25 %	25 %	25 %	55377151
4517	NC_006396	GCC	2	6	213661	213666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377151
4518	NC_006396	AGT	2	6	213715	213720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377151
4519	NC_006396	GCC	2	6	213770	213775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377151
4520	NC_006396	C	7	7	213829	213835	0 %	0 %	0 %	100 %	55377151
4521	NC_006396	GC	3	6	213864	213869	0 %	0 %	50 %	50 %	55377151
4522	NC_006396	CGC	2	6	213917	213922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377151
4523	NC_006396	GAT	2	6	213983	213988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377151
4524	NC_006396	AGC	2	6	214011	214016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4525	NC_006396	CAA	2	6	214079	214084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377151
4526	NC_006396	GGT	2	6	214132	214137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55377151
4527	NC_006396	TTGG	2	8	214283	214290	0 %	50 %	50 %	0 %	55377151
4528	NC_006396	GTA	2	6	214298	214303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377151
4529	NC_006396	CCG	2	6	214315	214320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377151
4530	NC_006396	TCG	2	6	214386	214391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4531	NC_006396	CGC	2	6	214411	214416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377151
4532	NC_006396	CGT	3	9	214510	214518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4533	NC_006396	GAC	2	6	214550	214555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377151
4534	NC_006396	CGAG	2	8	214558	214565	25 %	0 %	50 %	25 %	55377151
4535	NC_006396	CGA	2	6	214983	214988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4536	NC_006396	CGA	2	6	215010	215015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4537	NC_006396	TCG	2	6	215033	215038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4538	NC_006396	GAC	2	6	215050	215055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4539	NC_006396	GTCGCC	2	12	215098	215109	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55377152
4540	NC_006396	GGCC	2	8	215112	215119	0 %	0 %	50 %	50 %	55377152
4541	NC_006396	GCC	2	6	215182	215187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377152
4542	NC_006396	ACGCCG	2	12	215246	215257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55377152
4543	NC_006396	GTC	2	6	215287	215292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4544	NC_006396	ACA	2	6	215309	215314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55377152
4545	NC_006396	AC	3	6	215329	215334	50 %	0 %	0 %	50 %	55377152
4546	NC_006396	CGA	2	6	215366	215371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4547	NC_006396	GGC	2	6	215376	215381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377152
4548	NC_006396	CGG	2	6	215406	215411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377152
4549	NC_006396	TGC	2	6	215430	215435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4550	NC_006396	TTC	2	6	215437	215442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55377152
4551	NC_006396	TGC	2	6	215457	215462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4552	NC_006396	CTG	2	6	215545	215550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377152
4553	NC_006396	GCTG	2	8	215552	215559	0 %	25 %	50 %	25 %	55377152
4554	NC_006396	GCGA	2	8	215573	215580	25 %	0 %	50 %	25 %	55377152
4555	NC_006396	CGACG	2	10	215599	215608	20 %	0 %	40 %	40 %	55377152
4556	NC_006396	CGGCAA	2	12	215784	215795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4557	NC_006396	TCG	2	6	215810	215815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4558	NC_006396	CGG	2	6	215829	215834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377153
4559	NC_006396	TTG	2	6	215840	215845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55377153
4560	NC_006396	CCG	2	6	215930	215935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377153
4561	NC_006396	GTC	2	6	215983	215988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4562	NC_006396	CAG	2	6	215996	216001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4563	NC_006396	GCGGTC	2	12	216031	216042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55377153
4564	NC_006396	GTGC	2	8	216108	216115	0 %	25 %	50 %	25 %	55377153
4565	NC_006396	CGAC	2	8	216144	216151	25 %	0 %	25 %	50 %	55377153
4566	NC_006396	ACC	2	6	216163	216168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55377153
4567	NC_006396	GCG	2	6	216180	216185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377153
4568	NC_006396	GGC	2	6	216194	216199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377153
4569	NC_006396	CGT	2	6	216240	216245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4570	NC_006396	ATG	2	6	216278	216283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377153
4571	NC_006396	CGC	2	6	216409	216414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377153
4572	NC_006396	AGC	2	6	216425	216430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4573	NC_006396	GAG	2	6	216461	216466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377153
4574	NC_006396	CGT	2	6	216508	216513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4575	NC_006396	CTG	2	6	216574	216579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4576	NC_006396	CGA	2	6	216588	216593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377153
4577	NC_006396	CGAC	2	8	216600	216607	25 %	0 %	25 %	50 %	55377153
4578	NC_006396	GGCTG	2	10	216608	216617	0 %	20 %	60 %	20 %	55377153
4579	NC_006396	TAT	2	6	216866	216871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55377154
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4581	NC_006396	GTC	3	9	217005	217013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377154
4582	NC_006396	TCG	2	6	217102	217107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377154
4583	NC_006396	CGA	2	6	217136	217141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377154
4584	NC_006396	TCA	3	9	217177	217185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55377154
4585	NC_006396	GT	3	6	217189	217194	0 %	50 %	50 %	0 %	55377154
4586	NC_006396	GAC	2	6	217364	217369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4587	NC_006396	TCG	2	6	217396	217401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377155
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4589	NC_006396	GAC	2	6	217440	217445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4590	NC_006396	CGCT	2	8	217476	217483	0 %	25 %	25 %	50 %	55377155
4591	NC_006396	CGA	2	6	217601	217606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4592	NC_006396	CGA	2	6	217640	217645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4593	NC_006396	ACG	2	6	217672	217677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4594	NC_006396	GTC	2	6	217695	217700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4595	NC_006396	CGG	2	6	217751	217756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55377155
4596	NC_006396	CGA	2	6	217781	217786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4597	NC_006396	CAG	3	9	217804	217812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4598	NC_006396	GAG	2	6	217854	217859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377155
4599	NC_006396	CGA	2	6	217937	217942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4600	NC_006396	GCCA	2	8	217966	217973	25 %	0 %	25 %	50 %	55377155
4601	NC_006396	ACG	2	6	218005	218010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377155
4602	NC_006396	GAG	2	6	218020	218025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377155
4603	NC_006396	TCG	2	6	218400	218405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4604	NC_006396	CTC	2	6	218438	218443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377156
4605	NC_006396	CCG	2	6	218485	218490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377156
4606	NC_006396	CAG	2	6	218498	218503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4607	NC_006396	CGGA	2	8	218509	218516	25 %	0 %	50 %	25 %	55377156
4608	NC_006396	TCG	2	6	218526	218531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4609	NC_006396	GAC	2	6	218533	218538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4610	NC_006396	TGA	2	6	218575	218580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55377156
4611	NC_006396	AGC	2	6	218670	218675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4612	NC_006396	CGA	2	6	218683	218688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377156
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4614	NC_006396	TCG	2	6	218793	218798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4615	NC_006396	TCGGCC	2	12	218817	218828	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55377156
4616	NC_006396	CTC	2	6	218915	218920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377156
4617	NC_006396	CAG	2	6	218933	218938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377156
4618	NC_006396	CGT	2	6	218941	218946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377156
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4621	NC_006396	GCC	3	9	218990	218998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377156
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4625	NC_006396	CGT	2	6	219401	219406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377157
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4743	NC_006396	TCC	2	6	226051	226056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377162
4744	NC_006396	TCG	2	6	226146	226151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377163
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4747	NC_006396	GCA	2	6	226383	226388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377163
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4857	NC_006396	CTTGGG	2	12	231644	231655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55377167
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4864	NC_006396	CGA	2	6	231936	231941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377168
4865	NC_006396	CGT	2	6	231954	231959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377168
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4884	NC_006396	CTG	2	6	232921	232926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377169
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4954	NC_006396	CCCA	2	8	236511	236518	25 %	0 %	0 %	75 %	55377176
4955	NC_006396	GCC	2	6	236568	236573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55377176
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4961	NC_006396	CGA	2	6	236895	236900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377176
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4965	NC_006396	G	6	6	236969	236974	0 %	0 %	100 %	0 %	55377176
4966	NC_006396	TCC	2	6	236975	236980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55377176
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4971	NC_006396	GT	3	6	237356	237361	0 %	50 %	50 %	0 %	55377177
4972	NC_006396	ACG	2	6	237367	237372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
4973	NC_006396	CGA	2	6	237395	237400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
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4975	NC_006396	CGT	2	6	237429	237434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377177
4976	NC_006396	GAC	2	6	237447	237452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
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4981	NC_006396	GAC	2	6	237648	237653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377177
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4984	NC_006396	TCG	2	6	237736	237741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55377177
4985	NC_006396	CGA	2	6	238048	238053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377178
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4987	NC_006396	CGA	2	6	238120	238125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55377178
4988	NC_006396	GAG	2	6	238157	238162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55377178
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