MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG700

Total Repeats: 7530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006395	CGA	2	6	31426	31431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376601
502	NC_006395	GGC	2	6	31466	31471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376601
503	NC_006395	CGT	2	6	31624	31629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376601
504	NC_006395	TCA	2	6	31758	31763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376601
505	NC_006395	CGC	2	6	31765	31770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376601
506	NC_006395	CTG	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376601
507	NC_006395	CGA	2	6	31845	31850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376601
508	NC_006395	GC	3	6	31861	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	55376601
509	NC_006395	CTC	2	6	31921	31926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376601
510	NC_006395	ACA	2	6	31935	31940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376601
511	NC_006395	CGC	2	6	32107	32112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376601
512	NC_006395	TCCG	2	8	32117	32124	0 %	25 %	25 %	50 %	55376601
513	NC_006395	ACG	2	6	32142	32147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376601
514	NC_006395	GC	3	6	32272	32277	0 %	0 %	50 %	50 %	55376601
515	NC_006395	CCG	2	6	32295	32300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376601
516	NC_006395	AGG	2	6	32301	32306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376601
517	NC_006395	GGC	2	6	32317	32322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376601
518	NC_006395	AGA	2	6	32332	32337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376601
519	NC_006395	TGA	2	6	32499	32504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376602
520	NC_006395	CTT	2	6	32515	32520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376602
521	NC_006395	CGG	2	6	32626	32631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376602
522	NC_006395	TCGT	2	8	32642	32649	0 %	50 %	25 %	25 %	55376602
523	NC_006395	CGT	3	9	32662	32670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376602
524	NC_006395	GC	3	6	32673	32678	0 %	0 %	50 %	50 %	55376602
525	NC_006395	CTC	2	6	32681	32686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376602
526	NC_006395	TCG	2	6	32718	32723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376602
527	NC_006395	CCGG	2	8	32736	32743	0 %	0 %	50 %	50 %	55376602
528	NC_006395	GTT	2	6	32764	32769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376602
529	NC_006395	CAT	2	6	32770	32775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376602
530	NC_006395	TCGC	2	8	32798	32805	0 %	25 %	25 %	50 %	55376602
531	NC_006395	CAT	2	6	32842	32847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376602
532	NC_006395	CT	3	6	32894	32899	0 %	50 %	0 %	50 %	55376602
533	NC_006395	GCT	2	6	32908	32913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376602
534	NC_006395	GTTCAT	2	12	32950	32961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55376602
535	NC_006395	TCT	2	6	32964	32969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376602
536	NC_006395	TCG	2	6	32981	32986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376602
537	NC_006395	CG	3	6	33012	33017	0 %	0 %	50 %	50 %	55376602
538	NC_006395	GGC	2	6	33036	33041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376602
539	NC_006395	TCA	2	6	33054	33059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376602
540	NC_006395	GTG	2	6	33131	33136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376602
541	NC_006395	GCG	2	6	33150	33155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376602
542	NC_006395	TCA	2	6	33207	33212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376602
543	NC_006395	GCA	2	6	33233	33238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376602
544	NC_006395	CCTCGT	2	12	33253	33264	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55376602
545	NC_006395	TCA	2	6	33282	33287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376602
546	NC_006395	CGA	2	6	33326	33331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376603
547	NC_006395	TCA	2	6	33389	33394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376603
548	NC_006395	AC	3	6	33405	33410	50 %	0 %	0 %	50 %	55376603
549	NC_006395	GCC	2	6	33501	33506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376603
550	NC_006395	TCG	2	6	33566	33571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376603
551	NC_006395	GTCG	2	8	33606	33613	0 %	25 %	50 %	25 %	55376603
552	NC_006395	CGC	2	6	33639	33644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376603
553	NC_006395	CT	3	6	33700	33705	0 %	50 %	0 %	50 %	55376603
554	NC_006395	CGT	2	6	33729	33734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376603
555	NC_006395	TTC	2	6	33742	33747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376603
556	NC_006395	ATC	2	6	33748	33753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376603
557	NC_006395	CTCG	2	8	33819	33826	0 %	25 %	25 %	50 %	55376603
558	NC_006395	TGA	2	6	33836	33841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376603
559	NC_006395	TTC	2	6	33847	33852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376603
560	NC_006395	AGG	2	6	33875	33880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376603
561	NC_006395	CCGC	2	8	33881	33888	0 %	0 %	25 %	75 %	55376603
562	NC_006395	GTC	2	6	33925	33930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376603
563	NC_006395	CGG	2	6	33935	33940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376603
564	NC_006395	TCT	2	6	33953	33958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376603
565	NC_006395	CAT	2	6	33966	33971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376603
566	NC_006395	TCGA	2	8	34075	34082	25 %	25 %	25 %	25 %	55376603
567	NC_006395	GCC	2	6	34099	34104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376603
568	NC_006395	GAT	2	6	34113	34118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376603
569	NC_006395	GTC	2	6	34126	34131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376603
570	NC_006395	CAA	2	6	34149	34154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376603
571	NC_006395	GTG	2	6	34183	34188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376603
572	NC_006395	AAT	2	6	34288	34293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376604
573	NC_006395	CGA	2	6	34309	34314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376604
574	NC_006395	ATC	2	6	34349	34354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376604
575	NC_006395	CGA	2	6	34360	34365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376604
576	NC_006395	TCG	2	6	34404	34409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
577	NC_006395	GTCC	2	8	34410	34417	0 %	25 %	25 %	50 %	55376604
578	NC_006395	TCG	2	6	34446	34451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
579	NC_006395	CGA	2	6	34492	34497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376604
580	NC_006395	CCG	2	6	34623	34628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376604
581	NC_006395	GAA	2	6	34637	34642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376604
582	NC_006395	CCG	3	9	34653	34661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376604
583	NC_006395	GAT	2	6	34663	34668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376604
584	NC_006395	GAC	2	6	34688	34693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376604
585	NC_006395	ACA	3	9	34717	34725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376604
586	NC_006395	CAGA	2	8	34886	34893	50 %	0 %	25 %	25 %	55376604
587	NC_006395	GTC	2	6	34919	34924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
588	NC_006395	CAG	2	6	34943	34948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376604
589	NC_006395	CGC	2	6	34956	34961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376604
590	NC_006395	TCG	2	6	34992	34997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
591	NC_006395	CTT	2	6	35026	35031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376604
592	NC_006395	CG	3	6	35060	35065	0 %	0 %	50 %	50 %	55376604
593	NC_006395	CTTCGA	2	12	35071	35082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55376604
594	NC_006395	CCGG	2	8	35140	35147	0 %	0 %	50 %	50 %	55376604
595	NC_006395	CGT	2	6	35197	35202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
596	NC_006395	CGT	2	6	35206	35211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
597	NC_006395	TCG	2	6	35280	35285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376604
598	NC_006395	GACG	2	8	35287	35294	25 %	0 %	50 %	25 %	55376604
599	NC_006395	CGC	2	6	35365	35370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376604
600	NC_006395	GCG	2	6	35373	35378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376604
601	NC_006395	CCA	2	6	35386	35391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376604
602	NC_006395	GAC	2	6	35405	35410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376604
603	NC_006395	CCG	2	6	35442	35447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376604
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605	NC_006395	CGA	2	6	35626	35631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376605
606	NC_006395	GA	3	6	35670	35675	50 %	0 %	50 %	0 %	55376605
607	NC_006395	AC	3	6	35701	35706	50 %	0 %	0 %	50 %	55376605
608	NC_006395	GTC	2	6	35717	35722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376605
609	NC_006395	CGG	2	6	35784	35789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376605
610	NC_006395	CGG	2	6	35791	35796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376605
611	NC_006395	CGT	2	6	35797	35802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376605
612	NC_006395	CGA	2	6	35823	35828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376605
613	NC_006395	CCT	2	6	35869	35874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376605
614	NC_006395	AC	3	6	35915	35920	50 %	0 %	0 %	50 %	55376605
615	NC_006395	GAA	2	6	35927	35932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376605
616	NC_006395	CGA	2	6	36010	36015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376605
617	NC_006395	GAC	2	6	36023	36028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376605
618	NC_006395	CCA	2	6	36070	36075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376605
619	NC_006395	TCC	2	6	36105	36110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376605
620	NC_006395	GCG	2	6	36227	36232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376606
621	NC_006395	GTC	2	6	36261	36266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376606
622	NC_006395	GAACG	2	10	36310	36319	40 %	0 %	40 %	20 %	55376606
623	NC_006395	TCA	2	6	36356	36361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376606
624	NC_006395	CGA	2	6	36381	36386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376606
625	NC_006395	CGGT	2	8	36407	36414	0 %	25 %	50 %	25 %	55376606
626	NC_006395	CG	3	6	36506	36511	0 %	0 %	50 %	50 %	55376606
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628	NC_006395	AC	3	6	36575	36580	50 %	0 %	0 %	50 %	55376606
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756	NC_006395	GCGTT	2	10	43164	43173	0 %	40 %	40 %	20 %	55376611
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878	NC_006395	AC	3	6	48189	48194	50 %	0 %	0 %	50 %	55376614
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880	NC_006395	ACC	2	6	48214	48219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376614
881	NC_006395	TAC	2	6	48245	48250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376614
882	NC_006395	TGC	2	6	48336	48341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376614
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