MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG600

Total Repeats: 3108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006394	GAAC	2	8	48371	48378	50 %	0 %	25 %	25 %	55376465
1002	NC_006394	GGT	2	6	48421	48426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376465
1003	NC_006394	TCG	2	6	48464	48469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376465
1004	NC_006394	ATG	2	6	48470	48475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376465
1005	NC_006394	CGG	2	6	48482	48487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376465
1006	NC_006394	GAC	2	6	48492	48497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376465
1007	NC_006394	TCG	2	6	48519	48524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376465
1008	NC_006394	AAC	2	6	48538	48543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376465
1009	NC_006394	GCT	2	6	48552	48557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376465
1010	NC_006394	CGG	2	6	48636	48641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376465
1011	NC_006394	GAT	2	6	48805	48810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376466
1012	NC_006394	GGA	2	6	48846	48851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376466
1013	NC_006394	GAC	2	6	48912	48917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376466
1014	NC_006394	AT	3	6	48929	48934	50 %	50 %	0 %	0 %	55376466
1015	NC_006394	TACCT	2	10	48976	48985	20 %	40 %	0 %	40 %	55376467
1016	NC_006394	CCG	2	6	48990	48995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376467
1017	NC_006394	GAT	2	6	48997	49002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376467
1018	NC_006394	GCT	2	6	49028	49033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1019	NC_006394	GCG	2	6	49098	49103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376467
1020	NC_006394	CGA	2	6	49113	49118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1021	NC_006394	AG	3	6	49128	49133	50 %	0 %	50 %	0 %	55376467
1022	NC_006394	GGC	2	6	49135	49140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376467
1023	NC_006394	GCA	2	6	49154	49159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1024	NC_006394	CGA	2	6	49176	49181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1025	NC_006394	CGA	2	6	49212	49217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1026	NC_006394	CGG	2	6	49230	49235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376467
1027	NC_006394	GCG	2	6	49289	49294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376467
1028	NC_006394	CGA	3	9	49323	49331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1029	NC_006394	GAA	2	6	49357	49362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376467
1030	NC_006394	ACG	2	6	49442	49447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376467
1031	NC_006394	CTC	2	6	49471	49476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376467
1032	NC_006394	GT	3	6	49660	49665	0 %	50 %	50 %	0 %	55376467
1033	NC_006394	ATG	2	6	49787	49792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376467
1034	NC_006394	GTT	2	6	49943	49948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376467
1035	NC_006394	GCC	2	6	49984	49989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376467
1036	NC_006394	AAG	2	6	50014	50019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376467
1037	NC_006394	TGAG	2	8	50084	50091	25 %	25 %	50 %	0 %	55376467
1038	NC_006394	AAG	2	6	50107	50112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376467
1039	NC_006394	AG	3	6	50116	50121	50 %	0 %	50 %	0 %	55376467
1040	NC_006394	GGGA	2	8	50157	50164	25 %	0 %	75 %	0 %	55376467
1041	NC_006394	ATT	2	6	50195	50200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376467
1042	NC_006394	GAA	2	6	50364	50369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376468
1043	NC_006394	GAA	2	6	50378	50383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376468
1044	NC_006394	AAT	2	6	50454	50459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376468
1045	NC_006394	TGA	2	6	50525	50530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376468
1046	NC_006394	CCGG	2	8	50553	50560	0 %	0 %	50 %	50 %	55376468
1047	NC_006394	TAC	2	6	50562	50567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376468
1048	NC_006394	TTG	2	6	50727	50732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376468
1049	NC_006394	AGT	2	6	51030	51035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376469
1050	NC_006394	TGG	2	6	51092	51097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376469
1051	NC_006394	ATG	2	6	51120	51125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376469
1052	NC_006394	TAT	2	6	51144	51149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376469
1053	NC_006394	GGTC	2	8	51392	51399	0 %	25 %	50 %	25 %	55376469
1054	NC_006394	TCG	2	6	51403	51408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376469
1055	NC_006394	CGG	2	6	51419	51424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376469
1056	NC_006394	GCC	2	6	51443	51448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376469
1057	NC_006394	GGC	2	6	51521	51526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376469
1058	NC_006394	TGC	2	6	51663	51668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376470
1059	NC_006394	ACG	2	6	51690	51695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376470
1060	NC_006394	AC	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	55376470
1061	NC_006394	CTC	2	6	51764	51769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376470
1062	NC_006394	GTT	2	6	51784	51789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376470
1063	NC_006394	TTCG	2	8	51900	51907	0 %	50 %	25 %	25 %	55376470
1064	NC_006394	TCA	2	6	51980	51985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376470
1065	NC_006394	AAC	2	6	51986	51991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376470
1066	NC_006394	CTC	2	6	51994	51999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376470
1067	NC_006394	CAG	2	6	52009	52014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376470
1068	NC_006394	CCG	2	6	52026	52031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376470
1069	NC_006394	ACCG	2	8	52162	52169	25 %	0 %	25 %	50 %	55376470
1070	NC_006394	ATG	2	6	52193	52198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376470
1071	NC_006394	AGG	2	6	52226	52231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376470
1072	NC_006394	ATCGA	2	10	52244	52253	40 %	20 %	20 %	20 %	55376470
1073	NC_006394	TCGG	2	8	52254	52261	0 %	25 %	50 %	25 %	55376470
1074	NC_006394	ATC	2	6	52357	52362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376470
1075	NC_006394	AGT	2	6	52373	52378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376470
1076	NC_006394	C	6	6	52689	52694	0 %	0 %	0 %	100 %	55376471
1077	NC_006394	TGA	2	6	52737	52742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376471
1078	NC_006394	CCT	2	6	52743	52748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376471
1079	NC_006394	ATG	2	6	52760	52765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376471
1080	NC_006394	GAT	2	6	52777	52782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376471
1081	NC_006394	TCT	2	6	52785	52790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376471
1082	NC_006394	TTC	2	6	52802	52807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376471
1083	NC_006394	ATA	2	6	52843	52848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376471
1084	NC_006394	GTTG	2	8	53080	53087	0 %	50 %	50 %	0 %	55376472
1085	NC_006394	CCG	2	6	53136	53141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376472
1086	NC_006394	TCA	2	6	53158	53163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376472
1087	NC_006394	GT	3	6	53229	53234	0 %	50 %	50 %	0 %	55376472
1088	NC_006394	CCG	2	6	53295	53300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376472
1089	NC_006394	GGT	2	6	53323	53328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376472
1090	NC_006394	TCG	2	6	53394	53399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1091	NC_006394	GAT	2	6	53402	53407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376472
1092	NC_006394	CTT	2	6	53416	53421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376472
1093	NC_006394	CCG	2	6	53572	53577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376472
1094	NC_006394	GT	4	8	53697	53704	0 %	50 %	50 %	0 %	55376472
1095	NC_006394	GTC	3	9	53730	53738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1096	NC_006394	CGT	2	6	53746	53751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1097	NC_006394	GTC	2	6	53882	53887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1098	NC_006394	CCCA	2	8	53924	53931	25 %	0 %	0 %	75 %	55376472
1099	NC_006394	CCA	2	6	53985	53990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376472
1100	NC_006394	TCG	2	6	53997	54002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1101	NC_006394	GAC	2	6	54008	54013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1102	NC_006394	TGC	2	6	54080	54085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376472
1103	NC_006394	CCGC	2	8	54099	54106	0 %	0 %	25 %	75 %	55376472
1104	NC_006394	GCT	2	6	54477	54482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376473
1105	NC_006394	GAT	2	6	54584	54589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376473
1106	NC_006394	AAC	2	6	54642	54647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376473
1107	NC_006394	AGA	2	6	54690	54695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376473
1108	NC_006394	CGA	2	6	54727	54732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376473
1109	NC_006394	CAA	2	6	54817	54822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376473
1110	NC_006394	GAAC	2	8	54849	54856	50 %	0 %	25 %	25 %	55376473
1111	NC_006394	GGA	2	6	54928	54933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376473
1112	NC_006394	AAC	2	6	54987	54992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376473
1113	NC_006394	CGA	2	6	55091	55096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376473
1114	NC_006394	CGA	2	6	55218	55223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376474
1115	NC_006394	TGAG	2	8	55269	55276	25 %	25 %	50 %	0 %	55376474
1116	NC_006394	CGT	2	6	55354	55359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376474
1117	NC_006394	CAC	2	6	55399	55404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376474
1118	NC_006394	TTGTG	2	10	55431	55440	0 %	60 %	40 %	0 %	55376474
1119	NC_006394	GGC	2	6	55450	55455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376474
1120	NC_006394	ACG	2	6	55466	55471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376474
1121	NC_006394	CAG	2	6	55502	55507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376474
1122	NC_006394	CGC	2	6	55567	55572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376474
1123	NC_006394	CGTC	2	8	55601	55608	0 %	25 %	25 %	50 %	55376474
1124	NC_006394	GAG	2	6	55703	55708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376475
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1126	NC_006394	CGT	2	6	55765	55770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376475
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1253	NC_006394	CGAC	2	8	61952	61959	25 %	0 %	25 %	50 %	55376483
1254	NC_006394	CCA	2	6	61972	61977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376483
1255	NC_006394	GAC	2	6	62007	62012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376483
1256	NC_006394	CGA	2	6	62015	62020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376483
1257	NC_006394	TCA	2	6	62080	62085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376483
1258	NC_006394	GTT	2	6	62150	62155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376484
1259	NC_006394	CTCC	2	8	62249	62256	0 %	25 %	0 %	75 %	55376484
1260	NC_006394	TTC	2	6	62280	62285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376484
1261	NC_006394	GGA	2	6	62307	62312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376484
1262	NC_006394	AACCA	2	10	62344	62353	60 %	0 %	0 %	40 %	55376484
1263	NC_006394	CGA	2	6	62375	62380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376484
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1269	NC_006394	GACTGC	2	12	62704	62715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376485
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1284	NC_006394	CTC	2	6	63334	63339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376485
1285	NC_006394	ATC	2	6	63418	63423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376485
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1287	NC_006394	CGA	2	6	63462	63467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376485
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1363	NC_006394	CTGA	2	8	67586	67593	25 %	25 %	25 %	25 %	55376489
1364	NC_006394	TCA	2	6	67668	67673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376489
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1369	NC_006394	CT	3	6	67826	67831	0 %	50 %	0 %	50 %	55376489
1370	NC_006394	ACAT	2	8	67847	67854	50 %	25 %	0 %	25 %	55376489
1371	NC_006394	TC	4	8	67975	67982	0 %	50 %	0 %	50 %	55376489
1372	NC_006394	GGT	2	6	68025	68030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376489
1373	NC_006394	GTC	2	6	68118	68123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376489
1374	NC_006394	TCG	2	6	68124	68129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376489
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