MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG500

Total Repeats: 1999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006393	CTCG	2	8	204	211	0 %	25 %	25 %	50 %	55376281
2	NC_006393	CATCG	2	10	312	321	20 %	20 %	20 %	40 %	55376281
3	NC_006393	ACC	2	6	381	386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376281
4	NC_006393	AGC	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376281
5	NC_006393	TGA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376281
6	NC_006393	CTG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
7	NC_006393	CGAG	2	8	602	609	25 %	0 %	50 %	25 %	55376281
8	NC_006393	GCT	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
9	NC_006393	TGAG	2	8	647	654	25 %	25 %	50 %	0 %	55376281
10	NC_006393	GAAC	2	8	735	742	50 %	0 %	25 %	25 %	55376281
11	NC_006393	GAG	2	6	778	783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376281
12	NC_006393	CTT	2	6	794	799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376281
13	NC_006393	GC	3	6	893	898	0 %	0 %	50 %	50 %	55376281
14	NC_006393	CCT	2	6	923	928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376281
15	NC_006393	GCT	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376281
16	NC_006393	GGC	2	6	978	983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376281
17	NC_006393	CG	3	6	1013	1018	0 %	0 %	50 %	50 %	55376281
18	NC_006393	GCTT	2	8	1047	1054	0 %	50 %	25 %	25 %	55376281
19	NC_006393	AGCGA	2	10	1192	1201	40 %	0 %	40 %	20 %	55376281
20	NC_006393	CGA	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376281
21	NC_006393	TCGT	2	8	1253	1260	0 %	50 %	25 %	25 %	55376281
22	NC_006393	GCGCC	2	10	1269	1278	0 %	0 %	40 %	60 %	55376281
23	NC_006393	CT	3	6	1318	1323	0 %	50 %	0 %	50 %	55376282
24	NC_006393	CGA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
25	NC_006393	CGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
26	NC_006393	TCG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
27	NC_006393	GCG	2	6	1426	1431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376282
28	NC_006393	TCG	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
29	NC_006393	TCG	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
30	NC_006393	TGA	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376282
31	NC_006393	GC	3	6	1522	1527	0 %	0 %	50 %	50 %	55376282
32	NC_006393	GCT	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
33	NC_006393	TCG	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376282
34	NC_006393	GTCG	2	8	1581	1588	0 %	25 %	50 %	25 %	55376282
35	NC_006393	CAG	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
36	NC_006393	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
37	NC_006393	CAG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
38	NC_006393	CAG	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376282
39	NC_006393	CCG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376282
40	NC_006393	CAC	2	6	2000	2005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376283
41	NC_006393	GCG	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
42	NC_006393	ACG	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
43	NC_006393	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
44	NC_006393	CTG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
45	NC_006393	GTC	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
46	NC_006393	TCCG	2	8	2230	2237	0 %	25 %	25 %	50 %	55376283
47	NC_006393	CGA	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
48	NC_006393	AGT	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376283
49	NC_006393	GCCC	2	8	2402	2409	0 %	0 %	25 %	75 %	55376283
50	NC_006393	GGAC	2	8	2450	2457	25 %	0 %	50 %	25 %	55376283
51	NC_006393	CGT	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
52	NC_006393	CGG	2	6	2471	2476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
53	NC_006393	CGTC	2	8	2540	2547	0 %	25 %	25 %	50 %	55376283
54	NC_006393	CTT	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376283
55	NC_006393	ACG	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
56	NC_006393	GCG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376283
57	NC_006393	GC	3	6	2690	2695	0 %	0 %	50 %	50 %	55376283
58	NC_006393	GTC	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
59	NC_006393	ACCG	2	8	2799	2806	25 %	0 %	25 %	50 %	55376283
60	NC_006393	CGT	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
61	NC_006393	CCGGAA	2	12	2853	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
62	NC_006393	GA	3	6	2888	2893	50 %	0 %	50 %	0 %	55376283
63	NC_006393	GTC	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376283
64	NC_006393	ACG	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376283
65	NC_006393	TG	3	6	3769	3774	0 %	50 %	50 %	0 %	55376284
66	NC_006393	CGT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
67	NC_006393	GGCG	2	8	4817	4824	0 %	0 %	75 %	25 %	55376285
68	NC_006393	CTG	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
69	NC_006393	GCA	3	9	4842	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
70	NC_006393	CGC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376285
71	NC_006393	TTC	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376285
72	NC_006393	CCG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376285
73	NC_006393	TCA	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376285
74	NC_006393	TAC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376285
75	NC_006393	GAC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
76	NC_006393	GTC	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
77	NC_006393	GAC	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376285
78	NC_006393	CTG	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376285
79	NC_006393	GCTC	2	8	5258	5265	0 %	25 %	25 %	50 %	55376285
80	NC_006393	GACCA	2	10	5660	5669	40 %	0 %	20 %	40 %	55376286
81	NC_006393	CG	3	6	5709	5714	0 %	0 %	50 %	50 %	55376286
82	NC_006393	CCG	2	6	5823	5828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376286
83	NC_006393	GAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376286
84	NC_006393	GAA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376286
85	NC_006393	TCG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376286
86	NC_006393	GGC	2	6	5935	5940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376286
87	NC_006393	GAC	2	6	5945	5950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376286
88	NC_006393	TTC	2	6	6041	6046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376286
89	NC_006393	ACC	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376286
90	NC_006393	CGAT	2	8	6072	6079	25 %	25 %	25 %	25 %	55376286
91	NC_006393	ATT	2	6	6117	6122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376286
92	NC_006393	GAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376287
93	NC_006393	CGAC	2	8	7259	7266	25 %	0 %	25 %	50 %	55376287
94	NC_006393	CAA	2	6	7299	7304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376287
95	NC_006393	GAA	2	6	7319	7324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376287
96	NC_006393	GTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376287
97	NC_006393	AAC	2	6	7349	7354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376287
98	NC_006393	TC	3	6	7389	7394	0 %	50 %	0 %	50 %	55376287
99	NC_006393	CTC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376287
100	NC_006393	ATT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376287
101	NC_006393	TTG	2	6	7728	7733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376287
102	NC_006393	GGC	2	6	7780	7785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376287
103	NC_006393	CT	3	6	7814	7819	0 %	50 %	0 %	50 %	55376287
104	NC_006393	GCA	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376287
105	NC_006393	GTG	2	6	7827	7832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376287
106	NC_006393	ACC	2	6	7913	7918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376287
107	NC_006393	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55376287
108	NC_006393	TGGC	2	8	8008	8015	0 %	25 %	50 %	25 %	55376287
109	NC_006393	GGT	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376287
110	NC_006393	T	7	7	8118	8124	0 %	100 %	0 %	0 %	55376288
111	NC_006393	CGA	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
112	NC_006393	ACA	2	6	8232	8237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
113	NC_006393	GAC	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
114	NC_006393	GCA	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
115	NC_006393	CCA	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376288
116	NC_006393	CAGC	2	8	8562	8569	25 %	0 %	25 %	50 %	55376288
117	NC_006393	CAA	2	6	8577	8582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
118	NC_006393	AAACCG	2	12	8607	8618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	55376288
119	NC_006393	AGC	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376288
120	NC_006393	CACT	2	8	8649	8656	25 %	25 %	0 %	50 %	55376288
121	NC_006393	CAA	2	6	8666	8671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
122	NC_006393	TTG	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376288
123	NC_006393	CGG	2	6	8695	8700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376288
124	NC_006393	TCA	2	6	8744	8749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
125	NC_006393	TAG	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
126	NC_006393	ATC	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
127	NC_006393	GGCA	2	8	8902	8909	25 %	0 %	50 %	25 %	55376288
128	NC_006393	TCCC	2	8	8937	8944	0 %	25 %	0 %	75 %	55376288
129	NC_006393	GATT	2	8	8962	8969	25 %	50 %	25 %	0 %	55376288
130	NC_006393	TCG	2	6	9060	9065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
131	NC_006393	ACT	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
132	NC_006393	TGC	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
133	NC_006393	TCG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376288
134	NC_006393	GCAA	2	8	9206	9213	50 %	0 %	25 %	25 %	55376288
135	NC_006393	GGA	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376288
136	NC_006393	ACT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376288
137	NC_006393	TGGC	2	8	9309	9316	0 %	25 %	50 %	25 %	55376288
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143	NC_006393	GAT	2	6	9587	9592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376288
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151	NC_006393	GGCC	2	8	10079	10086	0 %	0 %	50 %	50 %	55376288
152	NC_006393	CTT	2	6	10088	10093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376288
153	NC_006393	CCT	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376288
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160	NC_006393	AAC	2	6	10520	10525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376288
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164	NC_006393	GCGT	2	8	10750	10757	0 %	25 %	50 %	25 %	55376289
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254	NC_006393	ACC	2	6	16531	16536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376294
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259	NC_006393	CAGC	2	8	16758	16765	25 %	0 %	25 %	50 %	55376294
260	NC_006393	CAA	2	6	16771	16776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376294
261	NC_006393	GGC	2	6	16802	16807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376294
262	NC_006393	CGA	2	6	16859	16864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376294
263	NC_006393	TCC	2	6	16884	16889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376294
264	NC_006393	TGG	2	6	16897	16902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376294
265	NC_006393	CAA	2	6	16927	16932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376294
266	NC_006393	CG	4	8	16966	16973	0 %	0 %	50 %	50 %	55376294
267	NC_006393	GAG	2	6	17075	17080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376294
268	NC_006393	ATC	2	6	17081	17086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376294
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272	NC_006393	CGT	2	6	17297	17302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376294
273	NC_006393	GTT	2	6	17345	17350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376294
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293	NC_006393	CG	3	6	18386	18391	0 %	0 %	50 %	50 %	55376295
294	NC_006393	GA	3	6	18426	18431	50 %	0 %	50 %	0 %	55376295
295	NC_006393	CTC	2	6	18495	18500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376295
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299	NC_006393	TCGA	2	8	18748	18755	25 %	25 %	25 %	25 %	55376295
300	NC_006393	GA	3	6	18848	18853	50 %	0 %	50 %	0 %	55376295
301	NC_006393	CAG	2	6	18870	18875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376295
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374	NC_006393	TCGAT	2	10	22722	22731	20 %	40 %	20 %	20 %	55376300
375	NC_006393	GAGC	2	8	22732	22739	25 %	0 %	50 %	25 %	55376300
376	NC_006393	CATC	2	8	22757	22764	25 %	25 %	0 %	50 %	55376300
377	NC_006393	GA	3	6	22769	22774	50 %	0 %	50 %	0 %	55376300
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380	NC_006393	TGC	2	6	22859	22864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376300
381	NC_006393	CCG	2	6	22876	22881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376300
382	NC_006393	GCG	2	6	22930	22935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376300
383	NC_006393	AGC	2	6	22947	22952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376300
384	NC_006393	TATT	2	8	22954	22961	25 %	75 %	0 %	0 %	55376300
385	NC_006393	CTG	2	6	22965	22970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376300
386	NC_006393	GAA	2	6	22986	22991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376300
387	NC_006393	CCACG	2	10	23007	23016	20 %	0 %	20 %	60 %	55376300
388	NC_006393	TCC	2	6	23062	23067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376301
389	NC_006393	GGTG	2	8	23074	23081	0 %	25 %	75 %	0 %	55376301
390	NC_006393	CTG	2	6	23178	23183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376301
391	NC_006393	GAG	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376301
392	NC_006393	GTG	2	6	23312	23317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376301
393	NC_006393	CGAC	2	8	23320	23327	25 %	0 %	25 %	50 %	55376301
394	NC_006393	TCT	2	6	23414	23419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376301
395	NC_006393	CGA	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376301
396	NC_006393	CGA	2	6	23504	23509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376301
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401	NC_006393	TCAG	2	8	25512	25519	25 %	25 %	25 %	25 %	55376302
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421	NC_006393	GTT	2	6	26111	26116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376302
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475	NC_006393	CTGG	2	8	29456	29463	0 %	25 %	50 %	25 %	55376306
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499	NC_006393	CTT	2	6	31334	31339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376310
500	NC_006393	CGG	2	6	31345	31350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376310

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