MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 plasmid pNG300

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006391	TGA	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376188
2	NC_006391	AAC	2	6	183	188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
3	NC_006391	GTC	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
4	NC_006391	CGC	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
5	NC_006391	CGA	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
6	NC_006391	CAGC	2	8	354	361	25 %	0 %	25 %	50 %	55376188
7	NC_006391	CGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
8	NC_006391	CCGCG	2	10	384	393	0 %	0 %	40 %	60 %	55376188
9	NC_006391	CGG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
10	NC_006391	CGA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
11	NC_006391	CGCA	2	8	545	552	25 %	0 %	25 %	50 %	55376188
12	NC_006391	CGT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
13	NC_006391	AAG	2	6	654	659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376188
14	NC_006391	CGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
15	NC_006391	CGG	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
16	NC_006391	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
17	NC_006391	ACG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
18	NC_006391	CGAC	2	8	876	883	25 %	0 %	25 %	50 %	55376188
19	NC_006391	ACG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
20	NC_006391	CAA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
21	NC_006391	AG	3	6	1093	1098	50 %	0 %	50 %	0 %	55376188
22	NC_006391	CA	3	6	1104	1109	50 %	0 %	0 %	50 %	55376188
23	NC_006391	GTCT	2	8	1113	1120	0 %	50 %	25 %	25 %	55376188
24	NC_006391	CGA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
25	NC_006391	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
26	NC_006391	GTC	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
27	NC_006391	ACGG	2	8	1280	1287	25 %	0 %	50 %	25 %	55376188
28	NC_006391	CAA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
29	NC_006391	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
30	NC_006391	TCA	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
31	NC_006391	CA	3	6	1570	1575	50 %	0 %	0 %	50 %	55376188
32	NC_006391	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
33	NC_006391	ACG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
34	NC_006391	GCA	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
35	NC_006391	CAAAC	2	10	1784	1793	60 %	0 %	0 %	40 %	55376188
36	NC_006391	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
37	NC_006391	AT	3	6	1827	1832	50 %	50 %	0 %	0 %	55376188
38	NC_006391	TTGA	2	8	1958	1965	25 %	50 %	25 %	0 %	55376188
39	NC_006391	CA	3	6	2010	2015	50 %	0 %	0 %	50 %	55376188
40	NC_006391	CAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
41	NC_006391	GCG	2	6	2136	2141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
42	NC_006391	GAC	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
43	NC_006391	ACG	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
44	NC_006391	TCG	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
45	NC_006391	TCA	3	9	2466	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
46	NC_006391	GAC	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
47	NC_006391	AGC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
48	NC_006391	AAC	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
49	NC_006391	CGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
50	NC_006391	GGCGAC	2	12	2585	2596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55376188
51	NC_006391	ACC	2	6	2637	2642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376188
52	NC_006391	GAC	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
53	NC_006391	AGCG	2	8	2690	2697	25 %	0 %	50 %	25 %	55376188
54	NC_006391	TC	3	6	2706	2711	0 %	50 %	0 %	50 %	55376188
55	NC_006391	CAT	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
56	NC_006391	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
57	NC_006391	CGG	2	6	2887	2892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
58	NC_006391	CGGT	2	8	2924	2931	0 %	25 %	50 %	25 %	55376188
59	NC_006391	CGGTCA	2	12	2961	2972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55376188
60	NC_006391	GACC	2	8	2992	2999	25 %	0 %	25 %	50 %	55376188
61	NC_006391	CGG	2	6	3105	3110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
62	NC_006391	CGAA	2	8	3257	3264	50 %	0 %	25 %	25 %	55376188
63	NC_006391	CCA	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376188
64	NC_006391	CCAG	2	8	3378	3385	25 %	0 %	25 %	50 %	55376188
65	NC_006391	ACA	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
66	NC_006391	GGT	2	6	3445	3450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
67	NC_006391	CGG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
68	NC_006391	CGA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
69	NC_006391	TCG	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
70	NC_006391	GCC	2	6	3582	3587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
71	NC_006391	CG	3	6	3600	3605	0 %	0 %	50 %	50 %	55376188
72	NC_006391	TCGC	2	8	3617	3624	0 %	25 %	25 %	50 %	55376188
73	NC_006391	GCC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376188
74	NC_006391	CGG	2	6	3664	3669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
75	NC_006391	TCG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
76	NC_006391	GTC	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
77	NC_006391	CGGCG	2	10	3760	3769	0 %	0 %	60 %	40 %	55376188
78	NC_006391	TGG	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376188
79	NC_006391	ACG	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
80	NC_006391	CTG	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376188
81	NC_006391	CG	3	6	4049	4054	0 %	0 %	50 %	50 %	55376188
82	NC_006391	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376188
83	NC_006391	GAC	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
84	NC_006391	ATC	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376188
85	NC_006391	GGC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376188
86	NC_006391	GGAG	2	8	4118	4125	25 %	0 %	75 %	0 %	55376188
87	NC_006391	GAC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376188
88	NC_006391	CGT	2	6	4499	4504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376189
89	NC_006391	CGG	2	6	4508	4513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376189
90	NC_006391	ATC	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376189
91	NC_006391	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376189
92	NC_006391	GC	3	6	4585	4590	0 %	0 %	50 %	50 %	55376189
93	NC_006391	GAT	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376189
94	NC_006391	GAC	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
95	NC_006391	GGC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376190
96	NC_006391	CCTG	2	8	4815	4822	0 %	25 %	25 %	50 %	55376190
97	NC_006391	TGG	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376190
98	NC_006391	ACG	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
99	NC_006391	AGG	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376190
100	NC_006391	CGA	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376190
101	NC_006391	GGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376190
102	NC_006391	CAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
103	NC_006391	CTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
104	NC_006391	AGC	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
105	NC_006391	CAC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376191
106	NC_006391	GTC	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
107	NC_006391	AC	3	6	5507	5512	50 %	0 %	0 %	50 %	55376191
108	NC_006391	CCT	2	6	5556	5561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376191
109	NC_006391	CGAG	2	8	5586	5593	25 %	0 %	50 %	25 %	55376191
110	NC_006391	GAT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376191
111	NC_006391	ATC	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376191
112	NC_006391	CAG	3	9	5735	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
113	NC_006391	CTG	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376191
114	NC_006391	GTA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376191
115	NC_006391	A	7	7	5781	5787	100 %	0 %	0 %	0 %	55376191
116	NC_006391	GAC	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376191
117	NC_006391	TCAA	2	8	5812	5819	50 %	25 %	0 %	25 %	55376192
118	NC_006391	AAAC	2	8	5915	5922	75 %	0 %	0 %	25 %	55376192
119	NC_006391	AT	3	6	5968	5973	50 %	50 %	0 %	0 %	55376193
120	NC_006391	CGA	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376193
121	NC_006391	TCG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376193
122	NC_006391	CTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376193
123	NC_006391	GC	3	6	6106	6111	0 %	0 %	50 %	50 %	55376193
124	NC_006391	TGC	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376194
125	NC_006391	GTC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376194
126	NC_006391	TGT	2	6	7440	7445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376194
127	NC_006391	TCACTG	2	12	7877	7888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55376195
128	NC_006391	CTG	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376195
129	NC_006391	TTG	2	6	8024	8029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376195
130	NC_006391	G	6	6	8053	8058	0 %	0 %	100 %	0 %	55376195
131	NC_006391	ACA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
132	NC_006391	TCA	2	6	8107	8112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376195
133	NC_006391	GAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376195
134	NC_006391	GCTG	2	8	8147	8154	0 %	25 %	50 %	25 %	55376195
135	NC_006391	AAC	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376195
136	NC_006391	CGGA	2	8	8203	8210	25 %	0 %	50 %	25 %	55376195
137	NC_006391	CGA	2	6	8475	8480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376195
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140	NC_006391	AAT	2	6	8622	8627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376195
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142	NC_006391	GTAC	2	8	8730	8737	25 %	25 %	25 %	25 %	55376195
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144	NC_006391	ACT	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376195
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159	NC_006391	CGA	2	6	9618	9623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376196
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232	NC_006391	CGA	2	6	14258	14263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376203
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241	NC_006391	ACG	2	6	14583	14588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376203
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244	NC_006391	ACG	2	6	14839	14844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376204
245	NC_006391	TG	3	6	14903	14908	0 %	50 %	50 %	0 %	55376204
246	NC_006391	ACGG	2	8	14917	14924	25 %	0 %	50 %	25 %	55376205
247	NC_006391	GAG	2	6	15025	15030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376205
248	NC_006391	ACG	2	6	15062	15067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376205
249	NC_006391	CGA	2	6	15102	15107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376205
250	NC_006391	GCG	2	6	15122	15127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376205
251	NC_006391	ACG	2	6	15128	15133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376205
252	NC_006391	GAC	2	6	15168	15173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376205
253	NC_006391	CTGA	2	8	15178	15185	25 %	25 %	25 %	25 %	55376205
254	NC_006391	TGA	2	6	15198	15203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376205
255	NC_006391	TCA	2	6	15239	15244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376205
256	NC_006391	CG	3	6	15280	15285	0 %	0 %	50 %	50 %	55376205
257	NC_006391	A	6	6	15381	15386	100 %	0 %	0 %	0 %	55376205
258	NC_006391	GA	3	6	15392	15397	50 %	0 %	50 %	0 %	55376205
259	NC_006391	CGA	2	6	15521	15526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376206
260	NC_006391	CGA	2	6	15549	15554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376206
261	NC_006391	CATC	2	8	15578	15585	25 %	25 %	0 %	50 %	55376206
262	NC_006391	TG	3	6	15758	15763	0 %	50 %	50 %	0 %	55376207
263	NC_006391	CG	3	6	15821	15826	0 %	0 %	50 %	50 %	55376207
264	NC_006391	TCG	2	6	15937	15942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376208
265	NC_006391	TCG	2	6	16077	16082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376208
266	NC_006391	CGA	2	6	16135	16140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376208
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385	NC_006391	GT	4	8	25420	25427	0 %	50 %	50 %	0 %	55376212
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387	NC_006391	CGCT	2	8	25562	25569	0 %	25 %	25 %	50 %	55376212
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391	NC_006391	CGA	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
392	NC_006391	TCG	2	6	25805	25810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376212
393	NC_006391	TGT	2	6	25896	25901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376212
394	NC_006391	CGA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
395	NC_006391	GAC	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376212
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423	NC_006391	GCCG	2	8	27906	27913	0 %	0 %	50 %	50 %	55376213
424	NC_006391	GACC	2	8	27947	27954	25 %	0 %	25 %	50 %	55376213
425	NC_006391	CGC	2	6	27965	27970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376213
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434	NC_006391	ACA	2	6	28197	28202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55376214
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465	NC_006391	ACG	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376217
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468	NC_006391	GGC	2	6	29736	29741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376217
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472	NC_006391	CGCCA	2	10	29998	30007	20 %	0 %	20 %	60 %	55376218
473	NC_006391	CGACCT	2	12	30012	30023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55376218
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476	NC_006391	CGG	2	6	30174	30179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
477	NC_006391	GCG	2	6	30183	30188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
478	NC_006391	TCG	2	6	30218	30223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
479	NC_006391	ACG	2	6	30228	30233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376218
480	NC_006391	GTC	2	6	30245	30250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
481	NC_006391	CTG	2	6	30282	30287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
482	NC_006391	CAG	2	6	30314	30319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376218
483	NC_006391	CGGG	2	8	30324	30331	0 %	0 %	75 %	25 %	55376218
484	NC_006391	CGG	4	12	30340	30351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376218
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487	NC_006391	CTG	2	6	30413	30418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376218
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489	NC_006391	CCT	2	6	30718	30723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376219
490	NC_006391	GCTG	2	8	30778	30785	0 %	25 %	50 %	25 %	55376219
491	NC_006391	TGA	2	6	30819	30824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376219
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493	NC_006391	GCCT	2	8	30885	30892	0 %	25 %	25 %	50 %	55376219
494	NC_006391	AGG	2	6	30927	30932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376219
495	NC_006391	TGA	2	6	31308	31313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376220
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497	NC_006391	CGG	2	6	31424	31429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376220
498	NC_006391	CGA	2	6	31464	31469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376220
499	NC_006391	CGT	2	6	31508	31513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376220
500	NC_006391	TCG	2	6	31514	31519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376220

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