MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 30157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002940	GCG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33151283
2	NC_002940	ATT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
3	NC_002940	ACTC	2	8	397	404	25 %	25 %	0 %	50 %	33151283
4	NC_002940	TGG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
5	NC_002940	GGT	2	6	494	499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
6	NC_002940	AAG	2	6	663	668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151283
7	NC_002940	ATC	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151283
8	NC_002940	GTG	2	6	702	707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151283
9	NC_002940	GCG	2	6	830	835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33151283
10	NC_002940	ACC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151283
11	NC_002940	AAC	2	6	945	950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151283
12	NC_002940	ATC	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151283
13	NC_002940	AC	3	6	1046	1051	50 %	0 %	0 %	50 %	33151283
14	NC_002940	ATT	2	6	1055	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
15	NC_002940	ATT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
16	NC_002940	ATT	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
17	NC_002940	AACC	2	8	1356	1363	50 %	0 %	0 %	50 %	33151283
18	NC_002940	GAA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151283
19	NC_002940	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151283
20	NC_002940	TACAAG	2	12	1473	1484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33151283
21	NC_002940	GAC	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151283
22	NC_002940	TGAT	2	8	1665	1672	25 %	50 %	25 %	0 %	33151283
23	NC_002940	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	33151283
24	NC_002940	GCT	2	6	1874	1879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151283
25	NC_002940	TAA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151283
26	NC_002940	GCAA	2	8	2092	2099	50 %	0 %	25 %	25 %	33151283
27	NC_002940	GCGAG	2	10	2173	2182	20 %	0 %	60 %	20 %	33151283
28	NC_002940	GCAG	2	8	2322	2329	25 %	0 %	50 %	25 %	33151284
29	NC_002940	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151284
30	NC_002940	AGA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151284
31	NC_002940	GTC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151284
32	NC_002940	CAAG	2	8	2607	2614	50 %	0 %	25 %	25 %	33151284
33	NC_002940	GAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151284
34	NC_002940	GT	3	6	2786	2791	0 %	50 %	50 %	0 %	33151284
35	NC_002940	ATT	2	6	3251	3256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151285
36	NC_002940	T	6	6	3296	3301	0 %	100 %	0 %	0 %	33151285
37	NC_002940	AGG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33151285
38	NC_002940	T	6	6	3363	3368	0 %	100 %	0 %	0 %	33151285
39	NC_002940	TTGT	2	8	3379	3386	0 %	75 %	25 %	0 %	33151285
40	NC_002940	A	6	6	3403	3408	100 %	0 %	0 %	0 %	33151285
41	NC_002940	A	6	6	3414	3419	100 %	0 %	0 %	0 %	33151285
42	NC_002940	GTG	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151285
43	NC_002940	TTA	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151285
44	NC_002940	AGC	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151285
45	NC_002940	T	6	6	3529	3534	0 %	100 %	0 %	0 %	33151285
46	NC_002940	GTT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151285
47	NC_002940	CAA	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151285
48	NC_002940	AACT	2	8	3594	3601	50 %	25 %	0 %	25 %	33151285
49	NC_002940	AT	3	6	3649	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	33151286
50	NC_002940	CAC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33151286
51	NC_002940	CTTTT	2	10	3716	3725	0 %	80 %	0 %	20 %	33151286
52	NC_002940	TTG	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151286
53	NC_002940	T	7	7	3744	3750	0 %	100 %	0 %	0 %	33151286
54	NC_002940	CG	3	6	3762	3767	0 %	0 %	50 %	50 %	33151286
55	NC_002940	TGG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151286
56	NC_002940	T	6	6	3903	3908	0 %	100 %	0 %	0 %	33151286
57	NC_002940	TAT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151286
58	NC_002940	ATG	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151286
59	NC_002940	TAA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151286
60	NC_002940	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151287
61	NC_002940	TAT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151287
62	NC_002940	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151287
63	NC_002940	GGT	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151287
64	NC_002940	ATC	3	9	4645	4653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151287
65	NC_002940	TAG	2	6	4672	4677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151287
66	NC_002940	CATT	2	8	4770	4777	25 %	50 %	0 %	25 %	33151287
67	NC_002940	TTG	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151288
68	NC_002940	TTA	2	6	4931	4936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151288
69	NC_002940	ATC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151288
70	NC_002940	AGA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151288
71	NC_002940	A	6	6	5063	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	33151288
72	NC_002940	CAA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151288
73	NC_002940	CGT	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151288
74	NC_002940	ATAG	2	8	5170	5177	50 %	25 %	25 %	0 %	33151288
75	NC_002940	AAG	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151288
76	NC_002940	GCA	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151288
77	NC_002940	TAGCTG	2	12	5225	5236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33151288
78	NC_002940	AGAA	2	8	5241	5248	75 %	0 %	25 %	0 %	33151288
79	NC_002940	TTG	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151288
80	NC_002940	GCA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151288
81	NC_002940	AAT	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33151288
82	NC_002940	AGC	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151289
83	NC_002940	AGT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
84	NC_002940	AT	3	6	5467	5472	50 %	50 %	0 %	0 %	33151289
85	NC_002940	TTC	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33151289
86	NC_002940	TGA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
87	NC_002940	AAG	2	6	5691	5696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151289
88	NC_002940	A	6	6	5697	5702	100 %	0 %	0 %	0 %	33151289
89	NC_002940	AAC	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151289
90	NC_002940	TTAC	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	33151289
91	NC_002940	TAT	3	9	5779	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151289
92	NC_002940	ATG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151289
93	NC_002940	A	6	6	5871	5876	100 %	0 %	0 %	0 %	33151290
94	NC_002940	A	6	6	5912	5917	100 %	0 %	0 %	0 %	33151290
95	NC_002940	TAT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
96	NC_002940	ACTTA	2	10	6064	6073	40 %	40 %	0 %	20 %	33151290
97	NC_002940	TTA	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
98	NC_002940	ATG	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
99	NC_002940	CAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151290
100	NC_002940	AGA	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151290
101	NC_002940	GTG	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151290
102	NC_002940	ATG	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
103	NC_002940	TATTT	2	10	6744	6753	20 %	80 %	0 %	0 %	33151290
104	NC_002940	ATT	2	6	6860	6865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151290
105	NC_002940	CAA	2	6	6900	6905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151290
106	NC_002940	GCA	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151290
107	NC_002940	CAAA	2	8	7019	7026	75 %	0 %	0 %	25 %	33151290
108	NC_002940	A	6	6	7034	7039	100 %	0 %	0 %	0 %	33151290
109	NC_002940	GGT	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151290
110	NC_002940	TGA	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151290
111	NC_002940	AAAACA	2	12	7168	7179	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	33151290
112	NC_002940	ATTCA	2	10	7356	7365	40 %	40 %	0 %	20 %	33151290
113	NC_002940	A	6	6	7493	7498	100 %	0 %	0 %	0 %	33151291
114	NC_002940	TGG	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151291
115	NC_002940	GCA	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33151291
116	NC_002940	GTC	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151291
117	NC_002940	A	6	6	7660	7665	100 %	0 %	0 %	0 %	33151291
118	NC_002940	ACCG	2	8	7687	7694	25 %	0 %	25 %	50 %	33151291
119	NC_002940	TGAA	2	8	7739	7746	50 %	25 %	25 %	0 %	33151291
120	NC_002940	TAG	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
121	NC_002940	TTG	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151291
122	NC_002940	AATGA	2	10	7900	7909	60 %	20 %	20 %	0 %	33151291
123	NC_002940	A	6	6	7982	7987	100 %	0 %	0 %	0 %	33151291
124	NC_002940	TAC	2	6	8003	8008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151291
125	NC_002940	ATG	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
126	NC_002940	TAT	2	6	8084	8089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151291
127	NC_002940	TGA	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151291
128	NC_002940	CAAG	2	8	8251	8258	50 %	0 %	25 %	25 %	33151291
129	NC_002940	TTG	2	6	8282	8287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33151291
130	NC_002940	TGC	3	9	8292	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33151291
131	NC_002940	ATG	2	6	8402	8407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
132	NC_002940	CAA	3	9	8443	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33151292
133	NC_002940	GGT	3	9	8455	8463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33151292
134	NC_002940	TAT	2	6	8574	8579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33151292
135	NC_002940	TGA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33151292
136	NC_002940	GAA	2	6	8623	8628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33151292
137	NC_002940	GC	3	6	8629	8634	0 %	0 %	50 %	50 %	33151292
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401	NC_002940	GC	3	6	29820	29825	0 %	0 %	50 %	50 %	33151304
402	NC_002940	TCA	2	6	29849	29854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33151304
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