MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 30157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_002940	CGAT	2	8	879235	879242	25 %	25 %	25 %	25 %	33152227
15502	NC_002940	TTA	2	6	879260	879265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152227
15503	NC_002940	A	6	6	879270	879275	100 %	0 %	0 %	0 %	33152227
15504	NC_002940	AGT	2	6	879305	879310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152227
15505	NC_002940	T	6	6	879315	879320	0 %	100 %	0 %	0 %	33152227
15506	NC_002940	TGG	2	6	879485	879490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33152227
15507	NC_002940	GAT	2	6	879501	879506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152227
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15510	NC_002940	TTGG	2	8	879690	879697	0 %	50 %	50 %	0 %	33152228
15511	NC_002940	CAA	2	6	879725	879730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33152228
15512	NC_002940	AGA	2	6	879736	879741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152228
15513	NC_002940	GGA	2	6	879931	879936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33152228
15514	NC_002940	CGTTAT	2	12	879968	879979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33152228
15515	NC_002940	ATT	2	6	879980	879985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152228
15516	NC_002940	TCATTA	2	12	880030	880041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33152228
15517	NC_002940	TTA	2	6	880082	880087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152228
15518	NC_002940	TCA	2	6	880153	880158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152228
15519	NC_002940	GTA	2	6	880166	880171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152228
15520	NC_002940	CAT	2	6	880220	880225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152228
15521	NC_002940	TTG	2	6	880239	880244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152228
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15524	NC_002940	ATT	2	6	880414	880419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152228
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15528	NC_002940	TAA	2	6	880703	880708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152229
15529	NC_002940	TTTG	2	8	880781	880788	0 %	75 %	25 %	0 %	33152229
15530	NC_002940	CATTG	2	10	880806	880815	20 %	40 %	20 %	20 %	33152229
15531	NC_002940	A	7	7	880967	880973	100 %	0 %	0 %	0 %	33152230
15532	NC_002940	ATA	2	6	880983	880988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152230
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15534	NC_002940	T	6	6	881121	881126	0 %	100 %	0 %	0 %	33152230
15535	NC_002940	GGA	2	6	881148	881153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33152230
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15539	NC_002940	TATTT	2	10	881356	881365	20 %	80 %	0 %	0 %	33152230
15540	NC_002940	T	6	6	881377	881382	0 %	100 %	0 %	0 %	33152230
15541	NC_002940	TTG	2	6	881406	881411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152230
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15545	NC_002940	T	6	6	881618	881623	0 %	100 %	0 %	0 %	33152230
15546	NC_002940	CTG	2	6	881646	881651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152230
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15549	NC_002940	AGT	2	6	881809	881814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152230
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15552	NC_002940	GAT	2	6	882024	882029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152231
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15554	NC_002940	TTG	2	6	882059	882064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152231
15555	NC_002940	TTA	2	6	882067	882072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152231
15556	NC_002940	A	6	6	882111	882116	100 %	0 %	0 %	0 %	33152231
15557	NC_002940	GAC	2	6	882168	882173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152231
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15559	NC_002940	GAA	2	6	882245	882250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152231
15560	NC_002940	ATT	2	6	882256	882261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152231
15561	NC_002940	ATT	2	6	882309	882314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152231
15562	NC_002940	TAT	2	6	882355	882360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152231
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15565	NC_002940	TTAA	2	8	882553	882560	50 %	50 %	0 %	0 %	33152231
15566	NC_002940	T	7	7	882584	882590	0 %	100 %	0 %	0 %	33152231
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15607	NC_002940	TGA	2	6	884797	884802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152233
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15615	NC_002940	TTTA	2	8	885272	885279	25 %	75 %	0 %	0 %	33152233
15616	NC_002940	T	6	6	885293	885298	0 %	100 %	0 %	0 %	33152233
15617	NC_002940	TTTAT	2	10	885370	885379	20 %	80 %	0 %	0 %	33152233
15618	NC_002940	ATCG	2	8	885386	885393	25 %	25 %	25 %	25 %	33152233
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15991	NC_002940	GTT	2	6	904920	904925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152256
15992	NC_002940	TTG	3	9	904945	904953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152256
15993	NC_002940	CCAA	2	8	905019	905026	50 %	0 %	0 %	50 %	33152257
15994	NC_002940	T	6	6	905078	905083	0 %	100 %	0 %	0 %	33152257
15995	NC_002940	GGGT	2	8	905095	905102	0 %	25 %	75 %	0 %	33152257
15996	NC_002940	T	6	6	905147	905152	0 %	100 %	0 %	0 %	33152257
15997	NC_002940	AAAT	2	8	905211	905218	75 %	25 %	0 %	0 %	33152257
15998	NC_002940	AACTA	2	10	905271	905280	60 %	20 %	0 %	20 %	33152257
15999	NC_002940	TTG	2	6	905355	905360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152257
16000	NC_002940	GCT	2	6	905362	905367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152257

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