MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 30157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_002940	TACCAT	2	12	851659	851670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152198
15003	NC_002940	GAT	2	6	851727	851732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152198
15004	NC_002940	T	6	6	851889	851894	0 %	100 %	0 %	0 %	33152198
15005	NC_002940	CTA	2	6	851943	851948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152198
15006	NC_002940	TAA	2	6	851953	851958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152198
15007	NC_002940	CGG	3	9	852017	852025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33152198
15008	NC_002940	AAC	2	6	852120	852125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33152198
15009	NC_002940	TTC	2	6	852187	852192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33152198
15010	NC_002940	A	6	6	852500	852505	100 %	0 %	0 %	0 %	33152199
15011	NC_002940	GCA	2	6	852521	852526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152199
15012	NC_002940	AGCAA	2	10	852581	852590	60 %	0 %	20 %	20 %	33152199
15013	NC_002940	TGC	2	6	852595	852600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152199
15014	NC_002940	ACAAA	2	10	852665	852674	80 %	0 %	0 %	20 %	33152199
15015	NC_002940	TGG	2	6	852751	852756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33152199
15016	NC_002940	ATG	2	6	852759	852764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152199
15017	NC_002940	AAG	2	6	852804	852809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152199
15018	NC_002940	TTA	2	6	852846	852851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152199
15019	NC_002940	TAAA	2	8	852873	852880	75 %	25 %	0 %	0 %	33152199
15020	NC_002940	AATA	2	8	852896	852903	75 %	25 %	0 %	0 %	33152199
15021	NC_002940	ATT	2	6	852916	852921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152199
15022	NC_002940	GAT	2	6	853028	853033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152199
15023	NC_002940	GTT	2	6	853057	853062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152199
15024	NC_002940	AAG	2	6	853107	853112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152199
15025	NC_002940	GAA	2	6	853118	853123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152199
15026	NC_002940	A	6	6	853127	853132	100 %	0 %	0 %	0 %	33152199
15027	NC_002940	ATTCA	2	10	853153	853162	40 %	40 %	0 %	20 %	33152199
15028	NC_002940	TCGG	2	8	853199	853206	0 %	25 %	50 %	25 %	33152199
15029	NC_002940	AAGA	2	8	853238	853245	75 %	0 %	25 %	0 %	33152199
15030	NC_002940	AAG	2	6	853275	853280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152199
15031	NC_002940	A	6	6	853324	853329	100 %	0 %	0 %	0 %	33152199
15032	NC_002940	ATTA	2	8	853348	853355	50 %	50 %	0 %	0 %	33152199
15033	NC_002940	TATT	2	8	853358	853365	25 %	75 %	0 %	0 %	33152199
15034	NC_002940	GAT	2	6	853511	853516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152199
15035	NC_002940	TAT	2	6	853547	853552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152199
15036	NC_002940	AAGT	2	8	853755	853762	50 %	25 %	25 %	0 %	33152200
15037	NC_002940	TGA	3	9	853851	853859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152200
15038	NC_002940	TATT	2	8	853887	853894	25 %	75 %	0 %	0 %	33152200
15039	NC_002940	T	7	7	853901	853907	0 %	100 %	0 %	0 %	33152200
15040	NC_002940	ATTG	2	8	854034	854041	25 %	50 %	25 %	0 %	33152200
15041	NC_002940	ATT	2	6	854114	854119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152200
15042	NC_002940	TTA	2	6	854152	854157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152200
15043	NC_002940	TATTTT	2	12	854256	854267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33152200
15044	NC_002940	TGA	2	6	854345	854350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152200
15045	NC_002940	ATT	2	6	854357	854362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152200
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15049	NC_002940	GAA	2	6	854656	854661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152200
15050	NC_002940	ATT	2	6	854668	854673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152200
15051	NC_002940	AAT	2	6	854740	854745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152200
15052	NC_002940	TTA	2	6	854800	854805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152200
15053	NC_002940	GATTG	2	10	854959	854968	20 %	40 %	40 %	0 %	33152200
15054	NC_002940	AGTTTA	2	12	855013	855024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33152200
15055	NC_002940	A	6	6	855062	855067	100 %	0 %	0 %	0 %	33152200
15056	NC_002940	CAG	2	6	855071	855076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152200
15057	NC_002940	AAT	2	6	855167	855172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152201
15058	NC_002940	TTG	2	6	855272	855277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152201
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15060	NC_002940	GAA	2	6	855344	855349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152201
15061	NC_002940	TCG	2	6	855364	855369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152201
15062	NC_002940	T	7	7	855392	855398	0 %	100 %	0 %	0 %	33152201
15063	NC_002940	A	6	6	855555	855560	100 %	0 %	0 %	0 %	33152201
15064	NC_002940	TAT	2	6	855561	855566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152201
15065	NC_002940	CAGA	2	8	855611	855618	50 %	0 %	25 %	25 %	33152201
15066	NC_002940	CAG	2	6	855635	855640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152201
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15069	NC_002940	T	6	6	855844	855849	0 %	100 %	0 %	0 %	33152201
15070	NC_002940	AAAT	2	8	855873	855880	75 %	25 %	0 %	0 %	33152201
15071	NC_002940	TAT	2	6	855898	855903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152201
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15073	NC_002940	TA	3	6	855924	855929	50 %	50 %	0 %	0 %	33152201
15074	NC_002940	A	6	6	855941	855946	100 %	0 %	0 %	0 %	33152201
15075	NC_002940	ATCA	2	8	855990	855997	50 %	25 %	0 %	25 %	33152201
15076	NC_002940	A	6	6	856039	856044	100 %	0 %	0 %	0 %	33152201
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15079	NC_002940	A	8	8	856172	856179	100 %	0 %	0 %	0 %	33152201
15080	NC_002940	A	6	6	856251	856256	100 %	0 %	0 %	0 %	33152201
15081	NC_002940	GAT	2	6	856351	856356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152201
15082	NC_002940	TGA	2	6	856357	856362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152201
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15088	NC_002940	GCA	2	6	856742	856747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152201
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15090	NC_002940	A	6	6	856877	856882	100 %	0 %	0 %	0 %	33152201
15091	NC_002940	AGA	2	6	856942	856947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152201
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15093	NC_002940	TAT	2	6	856983	856988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152201
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15104	NC_002940	GGC	2	6	857829	857834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33152201
15105	NC_002940	GTAC	2	8	857864	857871	25 %	25 %	25 %	25 %	33152201
15106	NC_002940	TAT	2	6	857881	857886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152201
15107	NC_002940	AAG	2	6	857892	857897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152201
15108	NC_002940	CAT	2	6	857924	857929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152201
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15110	NC_002940	CAG	2	6	857985	857990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152201
15111	NC_002940	ATT	2	6	858007	858012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152201
15112	NC_002940	CA	3	6	858075	858080	50 %	0 %	0 %	50 %	33152201
15113	NC_002940	T	6	6	858110	858115	0 %	100 %	0 %	0 %	33152201
15114	NC_002940	GAA	2	6	858185	858190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33152201
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15121	NC_002940	TTC	2	6	858499	858504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33152201
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15123	NC_002940	ACTATG	2	12	858624	858635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33152201
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15233	NC_002940	GGT	2	6	865259	865264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33152211
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15236	NC_002940	TTACC	2	10	865401	865410	20 %	40 %	0 %	40 %	33152211
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15241	NC_002940	G	6	6	865784	865789	0 %	0 %	100 %	0 %	33152211
15242	NC_002940	GAT	2	6	865809	865814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152211
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15244	NC_002940	GATTG	2	10	865833	865842	20 %	40 %	40 %	0 %	33152211
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