MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus ducreyi 35000HP chromosome

Total Repeats: 30157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_002940	A	6	6	739443	739448	100 %	0 %	0 %	0 %	33152065
13003	NC_002940	TGTT	2	8	739480	739487	0 %	75 %	25 %	0 %	33152066
13004	NC_002940	TATTT	2	10	739489	739498	20 %	80 %	0 %	0 %	33152066
13005	NC_002940	CT	3	6	739519	739524	0 %	50 %	0 %	50 %	33152066
13006	NC_002940	TC	3	6	739543	739548	0 %	50 %	0 %	50 %	33152066
13007	NC_002940	ACA	2	6	739650	739655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33152067
13008	NC_002940	ATG	2	6	739683	739688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152067
13009	NC_002940	TG	3	6	739729	739734	0 %	50 %	50 %	0 %	33152067
13010	NC_002940	CCA	2	6	739790	739795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33152067
13011	NC_002940	TAA	2	6	739807	739812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152067
13012	NC_002940	ATG	2	6	739872	739877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152067
13013	NC_002940	AAT	2	6	739889	739894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152067
13014	NC_002940	GAC	2	6	739895	739900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152067
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13017	NC_002940	CAC	2	6	740224	740229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33152069
13018	NC_002940	GCC	2	6	740243	740248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33152069
13019	NC_002940	GTT	2	6	740308	740313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152069
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13021	NC_002940	CCG	2	6	740361	740366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33152069
13022	NC_002940	CGT	2	6	740427	740432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152069
13023	NC_002940	AAT	2	6	740475	740480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33152069
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13025	NC_002940	T	6	6	740494	740499	0 %	100 %	0 %	0 %	33152069
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13027	NC_002940	ACC	2	6	740627	740632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33152069
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13029	NC_002940	TCA	2	6	740838	740843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152069
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13032	NC_002940	GAT	2	6	741065	741070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152070
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13040	NC_002940	GGCC	2	8	741483	741490	0 %	0 %	50 %	50 %	33152071
13041	NC_002940	TGT	2	6	741493	741498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152071
13042	NC_002940	TCG	2	6	741499	741504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152071
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13045	NC_002940	TCTA	2	8	741805	741812	25 %	50 %	0 %	25 %	33152072
13046	NC_002940	CAT	2	6	741862	741867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152072
13047	NC_002940	TTGC	2	8	741871	741878	0 %	50 %	25 %	25 %	33152072
13048	NC_002940	T	6	6	741988	741993	0 %	100 %	0 %	0 %	33152072
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13050	NC_002940	TCA	2	6	742070	742075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152072
13051	NC_002940	CCA	2	6	742096	742101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33152072
13052	NC_002940	AGCC	2	8	742159	742166	25 %	0 %	25 %	50 %	33152073
13053	NC_002940	TTAA	2	8	742242	742249	50 %	50 %	0 %	0 %	33152073
13054	NC_002940	CAA	2	6	742309	742314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33152073
13055	NC_002940	A	6	6	742356	742361	100 %	0 %	0 %	0 %	33152073
13056	NC_002940	CGT	2	6	742422	742427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152073
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13059	NC_002940	TCGGC	2	10	742557	742566	0 %	20 %	40 %	40 %	33152073
13060	NC_002940	TCT	2	6	742578	742583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33152073
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13063	NC_002940	CGT	2	6	742657	742662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33152073
13064	NC_002940	TCT	2	6	742665	742670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33152073
13065	NC_002940	A	6	6	742732	742737	100 %	0 %	0 %	0 %	33152073
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13079	NC_002940	TGCCA	2	10	743643	743652	20 %	20 %	20 %	40 %	33152073
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13104	NC_002940	CCG	2	6	744821	744826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33152074
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13113	NC_002940	CGTC	2	8	745407	745414	0 %	25 %	25 %	50 %	33152075
13114	NC_002940	CA	3	6	745451	745456	50 %	0 %	0 %	50 %	33152075
13115	NC_002940	ATT	2	6	745583	745588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33152075
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13117	NC_002940	AAAG	2	8	745661	745668	75 %	0 %	25 %	0 %	33152075
13118	NC_002940	CTT	2	6	745672	745677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33152075
13119	NC_002940	T	7	7	745682	745688	0 %	100 %	0 %	0 %	33152075
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13123	NC_002940	TGT	2	6	745892	745897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152075
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13233	NC_002940	T	6	6	751171	751176	0 %	100 %	0 %	0 %	33152084
13234	NC_002940	A	7	7	751209	751215	100 %	0 %	0 %	0 %	33152084
13235	NC_002940	TGT	2	6	751216	751221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33152084
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13237	NC_002940	GTTT	2	8	751460	751467	0 %	75 %	25 %	0 %	33152085
13238	NC_002940	ACCTG	2	10	751487	751496	20 %	20 %	20 %	40 %	33152085
13239	NC_002940	T	6	6	751546	751551	0 %	100 %	0 %	0 %	33152085
13240	NC_002940	AC	3	6	751644	751649	50 %	0 %	0 %	50 %	33152085
13241	NC_002940	CTT	2	6	751701	751706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33152085
13242	NC_002940	TCA	2	6	751709	751714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152085
13243	NC_002940	GTTGA	2	10	751806	751815	20 %	40 %	40 %	0 %	33152085
13244	NC_002940	GT	3	6	751901	751906	0 %	50 %	50 %	0 %	33152086
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13246	NC_002940	CGC	2	6	751927	751932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33152086
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13492	NC_002940	GAT	2	6	766988	766993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152112
13493	NC_002940	TCC	2	6	767000	767005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33152112
13494	NC_002940	CAT	2	6	767049	767054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33152112
13495	NC_002940	T	7	7	767054	767060	0 %	100 %	0 %	0 %	33152112
13496	NC_002940	TGA	2	6	767134	767139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33152112
13497	NC_002940	ACG	2	6	767179	767184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33152112
13498	NC_002940	CAA	2	6	767202	767207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33152112
13499	NC_002940	GCG	2	6	767231	767236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33152112
13500	NC_002940	AACCGA	2	12	767268	767279	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	33152112

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