MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 6768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002608	GTG	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120008
502	NC_002608	ACG	2	6	27266	27271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
503	NC_002608	TCG	2	6	27281	27286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
504	NC_002608	CCG	2	6	27422	27427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120008
505	NC_002608	AGA	2	6	27469	27474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120008
506	NC_002608	GAG	2	6	27475	27480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120008
507	NC_002608	GTT	2	6	27492	27497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120008
508	NC_002608	TCC	3	9	27515	27523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
509	NC_002608	GGT	2	6	27571	27576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120008
510	NC_002608	CGT	2	6	27588	27593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
511	NC_002608	ATCGG	2	10	27632	27641	20 %	20 %	40 %	20 %	16120008
512	NC_002608	CGA	2	6	27651	27656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
513	NC_002608	CGG	2	6	27795	27800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120008
514	NC_002608	CGA	2	6	27912	27917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
515	NC_002608	ATCCCC	2	12	27919	27930	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	16120008
516	NC_002608	GCG	2	6	28034	28039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120008
517	NC_002608	CCT	2	6	28062	28067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
518	NC_002608	ATG	2	6	28225	28230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120008
519	NC_002608	TCC	2	6	28244	28249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
520	NC_002608	GC	3	6	28278	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	16120008
521	NC_002608	GAG	2	6	28285	28290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120008
522	NC_002608	CGA	2	6	28386	28391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
523	NC_002608	CTG	2	6	28402	28407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
524	NC_002608	CTT	2	6	28413	28418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120008
525	NC_002608	TGCT	2	8	28429	28436	0 %	50 %	25 %	25 %	16120008
526	NC_002608	GTC	2	6	28522	28527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
527	NC_002608	GGT	2	6	28540	28545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120008
528	NC_002608	TTC	2	6	28567	28572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120008
529	NC_002608	CCT	2	6	28587	28592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
530	NC_002608	CCT	2	6	28608	28613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
531	NC_002608	AT	3	6	28621	28626	50 %	50 %	0 %	0 %	16120008
532	NC_002608	ATC	2	6	28646	28651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120008
533	NC_002608	CTT	2	6	28734	28739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120008
534	NC_002608	GCT	2	6	28767	28772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
535	NC_002608	TGCGC	2	10	28776	28785	0 %	20 %	40 %	40 %	16120008
536	NC_002608	CAG	2	6	28822	28827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
537	NC_002608	CGG	2	6	28875	28880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120008
538	NC_002608	AGTCGT	2	12	29016	29027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16120008
539	NC_002608	TCG	2	6	29030	29035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
540	NC_002608	GTC	2	6	29086	29091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
541	NC_002608	C	11	11	29165	29175	0 %	0 %	0 %	100 %	16120008
542	NC_002608	GATT	2	8	29323	29330	25 %	50 %	25 %	0 %	16120008
543	NC_002608	GTC	2	6	29369	29374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
544	NC_002608	TGT	2	6	29390	29395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120008
545	NC_002608	GAC	2	6	29404	29409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
546	NC_002608	CGA	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120008
547	NC_002608	CGT	2	6	29771	29776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120009
548	NC_002608	CGA	2	6	30190	30195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120010
549	NC_002608	GTCG	2	8	30199	30206	0 %	25 %	50 %	25 %	16120010
550	NC_002608	GCT	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120010
551	NC_002608	TCA	2	6	30237	30242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120010
552	NC_002608	CGG	2	6	30244	30249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120010
553	NC_002608	GGA	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120010
554	NC_002608	AGCG	2	8	30652	30659	25 %	0 %	50 %	25 %	16120011
555	NC_002608	GCG	2	6	30723	30728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120011
556	NC_002608	GTG	2	6	30729	30734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120011
557	NC_002608	CGC	2	6	30793	30798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120011
558	NC_002608	TCA	2	6	30824	30829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120011
559	NC_002608	AGC	2	6	30872	30877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120011
560	NC_002608	CAG	2	6	30880	30885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120011
561	NC_002608	CAC	2	6	30907	30912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120011
562	NC_002608	CAACT	2	10	30973	30982	40 %	20 %	0 %	40 %	16120011
563	NC_002608	CCG	2	6	31014	31019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120011
564	NC_002608	GGT	2	6	31056	31061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16120011
565	NC_002608	GTC	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120011
566	NC_002608	TCG	2	6	31076	31081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120011
567	NC_002608	CGA	2	6	31089	31094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120011
568	NC_002608	TTCGAC	2	12	31150	31161	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16120011
569	NC_002608	ATC	2	6	31189	31194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120011
570	NC_002608	GCT	2	6	31209	31214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120011
571	NC_002608	TCG	2	6	31316	31321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120011
572	NC_002608	CGG	2	6	31334	31339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120011
573	NC_002608	CTC	2	6	31498	31503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120011
574	NC_002608	GA	3	6	31526	31531	50 %	0 %	50 %	0 %	16120011
575	NC_002608	ATC	2	6	31565	31570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120011
576	NC_002608	TCG	2	6	31622	31627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120011
577	NC_002608	CGA	2	6	31638	31643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120011
578	NC_002608	GCG	2	6	31766	31771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120011
579	NC_002608	TGA	2	6	33430	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120012
580	NC_002608	TCA	2	6	33441	33446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120012
581	NC_002608	CTCC	2	8	33502	33509	0 %	25 %	0 %	75 %	16120012
582	NC_002608	CTGC	2	8	33604	33611	0 %	25 %	25 %	50 %	16120012
583	NC_002608	CCG	2	6	33633	33638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120012
584	NC_002608	ATTTCA	2	12	33642	33653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16120012
585	NC_002608	TCG	2	6	33726	33731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120012
586	NC_002608	TAG	3	9	33735	33743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120012
587	NC_002608	TCG	2	6	33834	33839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120012
588	NC_002608	TGC	2	6	33931	33936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120012
589	NC_002608	AGT	2	6	33989	33994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120012
590	NC_002608	GCT	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120012
591	NC_002608	AT	3	6	34014	34019	50 %	50 %	0 %	0 %	16120012
592	NC_002608	CGA	2	6	34024	34029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120012
593	NC_002608	GAC	2	6	34079	34084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120012
594	NC_002608	ATC	2	6	34085	34090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120012
595	NC_002608	TGA	2	6	34212	34217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120012
596	NC_002608	GAA	2	6	34557	34562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120013
597	NC_002608	CGC	2	6	34608	34613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120013
598	NC_002608	GGC	2	6	34627	34632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120013
599	NC_002608	CTG	2	6	34708	34713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120013
600	NC_002608	CA	3	6	34724	34729	50 %	0 %	0 %	50 %	16120013
601	NC_002608	TGC	3	9	34823	34831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120013
602	NC_002608	CGC	2	6	34866	34871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120013
603	NC_002608	CGACG	2	10	34875	34884	20 %	0 %	40 %	40 %	16120013
604	NC_002608	TTC	2	6	34885	34890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120013
605	NC_002608	AGCA	2	8	34906	34913	50 %	0 %	25 %	25 %	16120013
606	NC_002608	ACC	2	6	34954	34959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120013
607	NC_002608	TCG	2	6	34964	34969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120013
608	NC_002608	AC	3	6	35024	35029	50 %	0 %	0 %	50 %	16120013
609	NC_002608	CGCC	2	8	35046	35053	0 %	0 %	25 %	75 %	16120013
610	NC_002608	CGC	2	6	35079	35084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120013
611	NC_002608	TGGA	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	16120013
612	NC_002608	CG	3	6	35190	35195	0 %	0 %	50 %	50 %	16120013
613	NC_002608	TG	3	6	35228	35233	0 %	50 %	50 %	0 %	16120013
614	NC_002608	TCT	2	6	35240	35245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120013
615	NC_002608	CGA	2	6	35246	35251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120013
616	NC_002608	CGTG	2	8	35274	35281	0 %	25 %	50 %	25 %	16120013
617	NC_002608	GTC	2	6	35326	35331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120013
618	NC_002608	CGA	2	6	36019	36024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120014
619	NC_002608	CT	3	6	36026	36031	0 %	50 %	0 %	50 %	16120014
620	NC_002608	GA	3	6	36081	36086	50 %	0 %	50 %	0 %	16120014
621	NC_002608	GAT	2	6	36092	36097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120014
622	NC_002608	CGC	2	6	36202	36207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120014
623	NC_002608	CGC	2	6	36217	36222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120014
624	NC_002608	CTGAA	2	10	36240	36249	40 %	20 %	20 %	20 %	16120014
625	NC_002608	GTT	2	6	36397	36402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120014
626	NC_002608	CGG	2	6	36421	36426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120014
627	NC_002608	GAA	2	6	36473	36478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16120014
628	NC_002608	CGA	2	6	36538	36543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120014
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632	NC_002608	GC	3	6	36734	36739	0 %	0 %	50 %	50 %	16120014
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1000	NC_002608	CGT	3	9	53715	53723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120035

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