MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 53236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002607	GCGG	2	8	81132	81139	0 %	0 %	75 %	25 %	15789420
1502	NC_002607	CTC	2	6	81140	81145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789420
1503	NC_002607	GTG	2	6	81180	81185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789420
1504	NC_002607	GGC	2	6	81203	81208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789420
1505	NC_002607	GC	3	6	81219	81224	0 %	0 %	50 %	50 %	15789420
1506	NC_002607	GTC	2	6	81242	81247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789420
1507	NC_002607	GAC	3	9	81251	81259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789420
1508	NC_002607	AC	3	6	81258	81263	50 %	0 %	0 %	50 %	15789420
1509	NC_002607	CTC	2	6	81266	81271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789420
1510	NC_002607	CGC	2	6	81511	81516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789421
1511	NC_002607	CA	3	6	81571	81576	50 %	0 %	0 %	50 %	15789421
1512	NC_002607	CCG	2	6	81606	81611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789421
1513	NC_002607	CCG	2	6	81654	81659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789421
1514	NC_002607	CGA	2	6	81667	81672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1515	NC_002607	GTC	3	9	81692	81700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1516	NC_002607	ACGCC	2	10	81702	81711	20 %	0 %	20 %	60 %	15789421
1517	NC_002607	GCG	2	6	81777	81782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789421
1518	NC_002607	CG	3	6	81818	81823	0 %	0 %	50 %	50 %	15789421
1519	NC_002607	GGC	2	6	81832	81837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789421
1520	NC_002607	CGCCGA	2	12	81838	81849	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15789421
1521	NC_002607	CGT	2	6	81859	81864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1522	NC_002607	CGC	2	6	81900	81905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789421
1523	NC_002607	GC	3	6	81934	81939	0 %	0 %	50 %	50 %	15789421
1524	NC_002607	CGG	2	6	81955	81960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789421
1525	NC_002607	GACC	2	8	81973	81980	25 %	0 %	25 %	50 %	15789421
1526	NC_002607	TCC	2	6	81999	82004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789421
1527	NC_002607	CCA	2	6	82027	82032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789421
1528	NC_002607	TCGACA	2	12	82065	82076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15789421
1529	NC_002607	CGC	2	6	82150	82155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789421
1530	NC_002607	CAT	2	6	82189	82194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789421
1531	NC_002607	GCT	2	6	82195	82200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1532	NC_002607	GAC	2	6	82205	82210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1533	NC_002607	GCC	2	6	82260	82265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789421
1534	NC_002607	G	6	6	82296	82301	0 %	0 %	100 %	0 %	15789421
1535	NC_002607	CCA	2	6	82348	82353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789421
1536	NC_002607	CGT	2	6	82363	82368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1537	NC_002607	CGACGC	2	12	82405	82416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15789421
1538	NC_002607	CCA	3	9	82431	82439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789421
1539	NC_002607	ACG	2	6	82440	82445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789421
1540	NC_002607	CGA	2	6	82548	82553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789422
1541	NC_002607	TGA	2	6	82569	82574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789422
1542	NC_002607	ATG	2	6	82597	82602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789422
1543	NC_002607	ATG	2	6	82609	82614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789422
1544	NC_002607	GAC	2	6	82735	82740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789422
1545	NC_002607	TCCA	2	8	82744	82751	25 %	25 %	0 %	50 %	15789422
1546	NC_002607	ACG	2	6	82802	82807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789422
1547	NC_002607	GCC	2	6	82849	82854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789422
1548	NC_002607	ACA	2	6	82859	82864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789422
1549	NC_002607	TCC	2	6	82900	82905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789422
1550	NC_002607	CGCC	2	8	82935	82942	0 %	0 %	25 %	75 %	15789423
1551	NC_002607	CGG	2	6	82949	82954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789423
1552	NC_002607	CCG	2	6	82956	82961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789423
1553	NC_002607	CGC	2	6	82968	82973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789423
1554	NC_002607	GTC	2	6	83010	83015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789423
1555	NC_002607	TCG	2	6	83018	83023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789423
1556	NC_002607	CG	3	6	83026	83031	0 %	0 %	50 %	50 %	15789423
1557	NC_002607	ACC	2	6	83044	83049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789423
1558	NC_002607	GC	3	6	83050	83055	0 %	0 %	50 %	50 %	15789423
1559	NC_002607	TCG	2	6	83056	83061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789423
1560	NC_002607	GCG	2	6	83101	83106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789423
1561	NC_002607	GC	4	8	83123	83130	0 %	0 %	50 %	50 %	15789423
1562	NC_002607	CGCC	2	8	83150	83157	0 %	0 %	25 %	75 %	15789423
1563	NC_002607	TGG	2	6	83170	83175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789423
1564	NC_002607	CGC	2	6	83203	83208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789423
1565	NC_002607	ACC	2	6	83218	83223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789423
1566	NC_002607	GAAC	2	8	83264	83271	50 %	0 %	25 %	25 %	15789423
1567	NC_002607	AGTC	2	8	83330	83337	25 %	25 %	25 %	25 %	15789423
1568	NC_002607	CCCA	2	8	83340	83347	25 %	0 %	0 %	75 %	15789423
1569	NC_002607	CAC	3	9	83406	83414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789423
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1571	NC_002607	TCG	2	6	83455	83460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789423
1572	NC_002607	CAG	2	6	83511	83516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789423
1573	NC_002607	CGG	2	6	83661	83666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789423
1574	NC_002607	CG	3	6	83746	83751	0 %	0 %	50 %	50 %	15789423
1575	NC_002607	CGT	2	6	83762	83767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789423
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1581	NC_002607	CCT	2	6	83965	83970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789424
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1583	NC_002607	GCGG	2	8	84032	84039	0 %	0 %	75 %	25 %	15789424
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1585	NC_002607	TGA	2	6	84184	84189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789424
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1591	NC_002607	TCC	2	6	84690	84695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789425
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1596	NC_002607	GAA	2	6	84785	84790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15789425
1597	NC_002607	ACTGT	2	10	84816	84825	20 %	40 %	20 %	20 %	15789425
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1607	NC_002607	CGT	2	6	85550	85555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789426
1608	NC_002607	ACG	2	6	85564	85569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789426
1609	NC_002607	TGG	2	6	85583	85588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789426
1610	NC_002607	CCG	2	6	85684	85689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789427
1611	NC_002607	CCA	2	6	85711	85716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789427
1612	NC_002607	CCG	3	9	85723	85731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789427
1613	NC_002607	ACC	2	6	85741	85746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789427
1614	NC_002607	GCG	2	6	85753	85758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789427
1615	NC_002607	CCA	2	6	85780	85785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789427
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1622	NC_002607	TCG	2	6	85944	85949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789427
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1624	NC_002607	GC	3	6	86005	86010	0 %	0 %	50 %	50 %	15789427
1625	NC_002607	CGG	2	6	86050	86055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789427
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