MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 3240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_001869	GTCG	2	8	176009	176016	0 %	25 %	50 %	25 %	10803710
3002	NC_001869	CGC	2	6	176023	176028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803710
3003	NC_001869	GAC	2	6	176036	176041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803710
3004	NC_001869	GCC	2	6	176086	176091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803712
3005	NC_001869	CTG	2	6	176111	176116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803712
3006	NC_001869	CAG	2	6	176222	176227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803712
3007	NC_001869	TAGCG	2	10	176236	176245	20 %	20 %	40 %	20 %	10803712
3008	NC_001869	AGTGGA	2	12	176283	176294	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	10803712
3009	NC_001869	CGT	2	6	176309	176314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3010	NC_001869	GA	3	6	176326	176331	50 %	0 %	50 %	0 %	10803713
3011	NC_001869	CTGG	2	8	176335	176342	0 %	25 %	50 %	25 %	10803713
3012	NC_001869	GTT	2	6	176350	176355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803713
3013	NC_001869	TCG	3	9	176384	176392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3014	NC_001869	TCG	2	6	176412	176417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3015	NC_001869	GAT	2	6	176419	176424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803713
3016	NC_001869	GGCC	2	8	176437	176444	0 %	0 %	50 %	50 %	10803713
3017	NC_001869	GCG	2	6	176445	176450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713
3018	NC_001869	CGA	2	6	176472	176477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3019	NC_001869	TCG	2	6	176510	176515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3020	NC_001869	CGG	3	9	176550	176558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713
3021	NC_001869	CGG	2	6	176562	176567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713
3022	NC_001869	GC	3	6	176580	176585	0 %	0 %	50 %	50 %	10803713
3023	NC_001869	CGA	2	6	176589	176594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3024	NC_001869	GC	3	6	176647	176652	0 %	0 %	50 %	50 %	10803713
3025	NC_001869	GC	3	6	176661	176666	0 %	0 %	50 %	50 %	10803713
3026	NC_001869	CGT	2	6	176667	176672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3027	NC_001869	CTC	2	6	176677	176682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803713
3028	NC_001869	GGGC	2	8	176690	176697	0 %	0 %	75 %	25 %	10803713
3029	NC_001869	GTC	2	6	176740	176745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
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3031	NC_001869	GT	3	6	176771	176776	0 %	50 %	50 %	0 %	10803713
3032	NC_001869	TGG	2	6	176799	176804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803713
3033	NC_001869	GCG	2	6	176834	176839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803713
3034	NC_001869	GTC	2	6	176840	176845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3035	NC_001869	GTC	2	6	176848	176853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3036	NC_001869	TCC	2	6	176906	176911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803713
3037	NC_001869	CGT	2	6	176997	177002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3038	NC_001869	CGGT	2	8	177011	177018	0 %	25 %	50 %	25 %	10803713
3039	NC_001869	ACGC	2	8	177021	177028	25 %	0 %	25 %	50 %	10803713
3040	NC_001869	GAT	2	6	177037	177042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803713
3041	NC_001869	TCG	2	6	177056	177061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3042	NC_001869	AGG	2	6	177065	177070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803713
3043	NC_001869	GAG	2	6	177086	177091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803713
3044	NC_001869	GCA	2	6	177105	177110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3045	NC_001869	CGT	2	6	177123	177128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3046	NC_001869	CTTCGA	2	12	177132	177143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10803713
3047	NC_001869	CGT	2	6	177147	177152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3048	NC_001869	GC	3	6	177157	177162	0 %	0 %	50 %	50 %	10803713
3049	NC_001869	GGT	2	6	177186	177191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803713
3050	NC_001869	CGT	2	6	177195	177200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3051	NC_001869	CGA	2	6	177225	177230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803713
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3053	NC_001869	GTC	2	6	177274	177279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3054	NC_001869	TCG	2	6	177302	177307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3055	NC_001869	GTC	2	6	177310	177315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3056	NC_001869	GACGT	2	10	177347	177356	20 %	20 %	40 %	20 %	10803713
3057	NC_001869	GAG	2	6	177406	177411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803713
3058	NC_001869	GTC	2	6	177493	177498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803713
3059	NC_001869	AGT	2	6	177819	177824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803714
3060	NC_001869	CGA	2	6	177843	177848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803714
3061	NC_001869	GACT	2	8	177882	177889	25 %	25 %	25 %	25 %	10803714
3062	NC_001869	TCG	2	6	177944	177949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803714
3063	NC_001869	AGG	2	6	177953	177958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803714
3064	NC_001869	CGA	2	6	177963	177968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803714
3065	NC_001869	AC	3	6	178015	178020	50 %	0 %	0 %	50 %	10803715
3066	NC_001869	CGTC	2	8	178027	178034	0 %	25 %	25 %	50 %	10803715
3067	NC_001869	CGC	2	6	178061	178066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803715
3068	NC_001869	GC	3	6	178065	178070	0 %	0 %	50 %	50 %	10803715
3069	NC_001869	CCA	2	6	178102	178107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803715
3070	NC_001869	GAC	2	6	178113	178118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803715
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3072	NC_001869	CAT	2	6	178133	178138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803715
3073	NC_001869	CGC	2	6	178171	178176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803715
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3075	NC_001869	GAA	2	6	178268	178273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803715
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3079	NC_001869	CGA	2	6	178379	178384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803715
3080	NC_001869	CCA	2	6	178396	178401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803715
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3082	NC_001869	GAC	2	6	178488	178493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803715
3083	NC_001869	ACG	2	6	178498	178503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803715
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3088	NC_001869	GCG	2	6	178815	178820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803716
3089	NC_001869	ACG	2	6	178823	178828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
3090	NC_001869	TC	3	6	178832	178837	0 %	50 %	0 %	50 %	10803716
3091	NC_001869	CAG	2	6	178840	178845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
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3093	NC_001869	CAG	2	6	178897	178902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
3094	NC_001869	GC	3	6	178917	178922	0 %	0 %	50 %	50 %	10803716
3095	NC_001869	CGA	2	6	178980	178985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
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3102	NC_001869	CGC	2	6	179155	179160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803716
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3104	NC_001869	CAC	2	6	179215	179220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803716
3105	NC_001869	CCGG	2	8	179248	179255	0 %	0 %	50 %	50 %	10803716
3106	NC_001869	CAG	2	6	179269	179274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
3107	NC_001869	CGA	2	6	179295	179300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
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3109	NC_001869	CGA	3	9	179382	179390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803716
3110	NC_001869	CG	3	6	179436	179441	0 %	0 %	50 %	50 %	10803716
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3116	NC_001869	CAGT	2	8	179797	179804	25 %	25 %	25 %	25 %	10803717
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3120	NC_001869	CTCG	2	8	179882	179889	0 %	25 %	25 %	50 %	10803717
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3122	NC_001869	CGC	2	6	179957	179962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803717
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