MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 3240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_001869	GAT	2	6	146182	146187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803679
2502	NC_001869	GTC	2	6	146195	146200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2503	NC_001869	TCG	2	6	146247	146252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2504	NC_001869	CACG	2	8	146275	146282	25 %	0 %	25 %	50 %	10803679
2505	NC_001869	CAG	2	6	146322	146327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2506	NC_001869	CCAG	2	8	146328	146335	25 %	0 %	25 %	50 %	10803679
2507	NC_001869	GCA	2	6	146356	146361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803679
2508	NC_001869	CCG	2	6	146393	146398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803680
2509	NC_001869	CG	3	6	146415	146420	0 %	0 %	50 %	50 %	10803680
2510	NC_001869	CGC	2	6	146463	146468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803680
2511	NC_001869	GC	3	6	146470	146475	0 %	0 %	50 %	50 %	10803680
2512	NC_001869	GT	3	6	146632	146637	0 %	50 %	50 %	0 %	10803680
2513	NC_001869	GCCC	2	8	146646	146653	0 %	0 %	25 %	75 %	10803680
2514	NC_001869	CGC	2	6	146658	146663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803680
2515	NC_001869	GCC	2	6	146665	146670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803680
2516	NC_001869	TCGC	2	8	146727	146734	0 %	25 %	25 %	50 %	10803680
2517	NC_001869	GACC	2	8	146735	146742	25 %	0 %	25 %	50 %	10803680
2518	NC_001869	GCC	2	6	146842	146847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803680
2519	NC_001869	GACG	2	8	146851	146858	25 %	0 %	50 %	25 %	10803680
2520	NC_001869	CGGG	2	8	146902	146909	0 %	0 %	75 %	25 %	10803680
2521	NC_001869	GC	3	6	146913	146918	0 %	0 %	50 %	50 %	10803680
2522	NC_001869	GC	3	6	146947	146952	0 %	0 %	50 %	50 %	10803680
2523	NC_001869	TCGC	2	8	146955	146962	0 %	25 %	25 %	50 %	10803680
2524	NC_001869	GCGA	2	8	146987	146994	25 %	0 %	50 %	25 %	10803680
2525	NC_001869	GC	3	6	146997	147002	0 %	0 %	50 %	50 %	10803680
2526	NC_001869	GTCG	2	8	147013	147020	0 %	25 %	50 %	25 %	10803680
2527	NC_001869	GTC	2	6	147023	147028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803680
2528	NC_001869	GGC	2	6	147058	147063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803680
2529	NC_001869	AAC	2	6	147107	147112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803680
2530	NC_001869	GGC	2	6	147169	147174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803680
2531	NC_001869	GTC	2	6	147194	147199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803680
2532	NC_001869	GGC	2	6	147220	147225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803680
2533	NC_001869	ACC	2	6	147261	147266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803680
2534	NC_001869	AGG	2	6	147321	147326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803680
2535	NC_001869	AGC	2	6	147402	147407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803680
2536	NC_001869	GCG	2	6	147442	147447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803680
2537	NC_001869	GAT	2	6	147503	147508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803680
2538	NC_001869	GGC	2	6	147538	147543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803680
2539	NC_001869	GCG	2	6	147596	147601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803681
2540	NC_001869	CGG	2	6	147608	147613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803681
2541	NC_001869	CGT	2	6	147625	147630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803681
2542	NC_001869	GTC	2	6	147656	147661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803681
2543	NC_001869	GAG	2	6	147671	147676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803681
2544	NC_001869	AAG	2	6	147735	147740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803681
2545	NC_001869	GCGA	2	8	147851	147858	25 %	0 %	50 %	25 %	10803681
2546	NC_001869	GAG	2	6	147872	147877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803681
2547	NC_001869	GCG	2	6	147902	147907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803681
2548	NC_001869	TGG	2	6	147983	147988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803681
2549	NC_001869	CCGA	2	8	148278	148285	25 %	0 %	25 %	50 %	10803682
2550	NC_001869	GGAT	2	8	148367	148374	25 %	25 %	50 %	0 %	10803682
2551	NC_001869	ACG	2	6	148497	148502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803682
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2553	NC_001869	CGC	2	6	148599	148604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803682
2554	NC_001869	AT	3	6	149189	149194	50 %	50 %	0 %	0 %	10803683
2555	NC_001869	GTC	2	6	149296	149301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803683
2556	NC_001869	TCA	2	6	149348	149353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803683
2557	NC_001869	GCC	2	6	149405	149410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803683
2558	NC_001869	CTC	2	6	149423	149428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803683
2559	NC_001869	GCC	2	6	149514	149519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803683
2560	NC_001869	GTC	2	6	149545	149550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803683
2561	NC_001869	GTT	2	6	149601	149606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803683
2562	NC_001869	CAT	2	6	149652	149657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803683
2563	NC_001869	CGC	2	6	149658	149663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803683
2564	NC_001869	TTCA	2	8	149677	149684	25 %	50 %	0 %	25 %	10803683
2565	NC_001869	CGT	2	6	149717	149722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803683
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2567	NC_001869	CGT	2	6	149734	149739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803683
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2569	NC_001869	CTCTC	2	10	149762	149771	0 %	40 %	0 %	60 %	10803683
2570	NC_001869	CGG	2	6	149795	149800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803683
2571	NC_001869	ACG	2	6	149815	149820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803683
2572	NC_001869	GGC	2	6	150004	150009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803683
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2574	NC_001869	AACAG	2	10	152212	152221	60 %	0 %	20 %	20 %	10803684
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2580	NC_001869	GAC	2	6	153108	153113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803685
2581	NC_001869	GAG	2	6	153195	153200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803685
2582	NC_001869	ATC	2	6	153204	153209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803685
2583	NC_001869	CT	3	6	153219	153224	0 %	50 %	0 %	50 %	10803685
2584	NC_001869	CGG	2	6	153248	153253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803685
2585	NC_001869	CAG	2	6	153287	153292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803685
2586	NC_001869	CCT	2	6	153346	153351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803685
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2588	NC_001869	TCG	2	6	153385	153390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803685
2589	NC_001869	TCG	2	6	154087	154092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803686
2590	NC_001869	GAT	2	6	154095	154100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803686
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2593	NC_001869	TCG	2	6	154144	154149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803686
2594	NC_001869	ATC	2	6	154191	154196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803686
2595	NC_001869	CAG	2	6	154237	154242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803686
2596	NC_001869	CGG	2	6	154352	154357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803686
2597	NC_001869	GGT	2	6	154394	154399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803686
2598	NC_001869	TC	3	6	154816	154821	0 %	50 %	0 %	50 %	10803687
2599	NC_001869	CGA	2	6	154867	154872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803687
2600	NC_001869	GCACA	2	10	154888	154897	40 %	0 %	20 %	40 %	10803687
2601	NC_001869	AGC	2	6	154900	154905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803687
2602	NC_001869	TCCG	2	8	154910	154917	0 %	25 %	25 %	50 %	10803687
2603	NC_001869	ACC	2	6	154931	154936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803687
2604	NC_001869	CGTGA	2	10	154965	154974	20 %	20 %	40 %	20 %	10803687
2605	NC_001869	AGG	4	12	155175	155186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803688
2606	NC_001869	TGCC	2	8	155198	155205	0 %	25 %	25 %	50 %	10803688
2607	NC_001869	CA	3	6	155245	155250	50 %	0 %	0 %	50 %	10803688
2608	NC_001869	CTC	2	6	155297	155302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803688
2609	NC_001869	CGC	2	6	155311	155316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803688
2610	NC_001869	CCA	2	6	155323	155328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803688
2611	NC_001869	AAT	2	6	155329	155334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10803688
2612	NC_001869	TCGA	2	8	155336	155343	25 %	25 %	25 %	25 %	10803688
2613	NC_001869	CCGC	2	8	155379	155386	0 %	0 %	25 %	75 %	10803688
2614	NC_001869	GCT	2	6	155428	155433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803688
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2617	NC_001869	GAG	2	6	155471	155476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803688
2618	NC_001869	CTA	2	6	155539	155544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803688
2619	NC_001869	CGT	2	6	155596	155601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803688
2620	NC_001869	TCGCG	2	10	155647	155656	0 %	20 %	40 %	40 %	10803688
2621	NC_001869	TTC	2	6	155675	155680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803688
2622	NC_001869	CGG	2	6	155808	155813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803689
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2624	NC_001869	TCG	2	6	155940	155945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803689
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2988	NC_001869	CG	3	6	175605	175610	0 %	0 %	50 %	50 %	10803710
2989	NC_001869	CAG	2	6	175614	175619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803710
2990	NC_001869	CGA	2	6	175628	175633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803710
2991	NC_001869	CGG	2	6	175652	175657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803710
2992	NC_001869	CGC	2	6	175658	175663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803710
2993	NC_001869	GGA	2	6	175700	175705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803710
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2999	NC_001869	CGC	2	6	175978	175983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803710
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