MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 3240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_001869	GGA	2	6	88502	88507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803632
1502	NC_001869	GC	3	6	88511	88516	0 %	0 %	50 %	50 %	10803632
1503	NC_001869	TCG	2	6	88564	88569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803632
1504	NC_001869	TTG	2	6	88641	88646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803632
1505	NC_001869	CCA	2	6	88676	88681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803632
1506	NC_001869	CGC	2	6	89714	89719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803633
1507	NC_001869	ACG	2	6	89794	89799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803633
1508	NC_001869	GTA	2	6	89805	89810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803633
1509	NC_001869	CTC	2	6	89829	89834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803633
1510	NC_001869	CGT	2	6	89874	89879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803633
1511	NC_001869	GTC	2	6	89886	89891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803633
1512	NC_001869	TGCAT	2	10	89953	89962	20 %	40 %	20 %	20 %	10803633
1513	NC_001869	CCTC	2	8	89998	90005	0 %	25 %	0 %	75 %	10803633
1514	NC_001869	GCT	2	6	90050	90055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803633
1515	NC_001869	CTGC	2	8	90065	90072	0 %	25 %	25 %	50 %	10803633
1516	NC_001869	TCT	2	6	90073	90078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803633
1517	NC_001869	CGC	2	6	90080	90085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803633
1518	NC_001869	TCG	2	6	90103	90108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803633
1519	NC_001869	CGT	2	6	90140	90145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803633
1520	NC_001869	CCT	2	6	90175	90180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803634
1521	NC_001869	CAT	2	6	90196	90201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803634
1522	NC_001869	TGTC	2	8	90217	90224	0 %	50 %	25 %	25 %	10803634
1523	NC_001869	CCA	2	6	90252	90257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803634
1524	NC_001869	AGC	2	6	90278	90283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1525	NC_001869	CGT	2	6	90415	90420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1526	NC_001869	GAG	2	6	90449	90454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803634
1527	NC_001869	CGA	2	6	90473	90478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1528	NC_001869	GTC	2	6	90479	90484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1529	NC_001869	GAT	3	9	90497	90505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803634
1530	NC_001869	CGG	2	6	90511	90516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803634
1531	NC_001869	CAG	2	6	90518	90523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1532	NC_001869	TGGG	2	8	90550	90557	0 %	25 %	75 %	0 %	10803634
1533	NC_001869	CGTAGT	2	12	90571	90582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	10803634
1534	NC_001869	CGG	2	6	90624	90629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803634
1535	NC_001869	GGA	2	6	90679	90684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803634
1536	NC_001869	CGA	3	9	90703	90711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1537	NC_001869	CGT	2	6	90721	90726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1538	NC_001869	CGT	2	6	90748	90753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803634
1539	NC_001869	CGG	2	6	90761	90766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803634
1540	NC_001869	TGG	2	6	90843	90848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803634
1541	NC_001869	CGC	2	6	90901	90906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803634
1542	NC_001869	GGT	2	6	91111	91116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803635
1543	NC_001869	GCT	2	6	91123	91128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803635
1544	NC_001869	GGT	2	6	91164	91169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803635
1545	NC_001869	CAG	2	6	91191	91196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803635
1546	NC_001869	ACT	2	6	91217	91222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803635
1547	NC_001869	CGC	2	6	91223	91228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803635
1548	NC_001869	CGC	2	6	91244	91249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803635
1549	NC_001869	GACG	2	8	91274	91281	25 %	0 %	50 %	25 %	10803635
1550	NC_001869	GTC	2	6	91287	91292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803635
1551	NC_001869	CGC	2	6	91298	91303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803635
1552	NC_001869	GCT	2	6	91340	91345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803635
1553	NC_001869	TTC	2	6	91502	91507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803636
1554	NC_001869	CGT	2	6	91564	91569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803636
1555	NC_001869	TCGA	2	8	91597	91604	25 %	25 %	25 %	25 %	10803636
1556	NC_001869	GAC	2	6	91637	91642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803636
1557	NC_001869	GA	3	6	92672	92677	50 %	0 %	50 %	0 %	10803637
1558	NC_001869	GAG	2	6	92693	92698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803637
1559	NC_001869	TCA	2	6	92706	92711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803637
1560	NC_001869	CAA	2	6	92722	92727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803637
1561	NC_001869	TCGCAT	2	12	92728	92739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10803637
1562	NC_001869	TCA	2	6	92763	92768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803637
1563	NC_001869	CCGTGA	2	12	92776	92787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10803637
1564	NC_001869	GAG	2	6	92849	92854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803637
1565	NC_001869	ACC	2	6	92881	92886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803637
1566	NC_001869	CCG	2	6	92904	92909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803637
1567	NC_001869	CGA	2	6	93019	93024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803637
1568	NC_001869	GTT	2	6	93068	93073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803637
1569	NC_001869	GACG	2	8	93118	93125	25 %	0 %	50 %	25 %	10803637
1570	NC_001869	CTC	2	6	93146	93151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803637
1571	NC_001869	GTT	2	6	93202	93207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803637
1572	NC_001869	CAC	2	6	93218	93223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803637
1573	NC_001869	GC	3	6	93237	93242	0 %	0 %	50 %	50 %	10803637
1574	NC_001869	GAC	2	6	93290	93295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803637
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1576	NC_001869	CGA	2	6	93370	93375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803637
1577	NC_001869	GCC	2	6	93503	93508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803637
1578	NC_001869	CGA	2	6	93517	93522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803637
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1580	NC_001869	ACC	2	6	93613	93618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803637
1581	NC_001869	CAT	2	6	93669	93674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803638
1582	NC_001869	CGA	2	6	93696	93701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803638
1583	NC_001869	CG	3	6	93721	93726	0 %	0 %	50 %	50 %	10803638
1584	NC_001869	ACC	2	6	93743	93748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803638
1585	NC_001869	ACT	2	6	93773	93778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803638
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1588	NC_001869	GAC	2	6	93870	93875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803638
1589	NC_001869	TCG	2	6	93891	93896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803638
1590	NC_001869	TGA	2	6	93906	93911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803638
1591	NC_001869	CGA	2	6	94142	94147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803639
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1593	NC_001869	CAG	2	6	94179	94184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803639
1594	NC_001869	GTC	2	6	94206	94211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803639
1595	NC_001869	CAGTC	2	10	94219	94228	20 %	20 %	20 %	40 %	10803639
1596	NC_001869	CTT	2	6	94284	94289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803639
1597	NC_001869	TCG	2	6	94335	94340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803639
1598	NC_001869	ATC	2	6	94372	94377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803639
1599	NC_001869	CGT	2	6	94400	94405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803639
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1601	NC_001869	TC	3	6	94544	94549	0 %	50 %	0 %	50 %	10803639
1602	NC_001869	TCG	2	6	94564	94569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803639
1603	NC_001869	TCCA	2	8	94677	94684	25 %	25 %	0 %	50 %	10803639
1604	NC_001869	CGG	2	6	94703	94708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803639
1605	NC_001869	CGTC	2	8	94709	94716	0 %	25 %	25 %	50 %	10803639
1606	NC_001869	CCGT	2	8	94732	94739	0 %	25 %	25 %	50 %	10803639
1607	NC_001869	GATA	2	8	94748	94755	50 %	25 %	25 %	0 %	10803639
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1609	NC_001869	GAG	2	6	94878	94883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803639
1610	NC_001869	CCACT	2	10	94884	94893	20 %	20 %	0 %	60 %	10803639
1611	NC_001869	CGT	2	6	94941	94946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803639
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1613	NC_001869	TGTT	2	8	95008	95015	0 %	75 %	25 %	0 %	10803639
1614	NC_001869	TGG	2	6	95041	95046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803639
1615	NC_001869	CAG	2	6	95081	95086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803639
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1622	NC_001869	TC	3	6	95360	95365	0 %	50 %	0 %	50 %	10803639
1623	NC_001869	GCG	2	6	95396	95401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803639
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1853	NC_001869	ATT	2	6	109028	109033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10803644
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1993	NC_001869	GCC	2	6	117698	117703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803652
1994	NC_001869	CGA	2	6	117742	117747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
1995	NC_001869	CTC	2	6	117776	117781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803652
1996	NC_001869	CG	3	6	117848	117853	0 %	0 %	50 %	50 %	10803652
1997	NC_001869	CGA	3	9	117892	117900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803652
1998	NC_001869	TGA	2	6	117913	117918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803652
1999	NC_001869	CTC	3	9	118169	118177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803652
2000	NC_001869	GGC	2	6	118200	118205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803652

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