MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 3240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_001869	GCA	2	6	56421	56426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1002	NC_001869	TCG	2	6	56429	56434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1003	NC_001869	TCGCGT	2	12	56480	56491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1004	NC_001869	GCT	2	6	56493	56498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1005	NC_001869	CGG	2	6	56553	56558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803603
1006	NC_001869	CGA	2	6	56565	56570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1007	NC_001869	GC	3	6	56581	56586	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
1008	NC_001869	TCA	2	6	56652	56657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803603
1009	NC_001869	CGCC	2	8	56658	56665	0 %	0 %	25 %	75 %	10803603
1010	NC_001869	CGTC	2	8	56676	56683	0 %	25 %	25 %	50 %	10803603
1011	NC_001869	GCG	2	6	56698	56703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803603
1012	NC_001869	CG	3	6	56785	56790	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
1013	NC_001869	GCG	2	6	56792	56797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803603
1014	NC_001869	GCT	2	6	56800	56805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1015	NC_001869	GCA	2	6	56819	56824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1016	NC_001869	GC	3	6	56828	56833	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
1017	NC_001869	TCG	2	6	56834	56839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1018	NC_001869	CGT	2	6	56892	56897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1019	NC_001869	CTT	2	6	56916	56921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803603
1020	NC_001869	CGG	2	6	56922	56927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803603
1021	NC_001869	GTC	2	6	56930	56935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1022	NC_001869	CCA	2	6	56971	56976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803603
1023	NC_001869	GC	4	8	56987	56994	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
1024	NC_001869	TCT	2	6	57035	57040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803603
1025	NC_001869	TCG	2	6	57077	57082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1026	NC_001869	GTT	2	6	57106	57111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803603
1027	NC_001869	TTG	2	6	57134	57139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803603
1028	NC_001869	GTC	2	6	57193	57198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1029	NC_001869	GAG	2	6	57199	57204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803603
1030	NC_001869	CGT	2	6	57234	57239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803603
1031	NC_001869	TCG	2	6	57381	57386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803605
1032	NC_001869	CAGC	2	8	57387	57394	25 %	0 %	25 %	50 %	10803605
1033	NC_001869	CGA	2	6	57400	57405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803605
1034	NC_001869	TGT	2	6	57412	57417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803605
1035	NC_001869	TGG	2	6	57459	57464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803605
1036	NC_001869	CGCT	2	8	57473	57480	0 %	25 %	25 %	50 %	10803605
1037	NC_001869	GGC	2	6	57512	57517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803605
1038	NC_001869	GTTT	2	8	57534	57541	0 %	75 %	25 %	0 %	10803605
1039	NC_001869	AAACC	2	10	57551	57560	60 %	0 %	0 %	40 %	10803605
1040	NC_001869	CGC	2	6	58742	58747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803606
1041	NC_001869	GGGT	2	8	58817	58824	0 %	25 %	75 %	0 %	10803606
1042	NC_001869	TCG	2	6	58870	58875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1043	NC_001869	CGA	2	6	58886	58891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1044	NC_001869	GTTGAC	2	12	58911	58922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	10803606
1045	NC_001869	GAG	2	6	59010	59015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803606
1046	NC_001869	CGA	2	6	59084	59089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1047	NC_001869	CGA	2	6	59192	59197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1048	NC_001869	CGG	2	6	59201	59206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803606
1049	NC_001869	GCAA	2	8	59296	59303	50 %	0 %	25 %	25 %	10803606
1050	NC_001869	CGA	2	6	59318	59323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1051	NC_001869	GAAGTC	2	12	59349	59360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10803606
1052	NC_001869	CGT	2	6	59417	59422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1053	NC_001869	CGA	2	6	59432	59437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1054	NC_001869	CGA	2	6	59444	59449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803606
1055	NC_001869	GAG	2	6	59481	59486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803606
1056	NC_001869	CGG	2	6	59494	59499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803606
1057	NC_001869	GTG	2	6	59601	59606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803606
1058	NC_001869	GAT	2	6	59682	59687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803606
1059	NC_001869	GCG	2	6	59715	59720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803606
1060	NC_001869	TCC	2	6	59746	59751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803606
1061	NC_001869	CCG	2	6	59784	59789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803606
1062	NC_001869	AGA	2	6	59818	59823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803606
1063	NC_001869	CGCT	2	8	59854	59861	0 %	25 %	25 %	50 %	10803606
1064	NC_001869	ACT	2	6	60257	60262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803607
1065	NC_001869	GTT	2	6	60275	60280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803607
1066	NC_001869	CG	3	6	60290	60295	0 %	0 %	50 %	50 %	10803607
1067	NC_001869	CTG	2	6	60321	60326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1068	NC_001869	TCG	2	6	60331	60336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1069	NC_001869	CCG	2	6	60454	60459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803607
1070	NC_001869	ACC	2	6	60510	60515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803607
1071	NC_001869	AC	3	6	60544	60549	50 %	0 %	0 %	50 %	10803607
1072	NC_001869	GCT	2	6	60628	60633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1073	NC_001869	CGT	2	6	60660	60665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1074	NC_001869	GGA	2	6	60851	60856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803607
1075	NC_001869	GCGTCG	2	12	60877	60888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	10803607
1076	NC_001869	ATC	2	6	60889	60894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803607
1077	NC_001869	CTGC	2	8	60899	60906	0 %	25 %	25 %	50 %	10803607
1078	NC_001869	GAC	2	6	60987	60992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1079	NC_001869	TCG	3	9	61015	61023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1080	NC_001869	GGC	2	6	61077	61082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803607
1081	NC_001869	CGT	2	6	61107	61112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1082	NC_001869	AG	3	6	61155	61160	50 %	0 %	50 %	0 %	10803607
1083	NC_001869	CGT	2	6	61196	61201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1084	NC_001869	CGT	2	6	61238	61243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803607
1085	NC_001869	GGT	2	6	61292	61297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803607
1086	NC_001869	TGT	2	6	61376	61381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803607
1087	NC_001869	TCG	2	6	61807	61812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803608
1088	NC_001869	AAC	2	6	61814	61819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803608
1089	NC_001869	ACT	2	6	61846	61851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803608
1090	NC_001869	CGA	2	6	61892	61897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803608
1091	NC_001869	ATC	2	6	61980	61985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803608
1092	NC_001869	CA	3	6	62083	62088	50 %	0 %	0 %	50 %	10803608
1093	NC_001869	TC	4	8	62132	62139	0 %	50 %	0 %	50 %	10803608
1094	NC_001869	TCG	2	6	62158	62163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803608
1095	NC_001869	TGA	2	6	62192	62197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803608
1096	NC_001869	CGA	2	6	62209	62214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803608
1097	NC_001869	AC	3	6	62218	62223	50 %	0 %	0 %	50 %	10803608
1098	NC_001869	G	6	6	62243	62248	0 %	0 %	100 %	0 %	10803608
1099	NC_001869	CAG	2	6	62409	62414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803609
1100	NC_001869	CGA	2	6	62457	62462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803609
1101	NC_001869	GAA	2	6	62486	62491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803609
1102	NC_001869	AGT	2	6	62546	62551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803609
1103	NC_001869	CAG	2	6	62600	62605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803609
1104	NC_001869	AAC	2	6	62624	62629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803609
1105	NC_001869	CGG	2	6	62640	62645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803609
1106	NC_001869	TCAC	2	8	62697	62704	25 %	25 %	0 %	50 %	10803609
1107	NC_001869	TAC	2	6	62759	62764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803609
1108	NC_001869	TAC	2	6	62780	62785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803609
1109	NC_001869	ACCC	2	8	62787	62794	25 %	0 %	0 %	75 %	10803609
1110	NC_001869	GAGT	2	8	62839	62846	25 %	25 %	50 %	0 %	10803609
1111	NC_001869	AG	3	6	62847	62852	50 %	0 %	50 %	0 %	10803609
1112	NC_001869	CGA	2	6	63317	63322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803610
1113	NC_001869	GGA	2	6	63326	63331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803610
1114	NC_001869	ACGA	2	8	63349	63356	50 %	0 %	25 %	25 %	10803610
1115	NC_001869	GAA	2	6	63360	63365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803610
1116	NC_001869	GAC	2	6	63453	63458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803610
1117	NC_001869	GAC	2	6	63462	63467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803610
1118	NC_001869	CGG	2	6	63482	63487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803610
1119	NC_001869	CGA	2	6	63542	63547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803610
1120	NC_001869	TGT	2	6	63570	63575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803610
1121	NC_001869	CGA	2	6	63596	63601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803610
1122	NC_001869	TCG	2	6	63625	63630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803610
1123	NC_001869	ACT	2	6	63679	63684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803610
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1125	NC_001869	GC	3	6	63884	63889	0 %	0 %	50 %	50 %	10803610
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