MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 31788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	16271977
2	NC_000907	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271977
3	NC_000907	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
4	NC_000907	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
5	NC_000907	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	16271977
6	NC_000907	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	16271977
7	NC_000907	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16271977
8	NC_000907	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271977
9	NC_000907	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
10	NC_000907	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	16271977
11	NC_000907	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271977
12	NC_000907	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271977
13	NC_000907	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
14	NC_000907	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271977
15	NC_000907	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
16	NC_000907	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
17	NC_000907	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	16271977
18	NC_000907	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
19	NC_000907	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16271977
20	NC_000907	CAA	3	9	1247	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
21	NC_000907	TCAA	2	8	1344	1351	50 %	25 %	0 %	25 %	16271978
22	NC_000907	TTGC	2	8	1364	1371	0 %	50 %	25 %	25 %	16271978
23	NC_000907	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
24	NC_000907	AGCA	2	8	1500	1507	50 %	0 %	25 %	25 %	16271978
25	NC_000907	TCG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
26	NC_000907	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
27	NC_000907	A	6	6	1608	1613	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
28	NC_000907	CCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
29	NC_000907	ACA	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
30	NC_000907	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
31	NC_000907	CAA	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
32	NC_000907	ATTT	2	8	1746	1753	25 %	75 %	0 %	0 %	16271978
33	NC_000907	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
34	NC_000907	CTTT	2	8	1877	1884	0 %	75 %	0 %	25 %	16271978
35	NC_000907	T	6	6	1882	1887	0 %	100 %	0 %	0 %	16271978
36	NC_000907	TC	3	6	1893	1898	0 %	50 %	0 %	50 %	16271978
37	NC_000907	GGC	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271978
38	NC_000907	TTC	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271978
39	NC_000907	AGA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
40	NC_000907	A	6	6	2037	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
41	NC_000907	TGC	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
42	NC_000907	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
43	NC_000907	ATT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
44	NC_000907	G	6	6	2230	2235	0 %	0 %	100 %	0 %	16271978
45	NC_000907	ATG	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
46	NC_000907	GGA	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16271978
47	NC_000907	AAC	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
48	NC_000907	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
49	NC_000907	TGA	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
50	NC_000907	AAG	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
51	NC_000907	AGA	2	6	2491	2496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
52	NC_000907	ATTT	2	8	2568	2575	25 %	75 %	0 %	0 %	16271978
53	NC_000907	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	16271978
54	NC_000907	CAC	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
55	NC_000907	AT	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	16271978
56	NC_000907	ATC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
57	NC_000907	A	6	6	2699	2704	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
58	NC_000907	GAA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
59	NC_000907	ACT	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
60	NC_000907	A	6	6	2797	2802	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
61	NC_000907	A	7	7	2875	2881	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
62	NC_000907	GCAA	2	8	2973	2980	50 %	0 %	25 %	25 %	16271978
63	NC_000907	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
64	NC_000907	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
65	NC_000907	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
66	NC_000907	ATT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
67	NC_000907	AAT	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
68	NC_000907	A	6	6	3252	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	16271979
69	NC_000907	CGCAC	2	10	3258	3267	20 %	0 %	20 %	60 %	16271979
70	NC_000907	A	6	6	3300	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	16271979
71	NC_000907	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
72	NC_000907	AAT	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
73	NC_000907	TCA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
74	NC_000907	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	16271979
75	NC_000907	CG	3	6	3493	3498	0 %	0 %	50 %	50 %	16271979
76	NC_000907	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
77	NC_000907	TAA	2	6	3519	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
78	NC_000907	CAC	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271979
79	NC_000907	CAA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271979
80	NC_000907	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
81	NC_000907	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
82	NC_000907	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
83	NC_000907	ATT	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271980
84	NC_000907	ATC	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271980
85	NC_000907	TTC	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271980
86	NC_000907	GAC	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271980
87	NC_000907	ATTCT	2	10	4317	4326	20 %	60 %	0 %	20 %	16271980
88	NC_000907	TTTCCT	2	12	4613	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271981
89	NC_000907	T	6	6	4731	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	16271981
90	NC_000907	CTCG	2	8	4751	4758	0 %	25 %	25 %	50 %	16271981
91	NC_000907	TAAAA	2	10	4768	4777	80 %	20 %	0 %	0 %	16271981
92	NC_000907	CCAA	2	8	4804	4811	50 %	0 %	0 %	50 %	16271981
93	NC_000907	T	7	7	4928	4934	0 %	100 %	0 %	0 %	16271981
94	NC_000907	TA	3	6	5007	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	16271981
95	NC_000907	ACG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271981
96	NC_000907	ACA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271981
97	NC_000907	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271981
98	NC_000907	CAT	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271981
99	NC_000907	TA	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	16271981
100	NC_000907	TTG	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271981
101	NC_000907	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	16271981
102	NC_000907	A	6	6	5356	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	16271981
103	NC_000907	ATA	2	6	8745	8750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271982
104	NC_000907	TTA	2	6	8787	8792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271982
105	NC_000907	CAC	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271982
106	NC_000907	GA	3	6	8833	8838	50 %	0 %	50 %	0 %	16271982
107	NC_000907	AATT	2	8	8859	8866	50 %	50 %	0 %	0 %	16271982
108	NC_000907	GTT	2	6	8907	8912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271982
109	NC_000907	GAA	2	6	9023	9028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
110	NC_000907	TGCAC	2	10	9069	9078	20 %	20 %	20 %	40 %	16271982
111	NC_000907	GTT	2	6	9087	9092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271982
112	NC_000907	TATTG	2	10	9179	9188	20 %	60 %	20 %	0 %	16271982
113	NC_000907	GAAT	2	8	9213	9220	50 %	25 %	25 %	0 %	16271982
114	NC_000907	AGA	2	6	9334	9339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
115	NC_000907	AAC	2	6	9357	9362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271982
116	NC_000907	TCC	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16271982
117	NC_000907	AC	3	6	9431	9436	50 %	0 %	0 %	50 %	16271982
118	NC_000907	ATGT	2	8	9440	9447	25 %	50 %	25 %	0 %	16271982
119	NC_000907	TCTAGC	2	12	9568	9579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16271982
120	NC_000907	ACT	2	6	9591	9596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271982
121	NC_000907	AGA	3	9	9616	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
122	NC_000907	ATC	3	9	9633	9641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271982
123	NC_000907	GAA	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271982
124	NC_000907	AAT	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271982
125	NC_000907	T	6	6	9768	9773	0 %	100 %	0 %	0 %	16271983
126	NC_000907	TTC	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271983
127	NC_000907	GC	4	8	9852	9859	0 %	0 %	50 %	50 %	16271983
128	NC_000907	TTC	2	6	9888	9893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271983
129	NC_000907	A	7	7	9940	9946	100 %	0 %	0 %	0 %	16271983
130	NC_000907	A	6	6	10033	10038	100 %	0 %	0 %	0 %	16271983
131	NC_000907	TTA	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271983
132	NC_000907	CAT	2	6	10088	10093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271983
133	NC_000907	AT	5	10	10201	10210	50 %	50 %	0 %	0 %	16271983
134	NC_000907	TTG	2	6	10243	10248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271983
135	NC_000907	CGTT	2	8	10262	10269	0 %	50 %	25 %	25 %	16271983
136	NC_000907	A	6	6	10275	10280	100 %	0 %	0 %	0 %	16271983
137	NC_000907	CAC	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271983
138	NC_000907	GAA	2	6	10302	10307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271983
139	NC_000907	ATC	2	6	10600	10605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271984
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141	NC_000907	TAT	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271984
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