MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022130	CCGCTC	2	12	168891	168902	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	532530644
3502	NC_022130	TCT	2	6	169103	169108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530644
3503	NC_022130	CTT	2	6	169125	169130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530644
3504	NC_022130	ATA	2	6	169210	169215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530644
3505	NC_022130	GCT	2	6	169216	169221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530644
3506	NC_022130	ATG	2	6	169244	169249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530644
3507	NC_022130	CATC	2	8	169305	169312	25 %	25 %	0 %	50 %	532530644
3508	NC_022130	T	6	6	169489	169494	0 %	100 %	0 %	0 %	532530644
3509	NC_022130	TC	4	8	169497	169504	0 %	50 %	0 %	50 %	532530644
3510	NC_022130	CAA	2	6	169515	169520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530644
3511	NC_022130	TTTA	2	8	169528	169535	25 %	75 %	0 %	0 %	532530644
3512	NC_022130	ATC	2	6	169690	169695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530644
3513	NC_022130	G	6	6	169713	169718	0 %	0 %	100 %	0 %	532530644
3514	NC_022130	TC	3	6	169748	169753	0 %	50 %	0 %	50 %	532530644
3515	NC_022130	TCT	2	6	169786	169791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530644
3516	NC_022130	TAT	2	6	169817	169822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_022130	CTTT	2	8	169826	169833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_022130	T	7	7	169849	169855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_022130	TTTC	2	8	169857	169864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_022130	T	7	7	169886	169892	0 %	100 %	0 %	0 %	532530645
3521	NC_022130	G	13	13	169894	169906	0 %	0 %	100 %	0 %	532530645
3522	NC_022130	CTT	2	6	169913	169918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530645
3523	NC_022130	CAT	2	6	169919	169924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530645
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3525	NC_022130	TCT	2	6	170116	170121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530645
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3528	NC_022130	T	6	6	170221	170226	0 %	100 %	0 %	0 %	532530645
3529	NC_022130	AAT	2	6	170259	170264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530645
3530	NC_022130	CTTT	2	8	170293	170300	0 %	75 %	0 %	25 %	532530645
3531	NC_022130	ATCA	2	8	170307	170314	50 %	25 %	0 %	25 %	532530645
3532	NC_022130	T	6	6	170321	170326	0 %	100 %	0 %	0 %	532530645
3533	NC_022130	ATCA	2	8	170334	170341	50 %	25 %	0 %	25 %	532530645
3534	NC_022130	TTC	2	6	170469	170474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530645
3535	NC_022130	CATG	2	8	170525	170532	25 %	25 %	25 %	25 %	532530645
3536	NC_022130	ATTC	2	8	170558	170565	25 %	50 %	0 %	25 %	532530645
3537	NC_022130	T	6	6	170576	170581	0 %	100 %	0 %	0 %	532530645
3538	NC_022130	TGCT	2	8	170629	170636	0 %	50 %	25 %	25 %	532530645
3539	NC_022130	CT	3	6	170691	170696	0 %	50 %	0 %	50 %	532530645
3540	NC_022130	CAA	3	9	170742	170750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530645
3541	NC_022130	AAT	2	6	170771	170776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530645
3542	NC_022130	T	6	6	170827	170832	0 %	100 %	0 %	0 %	532530645
3543	NC_022130	TGG	2	6	170899	170904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530645
3544	NC_022130	A	6	6	171147	171152	100 %	0 %	0 %	0 %	532530645
3545	NC_022130	CTC	2	6	171178	171183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_022130	GAT	2	6	171227	171232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530646
3547	NC_022130	AT	3	6	171231	171236	50 %	50 %	0 %	0 %	532530646
3548	NC_022130	T	7	7	171252	171258	0 %	100 %	0 %	0 %	532530646
3549	NC_022130	AAT	2	6	171281	171286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530646
3550	NC_022130	TTA	2	6	171300	171305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530646
3551	NC_022130	GCTCTC	2	12	171323	171334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532530646
3552	NC_022130	T	6	6	171368	171373	0 %	100 %	0 %	0 %	532530646
3553	NC_022130	TAA	2	6	171376	171381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530646
3554	NC_022130	T	7	7	171423	171429	0 %	100 %	0 %	0 %	532530646
3555	NC_022130	CTCA	2	8	171488	171495	25 %	25 %	0 %	50 %	532530646
3556	NC_022130	CTT	3	9	171496	171504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530646
3557	NC_022130	T	6	6	171503	171508	0 %	100 %	0 %	0 %	532530646
3558	NC_022130	TAA	2	6	171542	171547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530646
3559	NC_022130	ATC	2	6	171578	171583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530646
3560	NC_022130	ATCTT	2	10	171606	171615	20 %	60 %	0 %	20 %	532530646
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3564	NC_022130	TTTG	2	8	171658	171665	0 %	75 %	25 %	0 %	532530646
3565	NC_022130	CAA	4	12	171716	171727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530646
3566	NC_022130	TG	3	6	171738	171743	0 %	50 %	50 %	0 %	532530646
3567	NC_022130	ATC	2	6	171839	171844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530646
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3569	NC_022130	AAT	2	6	171887	171892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_022130	TTA	2	6	171952	171957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_022130	TAAAAA	2	12	171981	171992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_022130	TTA	2	6	172011	172016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_022130	A	6	6	172048	172053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3576	NC_022130	GAT	2	6	172123	172128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_022130	GCTA	2	8	172184	172191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_022130	A	6	6	172194	172199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_022130	A	8	8	172215	172222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_022130	ATA	2	6	172237	172242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_022130	ATCA	2	8	172253	172260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_022130	AG	3	6	172264	172269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_022130	TA	3	6	172290	172295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_022130	TAG	2	6	172315	172320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_022130	A	7	7	172695	172701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_022130	TCT	2	6	172797	172802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3597	NC_022130	T	6	6	172837	172842	0 %	100 %	0 %	0 %	532530648
3598	NC_022130	A	7	7	172905	172911	100 %	0 %	0 %	0 %	532530648
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3606	NC_022130	T	8	8	173167	173174	0 %	100 %	0 %	0 %	532530649
3607	NC_022130	CTT	2	6	173200	173205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530649
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3609	NC_022130	GCGA	2	8	173231	173238	25 %	0 %	50 %	25 %	532530649
3610	NC_022130	TC	3	6	173266	173271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_022130	A	6	6	173327	173332	100 %	0 %	0 %	0 %	532530650
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3615	NC_022130	A	7	7	173557	173563	100 %	0 %	0 %	0 %	532530650
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3620	NC_022130	GA	3	6	173867	173872	50 %	0 %	50 %	0 %	532530650
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3629	NC_022130	ATA	2	6	174287	174292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530650
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3633	NC_022130	T	7	7	174529	174535	0 %	100 %	0 %	0 %	532530650
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3742	NC_022130	TCT	2	6	179453	179458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3743	NC_022130	TTCTTT	2	12	179465	179476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3744	NC_022130	TAAC	2	8	179489	179496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3745	NC_022130	T	6	6	179541	179546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3746	NC_022130	A	8	8	179664	179671	100 %	0 %	0 %	0 %	532530656
3747	NC_022130	ATTTTG	2	12	179857	179868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532530656
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3750	NC_022130	CGCAC	2	10	179916	179925	20 %	0 %	20 %	60 %	532530656
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