MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022130	TAAA	2	8	143332	143339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_022130	TTG	2	6	143466	143471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_022130	CT	3	6	143578	143583	0 %	50 %	0 %	50 %	532530615
3004	NC_022130	T	6	6	143736	143741	0 %	100 %	0 %	0 %	532530615
3005	NC_022130	TGA	2	6	143783	143788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530615
3006	NC_022130	ACG	2	6	143827	143832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530615
3007	NC_022130	TTTTC	2	10	143840	143849	0 %	80 %	0 %	20 %	532530615
3008	NC_022130	ACA	2	6	143924	143929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530615
3009	NC_022130	T	6	6	143934	143939	0 %	100 %	0 %	0 %	532530615
3010	NC_022130	T	6	6	143980	143985	0 %	100 %	0 %	0 %	532530615
3011	NC_022130	TAG	2	6	144040	144045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530616
3012	NC_022130	T	6	6	144169	144174	0 %	100 %	0 %	0 %	532530616
3013	NC_022130	T	6	6	144216	144221	0 %	100 %	0 %	0 %	532530616
3014	NC_022130	GAA	2	6	144277	144282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530616
3015	NC_022130	TTC	2	6	144354	144359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530616
3016	NC_022130	CAAATC	2	12	144423	144434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532530616
3017	NC_022130	T	6	6	144449	144454	0 %	100 %	0 %	0 %	532530616
3018	NC_022130	TTC	2	6	144555	144560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530616
3019	NC_022130	CTT	2	6	144638	144643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530616
3020	NC_022130	TGCA	2	8	144703	144710	25 %	25 %	25 %	25 %	532530617
3021	NC_022130	TCGC	2	8	144842	144849	0 %	25 %	25 %	50 %	532530617
3022	NC_022130	TGT	2	6	144893	144898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530617
3023	NC_022130	TAA	2	6	144960	144965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530617
3024	NC_022130	ATT	2	6	145045	145050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530617
3025	NC_022130	G	6	6	145065	145070	0 %	0 %	100 %	0 %	532530617
3026	NC_022130	ACC	2	6	145073	145078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530617
3027	NC_022130	ATA	2	6	145186	145191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530617
3028	NC_022130	TCA	2	6	145196	145201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530617
3029	NC_022130	AAT	2	6	145234	145239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530617
3030	NC_022130	CTT	2	6	145245	145250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530617
3031	NC_022130	TCG	2	6	145265	145270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530617
3032	NC_022130	T	6	6	145271	145276	0 %	100 %	0 %	0 %	532530617
3033	NC_022130	CAT	2	6	145359	145364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530617
3034	NC_022130	CTA	2	6	145374	145379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530617
3035	NC_022130	GGT	2	6	145420	145425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530617
3036	NC_022130	TAGCGA	2	12	145476	145487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532530617
3037	NC_022130	CTT	2	6	145572	145577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530617
3038	NC_022130	GCG	2	6	145583	145588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530617
3039	NC_022130	TTC	2	6	145597	145602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530617
3040	NC_022130	TTTG	2	8	145617	145624	0 %	75 %	25 %	0 %	532530617
3041	NC_022130	ATGG	2	8	145633	145640	25 %	25 %	50 %	0 %	532530617
3042	NC_022130	TCGC	2	8	145757	145764	0 %	25 %	25 %	50 %	532530617
3043	NC_022130	TTCTT	2	10	145796	145805	0 %	80 %	0 %	20 %	532530617
3044	NC_022130	T	7	7	145883	145889	0 %	100 %	0 %	0 %	532530617
3045	NC_022130	TCA	2	6	145907	145912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530617
3046	NC_022130	TGA	2	6	146070	146075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530617
3047	NC_022130	TTC	2	6	146077	146082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530617
3048	NC_022130	ATT	2	6	146114	146119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_022130	TTTG	2	8	146182	146189	0 %	75 %	25 %	0 %	532530618
3050	NC_022130	T	6	6	146198	146203	0 %	100 %	0 %	0 %	532530618
3051	NC_022130	TCA	2	6	146222	146227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530618
3052	NC_022130	TCTTT	2	10	146285	146294	0 %	80 %	0 %	20 %	532530618
3053	NC_022130	C	6	6	146337	146342	0 %	0 %	0 %	100 %	532530618
3054	NC_022130	CTT	3	9	146357	146365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530618
3055	NC_022130	TGA	2	6	146402	146407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530618
3056	NC_022130	ACTTG	2	10	146498	146507	20 %	40 %	20 %	20 %	532530618
3057	NC_022130	T	6	6	146511	146516	0 %	100 %	0 %	0 %	532530618
3058	NC_022130	AAT	2	6	146600	146605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530618
3059	NC_022130	CAT	2	6	146613	146618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530618
3060	NC_022130	AAT	2	6	146643	146648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530618
3061	NC_022130	GTT	2	6	146658	146663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530618
3062	NC_022130	T	6	6	146694	146699	0 %	100 %	0 %	0 %	532530618
3063	NC_022130	TGGC	2	8	146730	146737	0 %	25 %	50 %	25 %	532530618
3064	NC_022130	T	6	6	146754	146759	0 %	100 %	0 %	0 %	532530618
3065	NC_022130	T	6	6	147033	147038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_022130	TAAG	2	8	147043	147050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_022130	A	7	7	147053	147059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_022130	ATT	2	6	147068	147073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_022130	T	6	6	147164	147169	0 %	100 %	0 %	0 %	532530619
3070	NC_022130	ATT	2	6	147236	147241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530619
3071	NC_022130	T	6	6	147286	147291	0 %	100 %	0 %	0 %	532530619
3072	NC_022130	CTTT	2	8	147298	147305	0 %	75 %	0 %	25 %	532530619
3073	NC_022130	AAAG	2	8	147392	147399	75 %	0 %	25 %	0 %	532530619
3074	NC_022130	ATC	2	6	147420	147425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530619
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3076	NC_022130	GCG	2	6	147509	147514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530619
3077	NC_022130	TAG	2	6	147519	147524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530619
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3081	NC_022130	T	6	6	147703	147708	0 %	100 %	0 %	0 %	532530619
3082	NC_022130	ATGG	2	8	147722	147729	25 %	25 %	50 %	0 %	532530619
3083	NC_022130	CGG	2	6	147756	147761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530619
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3087	NC_022130	CGTGG	2	10	147967	147976	0 %	20 %	60 %	20 %	532530619
3088	NC_022130	AAG	2	6	148044	148049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530619
3089	NC_022130	TTG	2	6	148223	148228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530619
3090	NC_022130	GCGAT	2	10	148242	148251	20 %	20 %	40 %	20 %	532530619
3091	NC_022130	CTTT	2	8	148395	148402	0 %	75 %	0 %	25 %	532530619
3092	NC_022130	TGT	2	6	148408	148413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530619
3093	NC_022130	GGCT	2	8	148415	148422	0 %	25 %	50 %	25 %	532530619
3094	NC_022130	GCTTG	2	10	148498	148507	0 %	40 %	40 %	20 %	532530619
3095	NC_022130	TATCGC	2	12	148576	148587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532530619
3096	NC_022130	AG	3	6	148615	148620	50 %	0 %	50 %	0 %	532530619
3097	NC_022130	TAT	2	6	148711	148716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530619
3098	NC_022130	T	6	6	148763	148768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_022130	TCA	2	6	148793	148798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530620
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3101	NC_022130	T	6	6	148910	148915	0 %	100 %	0 %	0 %	532530620
3102	NC_022130	ATT	2	6	148935	148940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530620
3103	NC_022130	CTTT	2	8	148985	148992	0 %	75 %	0 %	25 %	532530620
3104	NC_022130	ATC	2	6	149028	149033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530620
3105	NC_022130	GCG	2	6	149037	149042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530620
3106	NC_022130	T	7	7	149044	149050	0 %	100 %	0 %	0 %	532530620
3107	NC_022130	AAAG	2	8	149091	149098	75 %	0 %	25 %	0 %	532530620
3108	NC_022130	TTTTG	2	10	149148	149157	0 %	80 %	20 %	0 %	532530620
3109	NC_022130	CTG	2	6	149206	149211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530620
3110	NC_022130	T	6	6	149379	149384	0 %	100 %	0 %	0 %	532530620
3111	NC_022130	TTTC	2	8	149476	149483	0 %	75 %	0 %	25 %	532530620
3112	NC_022130	ATT	2	6	149509	149514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530620
3113	NC_022130	CAT	2	6	149534	149539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530620
3114	NC_022130	CAT	2	6	149626	149631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530620
3115	NC_022130	T	7	7	149723	149729	0 %	100 %	0 %	0 %	532530620
3116	NC_022130	TTTG	2	8	149735	149742	0 %	75 %	25 %	0 %	532530620
3117	NC_022130	TTG	2	6	149754	149759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530620
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3119	NC_022130	GGCTT	2	10	150087	150096	0 %	40 %	40 %	20 %	532530620
3120	NC_022130	T	6	6	150101	150106	0 %	100 %	0 %	0 %	532530620
3121	NC_022130	TGGG	2	8	150119	150126	0 %	25 %	75 %	0 %	532530620
3122	NC_022130	CAA	2	6	150183	150188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530620
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3124	NC_022130	GTGG	2	8	150243	150250	0 %	25 %	75 %	0 %	532530620
3125	NC_022130	GAT	2	6	150263	150268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530620
3126	NC_022130	ATCGCT	2	12	150282	150293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532530620
3127	NC_022130	GCG	2	6	150297	150302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532530620
3128	NC_022130	GAAA	2	8	150317	150324	75 %	0 %	25 %	0 %	532530620
3129	NC_022130	GTG	2	6	150417	150422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530620
3130	NC_022130	TAA	2	6	150562	150567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530621
3131	NC_022130	A	6	6	150619	150624	100 %	0 %	0 %	0 %	532530622
3132	NC_022130	T	6	6	150697	150702	0 %	100 %	0 %	0 %	532530622
3133	NC_022130	TTTC	2	8	150800	150807	0 %	75 %	0 %	25 %	532530622
3134	NC_022130	ATG	2	6	150819	150824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530622
3135	NC_022130	T	6	6	150851	150856	0 %	100 %	0 %	0 %	532530622
3136	NC_022130	GTT	2	6	150870	150875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530622
3137	NC_022130	CTT	2	6	150902	150907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530622
3138	NC_022130	T	6	6	150921	150926	0 %	100 %	0 %	0 %	532530622
3139	NC_022130	GT	3	6	150934	150939	0 %	50 %	50 %	0 %	532530622
3140	NC_022130	GTT	2	6	150948	150953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530622
3141	NC_022130	ATTC	2	8	151073	151080	25 %	50 %	0 %	25 %	532530622
3142	NC_022130	T	8	8	151298	151305	0 %	100 %	0 %	0 %	532530622
3143	NC_022130	AAT	2	6	151322	151327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530622
3144	NC_022130	CCT	2	6	151355	151360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532530622
3145	NC_022130	A	6	6	151405	151410	100 %	0 %	0 %	0 %	532530622
3146	NC_022130	TCA	2	6	151457	151462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530622
3147	NC_022130	TTC	2	6	151536	151541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_022130	ACC	2	6	151583	151588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530623
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3152	NC_022130	A	7	7	151869	151875	100 %	0 %	0 %	0 %	532530623
3153	NC_022130	ATAA	2	8	151883	151890	75 %	25 %	0 %	0 %	532530623
3154	NC_022130	CAA	2	6	151905	151910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530623
3155	NC_022130	A	6	6	151945	151950	100 %	0 %	0 %	0 %	532530623
3156	NC_022130	A	7	7	152032	152038	100 %	0 %	0 %	0 %	532530623
3157	NC_022130	ATG	2	6	152062	152067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530623
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3169	NC_022130	A	6	6	152988	152993	100 %	0 %	0 %	0 %	532530623
3170	NC_022130	T	6	6	153018	153023	0 %	100 %	0 %	0 %	532530623
3171	NC_022130	GTA	3	9	153046	153054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_022130	TTA	2	6	153090	153095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_022130	TTG	2	6	153165	153170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_022130	TAC	2	6	153175	153180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3175	NC_022130	TGCA	2	8	153193	153200	25 %	25 %	25 %	25 %	532530624
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3178	NC_022130	TAT	2	6	153430	153435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530624
3179	NC_022130	ACC	2	6	153464	153469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530624
3180	NC_022130	TTA	2	6	153539	153544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530624
3181	NC_022130	ATT	2	6	153604	153609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530624
3182	NC_022130	G	6	6	153632	153637	0 %	0 %	100 %	0 %	532530624
3183	NC_022130	GA	3	6	153666	153671	50 %	0 %	50 %	0 %	532530624
3184	NC_022130	AT	3	6	153679	153684	50 %	50 %	0 %	0 %	532530624
3185	NC_022130	TAT	2	6	153697	153702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530624
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3188	NC_022130	TGG	3	9	153838	153846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532530624
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3192	NC_022130	TGTT	2	8	153974	153981	0 %	75 %	25 %	0 %	532530624
3193	NC_022130	CAC	2	6	154000	154005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530624
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3200	NC_022130	AG	3	6	154345	154350	50 %	0 %	50 %	0 %	532530624
3201	NC_022130	GAT	2	6	154449	154454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530624
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3203	NC_022130	TAT	2	6	154572	154577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530624
3204	NC_022130	ACGCC	2	10	154640	154649	20 %	0 %	20 %	60 %	532530624
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3217	NC_022130	AGA	2	6	155222	155227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530625
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3219	NC_022130	GA	3	6	155280	155285	50 %	0 %	50 %	0 %	532530625
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3222	NC_022130	A	8	8	155480	155487	100 %	0 %	0 %	0 %	532530626
3223	NC_022130	ATG	2	6	155528	155533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530626
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3229	NC_022130	TGAT	2	8	155748	155755	25 %	50 %	25 %	0 %	532530627
3230	NC_022130	AAT	2	6	155774	155779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530627
3231	NC_022130	TG	3	6	155818	155823	0 %	50 %	50 %	0 %	532530627
3232	NC_022130	T	6	6	155836	155841	0 %	100 %	0 %	0 %	532530627
3233	NC_022130	AGC	2	6	155858	155863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530627
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3238	NC_022130	CCT	2	6	156125	156130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532530627
3239	NC_022130	TG	3	6	156257	156262	0 %	50 %	50 %	0 %	532530627
3240	NC_022130	T	6	6	156343	156348	0 %	100 %	0 %	0 %	532530627
3241	NC_022130	CAT	2	6	156396	156401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530627
3242	NC_022130	AGA	2	6	156472	156477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530627
3243	NC_022130	TG	4	8	156544	156551	0 %	50 %	50 %	0 %	532530628
3244	NC_022130	CCA	2	6	156598	156603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530628
3245	NC_022130	ATT	2	6	156604	156609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530628
3246	NC_022130	TCAA	2	8	156676	156683	50 %	25 %	0 %	25 %	532530628
3247	NC_022130	TGG	2	6	156732	156737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_022130	ATT	3	9	156758	156766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_022130	TTGTTT	2	12	156782	156793	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_022130	TAA	2	6	156864	156869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530629
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