MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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24121	NC_022130	AAT	2	6	1150223	1150228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24122	NC_022130	CTT	2	6	1150267	1150272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531659
24123	NC_022130	CT	3	6	1150299	1150304	0 %	50 %	0 %	50 %	532531659
24124	NC_022130	CGC	2	6	1150308	1150313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532531659
24125	NC_022130	CACACC	2	12	1150342	1150353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531659
24126	NC_022130	ATA	2	6	1150494	1150499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531659
24127	NC_022130	CAC	2	6	1150533	1150538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531659
24128	NC_022130	T	6	6	1150566	1150571	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24129	NC_022130	TTC	2	6	1150575	1150580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531659
24130	NC_022130	GTT	2	6	1150649	1150654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531659
24131	NC_022130	CTTT	2	8	1150671	1150678	0 %	75 %	0 %	25 %	532531659
24132	NC_022130	CTT	2	6	1150718	1150723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531659
24133	NC_022130	GCT	2	6	1150724	1150729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531659
24134	NC_022130	T	7	7	1150744	1150750	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24135	NC_022130	T	6	6	1150769	1150774	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24136	NC_022130	T	8	8	1150803	1150810	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24137	NC_022130	CTT	2	6	1150874	1150879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531659
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24140	NC_022130	A	6	6	1150957	1150962	100 %	0 %	0 %	0 %	532531659
24141	NC_022130	T	6	6	1150966	1150971	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24142	NC_022130	CTT	2	6	1150976	1150981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531659
24143	NC_022130	CAT	2	6	1151036	1151041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531659
24144	NC_022130	CTT	2	6	1151084	1151089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531659
24145	NC_022130	T	6	6	1151129	1151134	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24146	NC_022130	T	6	6	1151291	1151296	0 %	100 %	0 %	0 %	532531659
24147	NC_022130	TAA	2	6	1151305	1151310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531659
24148	NC_022130	A	7	7	1151392	1151398	100 %	0 %	0 %	0 %	532531659
24149	NC_022130	GAT	2	6	1151402	1151407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531659
24150	NC_022130	TAAA	2	8	1151415	1151422	75 %	25 %	0 %	0 %	532531659
24151	NC_022130	AAAATT	2	12	1151448	1151459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531659
24152	NC_022130	A	6	6	1151572	1151577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24153	NC_022130	TAAAA	2	10	1151661	1151670	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24154	NC_022130	CTT	2	6	1151710	1151715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24155	NC_022130	TAA	2	6	1151728	1151733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24156	NC_022130	AT	3	6	1151765	1151770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24157	NC_022130	CA	3	6	1151815	1151820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24158	NC_022130	TTTCAT	2	12	1151872	1151883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24159	NC_022130	ATCTT	2	10	1151904	1151913	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24160	NC_022130	TCAAGC	2	12	1151927	1151938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24161	NC_022130	TTC	2	6	1151978	1151983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24162	NC_022130	TTC	2	6	1151987	1151992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24163	NC_022130	ATG	2	6	1152006	1152011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24164	NC_022130	GTTT	2	8	1152022	1152029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24165	NC_022130	TTCG	2	8	1152093	1152100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24166	NC_022130	ACT	2	6	1152102	1152107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24168	NC_022130	CT	3	6	1152256	1152261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24169	NC_022130	ATTA	2	8	1152299	1152306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24170	NC_022130	A	6	6	1152324	1152329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24171	NC_022130	A	6	6	1152354	1152359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24172	NC_022130	CAAA	2	8	1152368	1152375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24173	NC_022130	AAAACC	2	12	1152378	1152389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24174	NC_022130	A	7	7	1152400	1152406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24175	NC_022130	AAC	2	6	1152409	1152414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24176	NC_022130	AGCA	2	8	1152436	1152443	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24177	NC_022130	A	6	6	1152467	1152472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24178	NC_022130	AGAA	2	8	1152483	1152490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24179	NC_022130	CAA	2	6	1152515	1152520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24180	NC_022130	TAA	2	6	1152555	1152560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24181	NC_022130	AGG	2	6	1152588	1152593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24182	NC_022130	TG	4	8	1152649	1152656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24183	NC_022130	GT	3	6	1152892	1152897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24184	NC_022130	ATG	2	6	1152917	1152922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24185	NC_022130	CGT	2	6	1152929	1152934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24186	NC_022130	TCC	3	9	1152943	1152951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24187	NC_022130	CACGA	2	10	1153043	1153052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24188	NC_022130	GAC	2	6	1153056	1153061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24189	NC_022130	GCA	2	6	1153068	1153073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24190	NC_022130	TC	3	6	1153123	1153128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24191	NC_022130	TTC	2	6	1153149	1153154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24192	NC_022130	GA	3	6	1153277	1153282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24193	NC_022130	CAA	2	6	1153293	1153298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24194	NC_022130	CATC	2	8	1153303	1153310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24195	NC_022130	CAG	2	6	1153388	1153393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24196	NC_022130	ACCT	2	8	1153457	1153464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24197	NC_022130	TAG	2	6	1153481	1153486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24198	NC_022130	CTGA	2	8	1153528	1153535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24199	NC_022130	GCT	2	6	1153604	1153609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24200	NC_022130	TCT	2	6	1153653	1153658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24201	NC_022130	TCC	2	6	1153693	1153698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24202	NC_022130	TGC	2	6	1153708	1153713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24203	NC_022130	CTG	2	6	1153747	1153752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24204	NC_022130	GT	3	6	1153788	1153793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24205	NC_022130	TTACC	2	10	1153841	1153850	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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24209	NC_022130	TAT	3	9	1154126	1154134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24210	NC_022130	ACA	3	9	1154213	1154221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24211	NC_022130	AGAA	2	8	1154226	1154233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24212	NC_022130	CAT	2	6	1154316	1154321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24214	NC_022130	CTT	2	6	1154434	1154439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24217	NC_022130	ATA	2	6	1154705	1154710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24220	NC_022130	GTT	2	6	1154836	1154841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24221	NC_022130	TTCTTT	2	12	1154864	1154875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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24223	NC_022130	CT	3	6	1154926	1154931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24224	NC_022130	CTT	2	6	1154944	1154949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24225	NC_022130	CTTT	2	8	1154975	1154982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24226	NC_022130	ATC	2	6	1155013	1155018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24227	NC_022130	GTA	2	6	1155088	1155093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531661
24228	NC_022130	CCCG	2	8	1155225	1155232	0 %	0 %	25 %	75 %	532531661
24229	NC_022130	TTG	2	6	1155253	1155258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531661
24230	NC_022130	TCT	2	6	1155306	1155311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531661
24231	NC_022130	AACG	2	8	1155447	1155454	50 %	0 %	25 %	25 %	532531661
24232	NC_022130	GCT	2	6	1155469	1155474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531661
24233	NC_022130	GTT	2	6	1155479	1155484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531661
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24235	NC_022130	T	6	6	1155586	1155591	0 %	100 %	0 %	0 %	532531661
24236	NC_022130	A	6	6	1155684	1155689	100 %	0 %	0 %	0 %	532531662
24237	NC_022130	GTTCT	2	10	1155695	1155704	0 %	60 %	20 %	20 %	532531662
24238	NC_022130	TTTC	2	8	1155737	1155744	0 %	75 %	0 %	25 %	532531662
24239	NC_022130	T	6	6	1155746	1155751	0 %	100 %	0 %	0 %	532531662
24240	NC_022130	TTTGT	2	10	1155758	1155767	0 %	80 %	20 %	0 %	532531662
24241	NC_022130	G	6	6	1155781	1155786	0 %	0 %	100 %	0 %	532531662
24242	NC_022130	T	7	7	1155840	1155846	0 %	100 %	0 %	0 %	532531662
24243	NC_022130	TTA	2	6	1155853	1155858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531662
24244	NC_022130	A	6	6	1155894	1155899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24245	NC_022130	CAAC	2	8	1155926	1155933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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24247	NC_022130	A	6	6	1155982	1155987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24392	NC_022130	AGA	2	6	1162807	1162812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24483	NC_022130	ACA	2	6	1167313	1167318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531674
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24489	NC_022130	AAC	2	6	1167759	1167764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531674
24490	NC_022130	AAT	2	6	1167882	1167887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531674
24491	NC_022130	CTAAA	2	10	1167916	1167925	60 %	20 %	0 %	20 %	532531674
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