MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_022130	TAA	2	6	1120937	1120942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23502	NC_022130	AGCGTT	2	12	1121003	1121014	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532531627
23503	NC_022130	GCAT	2	8	1121043	1121050	25 %	25 %	25 %	25 %	532531627
23504	NC_022130	A	6	6	1121069	1121074	100 %	0 %	0 %	0 %	532531627
23505	NC_022130	A	7	7	1121174	1121180	100 %	0 %	0 %	0 %	532531627
23506	NC_022130	GAT	2	6	1121251	1121256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531627
23507	NC_022130	TAA	2	6	1121285	1121290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531627
23508	NC_022130	TTTC	2	8	1121302	1121309	0 %	75 %	0 %	25 %	532531627
23509	NC_022130	ATT	2	6	1121364	1121369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531627
23510	NC_022130	ACG	2	6	1121393	1121398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531627
23511	NC_022130	A	8	8	1121435	1121442	100 %	0 %	0 %	0 %	532531627
23512	NC_022130	A	7	7	1121446	1121452	100 %	0 %	0 %	0 %	532531627
23513	NC_022130	A	6	6	1121495	1121500	100 %	0 %	0 %	0 %	532531627
23514	NC_022130	AAC	2	6	1121553	1121558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531627
23515	NC_022130	A	6	6	1121567	1121572	100 %	0 %	0 %	0 %	532531627
23516	NC_022130	TGA	2	6	1121601	1121606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531627
23517	NC_022130	TCCA	2	8	1121711	1121718	25 %	25 %	0 %	50 %	532531628
23518	NC_022130	CAC	2	6	1121765	1121770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531628
23519	NC_022130	TTA	2	6	1121843	1121848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531628
23520	NC_022130	CCA	2	6	1121919	1121924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531628
23521	NC_022130	TAA	2	6	1121991	1121996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531628
23522	NC_022130	TCA	2	6	1121999	1122004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531628
23523	NC_022130	TTA	2	6	1122008	1122013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23524	NC_022130	GTAA	2	8	1122043	1122050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23525	NC_022130	CAT	2	6	1122117	1122122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531629
23526	NC_022130	T	7	7	1122213	1122219	0 %	100 %	0 %	0 %	532531629
23527	NC_022130	ATT	2	6	1122220	1122225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531629
23528	NC_022130	TC	3	6	1122284	1122289	0 %	50 %	0 %	50 %	532531629
23529	NC_022130	ATT	2	6	1122310	1122315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531629
23530	NC_022130	TCA	2	6	1122332	1122337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531629
23531	NC_022130	TCCT	2	8	1122373	1122380	0 %	50 %	0 %	50 %	532531629
23532	NC_022130	GCTT	2	8	1122407	1122414	0 %	50 %	25 %	25 %	532531629
23533	NC_022130	GCT	2	6	1122452	1122457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531629
23534	NC_022130	CCA	2	6	1122501	1122506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531629
23535	NC_022130	T	6	6	1122613	1122618	0 %	100 %	0 %	0 %	532531629
23536	NC_022130	ATC	2	6	1122661	1122666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531629
23537	NC_022130	CTGT	2	8	1122791	1122798	0 %	50 %	25 %	25 %	532531629
23538	NC_022130	TCATG	2	10	1122882	1122891	20 %	40 %	20 %	20 %	532531629
23539	NC_022130	T	7	7	1122930	1122936	0 %	100 %	0 %	0 %	532531629
23540	NC_022130	A	6	6	1122966	1122971	100 %	0 %	0 %	0 %	532531629
23541	NC_022130	TTG	2	6	1123241	1123246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531629
23542	NC_022130	TAT	2	6	1123254	1123259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531629
23543	NC_022130	GGT	2	6	1123386	1123391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531629
23544	NC_022130	CGT	2	6	1123410	1123415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531629
23545	NC_022130	TTC	2	6	1123498	1123503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531629
23546	NC_022130	TG	3	6	1123523	1123528	0 %	50 %	50 %	0 %	532531629
23547	NC_022130	TC	3	6	1123593	1123598	0 %	50 %	0 %	50 %	532531629
23548	NC_022130	GTTC	2	8	1123599	1123606	0 %	50 %	25 %	25 %	532531629
23549	NC_022130	TCTG	2	8	1123643	1123650	0 %	50 %	25 %	25 %	532531629
23550	NC_022130	CTT	2	6	1123734	1123739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531629
23551	NC_022130	G	6	6	1123839	1123844	0 %	0 %	100 %	0 %	532531629
23552	NC_022130	TAT	2	6	1123962	1123967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23553	NC_022130	TTA	2	6	1124072	1124077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23554	NC_022130	TCT	2	6	1124180	1124185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23555	NC_022130	CA	3	6	1124228	1124233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23556	NC_022130	C	6	6	1124242	1124247	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23557	NC_022130	TCGC	2	8	1124411	1124418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23558	NC_022130	TTA	2	6	1124432	1124437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23559	NC_022130	GTT	2	6	1124461	1124466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23560	NC_022130	T	6	6	1124479	1124484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23561	NC_022130	TC	3	6	1124530	1124535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23562	NC_022130	TTCA	2	8	1124581	1124588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23563	NC_022130	CGCT	2	8	1124781	1124788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23564	NC_022130	GTTT	2	8	1124836	1124843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23565	NC_022130	TATT	2	8	1124857	1124864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23566	NC_022130	T	6	6	1124913	1124918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23567	NC_022130	TAC	2	6	1124952	1124957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23568	NC_022130	GAGC	2	8	1124971	1124978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23569	NC_022130	ACT	2	6	1124998	1125003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23570	NC_022130	A	6	6	1125011	1125016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23571	NC_022130	A	6	6	1125064	1125069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23572	NC_022130	AAGC	2	8	1125101	1125108	50 %	0 %	25 %	25 %	532531630
23573	NC_022130	TTC	2	6	1125185	1125190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531630
23574	NC_022130	AGA	2	6	1125260	1125265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23575	NC_022130	TAA	2	6	1125345	1125350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23576	NC_022130	TA	3	6	1125473	1125478	50 %	50 %	0 %	0 %	532531631
23577	NC_022130	T	8	8	1125527	1125534	0 %	100 %	0 %	0 %	532531631
23578	NC_022130	ATT	2	6	1125602	1125607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531631
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23580	NC_022130	AGAA	2	8	1125730	1125737	75 %	0 %	25 %	0 %	532531631
23581	NC_022130	CGCT	2	8	1125740	1125747	0 %	25 %	25 %	50 %	532531631
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23584	NC_022130	TAAA	2	8	1125829	1125836	75 %	25 %	0 %	0 %	532531631
23585	NC_022130	CAAA	2	8	1125848	1125855	75 %	0 %	0 %	25 %	532531631
23586	NC_022130	CTC	2	6	1125879	1125884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532531631
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23588	NC_022130	TAA	2	6	1125904	1125909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531631
23589	NC_022130	CA	3	6	1125993	1125998	50 %	0 %	0 %	50 %	532531631
23590	NC_022130	AAATT	2	10	1126059	1126068	60 %	40 %	0 %	0 %	532531631
23591	NC_022130	A	6	6	1126084	1126089	100 %	0 %	0 %	0 %	532531631
23592	NC_022130	C	6	6	1126091	1126096	0 %	0 %	0 %	100 %	532531631
23593	NC_022130	A	7	7	1126102	1126108	100 %	0 %	0 %	0 %	532531631
23594	NC_022130	CAG	2	6	1126301	1126306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23596	NC_022130	TGT	2	6	1126391	1126396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23597	NC_022130	AATC	2	8	1126397	1126404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23598	NC_022130	CAC	2	6	1126461	1126466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531632
23599	NC_022130	TCGCAT	2	12	1126538	1126549	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532531632
23600	NC_022130	ATC	2	6	1126599	1126604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531632
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23602	NC_022130	AAG	2	6	1126658	1126663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531632
23603	NC_022130	GTAA	2	8	1126674	1126681	50 %	25 %	25 %	0 %	532531632
23604	NC_022130	AAT	2	6	1126715	1126720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531632
23605	NC_022130	GTG	2	6	1126723	1126728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531632
23606	NC_022130	TTTGA	2	10	1126761	1126770	20 %	60 %	20 %	0 %	532531632
23607	NC_022130	TGA	2	6	1126832	1126837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531632
23608	NC_022130	CAA	2	6	1126856	1126861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531632
23609	NC_022130	TG	3	6	1127002	1127007	0 %	50 %	50 %	0 %	532531632
23610	NC_022130	TGG	2	6	1127019	1127024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531632
23611	NC_022130	TCT	2	6	1127101	1127106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531632
23612	NC_022130	C	6	6	1127118	1127123	0 %	0 %	0 %	100 %	532531632
23613	NC_022130	T	8	8	1127125	1127132	0 %	100 %	0 %	0 %	532531632
23614	NC_022130	TTTGA	2	10	1127193	1127202	20 %	60 %	20 %	0 %	532531632
23615	NC_022130	ACAA	2	8	1127230	1127237	75 %	0 %	0 %	25 %	532531632
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23617	NC_022130	T	6	6	1127265	1127270	0 %	100 %	0 %	0 %	532531632
23618	NC_022130	A	7	7	1127271	1127277	100 %	0 %	0 %	0 %	532531632
23619	NC_022130	CTT	2	6	1127318	1127323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531632
23620	NC_022130	T	6	6	1127403	1127408	0 %	100 %	0 %	0 %	532531632
23621	NC_022130	T	6	6	1127418	1127423	0 %	100 %	0 %	0 %	532531632
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23986	NC_022130	T	6	6	1144396	1144401	0 %	100 %	0 %	0 %	532531653
23987	NC_022130	AGA	2	6	1144427	1144432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531653
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