MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23239	NC_022130	TGG	2	6	1108688	1108693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23242	NC_022130	TGG	2	6	1108850	1108855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531614
23243	NC_022130	CAC	2	6	1108929	1108934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531614
23244	NC_022130	TGG	2	6	1108995	1109000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531614
23245	NC_022130	A	6	6	1109074	1109079	100 %	0 %	0 %	0 %	532531614
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23322	NC_022130	T	7	7	1112231	1112237	0 %	100 %	0 %	0 %	532531616
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23330	NC_022130	T	7	7	1112718	1112724	0 %	100 %	0 %	0 %	532531617
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23333	NC_022130	GAT	2	6	1112761	1112766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531617
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23335	NC_022130	T	7	7	1112822	1112828	0 %	100 %	0 %	0 %	532531617
23336	NC_022130	CAT	2	6	1112849	1112854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531617
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23338	NC_022130	AAAT	2	8	1112891	1112898	75 %	25 %	0 %	0 %	532531617
23339	NC_022130	AATA	2	8	1112935	1112942	75 %	25 %	0 %	0 %	532531617
23340	NC_022130	ATAA	3	12	1112957	1112968	75 %	25 %	0 %	0 %	532531617
23341	NC_022130	ATTT	2	8	1113103	1113110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23342	NC_022130	CTT	2	6	1113242	1113247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531618
23343	NC_022130	G	6	6	1113263	1113268	0 %	0 %	100 %	0 %	532531618
23344	NC_022130	ATG	2	6	1113274	1113279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531618
23345	NC_022130	TGA	3	9	1113294	1113302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531618
23346	NC_022130	TGAT	2	8	1113350	1113357	25 %	50 %	25 %	0 %	532531618
23347	NC_022130	GGTTT	2	10	1113361	1113370	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23348	NC_022130	AGA	2	6	1113399	1113404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23349	NC_022130	CAC	2	6	1113405	1113410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23350	NC_022130	AGA	2	6	1113438	1113443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531619
23351	NC_022130	GTT	2	6	1113444	1113449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531619
23352	NC_022130	A	7	7	1113452	1113458	100 %	0 %	0 %	0 %	532531619
23353	NC_022130	TGG	2	6	1113487	1113492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531619
23354	NC_022130	TGA	2	6	1113559	1113564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531619
23355	NC_022130	AAG	2	6	1113598	1113603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531619
23356	NC_022130	A	6	6	1113624	1113629	100 %	0 %	0 %	0 %	532531619
23357	NC_022130	CTCA	2	8	1113630	1113637	25 %	25 %	0 %	50 %	532531619
23358	NC_022130	GAA	2	6	1113681	1113686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531619
23359	NC_022130	GAAT	2	8	1113722	1113729	50 %	25 %	25 %	0 %	532531619
23360	NC_022130	A	7	7	1113760	1113766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23361	NC_022130	CAC	2	6	1113827	1113832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531620
23362	NC_022130	ATAACA	2	12	1113868	1113879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532531620
23363	NC_022130	TTG	2	6	1113899	1113904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531620
23364	NC_022130	AG	3	6	1113936	1113941	50 %	0 %	50 %	0 %	532531620
23365	NC_022130	ATT	2	6	1113961	1113966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531620
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23367	NC_022130	CACT	2	8	1114060	1114067	25 %	25 %	0 %	50 %	532531621
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23370	NC_022130	A	6	6	1114106	1114111	100 %	0 %	0 %	0 %	532531621
23371	NC_022130	GCGT	2	8	1114323	1114330	0 %	25 %	50 %	25 %	532531621
23372	NC_022130	GCG	2	6	1114335	1114340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532531621
23373	NC_022130	AGC	2	6	1114463	1114468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531622
23374	NC_022130	CTGG	2	8	1114519	1114526	0 %	25 %	50 %	25 %	532531622
23375	NC_022130	AAG	2	6	1114552	1114557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531622
23376	NC_022130	CTA	2	6	1114615	1114620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531622
23377	NC_022130	TCAA	2	8	1114624	1114631	50 %	25 %	0 %	25 %	532531622
23378	NC_022130	T	6	6	1114637	1114642	0 %	100 %	0 %	0 %	532531622
23379	NC_022130	CA	3	6	1114648	1114653	50 %	0 %	0 %	50 %	532531622
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23381	NC_022130	GAA	3	9	1114770	1114778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531622
23382	NC_022130	CCA	2	6	1114805	1114810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531622
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23386	NC_022130	ACT	2	6	1114941	1114946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531622
23387	NC_022130	A	6	6	1114983	1114988	100 %	0 %	0 %	0 %	532531622
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23389	NC_022130	GAA	2	6	1115244	1115249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531622
23390	NC_022130	CAA	2	6	1115292	1115297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531622
23391	NC_022130	T	7	7	1115328	1115334	0 %	100 %	0 %	0 %	532531622
23392	NC_022130	AAG	2	6	1115356	1115361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531622
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23400	NC_022130	A	6	6	1115859	1115864	100 %	0 %	0 %	0 %	532531623
23401	NC_022130	GAAAA	2	10	1115865	1115874	80 %	0 %	20 %	0 %	532531623
23402	NC_022130	A	6	6	1115871	1115876	100 %	0 %	0 %	0 %	532531623
23403	NC_022130	A	7	7	1115955	1115961	100 %	0 %	0 %	0 %	532531623
23404	NC_022130	TTA	2	6	1115995	1116000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531623
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23411	NC_022130	GAA	2	6	1116408	1116413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531623
23412	NC_022130	CAATGA	2	12	1116506	1116517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532531623
23413	NC_022130	A	6	6	1116523	1116528	100 %	0 %	0 %	0 %	532531623
23414	NC_022130	A	6	6	1116574	1116579	100 %	0 %	0 %	0 %	532531623
23415	NC_022130	CCA	2	6	1116580	1116585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531623
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23419	NC_022130	TGA	2	6	1116700	1116705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531624
23420	NC_022130	TGA	2	6	1116860	1116865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531624
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23422	NC_022130	A	6	6	1117087	1117092	100 %	0 %	0 %	0 %	532531624
23423	NC_022130	GAA	2	6	1117140	1117145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531624
23424	NC_022130	G	6	6	1117431	1117436	0 %	0 %	100 %	0 %	532531624
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23430	NC_022130	A	6	6	1117722	1117727	100 %	0 %	0 %	0 %	532531624
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23433	NC_022130	A	6	6	1117772	1117777	100 %	0 %	0 %	0 %	532531624
23434	NC_022130	TAT	2	6	1117822	1117827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531624
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23436	NC_022130	GATC	2	8	1117944	1117951	25 %	25 %	25 %	25 %	532531624
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23438	NC_022130	TGGG	2	8	1118124	1118131	0 %	25 %	75 %	0 %	532531625
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23468	NC_022130	CA	3	6	1119741	1119746	50 %	0 %	0 %	50 %	532531626
23469	NC_022130	A	6	6	1119827	1119832	100 %	0 %	0 %	0 %	532531626
23470	NC_022130	AAGC	2	8	1119844	1119851	50 %	0 %	25 %	25 %	532531626
23471	NC_022130	ACTG	2	8	1119904	1119911	25 %	25 %	25 %	25 %	532531626
23472	NC_022130	ATTTC	2	10	1119945	1119954	20 %	60 %	0 %	20 %	532531626
23473	NC_022130	A	6	6	1119998	1120003	100 %	0 %	0 %	0 %	532531626
23474	NC_022130	TAA	2	6	1120012	1120017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531626
23475	NC_022130	CAT	2	6	1120024	1120029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531626
23476	NC_022130	ACT	2	6	1120089	1120094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531626
23477	NC_022130	CTA	2	6	1120117	1120122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531626
23478	NC_022130	GC	3	6	1120146	1120151	0 %	0 %	50 %	50 %	532531626
23479	NC_022130	T	6	6	1120168	1120173	0 %	100 %	0 %	0 %	532531626
23480	NC_022130	TTC	2	6	1120190	1120195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531626
23481	NC_022130	CGCT	2	8	1120225	1120232	0 %	25 %	25 %	50 %	532531626
23482	NC_022130	ATCACA	2	12	1120233	1120244	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532531626
23483	NC_022130	TCA	2	6	1120245	1120250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531626
23484	NC_022130	GGT	2	6	1120265	1120270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531626
23485	NC_022130	GTA	2	6	1120361	1120366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531626
23486	NC_022130	TG	3	6	1120399	1120404	0 %	50 %	50 %	0 %	532531626
23487	NC_022130	GC	3	6	1120435	1120440	0 %	0 %	50 %	50 %	532531626
23488	NC_022130	TAT	2	6	1120450	1120455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531626
23489	NC_022130	GAT	2	6	1120490	1120495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531626
23490	NC_022130	GTT	2	6	1120553	1120558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531626
23491	NC_022130	TGG	2	6	1120610	1120615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531626
23492	NC_022130	T	6	6	1120660	1120665	0 %	100 %	0 %	0 %	532531626
23493	NC_022130	TAT	2	6	1120671	1120676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531626
23494	NC_022130	A	7	7	1120707	1120713	100 %	0 %	0 %	0 %	532531626
23495	NC_022130	ATG	2	6	1120728	1120733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531626
23496	NC_022130	TTG	2	6	1120766	1120771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531626
23497	NC_022130	TTG	2	6	1120809	1120814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531626
23498	NC_022130	CGTT	2	8	1120831	1120838	0 %	50 %	25 %	25 %	532531626
23499	NC_022130	CTT	2	6	1120843	1120848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531626
23500	NC_022130	GTT	2	6	1120889	1120894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531626

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