MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15127	NC_022130	A	6	6	720613	720618	100 %	0 %	0 %	0 %	532531219
15128	NC_022130	CTT	2	6	720629	720634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531219
15129	NC_022130	ATT	2	6	720663	720668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531219
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15131	NC_022130	TGA	2	6	720701	720706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531219
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15232	NC_022130	A	6	6	725030	725035	100 %	0 %	0 %	0 %	532531226
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15240	NC_022130	CTT	2	6	725565	725570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15251	NC_022130	CG	3	6	726035	726040	0 %	0 %	50 %	50 %	532531227
15252	NC_022130	TTG	2	6	726052	726057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531227
15253	NC_022130	TGA	2	6	726072	726077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531227
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15256	NC_022130	TGA	2	6	726306	726311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531227
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15260	NC_022130	CGCT	2	8	726458	726465	0 %	25 %	25 %	50 %	532531227
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15282	NC_022130	TTGA	2	8	728009	728016	25 %	50 %	25 %	0 %	532531229
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15284	NC_022130	GCT	3	9	728125	728133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531229
15285	NC_022130	CTT	2	6	728145	728150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531229
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15289	NC_022130	GC	3	6	728349	728354	0 %	0 %	50 %	50 %	532531229
15290	NC_022130	GCGT	2	8	728460	728467	0 %	25 %	50 %	25 %	532531229
15291	NC_022130	T	6	6	728469	728474	0 %	100 %	0 %	0 %	532531229
15292	NC_022130	T	8	8	728480	728487	0 %	100 %	0 %	0 %	532531229
15293	NC_022130	A	6	6	728500	728505	100 %	0 %	0 %	0 %	532531229
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15297	NC_022130	GGT	2	6	728733	728738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531230
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15315	NC_022130	A	8	8	729180	729187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15316	NC_022130	C	7	7	729191	729197	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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15321	NC_022130	A	7	7	729450	729456	100 %	0 %	0 %	0 %	532531231
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15326	NC_022130	CAAA	2	8	729724	729731	75 %	0 %	0 %	25 %	532531231
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15358	NC_022130	GTTT	2	8	730951	730958	0 %	75 %	25 %	0 %	532531232
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15362	NC_022130	CTT	2	6	731175	731180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531233
15363	NC_022130	A	6	6	731245	731250	100 %	0 %	0 %	0 %	532531233
15364	NC_022130	TGCA	2	8	731337	731344	25 %	25 %	25 %	25 %	532531233
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15374	NC_022130	ATC	2	6	732071	732076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531233
15375	NC_022130	A	6	6	732126	732131	100 %	0 %	0 %	0 %	532531233
15376	NC_022130	CCA	2	6	732174	732179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531233
15377	NC_022130	GATTT	2	10	732191	732200	20 %	60 %	20 %	0 %	532531233
15378	NC_022130	AAG	2	6	732231	732236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531233
15379	NC_022130	ATT	2	6	732273	732278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531233
15380	NC_022130	GAAA	2	8	732280	732287	75 %	0 %	25 %	0 %	532531233
15381	NC_022130	A	6	6	732285	732290	100 %	0 %	0 %	0 %	532531233
15382	NC_022130	T	6	6	732303	732308	0 %	100 %	0 %	0 %	532531233
15383	NC_022130	TGA	2	6	732381	732386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531233
15384	NC_022130	TTG	2	6	732413	732418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531233
15385	NC_022130	AGCG	2	8	732439	732446	25 %	0 %	50 %	25 %	532531233
15386	NC_022130	GATT	2	8	732667	732674	25 %	50 %	25 %	0 %	532531234
15387	NC_022130	TGAA	2	8	732675	732682	50 %	25 %	25 %	0 %	532531234
15388	NC_022130	A	6	6	732697	732702	100 %	0 %	0 %	0 %	532531234
15389	NC_022130	TTA	2	6	732704	732709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531234
15390	NC_022130	GT	3	6	732749	732754	0 %	50 %	50 %	0 %	532531234
15391	NC_022130	ATT	2	6	732759	732764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531234
15392	NC_022130	ATG	2	6	732789	732794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531234
15393	NC_022130	T	6	6	732835	732840	0 %	100 %	0 %	0 %	532531234
15394	NC_022130	GAT	2	6	732908	732913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531234
15395	NC_022130	CGG	2	6	733075	733080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532531235
15396	NC_022130	GACAG	2	10	733105	733114	40 %	0 %	40 %	20 %	532531235
15397	NC_022130	AAG	2	6	733168	733173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531235
15398	NC_022130	T	6	6	733227	733232	0 %	100 %	0 %	0 %	532531235
15399	NC_022130	TGGG	2	8	733327	733334	0 %	25 %	75 %	0 %	532531235
15400	NC_022130	ATC	2	6	733380	733385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531235
15401	NC_022130	TGA	2	6	733423	733428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531235
15402	NC_022130	TGAT	2	8	733477	733484	25 %	50 %	25 %	0 %	532531235
15403	NC_022130	GGCA	2	8	733487	733494	25 %	0 %	50 %	25 %	532531235
15404	NC_022130	GCTTTG	2	12	733509	733520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532531235
15405	NC_022130	AAAG	2	8	733596	733603	75 %	0 %	25 %	0 %	532531235
15406	NC_022130	GTG	2	6	733617	733622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531235
15407	NC_022130	ATTCC	2	10	733630	733639	20 %	40 %	0 %	40 %	532531235
15408	NC_022130	CAC	2	6	733664	733669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531235
15409	NC_022130	GTG	2	6	733771	733776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531235
15410	NC_022130	AGCA	2	8	733897	733904	50 %	0 %	25 %	25 %	532531235
15411	NC_022130	CTCC	2	8	733949	733956	0 %	25 %	0 %	75 %	532531235
15412	NC_022130	A	7	7	734103	734109	100 %	0 %	0 %	0 %	532531236
15413	NC_022130	TA	3	6	734128	734133	50 %	50 %	0 %	0 %	532531236
15414	NC_022130	AATTTG	2	12	734219	734230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532531236
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15416	NC_022130	A	6	6	734261	734266	100 %	0 %	0 %	0 %	532531236
15417	NC_022130	AGAA	2	8	734320	734327	75 %	0 %	25 %	0 %	532531236
15418	NC_022130	T	7	7	734342	734348	0 %	100 %	0 %	0 %	532531236
15419	NC_022130	GCC	2	6	734510	734515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532531236
15420	NC_022130	TAA	3	9	734602	734610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531236
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15422	NC_022130	TAA	2	6	734722	734727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531236
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15424	NC_022130	TAA	2	6	734822	734827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531236
15425	NC_022130	GCT	2	6	734854	734859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531236
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15428	NC_022130	TTGA	2	8	734991	734998	25 %	50 %	25 %	0 %	532531236
15429	NC_022130	AG	3	6	735025	735030	50 %	0 %	50 %	0 %	532531236
15430	NC_022130	TATCA	2	10	735035	735044	40 %	40 %	0 %	20 %	532531236
15431	NC_022130	TCA	2	6	735072	735077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531236
15432	NC_022130	GAAT	2	8	735172	735179	50 %	25 %	25 %	0 %	532531236
15433	NC_022130	CAA	2	6	735233	735238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531237
15434	NC_022130	TCAT	2	8	735291	735298	25 %	50 %	0 %	25 %	532531237
15435	NC_022130	AGCG	2	8	735332	735339	25 %	0 %	50 %	25 %	532531237
15436	NC_022130	ATA	2	6	735399	735404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531237
15437	NC_022130	TTC	2	6	735413	735418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531237
15438	NC_022130	ATC	3	9	735476	735484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531237
15439	NC_022130	TGA	2	6	735553	735558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531237
15440	NC_022130	T	6	6	735559	735564	0 %	100 %	0 %	0 %	532531237
15441	NC_022130	CTT	2	6	735568	735573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531237
15442	NC_022130	T	6	6	735635	735640	0 %	100 %	0 %	0 %	532531237
15443	NC_022130	CT	9	18	735656	735673	0 %	50 %	0 %	50 %	532531237
15444	NC_022130	CTT	2	6	735723	735728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531237
15445	NC_022130	TCA	2	6	735731	735736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531237
15446	NC_022130	CTTT	2	8	735834	735841	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15447	NC_022130	TCA	2	6	735842	735847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15448	NC_022130	TTC	2	6	735901	735906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531238
15449	NC_022130	GAGC	2	8	735925	735932	25 %	0 %	50 %	25 %	532531238
15450	NC_022130	TGA	2	6	735990	735995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531238
15451	NC_022130	TCC	2	6	736021	736026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532531238
15452	NC_022130	CGT	2	6	736095	736100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531238
15453	NC_022130	ACC	2	6	736132	736137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531238
15454	NC_022130	GTG	2	6	736141	736146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531238
15455	NC_022130	T	6	6	736186	736191	0 %	100 %	0 %	0 %	532531238
15456	NC_022130	AAT	2	6	736207	736212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531238
15457	NC_022130	ATA	2	6	736232	736237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531238
15458	NC_022130	TGA	2	6	736289	736294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531238
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15460	NC_022130	A	6	6	736383	736388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15461	NC_022130	G	6	6	736389	736394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15462	NC_022130	TTG	2	6	736506	736511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531239
15463	NC_022130	GAGC	2	8	736712	736719	25 %	0 %	50 %	25 %	532531239
15464	NC_022130	ATG	2	6	736734	736739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531239
15465	NC_022130	CTA	2	6	736745	736750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531239
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15467	NC_022130	A	6	6	736789	736794	100 %	0 %	0 %	0 %	532531239
15468	NC_022130	ATG	2	6	736842	736847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531239
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15470	NC_022130	GCAC	2	8	736951	736958	25 %	0 %	25 %	50 %	532531239
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15476	NC_022130	AGT	2	6	737224	737229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531239
15477	NC_022130	TTC	2	6	737256	737261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531239
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15480	NC_022130	TAT	2	6	737485	737490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531240
15481	NC_022130	AG	3	6	737508	737513	50 %	0 %	50 %	0 %	532531240
15482	NC_022130	T	6	6	737651	737656	0 %	100 %	0 %	0 %	532531240
15483	NC_022130	ACCCTA	2	12	737666	737677	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532531240
15484	NC_022130	AT	3	6	737688	737693	50 %	50 %	0 %	0 %	532531240
15485	NC_022130	TTGT	2	8	737752	737759	0 %	75 %	25 %	0 %	532531240
15486	NC_022130	T	6	6	737764	737769	0 %	100 %	0 %	0 %	532531240
15487	NC_022130	AGA	2	6	737781	737786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531240
15488	NC_022130	A	6	6	737791	737796	100 %	0 %	0 %	0 %	532531240
15489	NC_022130	CAT	2	6	737850	737855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531240
15490	NC_022130	ATTGA	2	10	737929	737938	40 %	40 %	20 %	0 %	532531240
15491	NC_022130	AGA	3	9	737955	737963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531240
15492	NC_022130	TGG	2	6	737966	737971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531240
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15494	NC_022130	CTCG	2	8	738070	738077	0 %	25 %	25 %	50 %	532531240
15495	NC_022130	TTA	2	6	738078	738083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531240
15496	NC_022130	GTC	2	6	738088	738093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531240
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15499	NC_022130	AAG	2	6	738410	738415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531240
15500	NC_022130	T	6	6	738457	738462	0 %	100 %	0 %	0 %	532531240

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