MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_022130	A	6	6	49600	49605	100 %	0 %	0 %	0 %	532530518
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1005	NC_022130	TGA	2	6	49765	49770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530518
1006	NC_022130	TTG	2	6	49790	49795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530518
1007	NC_022130	TGA	2	6	49807	49812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532530518
1008	NC_022130	AGG	2	6	49894	49899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532530519
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1013	NC_022130	TGGT	2	8	50198	50205	0 %	50 %	50 %	0 %	532530519
1014	NC_022130	T	6	6	50234	50239	0 %	100 %	0 %	0 %	532530519
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1061	NC_022130	AAGA	2	8	52229	52236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_022130	A	7	7	54009	54015	100 %	0 %	0 %	0 %	532530525
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1133	NC_022130	CAA	2	6	55196	55201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532530525
1134	NC_022130	TTTA	2	8	55215	55222	25 %	75 %	0 %	0 %	532530525
1135	NC_022130	CTT	2	6	55250	55255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530525
1136	NC_022130	AGTG	2	8	55338	55345	25 %	25 %	50 %	0 %	532530525
1137	NC_022130	CTT	2	6	55364	55369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530525
1138	NC_022130	T	6	6	55376	55381	0 %	100 %	0 %	0 %	532530525
1139	NC_022130	A	6	6	55398	55403	100 %	0 %	0 %	0 %	532530525
1140	NC_022130	TCA	2	6	55504	55509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530525
1141	NC_022130	TAAAA	2	10	55617	55626	80 %	20 %	0 %	0 %	532530525
1142	NC_022130	A	6	6	55623	55628	100 %	0 %	0 %	0 %	532530525
1143	NC_022130	TTTG	2	8	55640	55647	0 %	75 %	25 %	0 %	532530525
1144	NC_022130	AAT	2	6	55665	55670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530525
1145	NC_022130	T	6	6	55776	55781	0 %	100 %	0 %	0 %	532530525
1146	NC_022130	TTCA	2	8	55854	55861	25 %	50 %	0 %	25 %	532530525
1147	NC_022130	CTT	2	6	56095	56100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532530526
1148	NC_022130	AAAC	2	8	56123	56130	75 %	0 %	0 %	25 %	532530526
1149	NC_022130	AG	3	6	56237	56242	50 %	0 %	50 %	0 %	532530526
1150	NC_022130	A	6	6	56281	56286	100 %	0 %	0 %	0 %	532530526
1151	NC_022130	AGCC	2	8	56323	56330	25 %	0 %	25 %	50 %	532530526
1152	NC_022130	TGAAA	2	10	56375	56384	60 %	20 %	20 %	0 %	532530526
1153	NC_022130	A	6	6	56382	56387	100 %	0 %	0 %	0 %	532530526
1154	NC_022130	ATC	2	6	56427	56432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530526
1155	NC_022130	G	6	6	56443	56448	0 %	0 %	100 %	0 %	532530526
1156	NC_022130	TTA	2	6	56454	56459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532530526
1157	NC_022130	TCG	2	6	56464	56469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532530526
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1159	NC_022130	TCA	2	6	56527	56532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530526
1160	NC_022130	CCG	2	6	56533	56538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532530526
1161	NC_022130	TCA	2	6	56593	56598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530526
1162	NC_022130	AAATT	2	10	56631	56640	60 %	40 %	0 %	0 %	532530526
1163	NC_022130	CAAG	2	8	56802	56809	50 %	0 %	25 %	25 %	532530526
1164	NC_022130	ATA	2	6	56817	56822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530526
1165	NC_022130	AAAGG	2	10	56846	56855	60 %	0 %	40 %	0 %	532530526
1166	NC_022130	C	6	6	56900	56905	0 %	0 %	0 %	100 %	532530526
1167	NC_022130	GATG	2	8	56908	56915	25 %	25 %	50 %	0 %	532530526
1168	NC_022130	ATC	2	6	56916	56921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532530526
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1173	NC_022130	GAA	2	6	57105	57110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532530526
1174	NC_022130	A	6	6	57122	57127	100 %	0 %	0 %	0 %	532530526
1175	NC_022130	AAT	2	6	57193	57198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530526
1176	NC_022130	TG	3	6	57301	57306	0 %	50 %	50 %	0 %	532530526
1177	NC_022130	AAT	2	6	57427	57432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532530526
1178	NC_022130	GTT	2	6	57438	57443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530526
1179	NC_022130	TAAAAA	2	12	57456	57467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532530526
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1181	NC_022130	T	6	6	57552	57557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1182	NC_022130	GCA	2	6	57577	57582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532530527
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1235	NC_022130	GCTC	2	8	61047	61054	0 %	25 %	25 %	50 %	532530527
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1238	NC_022130	T	7	7	61132	61138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1239	NC_022130	T	6	6	61202	61207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1240	NC_022130	TAAT	2	8	61231	61238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_022130	T	6	6	61255	61260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_022130	TAT	2	6	61327	61332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_022130	TAT	2	6	61366	61371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_022130	AAAT	2	8	61398	61405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_022130	A	6	6	61472	61477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_022130	GTT	2	6	61544	61549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532530528
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1248	NC_022130	A	6	6	61611	61616	100 %	0 %	0 %	0 %	532530528
1249	NC_022130	CAC	2	6	61623	61628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532530528
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1251	NC_022130	T	6	6	61737	61742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_022130	TTG	2	6	61814	61819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_022130	GCTTG	2	10	61841	61850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1254	NC_022130	ATA	2	6	61860	61865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_022130	TTAGA	2	10	61885	61894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_022130	TTTTA	2	10	61904	61913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_022130	ACTTC	2	10	61960	61969	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1258	NC_022130	C	8	8	61971	61978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1259	NC_022130	A	6	6	62027	62032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_022130	TC	3	6	62073	62078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1261	NC_022130	CTT	2	6	62089	62094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_022130	T	6	6	62093	62098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_022130	AAG	2	6	62169	62174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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