MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022130	AAT	2	6	620736	620741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531122
13002	NC_022130	GCG	2	6	620796	620801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532531122
13003	NC_022130	TGGA	2	8	620894	620901	25 %	25 %	50 %	0 %	532531123
13004	NC_022130	AG	3	6	620981	620986	50 %	0 %	50 %	0 %	532531123
13005	NC_022130	AAAAG	2	10	621002	621011	80 %	0 %	20 %	0 %	532531123
13006	NC_022130	GCG	2	6	621087	621092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532531123
13007	NC_022130	A	7	7	621135	621141	100 %	0 %	0 %	0 %	532531123
13008	NC_022130	GTG	2	6	621144	621149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531123
13009	NC_022130	A	6	6	621190	621195	100 %	0 %	0 %	0 %	532531123
13010	NC_022130	AGC	2	6	621281	621286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531123
13011	NC_022130	GAA	2	6	621294	621299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531123
13012	NC_022130	GTG	2	6	621300	621305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531123
13013	NC_022130	ACTCA	2	10	621306	621315	40 %	20 %	0 %	40 %	532531123
13014	NC_022130	CT	3	6	621514	621519	0 %	50 %	0 %	50 %	532531123
13015	NC_022130	A	6	6	621528	621533	100 %	0 %	0 %	0 %	532531123
13016	NC_022130	ATT	2	6	621718	621723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531123
13017	NC_022130	A	7	7	621792	621798	100 %	0 %	0 %	0 %	532531124
13018	NC_022130	CCG	2	6	621810	621815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532531124
13019	NC_022130	GTTG	2	8	621840	621847	0 %	50 %	50 %	0 %	532531124
13020	NC_022130	TTC	2	6	621867	621872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531124
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13022	NC_022130	G	6	6	621947	621952	0 %	0 %	100 %	0 %	532531124
13023	NC_022130	GGAG	2	8	621966	621973	25 %	0 %	75 %	0 %	532531124
13024	NC_022130	A	6	6	622033	622038	100 %	0 %	0 %	0 %	532531124
13025	NC_022130	ATC	2	6	622093	622098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531124
13026	NC_022130	ATG	3	9	622189	622197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531124
13027	NC_022130	GATT	2	8	622215	622222	25 %	50 %	25 %	0 %	532531124
13028	NC_022130	CTTA	2	8	622262	622269	25 %	50 %	0 %	25 %	532531124
13029	NC_022130	GAA	2	6	622270	622275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531124
13030	NC_022130	TTAT	2	8	622376	622383	25 %	75 %	0 %	0 %	532531124
13031	NC_022130	TAAA	2	8	622392	622399	75 %	25 %	0 %	0 %	532531124
13032	NC_022130	A	6	6	622397	622402	100 %	0 %	0 %	0 %	532531124
13033	NC_022130	CAAAA	2	10	622424	622433	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13034	NC_022130	TTA	2	6	622555	622560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531125
13035	NC_022130	TTA	2	6	622568	622573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531125
13036	NC_022130	T	6	6	622597	622602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_022130	TAAG	2	8	622622	622629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_022130	T	7	7	622712	622718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_022130	AAGAAA	2	12	623039	623050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532531126
13040	NC_022130	ATG	2	6	623168	623173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531126
13041	NC_022130	A	6	6	623179	623184	100 %	0 %	0 %	0 %	532531126
13042	NC_022130	GAT	2	6	623272	623277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531126
13043	NC_022130	ATT	2	6	623299	623304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531126
13044	NC_022130	CAA	2	6	623350	623355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531126
13045	NC_022130	TAT	2	6	623376	623381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531126
13046	NC_022130	AAGC	2	8	623411	623418	50 %	0 %	25 %	25 %	532531126
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13053	NC_022130	ATT	2	6	623718	623723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531126
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13057	NC_022130	GTT	2	6	623769	623774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531126
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13062	NC_022130	TCA	2	6	624136	624141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531127
13063	NC_022130	CTCG	2	8	624183	624190	0 %	25 %	25 %	50 %	532531127
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13068	NC_022130	ATTTT	2	10	624362	624371	20 %	80 %	0 %	0 %	532531128
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13074	NC_022130	AAAATA	2	12	624531	624542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532531128
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13083	NC_022130	A	6	6	625097	625102	100 %	0 %	0 %	0 %	532531128
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13088	NC_022130	A	7	7	625208	625214	100 %	0 %	0 %	0 %	532531128
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13093	NC_022130	A	6	6	625383	625388	100 %	0 %	0 %	0 %	532531128
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13099	NC_022130	ATA	2	6	625689	625694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531128
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13109	NC_022130	TGC	2	6	626105	626110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532531129
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13118	NC_022130	CCAAG	2	10	626599	626608	40 %	0 %	20 %	40 %	532531129
13119	NC_022130	ACTC	2	8	626727	626734	25 %	25 %	0 %	50 %	532531129
13120	NC_022130	CAT	2	6	626751	626756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531129
13121	NC_022130	ACGAT	2	10	626778	626787	40 %	20 %	20 %	20 %	532531129
13122	NC_022130	TTA	2	6	626826	626831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531129
13123	NC_022130	A	6	6	626833	626838	100 %	0 %	0 %	0 %	532531129
13124	NC_022130	TTA	2	6	626873	626878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531130
13125	NC_022130	TTTG	2	8	626897	626904	0 %	75 %	25 %	0 %	532531130
13126	NC_022130	C	6	6	626954	626959	0 %	0 %	0 %	100 %	532531130
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13130	NC_022130	AGA	2	6	627152	627157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531130
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13151	NC_022130	CAC	2	6	628156	628161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531131
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13156	NC_022130	ATT	2	6	628570	628575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13157	NC_022130	TAT	2	6	628642	628647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531132
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13163	NC_022130	TTGA	2	8	628825	628832	25 %	50 %	25 %	0 %	532531132
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13202	NC_022130	ATC	2	6	630848	630853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531134
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13207	NC_022130	T	7	7	630968	630974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13208	NC_022130	AATC	2	8	631082	631089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13211	NC_022130	AATA	2	8	631169	631176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13212	NC_022130	T	6	6	631208	631213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13213	NC_022130	CATAGC	2	12	631220	631231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13219	NC_022130	A	7	7	631578	631584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13226	NC_022130	T	7	7	631753	631759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13227	NC_022130	TGA	2	6	631772	631777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13228	NC_022130	GCGTG	2	10	631805	631814	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13229	NC_022130	TAA	2	6	631926	631931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_022130	AGC	2	6	631945	631950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13231	NC_022130	CAT	2	6	631974	631979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13235	NC_022130	ATCT	2	8	632247	632254	25 %	50 %	0 %	25 %	532531135
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13237	NC_022130	C	6	6	632300	632305	0 %	0 %	0 %	100 %	532531135
13238	NC_022130	TCAAAA	2	12	632353	632364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532531135
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13244	NC_022130	G	6	6	633086	633091	0 %	0 %	100 %	0 %	532531136
13245	NC_022130	TTGA	2	8	633092	633099	25 %	50 %	25 %	0 %	532531136
13246	NC_022130	T	6	6	633119	633124	0 %	100 %	0 %	0 %	532531136
13247	NC_022130	AGC	2	6	633307	633312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13249	NC_022130	A	6	6	633430	633435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13492	NC_022130	A	6	6	645443	645448	100 %	0 %	0 %	0 %	532531146
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13495	NC_022130	A	7	7	645518	645524	100 %	0 %	0 %	0 %	532531146
13496	NC_022130	A	8	8	645569	645576	100 %	0 %	0 %	0 %	532531146
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