MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 33921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022130	T	6	6	522227	522232	0 %	100 %	0 %	0 %	532531018
11002	NC_022130	GAA	2	6	522297	522302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531018
11003	NC_022130	GGT	2	6	522311	522316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531018
11004	NC_022130	T	6	6	522316	522321	0 %	100 %	0 %	0 %	532531018
11005	NC_022130	GCAT	2	8	522379	522386	25 %	25 %	25 %	25 %	532531018
11006	NC_022130	CCA	2	6	522416	522421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531018
11007	NC_022130	TAT	2	6	522426	522431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531018
11008	NC_022130	AAT	2	6	522471	522476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531018
11009	NC_022130	A	7	7	522513	522519	100 %	0 %	0 %	0 %	532531018
11010	NC_022130	CCT	2	6	522564	522569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532531018
11011	NC_022130	ACA	2	6	522602	522607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532531018
11012	NC_022130	AGA	2	6	522641	522646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531018
11013	NC_022130	GCAA	2	8	522691	522698	50 %	0 %	25 %	25 %	532531019
11014	NC_022130	TCA	2	6	522722	522727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531019
11015	NC_022130	ATCT	2	8	522744	522751	25 %	50 %	0 %	25 %	532531019
11016	NC_022130	T	7	7	522775	522781	0 %	100 %	0 %	0 %	532531019
11017	NC_022130	A	6	6	522789	522794	100 %	0 %	0 %	0 %	532531019
11018	NC_022130	ATA	2	6	522820	522825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531019
11019	NC_022130	A	6	6	522825	522830	100 %	0 %	0 %	0 %	532531019
11020	NC_022130	G	7	7	522848	522854	0 %	0 %	100 %	0 %	532531019
11021	NC_022130	A	6	6	522915	522920	100 %	0 %	0 %	0 %	532531019
11022	NC_022130	ATGG	2	8	523002	523009	25 %	25 %	50 %	0 %	532531019
11023	NC_022130	TATG	2	8	523073	523080	25 %	50 %	25 %	0 %	532531019
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11026	NC_022130	T	7	7	523213	523219	0 %	100 %	0 %	0 %	532531019
11027	NC_022130	GAGC	2	8	523223	523230	25 %	0 %	50 %	25 %	532531019
11028	NC_022130	A	8	8	523244	523251	100 %	0 %	0 %	0 %	532531019
11029	NC_022130	GCG	2	6	523289	523294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532531019
11030	NC_022130	GCA	2	6	523323	523328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531019
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11033	NC_022130	A	7	7	523379	523385	100 %	0 %	0 %	0 %	532531020
11034	NC_022130	A	7	7	523416	523422	100 %	0 %	0 %	0 %	532531020
11035	NC_022130	AGA	2	6	523450	523455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531020
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11037	NC_022130	AG	3	6	523687	523692	50 %	0 %	50 %	0 %	532531020
11038	NC_022130	GAA	2	6	523727	523732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531020
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11045	NC_022130	A	6	6	524003	524008	100 %	0 %	0 %	0 %	532531020
11046	NC_022130	AAG	2	6	524010	524015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531020
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11048	NC_022130	TGAT	2	8	524100	524107	25 %	50 %	25 %	0 %	532531020
11049	NC_022130	GAA	2	6	524116	524121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531020
11050	NC_022130	A	8	8	524143	524150	100 %	0 %	0 %	0 %	532531020
11051	NC_022130	ACC	2	6	524171	524176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_022130	TGGGCA	2	12	524193	524204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532531021
11053	NC_022130	ACG	2	6	524243	524248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531021
11054	NC_022130	T	7	7	524338	524344	0 %	100 %	0 %	0 %	532531022
11055	NC_022130	TTG	2	6	524353	524358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531022
11056	NC_022130	T	7	7	524440	524446	0 %	100 %	0 %	0 %	532531022
11057	NC_022130	GTTT	2	8	524452	524459	0 %	75 %	25 %	0 %	532531022
11058	NC_022130	CAAGC	2	10	524555	524564	40 %	0 %	20 %	40 %	532531022
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11062	NC_022130	GA	3	6	524852	524857	50 %	0 %	50 %	0 %	532531022
11063	NC_022130	TAA	2	6	524951	524956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531022
11064	NC_022130	T	6	6	524980	524985	0 %	100 %	0 %	0 %	532531022
11065	NC_022130	ATG	2	6	524986	524991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531022
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11068	NC_022130	A	6	6	525092	525097	100 %	0 %	0 %	0 %	532531022
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11070	NC_022130	GATGC	2	10	525135	525144	20 %	20 %	40 %	20 %	532531022
11071	NC_022130	TAA	2	6	525173	525178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_022130	A	6	6	525204	525209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_022130	TAA	2	6	525218	525223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531023
11074	NC_022130	A	8	8	525247	525254	100 %	0 %	0 %	0 %	532531023
11075	NC_022130	CA	3	6	525265	525270	50 %	0 %	0 %	50 %	532531023
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11081	NC_022130	CCA	2	6	525461	525466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531023
11082	NC_022130	A	8	8	525476	525483	100 %	0 %	0 %	0 %	532531023
11083	NC_022130	CAAAT	2	10	525485	525494	60 %	20 %	0 %	20 %	532531023
11084	NC_022130	ACT	2	6	525536	525541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531023
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11086	NC_022130	A	6	6	525560	525565	100 %	0 %	0 %	0 %	532531023
11087	NC_022130	TGCC	2	8	525587	525594	0 %	25 %	25 %	50 %	532531023
11088	NC_022130	T	6	6	525636	525641	0 %	100 %	0 %	0 %	532531023
11089	NC_022130	AT	3	6	525643	525648	50 %	50 %	0 %	0 %	532531023
11090	NC_022130	T	6	6	525673	525678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_022130	TAAAA	2	10	525709	525718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_022130	AGCAT	2	10	525739	525748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11093	NC_022130	TCAAA	2	10	525762	525771	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11094	NC_022130	TGT	2	6	525800	525805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_022130	ACA	2	6	525822	525827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_022130	TTG	2	6	525974	525979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532531024
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11098	NC_022130	ATA	2	6	526068	526073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531024
11099	NC_022130	TCA	2	6	526074	526079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531024
11100	NC_022130	CTT	2	6	526090	526095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531024
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11102	NC_022130	CAT	2	6	526211	526216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531024
11103	NC_022130	CCA	2	6	526251	526256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531024
11104	NC_022130	ATA	3	9	526272	526280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531024
11105	NC_022130	AGG	2	6	526300	526305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532531024
11106	NC_022130	TCT	2	6	526350	526355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531024
11107	NC_022130	TTC	2	6	526514	526519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531024
11108	NC_022130	CAC	2	6	526526	526531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531024
11109	NC_022130	AC	3	6	526562	526567	50 %	0 %	0 %	50 %	532531024
11110	NC_022130	ATC	2	6	526577	526582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531024
11111	NC_022130	AGATC	2	10	526624	526633	40 %	20 %	20 %	20 %	532531024
11112	NC_022130	T	6	6	526735	526740	0 %	100 %	0 %	0 %	532531024
11113	NC_022130	TAAA	2	8	526826	526833	75 %	25 %	0 %	0 %	532531024
11114	NC_022130	T	6	6	526869	526874	0 %	100 %	0 %	0 %	532531025
11115	NC_022130	CCA	2	6	526897	526902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531025
11116	NC_022130	TCA	2	6	526919	526924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532531025
11117	NC_022130	TTGA	2	8	526995	527002	25 %	50 %	25 %	0 %	532531025
11118	NC_022130	TGG	2	6	527003	527008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531025
11119	NC_022130	ATG	2	6	527035	527040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531025
11120	NC_022130	GGA	2	6	527110	527115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532531025
11121	NC_022130	GGGGCT	2	12	527269	527280	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532531025
11122	NC_022130	CAC	2	6	527297	527302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531025
11123	NC_022130	T	6	6	527346	527351	0 %	100 %	0 %	0 %	532531025
11124	NC_022130	TTC	2	6	527364	527369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531025
11125	NC_022130	T	6	6	527439	527444	0 %	100 %	0 %	0 %	532531025
11126	NC_022130	CCA	2	6	527488	527493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531025
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11128	NC_022130	CCA	2	6	527548	527553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532531025
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11131	NC_022130	CAAAA	2	10	527723	527732	80 %	0 %	0 %	20 %	532531025
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11133	NC_022130	CAGAGC	2	12	527771	527782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531025
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11139	NC_022130	TCT	2	6	528040	528045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531025
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11142	NC_022130	CTC	2	6	528108	528113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11144	NC_022130	TAT	2	6	528215	528220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532531026
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11150	NC_022130	ACA	2	6	528522	528527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11167	NC_022130	T	6	6	529520	529525	0 %	100 %	0 %	0 %	532531028
11168	NC_022130	CTT	2	6	529554	529559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531028
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11171	NC_022130	T	6	6	529765	529770	0 %	100 %	0 %	0 %	532531029
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11191	NC_022130	TTACA	2	10	531152	531161	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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11193	NC_022130	AGA	2	6	531280	531285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531031
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11210	NC_022130	TAAAA	2	10	532159	532168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11211	NC_022130	TAT	2	6	532182	532187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11212	NC_022130	AAT	2	6	532188	532193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11231	NC_022130	ATTG	2	8	533019	533026	25 %	50 %	25 %	0 %	532531033
11232	NC_022130	T	6	6	533063	533068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11233	NC_022130	T	6	6	533084	533089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_022130	T	8	8	533150	533157	0 %	100 %	0 %	0 %	532531034
11235	NC_022130	T	7	7	533164	533170	0 %	100 %	0 %	0 %	532531034
11236	NC_022130	T	6	6	533207	533212	0 %	100 %	0 %	0 %	532531034
11237	NC_022130	TG	4	8	533239	533246	0 %	50 %	50 %	0 %	532531034
11238	NC_022130	T	7	7	533266	533272	0 %	100 %	0 %	0 %	532531034
11239	NC_022130	AGCG	2	8	533357	533364	25 %	0 %	50 %	25 %	532531034
11240	NC_022130	T	7	7	533410	533416	0 %	100 %	0 %	0 %	532531034
11241	NC_022130	AC	3	6	533461	533466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11242	NC_022130	ATG	2	6	533502	533507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531035
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11244	NC_022130	AGC	2	6	533570	533575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531035
11245	NC_022130	T	7	7	533642	533648	0 %	100 %	0 %	0 %	532531035
11246	NC_022130	T	6	6	533674	533679	0 %	100 %	0 %	0 %	532531035
11247	NC_022130	GAA	2	6	533723	533728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532531035
11248	NC_022130	CTT	2	6	533760	533765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531035
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11250	NC_022130	GGT	2	6	533829	533834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532531035
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11376	NC_022130	ACCAT	2	10	539630	539639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11377	NC_022130	TGA	2	6	539655	539660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532531043
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11379	NC_022130	ACG	2	6	539749	539754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532531043
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11383	NC_022130	A	6	6	540176	540181	100 %	0 %	0 %	0 %	532531044
11384	NC_022130	G	6	6	540192	540197	0 %	0 %	100 %	0 %	532531044
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11388	NC_022130	CCCA	2	8	540586	540593	25 %	0 %	0 %	75 %	532531044
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11392	NC_022130	A	6	6	540818	540823	100 %	0 %	0 %	0 %	532531044
11393	NC_022130	A	6	6	540830	540835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11394	NC_022130	TGCGT	2	10	540842	540851	0 %	40 %	40 %	20 %	532531045
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11396	NC_022130	T	6	6	540867	540872	0 %	100 %	0 %	0 %	532531045
11397	NC_022130	T	6	6	540922	540927	0 %	100 %	0 %	0 %	532531045
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11405	NC_022130	A	6	6	541630	541635	100 %	0 %	0 %	0 %	532531045
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11410	NC_022130	AATCA	2	10	541926	541935	60 %	20 %	0 %	20 %	532531046
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11423	NC_022130	TTA	2	6	542612	542617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11424	NC_022130	A	7	7	542729	542735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11425	NC_022130	TAT	2	6	542779	542784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11426	NC_022130	TTTA	2	8	542820	542827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11429	NC_022130	A	6	6	542888	542893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11430	NC_022130	TAA	2	6	542929	542934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532531047
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11496	NC_022130	CCCA	3	12	546150	546161	25 %	0 %	0 %	75 %	532531050
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11500	NC_022130	CTT	2	6	546348	546353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532531050

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