MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 69231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021921	GACC	2	8	37862	37869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_021921	CCG	2	6	37908	37913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_021921	GGT	2	6	38019	38024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076498
1004	NC_021921	CAGCG	2	10	38095	38104	20 %	0 %	40 %	40 %	529076498
1005	NC_021921	AGGCG	2	10	38124	38133	20 %	0 %	60 %	20 %	529076498
1006	NC_021921	GTC	2	6	38134	38139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1007	NC_021921	GAG	2	6	38161	38166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076498
1008	NC_021921	GTC	2	6	38167	38172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1009	NC_021921	GCC	2	6	38185	38190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076498
1010	NC_021921	TCG	2	6	38204	38209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1011	NC_021921	GAC	2	6	38227	38232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1012	NC_021921	ACG	2	6	38258	38263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1013	NC_021921	ACA	3	9	38297	38305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076498
1014	NC_021921	GTC	2	6	38323	38328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1015	NC_021921	CGC	2	6	38373	38378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076498
1016	NC_021921	TCG	2	6	38387	38392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1017	NC_021921	GAC	2	6	38449	38454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1018	NC_021921	TAC	2	6	38455	38460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076498
1019	NC_021921	CGA	2	6	38463	38468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1020	NC_021921	CGC	2	6	38502	38507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076498
1021	NC_021921	TCC	2	6	38543	38548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076498
1022	NC_021921	CGG	2	6	38583	38588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076498
1023	NC_021921	GGC	2	6	38625	38630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076498
1024	NC_021921	CGT	3	9	38640	38648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1025	NC_021921	GAG	2	6	38671	38676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076498
1026	NC_021921	ACA	2	6	38756	38761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076498
1027	NC_021921	CGAC	2	8	38777	38784	25 %	0 %	25 %	50 %	529076498
1028	NC_021921	TCG	2	6	38822	38827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1029	NC_021921	GAC	2	6	38874	38879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076498
1030	NC_021921	CAA	2	6	38937	38942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076498
1031	NC_021921	GGC	2	6	38973	38978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076498
1032	NC_021921	GAG	2	6	38983	38988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076498
1033	NC_021921	CCGA	2	8	39020	39027	25 %	0 %	25 %	50 %	529076499
1034	NC_021921	CTG	2	6	39051	39056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1035	NC_021921	CGT	2	6	39062	39067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1036	NC_021921	CGA	3	9	39137	39145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1037	NC_021921	GAC	2	6	39165	39170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1038	NC_021921	TCA	2	6	39181	39186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076499
1039	NC_021921	CG	3	6	39201	39206	0 %	0 %	50 %	50 %	529076499
1040	NC_021921	CGT	2	6	39215	39220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1041	NC_021921	GCG	2	6	39236	39241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076499
1042	NC_021921	ACT	2	6	39319	39324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076499
1043	NC_021921	CAAGC	2	10	39329	39338	40 %	0 %	20 %	40 %	529076499
1044	NC_021921	GTC	2	6	39339	39344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1045	NC_021921	TCG	2	6	39373	39378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1046	NC_021921	GAGTTC	2	12	39381	39392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529076499
1047	NC_021921	CGA	2	6	39395	39400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1048	NC_021921	GAG	2	6	39522	39527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076499
1049	NC_021921	CGA	2	6	39569	39574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1050	NC_021921	CGA	2	6	39586	39591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1051	NC_021921	CGA	2	6	39596	39601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1052	NC_021921	CGA	2	6	39650	39655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1053	NC_021921	ACT	2	6	39688	39693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076499
1054	NC_021921	GAG	2	6	39729	39734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076499
1055	NC_021921	CGT	2	6	39818	39823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1056	NC_021921	ACG	2	6	39832	39837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1057	NC_021921	ACA	2	6	39868	39873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076499
1058	NC_021921	AAG	2	6	39876	39881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076499
1059	NC_021921	GTC	2	6	39891	39896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076499
1060	NC_021921	GACT	2	8	39907	39914	25 %	25 %	25 %	25 %	529076499
1061	NC_021921	CTC	2	6	39939	39944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076499
1062	NC_021921	CCG	2	6	39985	39990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076499
1063	NC_021921	ACTC	2	8	40052	40059	25 %	25 %	0 %	50 %	529076500
1064	NC_021921	GTCG	2	8	40117	40124	0 %	25 %	50 %	25 %	529076500
1065	NC_021921	CGC	2	6	40127	40132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076500
1066	NC_021921	CGGC	2	8	40141	40148	0 %	0 %	50 %	50 %	529076500
1067	NC_021921	CGG	2	6	40168	40173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076500
1068	NC_021921	AGA	2	6	40222	40227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076500
1069	NC_021921	AAG	2	6	40284	40289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076500
1070	NC_021921	CGA	2	6	40319	40324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1071	NC_021921	CT	3	6	40373	40378	0 %	50 %	0 %	50 %	529076500
1072	NC_021921	TC	3	6	40381	40386	0 %	50 %	0 %	50 %	529076500
1073	NC_021921	TCG	2	6	40410	40415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1074	NC_021921	CCG	2	6	40428	40433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076500
1075	NC_021921	CGT	2	6	40483	40488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1076	NC_021921	GAC	2	6	40490	40495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1077	NC_021921	CGA	2	6	40507	40512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1078	NC_021921	CGT	2	6	40520	40525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076500
1079	NC_021921	CT	3	6	40594	40599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_021921	TGCTT	2	10	40627	40636	0 %	60 %	20 %	20 %	529076501
1081	NC_021921	CAG	2	6	40725	40730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1082	NC_021921	GGC	2	6	40734	40739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076501
1083	NC_021921	CGC	2	6	40746	40751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076501
1084	NC_021921	GCG	2	6	40753	40758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076501
1085	NC_021921	GGCGT	2	10	40821	40830	0 %	20 %	60 %	20 %	529076501
1086	NC_021921	TCG	2	6	40880	40885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1087	NC_021921	CGGC	2	8	40889	40896	0 %	0 %	50 %	50 %	529076501
1088	NC_021921	GAC	2	6	40920	40925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1089	NC_021921	GGCG	2	8	41009	41016	0 %	0 %	75 %	25 %	529076501
1090	NC_021921	AGG	2	6	41065	41070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076501
1091	NC_021921	TCG	2	6	41074	41079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1092	NC_021921	CG	3	6	41195	41200	0 %	0 %	50 %	50 %	529076501
1093	NC_021921	TCT	2	6	41237	41242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076501
1094	NC_021921	TCG	2	6	41300	41305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1095	NC_021921	CAT	2	6	41322	41327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076501
1096	NC_021921	TCG	3	9	41330	41338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1097	NC_021921	GC	3	6	41383	41388	0 %	0 %	50 %	50 %	529076501
1098	NC_021921	GATC	2	8	41402	41409	25 %	25 %	25 %	25 %	529076501
1099	NC_021921	TCC	2	6	41413	41418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076501
1100	NC_021921	CGA	3	9	41420	41428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076501
1101	NC_021921	TC	3	6	41450	41455	0 %	50 %	0 %	50 %	529076501
1102	NC_021921	CCA	2	6	41482	41487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076501
1103	NC_021921	GTCTCT	2	12	41506	41517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529076501
1104	NC_021921	GGT	2	6	41523	41528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076501
1105	NC_021921	TC	3	6	41531	41536	0 %	50 %	0 %	50 %	529076501
1106	NC_021921	TTCG	2	8	41542	41549	0 %	50 %	25 %	25 %	529076501
1107	NC_021921	GGT	2	6	41565	41570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076501
1108	NC_021921	TGACG	2	10	41587	41596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_021921	GAA	2	6	41609	41614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021921	G	6	6	41704	41709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021921	CGA	2	6	41772	41777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076502
1112	NC_021921	GCGAGC	2	12	41822	41833	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529076502
1113	NC_021921	CCTCG	2	10	41859	41868	0 %	20 %	20 %	60 %	529076502
1114	NC_021921	CGA	2	6	41880	41885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076502
1115	NC_021921	CGA	2	6	41934	41939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076502
1116	NC_021921	TTC	2	6	42001	42006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076502
1117	NC_021921	CGA	2	6	42052	42057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1118	NC_021921	CGA	2	6	42164	42169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1119	NC_021921	C	6	6	42177	42182	0 %	0 %	0 %	100 %	529076503
1120	NC_021921	ACG	2	6	42184	42189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1121	NC_021921	CGA	2	6	42223	42228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1122	NC_021921	GAC	2	6	42266	42271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1123	NC_021921	CCGA	2	8	42294	42301	25 %	0 %	25 %	50 %	529076503
1124	NC_021921	CGC	2	6	42308	42313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1125	NC_021921	CGG	2	6	42329	42334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076503
1126	NC_021921	GCC	2	6	42354	42359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1127	NC_021921	CGC	2	6	42362	42367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1128	NC_021921	TCGGT	2	10	42408	42417	0 %	40 %	40 %	20 %	529076503
1129	NC_021921	CT	3	6	42500	42505	0 %	50 %	0 %	50 %	529076503
1130	NC_021921	GCA	2	6	42543	42548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1131	NC_021921	ACT	2	6	42551	42556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076503
1132	NC_021921	ATC	2	6	42561	42566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076503
1133	NC_021921	GCC	2	6	42567	42572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1134	NC_021921	ACG	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
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1143	NC_021921	GAG	2	6	42930	42935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1144	NC_021921	GAG	2	6	42951	42956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1145	NC_021921	GAG	2	6	42966	42971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076503
1146	NC_021921	CGGC	2	8	43009	43016	0 %	0 %	50 %	50 %	529076503
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1149	NC_021921	CG	3	6	43053	43058	0 %	0 %	50 %	50 %	529076503
1150	NC_021921	CGA	2	6	43114	43119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076503
1151	NC_021921	CCG	2	6	43128	43133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076503
1152	NC_021921	GCG	2	6	43141	43146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076503
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1155	NC_021921	CA	3	6	43335	43340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1156	NC_021921	GGC	2	6	43392	43397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1157	NC_021921	CCG	2	6	43459	43464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076504
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1161	NC_021921	CGG	2	6	43638	43643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076504
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1198	NC_021921	CGC	2	6	45665	45670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1199	NC_021921	CGT	2	6	45792	45797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076507
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1231	NC_021921	TTC	2	6	46890	46895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1232	NC_021921	AGC	2	6	46937	46942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1233	NC_021921	TTCGA	2	10	46949	46958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1234	NC_021921	CGC	2	6	46978	46983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1235	NC_021921	GGT	2	6	47070	47075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1236	NC_021921	CCT	2	6	47138	47143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1237	NC_021921	GCT	2	6	47184	47189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1238	NC_021921	TCG	2	6	47436	47441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1239	NC_021921	AGA	2	6	47461	47466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076509
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1241	NC_021921	TCCG	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	529076509
1242	NC_021921	TCA	2	6	47575	47580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076509
1243	NC_021921	GAC	3	9	47585	47593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076509
1244	NC_021921	CGAGTG	2	12	47614	47625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529076509
1245	NC_021921	CGG	2	6	47632	47637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076509
1246	NC_021921	TTC	2	6	47657	47662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076509
1247	NC_021921	GAT	2	6	47681	47686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076509
1248	NC_021921	GTA	2	6	47738	47743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076509
1249	NC_021921	GCC	2	6	47856	47861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1250	NC_021921	CGTT	2	8	47878	47885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1251	NC_021921	GAA	2	6	47952	47957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076510
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1281	NC_021921	CG	4	8	49108	49115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1282	NC_021921	GTC	2	6	49127	49132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1283	NC_021921	CG	3	6	49138	49143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1284	NC_021921	ACG	2	6	49269	49274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1287	NC_021921	CG	3	6	49411	49416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1288	NC_021921	CAC	2	6	49420	49425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1302	NC_021921	GCCC	2	8	49981	49988	0 %	0 %	25 %	75 %	529076512
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1364	NC_021921	CCA	2	6	52366	52371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076514
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1369	NC_021921	GACA	2	8	52612	52619	50 %	0 %	25 %	25 %	529076514
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1372	NC_021921	GCC	2	6	52674	52679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076514
1373	NC_021921	ACC	2	6	52723	52728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076514
1374	NC_021921	GCAC	2	8	52738	52745	25 %	0 %	25 %	50 %	529076514
1375	NC_021921	CAT	2	6	52783	52788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076514
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1378	NC_021921	GTC	2	6	52864	52869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076514
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1468	NC_021921	GC	4	8	56524	56531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1473	NC_021921	GTG	3	9	56740	56748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1476	NC_021921	CTA	2	6	56837	56842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1477	NC_021921	C	6	6	56846	56851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1479	NC_021921	GTA	2	6	56905	56910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1480	NC_021921	GTA	2	6	56933	56938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_021921	GTTC	2	8	57048	57055	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1483	NC_021921	GCC	2	6	57106	57111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1484	NC_021921	CGGCG	2	10	57117	57126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1485	NC_021921	AG	4	8	57134	57141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_021921	GT	3	6	57153	57158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_021921	TCC	2	6	57159	57164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1488	NC_021921	TGG	2	6	57192	57197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_021921	GTG	2	6	57200	57205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_021921	CCA	2	6	57208	57213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1491	NC_021921	CGC	2	6	57217	57222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1492	NC_021921	CAGT	2	8	57230	57237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1493	NC_021921	TGC	2	6	57290	57295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076517
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1498	NC_021921	CGT	2	6	57547	57552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076517
1499	NC_021921	ACC	2	6	57580	57585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076517
1500	NC_021921	GAG	2	6	57623	57628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076517

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