MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 7237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021913	CA	3	6	255944	255949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_021913	A	6	6	255952	255957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_021913	CAC	2	6	255986	255991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043661
5504	NC_021913	ACC	2	6	256020	256025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043661
5505	NC_021913	GCT	2	6	256067	256072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5506	NC_021913	CAC	2	6	256102	256107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043661
5507	NC_021913	CTG	2	6	256111	256116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5508	NC_021913	CAG	2	6	256127	256132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5509	NC_021913	ATC	2	6	256153	256158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043661
5510	NC_021913	GAG	2	6	256187	256192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043661
5511	NC_021913	ACCG	2	8	256237	256244	25 %	0 %	25 %	50 %	529043661
5512	NC_021913	GCC	2	6	256286	256291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043661
5513	NC_021913	CTC	2	6	256297	256302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043661
5514	NC_021913	GCT	2	6	256359	256364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5515	NC_021913	CGA	2	6	256368	256373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5516	NC_021913	GCC	2	6	256387	256392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043661
5517	NC_021913	TCG	2	6	256400	256405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5518	NC_021913	TTGC	2	8	256416	256423	0 %	50 %	25 %	25 %	529043661
5519	NC_021913	TC	3	6	256458	256463	0 %	50 %	0 %	50 %	529043661
5520	NC_021913	CCG	2	6	256479	256484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043661
5521	NC_021913	GAC	2	6	256516	256521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5522	NC_021913	GCT	2	6	256533	256538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5523	NC_021913	CTC	2	6	256612	256617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043661
5524	NC_021913	GGT	2	6	256674	256679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529043661
5525	NC_021913	TCG	2	6	256736	256741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043661
5526	NC_021913	CCGC	2	8	256775	256782	0 %	0 %	25 %	75 %	529043661
5527	NC_021913	GTT	2	6	256828	256833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529043661
5528	NC_021913	CGA	2	6	256910	256915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_021913	CGAC	2	8	256919	256926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_021913	GC	3	6	256937	256942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_021913	TCGC	2	8	256945	256952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_021913	GCGA	2	8	256977	256984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_021913	GC	3	6	256987	256992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_021913	CG	3	6	257019	257024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_021913	CCCG	2	8	257029	257036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5536	NC_021913	GAGC	2	8	257037	257044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_021913	G	6	6	257063	257068	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021913	AGC	2	6	257071	257076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_021913	CGC	2	6	257079	257084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_021913	CGGGCG	2	12	257140	257151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_021913	GGTC	2	8	257180	257187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_021913	GCGA	2	8	257188	257195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_021913	GCG	2	6	257210	257215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_021913	GCGGG	2	10	257217	257226	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5545	NC_021913	GTAC	2	8	257230	257237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_021913	AC	3	6	257236	257241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_021913	GC	3	6	257351	257356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_021913	GCG	2	6	257358	257363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_021913	CGT	2	6	257422	257427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043662
5550	NC_021913	CGA	2	6	257456	257461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043662
5551	NC_021913	GCAA	2	8	257542	257549	50 %	0 %	25 %	25 %	529043662
5552	NC_021913	CGT	2	6	257594	257599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043662
5553	NC_021913	GAT	2	6	257628	257633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043662
5554	NC_021913	CGA	3	9	257636	257644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043662
5555	NC_021913	TC	3	6	257862	257867	0 %	50 %	0 %	50 %	529043663
5556	NC_021913	CTC	2	6	257971	257976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043663
5557	NC_021913	CTCG	2	8	258144	258151	0 %	25 %	25 %	50 %	529043664
5558	NC_021913	GCCG	2	8	258174	258181	0 %	0 %	50 %	50 %	529043664
5559	NC_021913	GCC	2	6	258211	258216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043664
5560	NC_021913	GCG	2	6	258247	258252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043664
5561	NC_021913	GCG	2	6	258256	258261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043664
5562	NC_021913	TCG	2	6	258277	258282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043664
5563	NC_021913	GTC	2	6	258291	258296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043664
5564	NC_021913	GAC	2	6	258339	258344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043664
5565	NC_021913	GCG	2	6	258362	258367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529043664
5566	NC_021913	TCG	2	6	258388	258393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043664
5567	NC_021913	TCG	2	6	258430	258435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043664
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5570	NC_021913	GCGA	2	8	258489	258496	25 %	0 %	50 %	25 %	529043664
5571	NC_021913	CCG	2	6	258498	258503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043664
5572	NC_021913	CGA	2	6	258542	258547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043664
5573	NC_021913	TCG	2	6	258612	258617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043665
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5578	NC_021913	GTC	3	9	258821	258829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043665
5579	NC_021913	TCG	2	6	258836	258841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043665
5580	NC_021913	CCG	2	6	258932	258937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043665
5581	NC_021913	CGA	2	6	258976	258981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043665
5582	NC_021913	TCGCC	2	10	259048	259057	0 %	20 %	20 %	60 %	529043665
5583	NC_021913	CGAG	2	8	259062	259069	25 %	0 %	50 %	25 %	529043665
5584	NC_021913	TTC	2	6	259097	259102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529043665
5585	NC_021913	GAG	2	6	259103	259108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043665
5586	NC_021913	TTA	2	6	259183	259188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021913	CGAGA	2	10	259246	259255	40 %	0 %	40 %	20 %	529043666
5588	NC_021913	GTC	2	6	259258	259263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043666
5589	NC_021913	CCA	2	6	259292	259297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529043666
5590	NC_021913	AGCG	2	8	259369	259376	25 %	0 %	50 %	25 %	529043666
5591	NC_021913	CGA	2	6	259380	259385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043666
5592	NC_021913	TCGT	2	8	259477	259484	0 %	50 %	25 %	25 %	529043666
5593	NC_021913	CTCG	2	8	259509	259516	0 %	25 %	25 %	50 %	529043666
5594	NC_021913	CTG	2	6	259558	259563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043666
5595	NC_021913	AGC	2	6	259590	259595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043667
5596	NC_021913	ATCGA	2	10	259630	259639	40 %	20 %	20 %	20 %	529043667
5597	NC_021913	TCG	2	6	259741	259746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043667
5598	NC_021913	GAG	2	6	259788	259793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043667
5599	NC_021913	TCGT	2	8	259806	259813	0 %	50 %	25 %	25 %	529043667
5600	NC_021913	ATC	2	6	259827	259832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043667
5601	NC_021913	GC	3	6	259881	259886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_021913	CCT	2	6	259893	259898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_021913	AG	3	6	259920	259925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021913	AGG	2	6	259934	259939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021913	GAT	2	6	260015	260020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021913	AT	3	6	260019	260024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021913	GCCG	2	8	260028	260035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_021913	CGT	2	6	260101	260106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043668
5609	NC_021913	TTGC	2	8	260123	260130	0 %	50 %	25 %	25 %	529043668
5610	NC_021913	TCG	2	6	260151	260156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043668
5611	NC_021913	CGAC	2	8	260175	260182	25 %	0 %	25 %	50 %	529043668
5612	NC_021913	CTC	2	6	260186	260191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529043668
5613	NC_021913	GACGCC	2	12	260192	260203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529043668
5614	NC_021913	CGC	2	6	260215	260220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043668
5615	NC_021913	GC	3	6	260283	260288	0 %	0 %	50 %	50 %	529043668
5616	NC_021913	CGC	2	6	260296	260301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043668
5617	NC_021913	CAT	2	6	260314	260319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043668
5618	NC_021913	CGC	2	6	260335	260340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043668
5619	NC_021913	GCCG	2	8	260446	260453	0 %	0 %	50 %	50 %	529043668
5620	NC_021913	CGA	3	9	260497	260505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043668
5621	NC_021913	CGC	2	6	260548	260553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529043668
5622	NC_021913	GACGTC	2	12	260588	260599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529043668
5623	NC_021913	GGCT	2	8	260680	260687	0 %	25 %	50 %	25 %	529043668
5624	NC_021913	ACGA	2	8	260766	260773	50 %	0 %	25 %	25 %	529043668
5625	NC_021913	GAC	2	6	260845	260850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043668
5626	NC_021913	CAG	2	6	260868	260873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043668
5627	NC_021913	GCCGG	2	10	260903	260912	0 %	0 %	60 %	40 %	529043668
5628	NC_021913	CGA	2	6	260959	260964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043668
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5647	NC_021913	GA	3	6	261475	261480	50 %	0 %	50 %	0 %	529043668
5648	NC_021913	GCTG	2	8	261496	261503	0 %	25 %	50 %	25 %	529043668
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5657	NC_021913	GTC	2	6	261772	261777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529043668
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5659	NC_021913	GA	3	6	261794	261799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5662	NC_021913	CGA	3	9	262146	262154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5736	NC_021913	TCGT	2	8	265370	265377	0 %	50 %	25 %	25 %	529043675
5737	NC_021913	TTCC	2	8	265526	265533	0 %	50 %	0 %	50 %	529043675
5738	NC_021913	GGA	2	6	265551	265556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529043675
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5742	NC_021913	CGA	2	6	265590	265595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043675
5743	NC_021913	CGA	2	6	265644	265649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529043675
5744	NC_021913	AAGC	2	8	265666	265673	50 %	0 %	25 %	25 %	529043675
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5746	NC_021913	GACG	2	8	265710	265717	25 %	0 %	50 %	25 %	529043675
5747	NC_021913	CTA	2	6	265737	265742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529043675
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5866	NC_021913	CCT	2	6	271027	271032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5867	NC_021913	GTT	2	6	271104	271109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5997	NC_021913	ACA	2	6	277621	277626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043683
5998	NC_021913	TGA	2	6	277633	277638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529043683
5999	NC_021913	AAC	2	6	277659	277664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529043683
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