MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 33492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	C	6	6	28	33	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_021882	TGG	2	6	51	56	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021882	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021882	CTG	2	6	135	140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021882	AG	3	6	157	162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021882	ACC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021882	A	6	6	232	237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021882	CAAAA	2	10	264	273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021882	A	6	6	270	275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021882	CAGAGC	2	12	312	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021882	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021882	TGAA	2	8	422	429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021882	TCA	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021882	A	6	6	575	580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021882	TCTT	2	8	584	591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021882	CATTCC	2	12	616	627	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021882	TAC	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021882	CTC	2	6	655	660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021882	CTAA	2	8	714	721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021882	TTTAG	2	10	811	820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021882	ATTT	2	8	967	974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021882	T	7	7	972	978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021882	CAC	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021882	T	7	7	1023	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021882	TCA	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021882	TTTC	2	8	1063	1070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021882	CTG	2	6	1182	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021882	CTC	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021882	ACC	2	6	1246	1251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021882	ACA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021882	AAT	2	6	1331	1336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021882	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021882	CCA	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021882	TC	3	6	1472	1477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021882	ATC	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021882	C	6	6	1700	1705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_021882	AGT	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021882	TCA	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021882	CT	3	6	1810	1815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021882	TCT	2	6	1865	1870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021882	CAC	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021882	TTC	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021882	CTT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465357
44	NC_021882	T	6	6	2283	2288	0 %	100 %	0 %	0 %	526465357
45	NC_021882	T	6	6	2290	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	526465357
46	NC_021882	ACC	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465357
47	NC_021882	TCA	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465357
48	NC_021882	TA	3	6	2497	2502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021882	T	6	6	2535	2540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021882	TAA	2	6	2554	2559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021882	CGCAT	2	10	2637	2646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021882	ACGG	2	8	2663	2670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021882	GAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021882	AAAT	2	8	2841	2848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021882	C	7	7	2893	2899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_021882	ATT	3	9	3058	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021882	T	8	8	3076	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021882	TAA	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021882	ATA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021882	AAT	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021882	AAT	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021882	TAG	2	6	3483	3488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021882	A	7	7	3535	3541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021882	TTG	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021882	CAT	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021882	A	6	6	3815	3820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021882	TAC	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021882	AC	3	6	3929	3934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021882	A	7	7	3940	3946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021882	AAAATA	2	12	3967	3978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021882	TC	3	6	4043	4048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021882	ATG	2	6	4060	4065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021882	TGA	2	6	4082	4087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021882	AG	3	6	4094	4099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021882	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021882	TTC	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021882	TTC	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021882	TAG	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021882	TGA	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465358
80	NC_021882	TCA	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465358
81	NC_021882	A	6	6	4438	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	526465358
82	NC_021882	CAAG	2	8	4472	4479	50 %	0 %	25 %	25 %	526465358
83	NC_021882	TCT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465358
84	NC_021882	T	6	6	4683	4688	0 %	100 %	0 %	0 %	526465358
85	NC_021882	GAAA	2	8	4701	4708	75 %	0 %	25 %	0 %	526465358
86	NC_021882	TCCAA	2	10	4773	4782	40 %	20 %	0 %	40 %	526465358
87	NC_021882	GCC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526465358
88	NC_021882	T	6	6	4895	4900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021882	A	6	6	5044	5049	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
90	NC_021882	TCA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465359
91	NC_021882	T	6	6	5058	5063	0 %	100 %	0 %	0 %	526465359
92	NC_021882	AAAG	2	8	5064	5071	75 %	0 %	25 %	0 %	526465359
93	NC_021882	T	6	6	5108	5113	0 %	100 %	0 %	0 %	526465359
94	NC_021882	A	6	6	5125	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
95	NC_021882	GC	3	6	5132	5137	0 %	0 %	50 %	50 %	526465359
96	NC_021882	CCG	2	6	5149	5154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526465359
97	NC_021882	A	7	7	5211	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
98	NC_021882	A	6	6	5402	5407	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
99	NC_021882	CT	3	6	5463	5468	0 %	50 %	0 %	50 %	526465359
100	NC_021882	TTC	2	6	5480	5485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465359
101	NC_021882	TC	3	6	5500	5505	0 %	50 %	0 %	50 %	526465359
102	NC_021882	A	7	7	5517	5523	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
103	NC_021882	GAC	2	6	5657	5662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465359
104	NC_021882	T	9	9	5729	5737	0 %	100 %	0 %	0 %	526465359
105	NC_021882	A	6	6	5754	5759	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
106	NC_021882	T	6	6	5837	5842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021882	T	6	6	5858	5863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021882	T	7	7	5938	5944	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
109	NC_021882	GAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465360
110	NC_021882	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
111	NC_021882	T	6	6	6024	6029	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
112	NC_021882	T	7	7	6040	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
113	NC_021882	AGCG	2	8	6098	6105	25 %	0 %	50 %	25 %	526465360
114	NC_021882	ATG	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465360
115	NC_021882	GAGC	2	8	6250	6257	25 %	0 %	50 %	25 %	526465360
116	NC_021882	TTG	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465360
117	NC_021882	AGC	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465360
118	NC_021882	TGT	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465360
119	NC_021882	T	7	7	6384	6390	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
120	NC_021882	GA	3	6	6399	6404	50 %	0 %	50 %	0 %	526465360
121	NC_021882	T	6	6	6416	6421	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
122	NC_021882	GAAT	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	526465360
123	NC_021882	GAA	2	6	6465	6470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465360
124	NC_021882	TC	3	6	6504	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	526465360
125	NC_021882	GGCGT	2	10	6528	6537	0 %	20 %	60 %	20 %	526465360
126	NC_021882	TGA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465360
127	NC_021882	G	7	7	6621	6627	0 %	0 %	100 %	0 %	526465360
128	NC_021882	TGAT	2	8	6727	6734	25 %	50 %	25 %	0 %	526465360
129	NC_021882	TCA	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465360
130	NC_021882	A	7	7	6768	6774	100 %	0 %	0 %	0 %	526465360
131	NC_021882	ACC	2	6	6786	6791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465360
132	NC_021882	TTTTC	2	10	6814	6823	0 %	80 %	0 %	20 %	526465360
133	NC_021882	CTA	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465360
134	NC_021882	T	6	6	6888	6893	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
135	NC_021882	AT	3	6	6995	7000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021882	GAA	2	6	7017	7022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021882	ATA	2	6	7064	7069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021882	T	6	6	7083	7088	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
139	NC_021882	A	6	6	7147	7152	100 %	0 %	0 %	0 %	526465361
140	NC_021882	GCA	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465361
141	NC_021882	T	6	6	7370	7375	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
142	NC_021882	A	6	6	7384	7389	100 %	0 %	0 %	0 %	526465361
143	NC_021882	T	7	7	7391	7397	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
144	NC_021882	AAAC	2	8	7398	7405	75 %	0 %	0 %	25 %	526465361
145	NC_021882	GC	3	6	7408	7413	0 %	0 %	50 %	50 %	526465361
146	NC_021882	CT	3	6	7429	7434	0 %	50 %	0 %	50 %	526465361
147	NC_021882	A	6	6	7459	7464	100 %	0 %	0 %	0 %	526465361
148	NC_021882	T	7	7	7534	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
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412	NC_021882	T	6	6	20416	20421	0 %	100 %	0 %	0 %	526466584
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414	NC_021882	TAC	2	6	20428	20433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526466584
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416	NC_021882	T	6	6	20458	20463	0 %	100 %	0 %	0 %	526466584
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