MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_021521	ACC	2	6	2266856	2266861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060912
44502	NC_021521	TGT	2	6	2266940	2266945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060912
44503	NC_021521	A	8	8	2267013	2267020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44504	NC_021521	TATGC	2	10	2267038	2267047	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44505	NC_021521	A	6	6	2267164	2267169	100 %	0 %	0 %	0 %	514060913
44506	NC_021521	TGG	2	6	2267228	2267233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060913
44507	NC_021521	GAT	2	6	2267346	2267351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060913
44508	NC_021521	AAC	2	6	2267443	2267448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060913
44509	NC_021521	TGAT	2	8	2267536	2267543	25 %	50 %	25 %	0 %	514060913
44510	NC_021521	TTC	2	6	2267570	2267575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060913
44511	NC_021521	TAT	2	6	2267648	2267653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060913
44512	NC_021521	CAT	2	6	2267753	2267758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060913
44513	NC_021521	TAC	2	6	2267767	2267772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060913
44514	NC_021521	CA	3	6	2267777	2267782	50 %	0 %	0 %	50 %	514060913
44515	NC_021521	CCG	2	6	2267864	2267869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060913
44516	NC_021521	A	6	6	2267874	2267879	100 %	0 %	0 %	0 %	514060913
44517	NC_021521	CAGAC	2	10	2267894	2267903	40 %	0 %	20 %	40 %	514060913
44518	NC_021521	TGA	2	6	2267923	2267928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060913
44519	NC_021521	TTA	2	6	2268017	2268022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060913
44520	NC_021521	TGTT	2	8	2268040	2268047	0 %	75 %	25 %	0 %	514060913
44521	NC_021521	TATTCT	2	12	2268072	2268083	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	514060913
44522	NC_021521	TCG	2	6	2268116	2268121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060913
44523	NC_021521	AAG	2	6	2268137	2268142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060913
44524	NC_021521	AAAC	2	8	2268144	2268151	75 %	0 %	0 %	25 %	514060913
44525	NC_021521	AAT	2	6	2268162	2268167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44526	NC_021521	TGAG	2	8	2268172	2268179	25 %	25 %	50 %	0 %	514060914
44527	NC_021521	T	6	6	2268213	2268218	0 %	100 %	0 %	0 %	514060914
44528	NC_021521	TTTATT	2	12	2268224	2268235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	514060914
44529	NC_021521	TTGGT	2	10	2268269	2268278	0 %	60 %	40 %	0 %	514060914
44530	NC_021521	CAA	2	6	2268280	2268285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060914
44531	NC_021521	TGG	2	6	2268356	2268361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060914
44532	NC_021521	GTTGT	2	10	2268390	2268399	0 %	60 %	40 %	0 %	514060914
44533	NC_021521	CTC	2	6	2268481	2268486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060915
44534	NC_021521	TTA	2	6	2268487	2268492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060915
44535	NC_021521	ACA	2	6	2268542	2268547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060915
44536	NC_021521	ACT	2	6	2268554	2268559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060915
44537	NC_021521	TTTG	2	8	2268575	2268582	0 %	75 %	25 %	0 %	514060915
44538	NC_021521	TGC	2	6	2268731	2268736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060915
44539	NC_021521	GAA	2	6	2268822	2268827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060915
44540	NC_021521	CAT	2	6	2268909	2268914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060915
44541	NC_021521	AGA	2	6	2268917	2268922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060915
44542	NC_021521	ATG	3	9	2268963	2268971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060915
44543	NC_021521	A	6	6	2268976	2268981	100 %	0 %	0 %	0 %	514060915
44544	NC_021521	ACCG	2	8	2268991	2268998	25 %	0 %	25 %	50 %	514060915
44545	NC_021521	CAG	3	9	2269014	2269022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060915
44546	NC_021521	GA	3	6	2269075	2269080	50 %	0 %	50 %	0 %	514060915
44547	NC_021521	CAA	2	6	2269272	2269277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060915
44548	NC_021521	GGC	2	6	2269302	2269307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060915
44549	NC_021521	AAG	3	9	2269312	2269320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060915
44550	NC_021521	AGTT	2	8	2269399	2269406	25 %	50 %	25 %	0 %	514060915
44551	NC_021521	ATT	2	6	2269445	2269450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060915
44552	NC_021521	CAA	2	6	2269461	2269466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060915
44553	NC_021521	CAA	2	6	2269470	2269475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060915
44554	NC_021521	AAC	2	6	2269540	2269545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060915
44555	NC_021521	CAG	2	6	2269620	2269625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060916
44556	NC_021521	ATTG	2	8	2269661	2269668	25 %	50 %	25 %	0 %	514060916
44557	NC_021521	ATCA	2	8	2269691	2269698	50 %	25 %	0 %	25 %	514060916
44558	NC_021521	AACC	2	8	2269782	2269789	50 %	0 %	0 %	50 %	514060916
44559	NC_021521	TAT	2	6	2269804	2269809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060916
44560	NC_021521	CAG	2	6	2269866	2269871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060916
44561	NC_021521	TAG	2	6	2269908	2269913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060916
44562	NC_021521	AAC	2	6	2269939	2269944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060916
44563	NC_021521	AAC	2	6	2269947	2269952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060916
44564	NC_021521	CA	3	6	2270101	2270106	50 %	0 %	0 %	50 %	514060916
44565	NC_021521	TAC	2	6	2270152	2270157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060916
44566	NC_021521	GGCT	2	8	2270166	2270173	0 %	25 %	50 %	25 %	514060916
44567	NC_021521	TCAATG	2	12	2270256	2270267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514060916
44568	NC_021521	TTG	2	6	2270370	2270375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060916
44569	NC_021521	ATAAA	2	10	2270448	2270457	80 %	20 %	0 %	0 %	514060916
44570	NC_021521	CAA	2	6	2270484	2270489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060916
44571	NC_021521	TCTGA	2	10	2270501	2270510	20 %	40 %	20 %	20 %	514060916
44572	NC_021521	GA	3	6	2270559	2270564	50 %	0 %	50 %	0 %	514060916
44573	NC_021521	GGT	2	6	2270620	2270625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060916
44574	NC_021521	TGT	2	6	2270707	2270712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060916
44575	NC_021521	TAG	2	6	2270721	2270726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060916
44576	NC_021521	ATC	2	6	2270727	2270732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060916
44577	NC_021521	ATCT	2	8	2270760	2270767	25 %	50 %	0 %	25 %	514060916
44578	NC_021521	TGGT	2	8	2270774	2270781	0 %	50 %	50 %	0 %	514060916
44579	NC_021521	AATT	2	8	2270804	2270811	50 %	50 %	0 %	0 %	514060916
44580	NC_021521	TTA	2	6	2270816	2270821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44581	NC_021521	TA	4	8	2270845	2270852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44582	NC_021521	ATC	2	6	2270858	2270863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44583	NC_021521	ATT	2	6	2270909	2270914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060917
44584	NC_021521	CTA	2	6	2271067	2271072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060917
44585	NC_021521	A	6	6	2271080	2271085	100 %	0 %	0 %	0 %	514060917
44586	NC_021521	T	6	6	2271161	2271166	0 %	100 %	0 %	0 %	514060917
44587	NC_021521	GTG	3	9	2271236	2271244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060917
44588	NC_021521	GAA	2	6	2271284	2271289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060917
44589	NC_021521	GCG	2	6	2271308	2271313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060917
44590	NC_021521	A	6	6	2271334	2271339	100 %	0 %	0 %	0 %	514060917
44591	NC_021521	ACC	2	6	2271417	2271422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060917
44592	NC_021521	T	6	6	2271429	2271434	0 %	100 %	0 %	0 %	514060917
44593	NC_021521	TG	3	6	2271473	2271478	0 %	50 %	50 %	0 %	514060917
44594	NC_021521	CG	3	6	2271542	2271547	0 %	0 %	50 %	50 %	514060917
44595	NC_021521	GCG	2	6	2271614	2271619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060917
44596	NC_021521	CAA	2	6	2271743	2271748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060917
44597	NC_021521	CAACAG	2	12	2271767	2271778	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	514060917
44598	NC_021521	T	6	6	2271788	2271793	0 %	100 %	0 %	0 %	514060917
44599	NC_021521	CT	3	6	2271912	2271917	0 %	50 %	0 %	50 %	514060917
44600	NC_021521	CT	3	6	2272058	2272063	0 %	50 %	0 %	50 %	514060917
44601	NC_021521	CTG	2	6	2272091	2272096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060917
44602	NC_021521	A	6	6	2272163	2272168	100 %	0 %	0 %	0 %	514060917
44603	NC_021521	CAAAC	2	10	2272248	2272257	60 %	0 %	0 %	40 %	514060917
44604	NC_021521	CAA	2	6	2272304	2272309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060917
44605	NC_021521	A	6	6	2272328	2272333	100 %	0 %	0 %	0 %	514060917
44606	NC_021521	TTG	2	6	2272395	2272400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060917
44607	NC_021521	A	6	6	2272456	2272461	100 %	0 %	0 %	0 %	514060917
44608	NC_021521	ATG	2	6	2272473	2272478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060917
44609	NC_021521	TGA	2	6	2272482	2272487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060917
44610	NC_021521	TGA	2	6	2272528	2272533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060917
44611	NC_021521	GCAG	2	8	2272576	2272583	25 %	0 %	50 %	25 %	514060917
44612	NC_021521	TCG	2	6	2272645	2272650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060918
44613	NC_021521	ACA	2	6	2272683	2272688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060918
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44615	NC_021521	GGT	2	6	2272825	2272830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060918
44616	NC_021521	T	6	6	2272841	2272846	0 %	100 %	0 %	0 %	514060918
44617	NC_021521	TGA	2	6	2272943	2272948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060918
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44619	NC_021521	ACGG	2	8	2272982	2272989	25 %	0 %	50 %	25 %	514060918
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44731	NC_021521	TATG	2	8	2278822	2278829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44740	NC_021521	TTA	2	6	2279230	2279235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44741	NC_021521	GCT	2	6	2279263	2279268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44742	NC_021521	AGC	2	6	2279271	2279276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44743	NC_021521	AAG	2	6	2279312	2279317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44744	NC_021521	GAA	2	6	2279377	2279382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44745	NC_021521	AAT	2	6	2279406	2279411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44746	NC_021521	ATT	2	6	2279418	2279423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44749	NC_021521	GTG	2	6	2279506	2279511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44858	NC_021521	TAT	2	6	2284377	2284382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060927
44859	NC_021521	TGG	2	6	2284401	2284406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060927
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44862	NC_021521	GCA	2	6	2284624	2284629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060927
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44877	NC_021521	ATA	2	6	2285110	2285115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44879	NC_021521	TGGA	2	8	2285164	2285171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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44881	NC_021521	GATG	2	8	2285267	2285274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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44890	NC_021521	TAAA	2	8	2285607	2285614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44981	NC_021521	AAC	2	6	2289573	2289578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060933
44982	NC_021521	TCAT	2	8	2289580	2289587	25 %	50 %	0 %	25 %	514060933
44983	NC_021521	CCG	2	6	2289661	2289666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060933
44984	NC_021521	T	6	6	2289732	2289737	0 %	100 %	0 %	0 %	514060933
44985	NC_021521	ATT	2	6	2289751	2289756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060933
44986	NC_021521	ACG	2	6	2289845	2289850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060934
44987	NC_021521	GT	3	6	2289893	2289898	0 %	50 %	50 %	0 %	514060934
44988	NC_021521	GC	3	6	2289913	2289918	0 %	0 %	50 %	50 %	514060934
44989	NC_021521	TTGG	2	8	2289959	2289966	0 %	50 %	50 %	0 %	514060934
44990	NC_021521	TAA	2	6	2290154	2290159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060934
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44993	NC_021521	CAACG	2	10	2290242	2290251	40 %	0 %	20 %	40 %	514060935
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44996	NC_021521	CAAT	2	8	2290473	2290480	50 %	25 %	0 %	25 %	514060935
44997	NC_021521	TGC	2	6	2290552	2290557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060935
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45000	NC_021521	CGTAA	2	10	2290629	2290638	40 %	20 %	20 %	20 %	514060935

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