MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_021521	CAT	2	6	2240639	2240644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060888
44002	NC_021521	GGT	2	6	2240689	2240694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060888
44003	NC_021521	ATT	2	6	2240698	2240703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060888
44004	NC_021521	TAAAC	2	10	2240730	2240739	60 %	20 %	0 %	20 %	514060888
44005	NC_021521	CAA	2	6	2240847	2240852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060888
44006	NC_021521	AAC	3	9	2240853	2240861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060888
44007	NC_021521	ACG	2	6	2240945	2240950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060889
44008	NC_021521	AAG	2	6	2240994	2240999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060889
44009	NC_021521	TC	3	6	2241006	2241011	0 %	50 %	0 %	50 %	514060889
44010	NC_021521	TTG	2	6	2241048	2241053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060889
44011	NC_021521	A	6	6	2241072	2241077	100 %	0 %	0 %	0 %	514060889
44012	NC_021521	ATG	2	6	2241093	2241098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060889
44013	NC_021521	TCG	2	6	2241218	2241223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44014	NC_021521	T	6	6	2241235	2241240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44015	NC_021521	A	6	6	2241277	2241282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_021521	ATT	2	6	2241306	2241311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060890
44017	NC_021521	A	6	6	2241409	2241414	100 %	0 %	0 %	0 %	514060890
44018	NC_021521	AAG	2	6	2241421	2241426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060890
44019	NC_021521	TGA	2	6	2241451	2241456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060890
44020	NC_021521	AAG	2	6	2241520	2241525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060890
44021	NC_021521	GCA	2	6	2241564	2241569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060890
44022	NC_021521	GCA	2	6	2241675	2241680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060890
44023	NC_021521	ATT	2	6	2241699	2241704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060890
44024	NC_021521	CAA	2	6	2241711	2241716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060890
44025	NC_021521	CAA	2	6	2241794	2241799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060890
44026	NC_021521	CAG	2	6	2241822	2241827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060890
44027	NC_021521	CAA	2	6	2241891	2241896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060890
44028	NC_021521	ATT	2	6	2241915	2241920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060890
44029	NC_021521	TGT	2	6	2241943	2241948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060890
44030	NC_021521	TGCT	2	8	2241979	2241986	0 %	50 %	25 %	25 %	514060890
44031	NC_021521	CTG	2	6	2242002	2242007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060890
44032	NC_021521	GAT	2	6	2242020	2242025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060890
44033	NC_021521	A	6	6	2242089	2242094	100 %	0 %	0 %	0 %	514060890
44034	NC_021521	GTTG	2	8	2242136	2242143	0 %	50 %	50 %	0 %	514060890
44035	NC_021521	CA	3	6	2242183	2242188	50 %	0 %	0 %	50 %	514060890
44036	NC_021521	ATT	2	6	2242275	2242280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060890
44037	NC_021521	CAC	2	6	2242384	2242389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060890
44038	NC_021521	TC	3	6	2242445	2242450	0 %	50 %	0 %	50 %	514060890
44039	NC_021521	GAC	2	6	2242592	2242597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060890
44040	NC_021521	ACTG	2	8	2242622	2242629	25 %	25 %	25 %	25 %	514060890
44041	NC_021521	AGTT	2	8	2242821	2242828	25 %	50 %	25 %	0 %	514060890
44042	NC_021521	CAA	2	6	2242865	2242870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060891
44043	NC_021521	TTGA	2	8	2242880	2242887	25 %	50 %	25 %	0 %	514060891
44044	NC_021521	AAT	2	6	2242925	2242930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060891
44045	NC_021521	TGT	2	6	2243076	2243081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060891
44046	NC_021521	GAC	2	6	2243307	2243312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060891
44047	NC_021521	AACC	2	8	2243324	2243331	50 %	0 %	0 %	50 %	514060891
44048	NC_021521	TGG	2	6	2243353	2243358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060891
44049	NC_021521	CGC	2	6	2243441	2243446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060891
44050	NC_021521	CCAG	2	8	2243469	2243476	25 %	0 %	25 %	50 %	514060891
44051	NC_021521	TTG	2	6	2243498	2243503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060891
44052	NC_021521	TGT	2	6	2243511	2243516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060891
44053	NC_021521	GATC	2	8	2243542	2243549	25 %	25 %	25 %	25 %	514060891
44054	NC_021521	ATC	2	6	2243561	2243566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060891
44055	NC_021521	AACA	2	8	2243613	2243620	75 %	0 %	0 %	25 %	514060891
44056	NC_021521	TGT	2	6	2243649	2243654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060891
44057	NC_021521	CTGT	2	8	2243715	2243722	0 %	50 %	25 %	25 %	514060891
44058	NC_021521	TTG	2	6	2243753	2243758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060891
44059	NC_021521	TGG	3	9	2243775	2243783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060891
44060	NC_021521	GTTT	2	8	2243784	2243791	0 %	75 %	25 %	0 %	514060891
44061	NC_021521	ATTC	2	8	2243813	2243820	25 %	50 %	0 %	25 %	514060891
44062	NC_021521	TAA	2	6	2243835	2243840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44063	NC_021521	CTTTGC	2	12	2243885	2243896	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44064	NC_021521	TTC	2	6	2243969	2243974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44065	NC_021521	GAAGA	2	10	2244074	2244083	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44066	NC_021521	AAT	2	6	2244112	2244117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44067	NC_021521	TA	3	6	2244129	2244134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_021521	AT	3	6	2244147	2244152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44069	NC_021521	ATT	2	6	2244182	2244187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060892
44070	NC_021521	TTG	2	6	2244216	2244221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060892
44071	NC_021521	CCG	2	6	2244227	2244232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060892
44072	NC_021521	A	6	6	2244321	2244326	100 %	0 %	0 %	0 %	514060892
44073	NC_021521	GCTC	2	8	2244373	2244380	0 %	25 %	25 %	50 %	514060892
44074	NC_021521	ACCT	2	8	2244450	2244457	25 %	25 %	0 %	50 %	514060892
44075	NC_021521	CCA	2	6	2244461	2244466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060892
44076	NC_021521	CAA	2	6	2244527	2244532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060892
44077	NC_021521	ATC	2	6	2244598	2244603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060892
44078	NC_021521	CTT	2	6	2244644	2244649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060892
44079	NC_021521	TAA	2	6	2244704	2244709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060892
44080	NC_021521	ATT	2	6	2244808	2244813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060892
44081	NC_021521	TAT	2	6	2244865	2244870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060893
44082	NC_021521	CCA	2	6	2244900	2244905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060893
44083	NC_021521	CGG	2	6	2244995	2245000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060893
44084	NC_021521	ATCA	2	8	2245007	2245014	50 %	25 %	0 %	25 %	514060893
44085	NC_021521	TAT	2	6	2245021	2245026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060893
44086	NC_021521	TCTT	2	8	2245047	2245054	0 %	75 %	0 %	25 %	514060893
44087	NC_021521	CAT	2	6	2245066	2245071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060893
44088	NC_021521	CTT	2	6	2245513	2245518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060893
44089	NC_021521	CAT	2	6	2245639	2245644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060893
44090	NC_021521	AAT	2	6	2245652	2245657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060893
44091	NC_021521	T	8	8	2245831	2245838	0 %	100 %	0 %	0 %	514060893
44092	NC_021521	A	6	6	2245899	2245904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44093	NC_021521	T	6	6	2245924	2245929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44094	NC_021521	GTG	2	6	2245950	2245955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_021521	GCT	2	6	2245999	2246004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44096	NC_021521	GTG	2	6	2246048	2246053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44097	NC_021521	GCT	2	6	2246097	2246102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44098	NC_021521	GTG	2	6	2246147	2246152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44099	NC_021521	GCT	2	6	2246196	2246201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44100	NC_021521	T	7	7	2246278	2246284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44101	NC_021521	ATA	2	6	2246319	2246324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44102	NC_021521	CAA	2	6	2246326	2246331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44103	NC_021521	A	7	7	2246384	2246390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44104	NC_021521	CGCTTT	2	12	2246394	2246405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	514060894
44105	NC_021521	CTG	2	6	2246408	2246413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060894
44106	NC_021521	CTG	2	6	2246498	2246503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060894
44107	NC_021521	CAT	2	6	2246510	2246515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060894
44108	NC_021521	CCG	2	6	2246524	2246529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060894
44109	NC_021521	CTT	2	6	2246801	2246806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060894
44110	NC_021521	TGC	2	6	2246811	2246816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060894
44111	NC_021521	T	6	6	2246820	2246825	0 %	100 %	0 %	0 %	514060894
44112	NC_021521	CT	3	6	2246842	2246847	0 %	50 %	0 %	50 %	514060894
44113	NC_021521	ACG	2	6	2246859	2246864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060894
44114	NC_021521	AT	3	6	2246884	2246889	50 %	50 %	0 %	0 %	514060894
44115	NC_021521	GTG	2	6	2246992	2246997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060894
44116	NC_021521	CACAGC	2	12	2247002	2247013	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	514060894
44117	NC_021521	GCTTCT	2	12	2247025	2247036	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	514060894
44118	NC_021521	GAC	2	6	2247170	2247175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060894
44119	NC_021521	TAAAA	2	10	2247208	2247217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44120	NC_021521	T	6	6	2247338	2247343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44121	NC_021521	A	6	6	2247353	2247358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44122	NC_021521	GAT	2	6	2247466	2247471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060895
44123	NC_021521	GA	3	6	2247525	2247530	50 %	0 %	50 %	0 %	514060895
44124	NC_021521	GAA	2	6	2247544	2247549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060895
44125	NC_021521	G	6	6	2247576	2247581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44126	NC_021521	AAAT	2	8	2247598	2247605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44127	NC_021521	TTG	2	6	2247704	2247709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060896
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44129	NC_021521	TGA	2	6	2247852	2247857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060896
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44201	NC_021521	TAAA	2	8	2251263	2251270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44234	NC_021521	TGT	3	9	2252294	2252302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060900
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44237	NC_021521	CTG	2	6	2252452	2252457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060900
44238	NC_021521	TAA	2	6	2252477	2252482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060900
44239	NC_021521	GCG	2	6	2252500	2252505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060900
44240	NC_021521	ATA	2	6	2252629	2252634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060900
44241	NC_021521	TAA	2	6	2252672	2252677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060900
44242	NC_021521	TCA	2	6	2252680	2252685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060900
44243	NC_021521	GGC	2	6	2252705	2252710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060900
44244	NC_021521	GAA	2	6	2252847	2252852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060900
44245	NC_021521	CAA	2	6	2252875	2252880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060900
44246	NC_021521	AAC	2	6	2252911	2252916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060900
44247	NC_021521	AAT	2	6	2253036	2253041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060900
44248	NC_021521	TAC	2	6	2253080	2253085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060900
44249	NC_021521	A	6	6	2253106	2253111	100 %	0 %	0 %	0 %	514060900
44250	NC_021521	ATG	2	6	2253133	2253138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060900
44251	NC_021521	AAT	2	6	2253153	2253158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060900
44252	NC_021521	TGA	2	6	2253172	2253177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060900
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44254	NC_021521	TTAA	2	8	2253318	2253325	50 %	50 %	0 %	0 %	514060900
44255	NC_021521	CAT	2	6	2253383	2253388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060900
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44258	NC_021521	GCT	2	6	2253471	2253476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060900
44259	NC_021521	CAG	2	6	2253679	2253684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060900
44260	NC_021521	TGG	2	6	2253733	2253738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060900
44261	NC_021521	GCGAG	2	10	2253761	2253770	20 %	0 %	60 %	20 %	514060900
44262	NC_021521	GA	3	6	2253813	2253818	50 %	0 %	50 %	0 %	514060900
44263	NC_021521	CAG	2	6	2253841	2253846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060900
44264	NC_021521	CTG	2	6	2253895	2253900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060900
44265	NC_021521	CAA	2	6	2254197	2254202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060901
44266	NC_021521	TCT	2	6	2254210	2254215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060901
44267	NC_021521	CTG	2	6	2254289	2254294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060901
44268	NC_021521	GGA	2	6	2254471	2254476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060901
44269	NC_021521	TG	3	6	2254488	2254493	0 %	50 %	50 %	0 %	514060901
44270	NC_021521	GTT	2	6	2254535	2254540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44271	NC_021521	TAG	2	6	2254566	2254571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44272	NC_021521	T	6	6	2254670	2254675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44273	NC_021521	AATG	2	8	2254678	2254685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44274	NC_021521	T	7	7	2254778	2254784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44275	NC_021521	ATT	2	6	2254886	2254891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060902
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44277	NC_021521	CACC	2	8	2255012	2255019	25 %	0 %	0 %	75 %	514060902
44278	NC_021521	TCA	2	6	2255026	2255031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060902
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44282	NC_021521	CCA	2	6	2255305	2255310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060902
44283	NC_021521	A	6	6	2255318	2255323	100 %	0 %	0 %	0 %	514060902
44284	NC_021521	CGA	2	6	2255330	2255335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060902
44285	NC_021521	AATA	2	8	2255351	2255358	75 %	25 %	0 %	0 %	514060902
44286	NC_021521	T	6	6	2255398	2255403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44287	NC_021521	TGG	2	6	2255413	2255418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44288	NC_021521	TAT	2	6	2255471	2255476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060903
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44291	NC_021521	GCT	2	6	2255563	2255568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060903
44292	NC_021521	CACC	2	8	2255570	2255577	25 %	0 %	0 %	75 %	514060903
44293	NC_021521	CAT	2	6	2255613	2255618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
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44295	NC_021521	CAA	2	6	2255657	2255662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060903
44296	NC_021521	GTA	2	6	2255675	2255680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060903
44297	NC_021521	GCAA	2	8	2255725	2255732	50 %	0 %	25 %	25 %	514060903
44298	NC_021521	ACGGC	2	10	2255762	2255771	20 %	0 %	40 %	40 %	514060903
44299	NC_021521	ATAA	2	8	2255821	2255828	75 %	25 %	0 %	0 %	514060903
44300	NC_021521	ATC	3	9	2255908	2255916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
44301	NC_021521	GTC	2	6	2256005	2256010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060903
44302	NC_021521	T	6	6	2256012	2256017	0 %	100 %	0 %	0 %	514060903
44303	NC_021521	TCA	2	6	2256031	2256036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060903
44304	NC_021521	TTGG	2	8	2256065	2256072	0 %	50 %	50 %	0 %	514060903
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44308	NC_021521	GCC	2	6	2256235	2256240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060903
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44310	NC_021521	TAG	2	6	2256480	2256485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060903
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44312	NC_021521	AATAA	2	10	2256523	2256532	80 %	20 %	0 %	0 %	514060903
44313	NC_021521	CAA	2	6	2256610	2256615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060903
44314	NC_021521	GTAA	2	8	2256677	2256684	50 %	25 %	25 %	0 %	514060903
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44316	NC_021521	TTGG	2	8	2256789	2256796	0 %	50 %	50 %	0 %	514060904
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44339	NC_021521	TTA	2	6	2258181	2258186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44340	NC_021521	AAT	2	6	2258285	2258290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060906
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44350	NC_021521	CTG	2	6	2258641	2258646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060907
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44353	NC_021521	T	6	6	2258703	2258708	0 %	100 %	0 %	0 %	514060907
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44476	NC_021521	TAGCT	2	10	2265327	2265336	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44477	NC_021521	GCT	2	6	2265340	2265345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44478	NC_021521	TA	3	6	2265465	2265470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44479	NC_021521	GGGT	2	8	2265492	2265499	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44480	NC_021521	CCA	2	6	2265506	2265511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44481	NC_021521	TGG	2	6	2265537	2265542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44482	NC_021521	CCTAC	2	10	2265550	2265559	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
44483	NC_021521	TATT	2	8	2265572	2265579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44484	NC_021521	GA	3	6	2265594	2265599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44485	NC_021521	GAA	2	6	2265800	2265805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060912
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