MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_021521	CGTT	2	8	2217165	2217172	0 %	50 %	25 %	25 %	514060867
43502	NC_021521	TTG	2	6	2217221	2217226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060867
43503	NC_021521	AAATT	2	10	2217265	2217274	60 %	40 %	0 %	0 %	514060867
43504	NC_021521	TCA	2	6	2217313	2217318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060867
43505	NC_021521	ATC	2	6	2217332	2217337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060867
43506	NC_021521	AT	3	6	2217364	2217369	50 %	50 %	0 %	0 %	514060867
43507	NC_021521	ATG	2	6	2217390	2217395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060867
43508	NC_021521	ATA	2	6	2217396	2217401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060867
43509	NC_021521	CTGC	2	8	2217427	2217434	0 %	25 %	25 %	50 %	514060867
43510	NC_021521	T	6	6	2217440	2217445	0 %	100 %	0 %	0 %	514060867
43511	NC_021521	TGT	2	6	2217506	2217511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060867
43512	NC_021521	TTA	2	6	2217519	2217524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060867
43513	NC_021521	CCA	2	6	2217537	2217542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060867
43514	NC_021521	ATA	2	6	2217550	2217555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060867
43515	NC_021521	T	6	6	2217604	2217609	0 %	100 %	0 %	0 %	514060867
43516	NC_021521	CAA	2	6	2217640	2217645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060867
43517	NC_021521	CTTG	9	36	2217701	2217736	0 %	50 %	25 %	25 %	514060867
43518	NC_021521	AAT	2	6	2217756	2217761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060867
43519	NC_021521	TGC	2	6	2217762	2217767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060867
43520	NC_021521	T	6	6	2217776	2217781	0 %	100 %	0 %	0 %	514060867
43521	NC_021521	GGC	2	6	2217794	2217799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060867
43522	NC_021521	TCA	2	6	2217828	2217833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060867
43523	NC_021521	GAA	2	6	2217837	2217842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060867
43524	NC_021521	T	6	6	2217856	2217861	0 %	100 %	0 %	0 %	514060867
43525	NC_021521	GTT	2	6	2217862	2217867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060867
43526	NC_021521	ATG	2	6	2217874	2217879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060867
43527	NC_021521	A	6	6	2217902	2217907	100 %	0 %	0 %	0 %	514060867
43528	NC_021521	CAA	2	6	2217926	2217931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060867
43529	NC_021521	CTT	2	6	2217949	2217954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060867
43530	NC_021521	ATT	2	6	2217974	2217979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060867
43531	NC_021521	A	7	7	2218007	2218013	100 %	0 %	0 %	0 %	514060867
43532	NC_021521	AT	3	6	2218053	2218058	50 %	50 %	0 %	0 %	514060867
43533	NC_021521	GTA	2	6	2218159	2218164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060867
43534	NC_021521	A	7	7	2218205	2218211	100 %	0 %	0 %	0 %	514060867
43535	NC_021521	TAAT	2	8	2218222	2218229	50 %	50 %	0 %	0 %	514060867
43536	NC_021521	ATT	2	6	2218262	2218267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060867
43537	NC_021521	T	6	6	2218275	2218280	0 %	100 %	0 %	0 %	514060867
43538	NC_021521	TTG	2	6	2218376	2218381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060867
43539	NC_021521	TTCTG	2	10	2218392	2218401	0 %	60 %	20 %	20 %	514060867
43540	NC_021521	CATT	2	8	2218405	2218412	25 %	50 %	0 %	25 %	514060867
43541	NC_021521	T	6	6	2218411	2218416	0 %	100 %	0 %	0 %	514060867
43542	NC_021521	TAT	2	6	2218547	2218552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060868
43543	NC_021521	AAT	2	6	2218564	2218569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060868
43544	NC_021521	T	7	7	2218633	2218639	0 %	100 %	0 %	0 %	514060868
43545	NC_021521	GTT	2	6	2218672	2218677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060868
43546	NC_021521	CAC	2	6	2218781	2218786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060868
43547	NC_021521	T	6	6	2218871	2218876	0 %	100 %	0 %	0 %	514060868
43548	NC_021521	TAA	2	6	2218958	2218963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060868
43549	NC_021521	TCA	2	6	2219028	2219033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060868
43550	NC_021521	A	6	6	2219040	2219045	100 %	0 %	0 %	0 %	514060868
43551	NC_021521	CTT	2	6	2219053	2219058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060868
43552	NC_021521	TCA	2	6	2219196	2219201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060868
43553	NC_021521	AAT	2	6	2219210	2219215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060869
43554	NC_021521	ATA	2	6	2219240	2219245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060869
43555	NC_021521	AAT	2	6	2219250	2219255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060869
43556	NC_021521	TCA	2	6	2219306	2219311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060869
43557	NC_021521	AAT	2	6	2219371	2219376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060869
43558	NC_021521	TTC	2	6	2219377	2219382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060869
43559	NC_021521	TGCGG	2	10	2219394	2219403	0 %	20 %	60 %	20 %	514060869
43560	NC_021521	T	6	6	2219466	2219471	0 %	100 %	0 %	0 %	514060869
43561	NC_021521	T	6	6	2219515	2219520	0 %	100 %	0 %	0 %	514060869
43562	NC_021521	AAT	2	6	2219609	2219614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060869
43563	NC_021521	ATT	2	6	2219641	2219646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43564	NC_021521	TTC	2	6	2219835	2219840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43565	NC_021521	GTTT	2	8	2219904	2219911	0 %	75 %	25 %	0 %	514060870
43566	NC_021521	CTT	2	6	2219945	2219950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43567	NC_021521	TA	3	6	2219985	2219990	50 %	50 %	0 %	0 %	514060870
43568	NC_021521	ATG	2	6	2219995	2220000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060870
43569	NC_021521	CATC	2	8	2220011	2220018	25 %	25 %	0 %	50 %	514060870
43570	NC_021521	GCT	2	6	2220024	2220029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060870
43571	NC_021521	CTA	2	6	2220044	2220049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43572	NC_021521	TGCG	2	8	2220052	2220059	0 %	25 %	50 %	25 %	514060870
43573	NC_021521	CTG	2	6	2220066	2220071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060870
43574	NC_021521	T	6	6	2220072	2220077	0 %	100 %	0 %	0 %	514060870
43575	NC_021521	ATG	2	6	2220109	2220114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060870
43576	NC_021521	ACA	2	6	2220143	2220148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060870
43577	NC_021521	TGG	2	6	2220183	2220188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060870
43578	NC_021521	TTG	2	6	2220219	2220224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060870
43579	NC_021521	GC	3	6	2220253	2220258	0 %	0 %	50 %	50 %	514060870
43580	NC_021521	CTT	2	6	2220350	2220355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43581	NC_021521	TGA	2	6	2220435	2220440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060870
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43583	NC_021521	CAA	2	6	2220503	2220508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060870
43584	NC_021521	GGTCTT	2	12	2220527	2220538	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514060870
43585	NC_021521	CTG	2	6	2220576	2220581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060870
43586	NC_021521	AGC	2	6	2220724	2220729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060870
43587	NC_021521	ACA	2	6	2220736	2220741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060870
43588	NC_021521	TGCGG	2	10	2220761	2220770	0 %	20 %	60 %	20 %	514060870
43589	NC_021521	TGG	2	6	2220790	2220795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060870
43590	NC_021521	TCA	2	6	2220877	2220882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43591	NC_021521	GGC	2	6	2220897	2220902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060870
43592	NC_021521	ATC	2	6	2220918	2220923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43593	NC_021521	TCC	2	6	2220937	2220942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060870
43594	NC_021521	CGG	2	6	2220986	2220991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060870
43595	NC_021521	CTT	2	6	2221061	2221066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43596	NC_021521	CAT	2	6	2221091	2221096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43597	NC_021521	ACG	2	6	2221128	2221133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060870
43598	NC_021521	GAT	2	6	2221196	2221201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060870
43599	NC_021521	CCTC	2	8	2221219	2221226	0 %	25 %	0 %	75 %	514060870
43600	NC_021521	TAA	2	6	2221234	2221239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060870
43601	NC_021521	CGT	2	6	2221265	2221270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060870
43602	NC_021521	GGT	2	6	2221323	2221328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060870
43603	NC_021521	TTC	2	6	2221374	2221379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43604	NC_021521	AAT	2	6	2221405	2221410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060870
43605	NC_021521	TGA	2	6	2221441	2221446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060870
43606	NC_021521	GC	3	6	2221508	2221513	0 %	0 %	50 %	50 %	514060870
43607	NC_021521	ATC	2	6	2221596	2221601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43608	NC_021521	AAGTAT	2	12	2221622	2221633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514060870
43609	NC_021521	CTT	2	6	2221655	2221660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43610	NC_021521	TTC	2	6	2221674	2221679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43611	NC_021521	ATT	2	6	2221740	2221745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060870
43612	NC_021521	TGAA	2	8	2221766	2221773	50 %	25 %	25 %	0 %	514060870
43613	NC_021521	TCA	2	6	2221877	2221882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43614	NC_021521	TAAT	2	8	2221981	2221988	50 %	50 %	0 %	0 %	514060870
43615	NC_021521	A	6	6	2222026	2222031	100 %	0 %	0 %	0 %	514060870
43616	NC_021521	GTCT	2	8	2222037	2222044	0 %	50 %	25 %	25 %	514060870
43617	NC_021521	TGTT	2	8	2222056	2222063	0 %	75 %	25 %	0 %	514060870
43618	NC_021521	TTG	2	6	2222068	2222073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060870
43619	NC_021521	TAC	2	6	2222087	2222092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43620	NC_021521	TGA	2	6	2222171	2222176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060870
43621	NC_021521	T	6	6	2222190	2222195	0 %	100 %	0 %	0 %	514060870
43622	NC_021521	AAC	2	6	2222229	2222234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060870
43623	NC_021521	GCTG	2	8	2222300	2222307	0 %	25 %	50 %	25 %	514060870
43624	NC_021521	GT	3	6	2222366	2222371	0 %	50 %	50 %	0 %	514060870
43625	NC_021521	GCG	2	6	2222413	2222418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060870
43626	NC_021521	AATG	2	8	2222477	2222484	50 %	25 %	25 %	0 %	514060870
43627	NC_021521	TCC	2	6	2222518	2222523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060870
43628	NC_021521	TGTC	2	8	2222530	2222537	0 %	50 %	25 %	25 %	514060870
43629	NC_021521	TCT	2	6	2222545	2222550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060870
43630	NC_021521	TTA	2	6	2222582	2222587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060870
43631	NC_021521	TCA	2	6	2222618	2222623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060870
43632	NC_021521	TATC	2	8	2222810	2222817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43633	NC_021521	A	6	6	2222832	2222837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43634	NC_021521	CTT	2	6	2222850	2222855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43635	NC_021521	TACT	2	8	2222946	2222953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43636	NC_021521	TTA	2	6	2222980	2222985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060871
43637	NC_021521	A	7	7	2223022	2223028	100 %	0 %	0 %	0 %	514060871
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43639	NC_021521	GCA	2	6	2223123	2223128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060871
43640	NC_021521	T	7	7	2223201	2223207	0 %	100 %	0 %	0 %	514060871
43641	NC_021521	GGT	2	6	2223219	2223224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060871
43642	NC_021521	GAC	2	6	2223235	2223240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060871
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43644	NC_021521	CTTG	2	8	2223370	2223377	0 %	50 %	25 %	25 %	514060872
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43646	NC_021521	GTG	2	6	2223491	2223496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060872
43647	NC_021521	TTG	2	6	2223588	2223593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060872
43648	NC_021521	GCA	2	6	2223631	2223636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060872
43649	NC_021521	CCA	2	6	2223879	2223884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060873
43650	NC_021521	TGT	2	6	2223995	2224000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060873
43651	NC_021521	CGG	2	6	2224043	2224048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060873
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43655	NC_021521	AAGT	2	8	2224265	2224272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43656	NC_021521	TTAAC	2	10	2224316	2224325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43657	NC_021521	A	6	6	2224342	2224347	100 %	0 %	0 %	0 %	514060874
43658	NC_021521	CAA	2	6	2224421	2224426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060874
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43660	NC_021521	GCTT	2	8	2224528	2224535	0 %	50 %	25 %	25 %	514060874
43661	NC_021521	TGC	2	6	2224723	2224728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43666	NC_021521	TCG	2	6	2224829	2224834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43668	NC_021521	GGT	2	6	2224876	2224881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43670	NC_021521	GTT	2	6	2224959	2224964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43672	NC_021521	ACC	3	9	2225004	2225012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43673	NC_021521	T	6	6	2225061	2225066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43674	NC_021521	TCA	2	6	2225098	2225103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43675	NC_021521	AAGT	2	8	2225133	2225140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43676	NC_021521	GCGTAA	2	12	2225345	2225356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43677	NC_021521	AGA	2	6	2225362	2225367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43678	NC_021521	C	6	6	2225396	2225401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43679	NC_021521	C	6	6	2225407	2225412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43680	NC_021521	G	6	6	2225422	2225427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43681	NC_021521	C	6	6	2225440	2225445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43682	NC_021521	TTA	2	6	2225454	2225459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060875
43683	NC_021521	TAA	2	6	2225552	2225557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060875
43684	NC_021521	CAC	2	6	2225607	2225612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060875
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43686	NC_021521	CGC	2	6	2225757	2225762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060875
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43692	NC_021521	GCA	2	6	2225989	2225994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060875
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43698	NC_021521	T	6	6	2226440	2226445	0 %	100 %	0 %	0 %	514060876
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43730	NC_021521	CTC	2	6	2227837	2227842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060877
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43732	NC_021521	CCA	2	6	2228030	2228035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060877
43733	NC_021521	CCAA	2	8	2228087	2228094	50 %	0 %	0 %	50 %	514060877
43734	NC_021521	TCA	2	6	2228169	2228174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060877
43735	NC_021521	CAA	2	6	2228182	2228187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060877
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43976	NC_021521	AAC	2	6	2239529	2239534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060885
43977	NC_021521	CGC	2	6	2239568	2239573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060885
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