MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_021521	TGC	2	6	2167093	2167098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060815
42502	NC_021521	ATC	2	6	2167169	2167174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42503	NC_021521	CGG	2	6	2167196	2167201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060815
42504	NC_021521	TAA	2	6	2167202	2167207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060815
42505	NC_021521	TCT	2	6	2167208	2167213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060815
42506	NC_021521	TCA	2	6	2167235	2167240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42507	NC_021521	TGT	2	6	2167256	2167261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060815
42508	NC_021521	TGCG	2	8	2167318	2167325	0 %	25 %	50 %	25 %	514060815
42509	NC_021521	T	6	6	2167348	2167353	0 %	100 %	0 %	0 %	514060815
42510	NC_021521	TCA	2	6	2167361	2167366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42511	NC_021521	A	9	9	2167429	2167437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42512	NC_021521	A	6	6	2167442	2167447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42513	NC_021521	TCT	2	6	2167453	2167458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42514	NC_021521	AAT	2	6	2167470	2167475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42515	NC_021521	A	7	7	2167481	2167487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42516	NC_021521	GT	3	6	2167527	2167532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_021521	TCT	2	6	2167606	2167611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42518	NC_021521	TAAA	2	8	2167630	2167637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42519	NC_021521	TAA	2	6	2167666	2167671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060816
42520	NC_021521	A	6	6	2167696	2167701	100 %	0 %	0 %	0 %	514060816
42521	NC_021521	TTG	2	6	2167755	2167760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060816
42522	NC_021521	CT	3	6	2167777	2167782	0 %	50 %	0 %	50 %	514060816
42523	NC_021521	CAAT	2	8	2167820	2167827	50 %	25 %	0 %	25 %	514060816
42524	NC_021521	TTA	2	6	2167991	2167996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060816
42525	NC_021521	GCT	2	6	2168018	2168023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060816
42526	NC_021521	ATCA	2	8	2168047	2168054	50 %	25 %	0 %	25 %	514060816
42527	NC_021521	CATAAT	2	12	2168055	2168066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	514060816
42528	NC_021521	AAT	2	6	2168076	2168081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060816
42529	NC_021521	ATC	2	6	2168107	2168112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060816
42530	NC_021521	GATT	2	8	2168136	2168143	25 %	50 %	25 %	0 %	514060816
42531	NC_021521	CCAATC	2	12	2168312	2168323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	514060816
42532	NC_021521	GAC	2	6	2168373	2168378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060816
42533	NC_021521	GTT	2	6	2168394	2168399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060816
42534	NC_021521	ACT	2	6	2168445	2168450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42535	NC_021521	TTG	2	6	2168457	2168462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42536	NC_021521	A	6	6	2168492	2168497	100 %	0 %	0 %	0 %	514060817
42537	NC_021521	ACCA	2	8	2168509	2168516	50 %	0 %	0 %	50 %	514060817
42538	NC_021521	CTAC	2	8	2168645	2168652	25 %	25 %	0 %	50 %	514060817
42539	NC_021521	GA	3	6	2168664	2168669	50 %	0 %	50 %	0 %	514060817
42540	NC_021521	ATC	2	6	2168689	2168694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
42541	NC_021521	GTTT	2	8	2168715	2168722	0 %	75 %	25 %	0 %	514060817
42542	NC_021521	AGG	2	6	2168785	2168790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060817
42543	NC_021521	TCA	2	6	2168849	2168854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
42544	NC_021521	GCC	2	6	2168948	2168953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060817
42545	NC_021521	TCA	2	6	2168981	2168986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
42546	NC_021521	CAA	2	6	2169106	2169111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060817
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42548	NC_021521	TAT	2	6	2169150	2169155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060817
42549	NC_021521	CCA	2	6	2169236	2169241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060817
42550	NC_021521	ACA	2	6	2169242	2169247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060817
42551	NC_021521	CTT	2	6	2169258	2169263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060817
42552	NC_021521	ATT	3	9	2169268	2169276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060817
42553	NC_021521	CAT	2	6	2169298	2169303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
42554	NC_021521	TGCT	2	8	2169322	2169329	0 %	50 %	25 %	25 %	514060817
42555	NC_021521	CTA	2	6	2169438	2169443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
42556	NC_021521	TCA	2	6	2169458	2169463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
42557	NC_021521	T	6	6	2169486	2169491	0 %	100 %	0 %	0 %	514060817
42558	NC_021521	CTG	2	6	2169492	2169497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060817
42559	NC_021521	TGA	2	6	2169536	2169541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060817
42560	NC_021521	CAT	2	6	2169579	2169584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060817
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42562	NC_021521	ATA	2	6	2169653	2169658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060817
42563	NC_021521	CTTTTT	2	12	2169664	2169675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	514060817
42564	NC_021521	CCG	2	6	2169722	2169727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060817
42565	NC_021521	AACGAT	2	12	2169730	2169741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514060817
42566	NC_021521	AATA	2	8	2169767	2169774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42567	NC_021521	ATT	2	6	2169831	2169836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42568	NC_021521	AATA	3	12	2169844	2169855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42569	NC_021521	ATG	2	6	2169883	2169888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42570	NC_021521	A	6	6	2169896	2169901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42571	NC_021521	A	6	6	2169906	2169911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42572	NC_021521	T	8	8	2169917	2169924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42573	NC_021521	GGA	2	6	2169998	2170003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42574	NC_021521	A	6	6	2170040	2170045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42575	NC_021521	T	6	6	2170094	2170099	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
42576	NC_021521	G	6	6	2170121	2170126	0 %	0 %	100 %	0 %	514060818
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42578	NC_021521	GGT	2	6	2170248	2170253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060818
42579	NC_021521	TCA	2	6	2170298	2170303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060818
42580	NC_021521	TAA	2	6	2170307	2170312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060818
42581	NC_021521	TTG	2	6	2170330	2170335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060818
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42583	NC_021521	CTT	2	6	2170362	2170367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060818
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42585	NC_021521	TAA	2	6	2170444	2170449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060818
42586	NC_021521	TA	3	6	2170465	2170470	50 %	50 %	0 %	0 %	514060818
42587	NC_021521	TGG	2	6	2170518	2170523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060818
42588	NC_021521	T	6	6	2170577	2170582	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
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42590	NC_021521	CCA	2	6	2170676	2170681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060818
42591	NC_021521	T	7	7	2170705	2170711	0 %	100 %	0 %	0 %	514060818
42592	NC_021521	CCA	2	6	2170752	2170757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060818
42593	NC_021521	GAA	2	6	2170804	2170809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060818
42594	NC_021521	TC	3	6	2170849	2170854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42595	NC_021521	T	6	6	2170933	2170938	0 %	100 %	0 %	0 %	514060819
42596	NC_021521	TGCCG	2	10	2170969	2170978	0 %	20 %	40 %	40 %	514060819
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42599	NC_021521	A	6	6	2171133	2171138	100 %	0 %	0 %	0 %	514060819
42600	NC_021521	AC	3	6	2171147	2171152	50 %	0 %	0 %	50 %	514060819
42601	NC_021521	A	6	6	2171182	2171187	100 %	0 %	0 %	0 %	514060819
42602	NC_021521	CAT	2	6	2171210	2171215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060819
42603	NC_021521	ATG	2	6	2171307	2171312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060819
42604	NC_021521	ATA	2	6	2171353	2171358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060819
42605	NC_021521	AACGC	2	10	2171483	2171492	40 %	0 %	20 %	40 %	514060819
42606	NC_021521	TAA	2	6	2171528	2171533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060819
42607	NC_021521	T	6	6	2171537	2171542	0 %	100 %	0 %	0 %	514060819
42608	NC_021521	GAT	2	6	2171609	2171614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060819
42609	NC_021521	ATA	2	6	2171836	2171841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060820
42610	NC_021521	AATC	2	8	2171856	2171863	50 %	25 %	0 %	25 %	514060820
42611	NC_021521	GGT	2	6	2171884	2171889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060820
42612	NC_021521	AAT	2	6	2171997	2172002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060820
42613	NC_021521	CAC	2	6	2172021	2172026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060820
42614	NC_021521	AAAGGC	2	12	2172177	2172188	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	514060820
42615	NC_021521	AAC	2	6	2172196	2172201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060820
42616	NC_021521	GTC	2	6	2172208	2172213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060820
42617	NC_021521	AAT	2	6	2172225	2172230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060820
42618	NC_021521	ATT	2	6	2172351	2172356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060820
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42620	NC_021521	TAAA	2	8	2172428	2172435	75 %	25 %	0 %	0 %	514060820
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42855	NC_021521	AT	3	6	2184572	2184577	50 %	50 %	0 %	0 %	514060834
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42858	NC_021521	T	7	7	2184640	2184646	0 %	100 %	0 %	0 %	514060834
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42964	NC_021521	T	6	6	2190171	2190176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42965	NC_021521	AT	3	6	2190183	2190188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42972	NC_021521	GTTGG	2	10	2190520	2190529	0 %	40 %	60 %	0 %	514060837
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42976	NC_021521	GCGG	2	8	2190703	2190710	0 %	0 %	75 %	25 %	514060837
42977	NC_021521	TGA	2	6	2190759	2190764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060837
42978	NC_021521	A	6	6	2190769	2190774	100 %	0 %	0 %	0 %	514060837
42979	NC_021521	GTG	2	6	2190775	2190780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060837
42980	NC_021521	GAA	3	9	2190820	2190828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060837
42981	NC_021521	ATT	2	6	2190904	2190909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060837
42982	NC_021521	GTT	2	6	2190961	2190966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060837
42983	NC_021521	AG	3	6	2191062	2191067	50 %	0 %	50 %	0 %	514060837
42984	NC_021521	CAA	2	6	2191121	2191126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060837
42985	NC_021521	TCTGC	2	10	2191144	2191153	0 %	40 %	20 %	40 %	514060837
42986	NC_021521	AAT	2	6	2191184	2191189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060837
42987	NC_021521	ATG	2	6	2191267	2191272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42988	NC_021521	AAT	2	6	2191315	2191320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42989	NC_021521	CTTT	2	8	2191328	2191335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42990	NC_021521	ACA	2	6	2191351	2191356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060838
42991	NC_021521	AT	4	8	2191360	2191367	50 %	50 %	0 %	0 %	514060838
42992	NC_021521	T	6	6	2191384	2191389	0 %	100 %	0 %	0 %	514060838
42993	NC_021521	TGA	2	6	2191421	2191426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060838
42994	NC_021521	CAGC	2	8	2191551	2191558	25 %	0 %	25 %	50 %	514060838
42995	NC_021521	CTG	2	6	2191595	2191600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060838
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42998	NC_021521	AATC	2	8	2191777	2191784	50 %	25 %	0 %	25 %	514060838
42999	NC_021521	GCT	2	6	2191831	2191836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060838
43000	NC_021521	ATC	2	6	2191911	2191916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060838

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