MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_021521	ACGA	2	8	2140122	2140129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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42004	NC_021521	ACA	2	6	2140294	2140299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060792
42005	NC_021521	AATA	2	8	2140479	2140486	75 %	25 %	0 %	0 %	514060792
42006	NC_021521	T	6	6	2140524	2140529	0 %	100 %	0 %	0 %	514060793
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42012	NC_021521	TGA	2	6	2140900	2140905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060793
42013	NC_021521	TAAAAG	2	12	2140918	2140929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514060793
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42017	NC_021521	ATT	2	6	2141043	2141048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42018	NC_021521	TACCGC	2	12	2141132	2141143	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	514060794
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42120	NC_021521	AG	3	6	2146883	2146888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42121	NC_021521	ATA	2	6	2146925	2146930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42122	NC_021521	TAT	2	6	2146950	2146955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060797
42123	NC_021521	AAC	2	6	2146964	2146969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060797
42124	NC_021521	AGA	2	6	2147013	2147018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060797
42125	NC_021521	TCAA	2	8	2147021	2147028	50 %	25 %	0 %	25 %	514060797
42126	NC_021521	ATG	2	6	2147072	2147077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060797
42127	NC_021521	GACC	2	8	2147082	2147089	25 %	0 %	25 %	50 %	514060797
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42130	NC_021521	A	7	7	2147267	2147273	100 %	0 %	0 %	0 %	514060798
42131	NC_021521	TGAT	2	8	2147320	2147327	25 %	50 %	25 %	0 %	514060798
42132	NC_021521	AGA	2	6	2147424	2147429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42133	NC_021521	ATC	2	6	2147450	2147455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42134	NC_021521	ACA	2	6	2147456	2147461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42135	NC_021521	TAA	2	6	2147525	2147530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42136	NC_021521	TCA	2	6	2147649	2147654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060799
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42150	NC_021521	CAA	2	6	2148318	2148323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060799
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42174	NC_021521	A	6	6	2149373	2149378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42175	NC_021521	AAT	2	6	2149429	2149434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42192	NC_021521	TAAA	2	8	2150575	2150582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42193	NC_021521	TTG	2	6	2150620	2150625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060802
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42222	NC_021521	TGAT	2	8	2152149	2152156	25 %	50 %	25 %	0 %	514060803
42223	NC_021521	AGA	2	6	2152468	2152473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060803
42224	NC_021521	AC	3	6	2152494	2152499	50 %	0 %	0 %	50 %	514060803
42225	NC_021521	GT	3	6	2152503	2152508	0 %	50 %	50 %	0 %	514060803
42226	NC_021521	ACGC	2	8	2152515	2152522	25 %	0 %	25 %	50 %	514060803
42227	NC_021521	AACA	2	8	2152543	2152550	75 %	0 %	0 %	25 %	514060803
42228	NC_021521	TGA	3	9	2152638	2152646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060803
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42231	NC_021521	T	6	6	2152747	2152752	0 %	100 %	0 %	0 %	514060803
42232	NC_021521	CAA	2	6	2152787	2152792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060803
42233	NC_021521	ATC	2	6	2152878	2152883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060803
42234	NC_021521	TAT	2	6	2152962	2152967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060803
42235	NC_021521	A	6	6	2153004	2153009	100 %	0 %	0 %	0 %	514060803
42236	NC_021521	A	6	6	2153069	2153074	100 %	0 %	0 %	0 %	514060803
42237	NC_021521	GGC	2	6	2153092	2153097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060803
42238	NC_021521	TGG	2	6	2153133	2153138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060803
42239	NC_021521	GGT	2	6	2153230	2153235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060803
42240	NC_021521	TGT	2	6	2153311	2153316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060803
42241	NC_021521	TGG	2	6	2153346	2153351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060803
42242	NC_021521	AAT	2	6	2153366	2153371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060803
42243	NC_021521	AGCA	2	8	2153513	2153520	50 %	0 %	25 %	25 %	514060803
42244	NC_021521	TGG	2	6	2153531	2153536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060803
42245	NC_021521	A	6	6	2153537	2153542	100 %	0 %	0 %	0 %	514060803
42246	NC_021521	ACT	2	6	2153563	2153568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060803
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42249	NC_021521	CCGTTG	2	12	2153720	2153731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060803
42250	NC_021521	GTT	2	6	2153899	2153904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060803
42251	NC_021521	TGAT	2	8	2154009	2154016	25 %	50 %	25 %	0 %	514060803
42252	NC_021521	TGA	2	6	2154052	2154057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060803
42253	NC_021521	A	6	6	2154179	2154184	100 %	0 %	0 %	0 %	514060803
42254	NC_021521	GTT	2	6	2154247	2154252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060803
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42259	NC_021521	GAA	2	6	2154476	2154481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060803
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42262	NC_021521	CAA	2	6	2154818	2154823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060803
42263	NC_021521	ATA	2	6	2154977	2154982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060803
42264	NC_021521	A	6	6	2154991	2154996	100 %	0 %	0 %	0 %	514060803
42265	NC_021521	AAAC	2	8	2155020	2155027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42266	NC_021521	ATT	2	6	2155046	2155051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42267	NC_021521	ATC	2	6	2155052	2155057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42268	NC_021521	ATA	2	6	2155073	2155078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42269	NC_021521	T	7	7	2155126	2155132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42270	NC_021521	T	6	6	2155136	2155141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42271	NC_021521	AAT	2	6	2155190	2155195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42272	NC_021521	GTG	2	6	2155237	2155242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060804
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42275	NC_021521	TAC	2	6	2155489	2155494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060804
42276	NC_021521	A	6	6	2155543	2155548	100 %	0 %	0 %	0 %	514060804
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42279	NC_021521	AAC	2	6	2155671	2155676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060804
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42282	NC_021521	A	7	7	2155872	2155878	100 %	0 %	0 %	0 %	514060804
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42287	NC_021521	ATT	2	6	2156213	2156218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060804
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42291	NC_021521	ATTCA	2	10	2156427	2156436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42292	NC_021521	AGA	2	6	2156439	2156444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42293	NC_021521	AAGCT	2	10	2156460	2156469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42294	NC_021521	TA	3	6	2156478	2156483	50 %	50 %	0 %	0 %	514060805
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42307	NC_021521	AGC	2	6	2157288	2157293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060805
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42311	NC_021521	A	7	7	2157365	2157371	100 %	0 %	0 %	0 %	514060805
42312	NC_021521	CTT	2	6	2157424	2157429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060805
42313	NC_021521	TCT	2	6	2157462	2157467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060805
42314	NC_021521	GAG	2	6	2157538	2157543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060805
42315	NC_021521	TTAA	2	8	2157552	2157559	50 %	50 %	0 %	0 %	514060805
42316	NC_021521	TCG	2	6	2157592	2157597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060805
42317	NC_021521	AT	3	6	2157697	2157702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42318	NC_021521	ATG	2	6	2157734	2157739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060806
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42320	NC_021521	ATG	2	6	2157929	2157934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060806
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42322	NC_021521	TCG	2	6	2158030	2158035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060806
42323	NC_021521	TGC	2	6	2158036	2158041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060806
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42327	NC_021521	AATG	2	8	2158261	2158268	50 %	25 %	25 %	0 %	514060806
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42330	NC_021521	AATT	2	8	2158498	2158505	50 %	50 %	0 %	0 %	514060806
42331	NC_021521	TGC	2	6	2158549	2158554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060806
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42338	NC_021521	CCA	2	6	2158824	2158829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060807
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42340	NC_021521	AAG	2	6	2158896	2158901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060807
42341	NC_021521	CAA	2	6	2158904	2158909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060807
42342	NC_021521	TTGT	2	8	2159081	2159088	0 %	75 %	25 %	0 %	514060807
42343	NC_021521	A	6	6	2159117	2159122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42344	NC_021521	CCG	2	6	2159288	2159293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060808
42345	NC_021521	TAC	2	6	2159308	2159313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060808
42346	NC_021521	CAT	2	6	2159407	2159412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060808
42347	NC_021521	CAA	2	6	2159489	2159494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060808
42348	NC_021521	GCC	2	6	2159495	2159500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060808
42349	NC_021521	TCA	2	6	2159505	2159510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060808
42350	NC_021521	TGG	2	6	2159572	2159577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060808
42351	NC_021521	GCT	2	6	2159594	2159599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060808
42352	NC_021521	ATA	2	6	2159684	2159689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060808
42353	NC_021521	CCA	2	6	2159690	2159695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060808
42354	NC_021521	CTG	2	6	2159706	2159711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060808
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42356	NC_021521	GTT	2	6	2159765	2159770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060808
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42363	NC_021521	C	6	6	2160140	2160145	0 %	0 %	0 %	100 %	514060808
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42371	NC_021521	TA	3	6	2160465	2160470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42372	NC_021521	T	7	7	2160493	2160499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42373	NC_021521	A	7	7	2160503	2160509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42374	NC_021521	CA	3	6	2160570	2160575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42375	NC_021521	CAAA	2	8	2160607	2160614	75 %	0 %	0 %	25 %	514060809
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42433	NC_021521	CCCT	2	8	2163384	2163391	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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42453	NC_021521	TTA	2	6	2164187	2164192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42456	NC_021521	TA	3	6	2164270	2164275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42457	NC_021521	T	6	6	2164399	2164404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42458	NC_021521	AAT	2	6	2164421	2164426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42465	NC_021521	TCA	2	6	2164736	2164741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060813
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42472	NC_021521	CCG	2	6	2165089	2165094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42473	NC_021521	TGA	2	6	2165132	2165137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060814
42474	NC_021521	T	6	6	2165146	2165151	0 %	100 %	0 %	0 %	514060814
42475	NC_021521	ATT	2	6	2165251	2165256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060814
42476	NC_021521	GTT	2	6	2165311	2165316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060814
42477	NC_021521	TTGA	2	8	2165446	2165453	25 %	50 %	25 %	0 %	514060814
42478	NC_021521	CCAA	2	8	2165497	2165504	50 %	0 %	0 %	50 %	514060814
42479	NC_021521	CAAG	2	8	2165562	2165569	50 %	0 %	25 %	25 %	514060814
42480	NC_021521	CAAC	2	8	2165650	2165657	50 %	0 %	0 %	50 %	514060814
42481	NC_021521	CGA	2	6	2165658	2165663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060814
42482	NC_021521	AG	3	6	2165842	2165847	50 %	0 %	50 %	0 %	514060814
42483	NC_021521	TA	3	6	2165885	2165890	50 %	50 %	0 %	0 %	514060814
42484	NC_021521	CAT	2	6	2165997	2166002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060814
42485	NC_021521	AAC	2	6	2166070	2166075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060814
42486	NC_021521	ATT	2	6	2166181	2166186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060814
42487	NC_021521	TAC	2	6	2166287	2166292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060814
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42489	NC_021521	ATC	2	6	2166599	2166604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42490	NC_021521	TCA	2	6	2166605	2166610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42491	NC_021521	ATC	3	9	2166686	2166694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42492	NC_021521	CT	3	6	2166736	2166741	0 %	50 %	0 %	50 %	514060815
42493	NC_021521	CCA	2	6	2166774	2166779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060815
42494	NC_021521	CA	3	6	2166813	2166818	50 %	0 %	0 %	50 %	514060815
42495	NC_021521	TTTC	2	8	2166828	2166835	0 %	75 %	0 %	25 %	514060815
42496	NC_021521	GCA	2	6	2166870	2166875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060815
42497	NC_021521	TCA	2	6	2166944	2166949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060815
42498	NC_021521	GCC	2	6	2166961	2166966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060815
42499	NC_021521	CCA	2	6	2166975	2166980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060815
42500	NC_021521	AAT	2	6	2167057	2167062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060815

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