MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_021521	TTC	2	6	1961656	1961661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060638
38503	NC_021521	TTCGCC	2	12	1961689	1961700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	514060638
38504	NC_021521	GTT	2	6	1961737	1961742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060638
38505	NC_021521	ATCA	2	8	1961743	1961750	50 %	25 %	0 %	25 %	514060638
38506	NC_021521	GCC	2	6	1961838	1961843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060638
38507	NC_021521	CCACG	2	10	1961864	1961873	20 %	0 %	20 %	60 %	514060638
38508	NC_021521	TGGTGT	2	12	1961955	1961966	0 %	50 %	50 %	0 %	514060638
38509	NC_021521	CCA	2	6	1961979	1961984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060638
38510	NC_021521	CTG	2	6	1962001	1962006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060638
38511	NC_021521	ATC	2	6	1962064	1962069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060638
38512	NC_021521	AAC	2	6	1962215	1962220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060638
38513	NC_021521	CAG	2	6	1962223	1962228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060638
38514	NC_021521	CAA	2	6	1962268	1962273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060638
38515	NC_021521	ACT	2	6	1962391	1962396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060638
38516	NC_021521	CCG	2	6	1962462	1962467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060638
38517	NC_021521	TGA	2	6	1962519	1962524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060638
38518	NC_021521	TTG	4	12	1962592	1962603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060638
38519	NC_021521	T	6	6	1962657	1962662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38520	NC_021521	CTA	2	6	1962707	1962712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38521	NC_021521	GTTATA	2	12	1962723	1962734	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38522	NC_021521	A	7	7	1962761	1962767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38523	NC_021521	CCCA	2	8	1962805	1962812	25 %	0 %	0 %	75 %	514060639
38524	NC_021521	A	6	6	1962836	1962841	100 %	0 %	0 %	0 %	514060639
38525	NC_021521	TGC	2	6	1962900	1962905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060639
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38530	NC_021521	TGC	2	6	1963035	1963040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060639
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38534	NC_021521	GGTGCA	2	12	1963246	1963257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	514060639
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38550	NC_021521	TTTTGA	2	12	1963923	1963934	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	514060640
38551	NC_021521	CA	3	6	1964050	1964055	50 %	0 %	0 %	50 %	514060640
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38555	NC_021521	GAAA	2	8	1964501	1964508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38556	NC_021521	A	7	7	1964542	1964548	100 %	0 %	0 %	0 %	514060641
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38585	NC_021521	TGA	2	6	1965801	1965806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060642
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38587	NC_021521	GTAG	2	8	1965981	1965988	25 %	25 %	50 %	0 %	514060642
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38589	NC_021521	AG	3	6	1966034	1966039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38590	NC_021521	TAG	2	6	1966056	1966061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38592	NC_021521	CTTT	2	8	1966100	1966107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38593	NC_021521	AAC	2	6	1966237	1966242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38594	NC_021521	ACT	2	6	1966269	1966274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060643
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38599	NC_021521	CTACG	2	10	1966428	1966437	20 %	20 %	20 %	40 %	514060643
38600	NC_021521	CGA	2	6	1966494	1966499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060643
38601	NC_021521	GCT	2	6	1966547	1966552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
38602	NC_021521	TGC	2	6	1966585	1966590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
38603	NC_021521	ATGA	2	8	1966595	1966602	50 %	25 %	25 %	0 %	514060643
38604	NC_021521	CCACTT	2	12	1966707	1966718	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	514060643
38605	NC_021521	CTT	2	6	1966836	1966841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060643
38606	NC_021521	CGTAAG	2	12	1966883	1966894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514060643
38607	NC_021521	ATCAC	2	10	1966925	1966934	40 %	20 %	0 %	40 %	514060643
38608	NC_021521	GT	3	6	1966996	1967001	0 %	50 %	50 %	0 %	514060643
38609	NC_021521	CTG	2	6	1967010	1967015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
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38613	NC_021521	AAG	2	6	1967249	1967254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060643
38614	NC_021521	TGC	2	6	1967260	1967265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
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38618	NC_021521	GCACC	2	10	1967544	1967553	20 %	0 %	20 %	60 %	514060643
38619	NC_021521	TTTG	2	8	1967644	1967651	0 %	75 %	25 %	0 %	514060643
38620	NC_021521	CAC	2	6	1967733	1967738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060643
38621	NC_021521	GATT	2	8	1967782	1967789	25 %	50 %	25 %	0 %	514060643
38622	NC_021521	CA	3	6	1967865	1967870	50 %	0 %	0 %	50 %	514060643
38623	NC_021521	ATCAC	2	10	1967936	1967945	40 %	20 %	0 %	40 %	514060643
38624	NC_021521	TCA	2	6	1967954	1967959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060643
38625	NC_021521	CTT	2	6	1967985	1967990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060643
38626	NC_021521	CTT	2	6	1968051	1968056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060643
38627	NC_021521	CAC	2	6	1968063	1968068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060643
38628	NC_021521	TCA	2	6	1968084	1968089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060643
38629	NC_021521	GT	3	6	1968100	1968105	0 %	50 %	50 %	0 %	514060643
38630	NC_021521	GTC	2	6	1968112	1968117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
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38633	NC_021521	GAT	2	6	1968286	1968291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060643
38634	NC_021521	TGC	2	6	1968346	1968351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
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38636	NC_021521	ATG	2	6	1968396	1968401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060643
38637	NC_021521	CTT	2	6	1968435	1968440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060643
38638	NC_021521	CAT	2	6	1968457	1968462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060643
38639	NC_021521	CGTT	2	8	1968476	1968483	0 %	50 %	25 %	25 %	514060643
38640	NC_021521	GCC	2	6	1968488	1968493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060643
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38647	NC_021521	ATC	2	6	1968806	1968811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060643
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38649	NC_021521	GTT	2	6	1969084	1969089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060643
38650	NC_021521	CAT	2	6	1969096	1969101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060643
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38654	NC_021521	CGC	2	6	1969360	1969365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060643
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38669	NC_021521	T	7	7	1969902	1969908	0 %	100 %	0 %	0 %	514060643
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38674	NC_021521	TTTGG	2	10	1970263	1970272	0 %	60 %	40 %	0 %	514060643
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38677	NC_021521	TCG	2	6	1970504	1970509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060643
38678	NC_021521	CGGT	2	8	1970627	1970634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38679	NC_021521	AC	3	6	1970685	1970690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38680	NC_021521	GT	3	6	1970694	1970699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38681	NC_021521	ACGC	2	8	1970706	1970713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38682	NC_021521	TTTC	2	8	1970780	1970787	0 %	75 %	0 %	25 %	514060644
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38684	NC_021521	CGT	2	6	1970876	1970881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060644
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38703	NC_021521	TTC	2	6	1971915	1971920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060644
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38712	NC_021521	TAC	2	6	1972563	1972568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060644
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38719	NC_021521	TCT	2	6	1972819	1972824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060644
38720	NC_021521	CAC	2	6	1972853	1972858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060644
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38722	NC_021521	AAG	2	6	1973008	1973013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060644
38723	NC_021521	GTT	2	6	1973019	1973024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060644
38724	NC_021521	AGTG	2	8	1973105	1973112	25 %	25 %	50 %	0 %	514060644
38725	NC_021521	GT	3	6	1973113	1973118	0 %	50 %	50 %	0 %	514060644
38726	NC_021521	ACG	2	6	1973181	1973186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060644
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38730	NC_021521	CGCAC	2	10	1973341	1973350	20 %	0 %	20 %	60 %	514060644
38731	NC_021521	ACG	2	6	1973412	1973417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060644
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38733	NC_021521	CAC	2	6	1973447	1973452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060644
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