MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_021521	AATG	2	8	1937462	1937469	50 %	25 %	25 %	0 %	514060620
38003	NC_021521	TAG	2	6	1937530	1937535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060621
38004	NC_021521	ATT	2	6	1937547	1937552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060621
38005	NC_021521	GTTCC	2	10	1937567	1937576	0 %	40 %	20 %	40 %	514060621
38006	NC_021521	GCA	2	6	1937607	1937612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060621
38007	NC_021521	TGA	2	6	1937770	1937775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060621
38008	NC_021521	GAT	2	6	1937804	1937809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060621
38009	NC_021521	GGCT	2	8	1938051	1938058	0 %	25 %	50 %	25 %	514060621
38010	NC_021521	CTAT	2	8	1938186	1938193	25 %	50 %	0 %	25 %	514060621
38011	NC_021521	TGA	2	6	1938301	1938306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060621
38012	NC_021521	TTGC	2	8	1938309	1938316	0 %	50 %	25 %	25 %	514060621
38013	NC_021521	AGT	2	6	1938345	1938350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060621
38014	NC_021521	TTG	2	6	1938433	1938438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060621
38015	NC_021521	GTGTG	2	10	1938493	1938502	0 %	40 %	60 %	0 %	514060621
38016	NC_021521	GTT	2	6	1938506	1938511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060621
38017	NC_021521	ATTAA	2	10	1938526	1938535	60 %	40 %	0 %	0 %	514060621
38018	NC_021521	A	7	7	1938550	1938556	100 %	0 %	0 %	0 %	514060622
38019	NC_021521	TTA	2	6	1938621	1938626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060622
38020	NC_021521	AATGG	2	10	1938635	1938644	40 %	20 %	40 %	0 %	514060622
38021	NC_021521	CA	3	6	1938651	1938656	50 %	0 %	0 %	50 %	514060622
38022	NC_021521	TC	3	6	1938674	1938679	0 %	50 %	0 %	50 %	514060622
38023	NC_021521	GTAA	2	8	1938707	1938714	50 %	25 %	25 %	0 %	514060622
38024	NC_021521	ATTA	2	8	1938745	1938752	50 %	50 %	0 %	0 %	514060622
38025	NC_021521	GA	3	6	1938802	1938807	50 %	0 %	50 %	0 %	514060622
38026	NC_021521	AT	3	6	1938897	1938902	50 %	50 %	0 %	0 %	514060622
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38028	NC_021521	T	7	7	1938933	1938939	0 %	100 %	0 %	0 %	514060622
38029	NC_021521	ATT	2	6	1938952	1938957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060622
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38032	NC_021521	TAT	2	6	1939035	1939040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060622
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38035	NC_021521	AGA	2	6	1939102	1939107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060622
38036	NC_021521	G	7	7	1939114	1939120	0 %	0 %	100 %	0 %	514060622
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38041	NC_021521	GATA	2	8	1939462	1939469	50 %	25 %	25 %	0 %	514060622
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38052	NC_021521	GAA	2	6	1939900	1939905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060623
38053	NC_021521	AAGATA	2	12	1939910	1939921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514060623
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38055	NC_021521	CGAT	2	8	1939971	1939978	25 %	25 %	25 %	25 %	514060623
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38063	NC_021521	AAG	2	6	1940553	1940558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060624
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38084	NC_021521	G	7	7	1941644	1941650	0 %	0 %	100 %	0 %	514060624
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38102	NC_021521	GGC	2	6	1942456	1942461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060624
38103	NC_021521	TGA	2	6	1942464	1942469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060624
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38107	NC_021521	TCG	2	6	1942732	1942737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060624
38108	NC_021521	ATTA	2	8	1942750	1942757	50 %	50 %	0 %	0 %	514060624
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38112	NC_021521	ATA	2	6	1942842	1942847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060624
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38114	NC_021521	GAA	2	6	1942901	1942906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060624
38115	NC_021521	ATGG	2	8	1942936	1942943	25 %	25 %	50 %	0 %	514060624
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38117	NC_021521	TAAAT	2	10	1943044	1943053	60 %	40 %	0 %	0 %	514060624
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38362	NC_021521	ATG	2	6	1954391	1954396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38363	NC_021521	TCC	2	6	1954417	1954422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38364	NC_021521	CAA	2	6	1954469	1954474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38365	NC_021521	GAC	2	6	1954530	1954535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38366	NC_021521	GCA	2	6	1954542	1954547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38367	NC_021521	CTT	2	6	1954590	1954595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38368	NC_021521	TTC	2	6	1954618	1954623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38369	NC_021521	GCCTTC	2	12	1954862	1954873	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38370	NC_021521	TCC	2	6	1954879	1954884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38371	NC_021521	CCCT	2	8	1954924	1954931	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38372	NC_021521	GCT	2	6	1955069	1955074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38373	NC_021521	CTT	2	6	1955094	1955099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38375	NC_021521	CTT	2	6	1955178	1955183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38376	NC_021521	C	6	6	1955213	1955218	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38377	NC_021521	CTG	2	6	1955237	1955242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38378	NC_021521	TCG	2	6	1955312	1955317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38380	NC_021521	CGT	2	6	1955437	1955442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38381	NC_021521	AAAG	2	8	1955501	1955508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38382	NC_021521	TCC	2	6	1955515	1955520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38383	NC_021521	GCC	2	6	1955553	1955558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38384	NC_021521	A	6	6	1955629	1955634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38385	NC_021521	A	6	6	1955683	1955688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38386	NC_021521	TCAA	2	8	1955704	1955711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38387	NC_021521	CA	3	6	1955720	1955725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38388	NC_021521	GTT	2	6	1955739	1955744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38391	NC_021521	ACT	2	6	1955780	1955785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38392	NC_021521	CGT	2	6	1955797	1955802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38393	NC_021521	TG	3	6	1955803	1955808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38394	NC_021521	T	6	6	1955847	1955852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38395	NC_021521	A	6	6	1955855	1955860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38396	NC_021521	A	8	8	1955865	1955872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38397	NC_021521	AAT	2	6	1955960	1955965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060634
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38401	NC_021521	ACT	2	6	1956119	1956124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060634
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38448	NC_021521	TGATT	2	10	1958989	1958998	20 %	60 %	20 %	0 %	514060635
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38451	NC_021521	TGTGC	2	10	1959109	1959118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38452	NC_021521	CCG	2	6	1959149	1959154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38454	NC_021521	CTG	2	6	1959182	1959187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38455	NC_021521	CTTC	2	8	1959280	1959287	0 %	50 %	0 %	50 %	514060636
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38462	NC_021521	CT	3	6	1959478	1959483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38463	NC_021521	ATA	2	6	1959711	1959716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38464	NC_021521	AT	3	6	1959722	1959727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38465	NC_021521	TCA	2	6	1959856	1959861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060637
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38467	NC_021521	CT	4	8	1959936	1959943	0 %	50 %	0 %	50 %	514060637
38468	NC_021521	AAG	2	6	1960026	1960031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060637
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38476	NC_021521	AT	3	6	1960356	1960361	50 %	50 %	0 %	0 %	514060637
38477	NC_021521	A	6	6	1960373	1960378	100 %	0 %	0 %	0 %	514060637
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38479	NC_021521	A	6	6	1960438	1960443	100 %	0 %	0 %	0 %	514060637
38480	NC_021521	GTT	2	6	1960475	1960480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060637
38481	NC_021521	A	6	6	1960493	1960498	100 %	0 %	0 %	0 %	514060637
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38483	NC_021521	CAG	2	6	1960641	1960646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060638
38484	NC_021521	CTCA	2	8	1960669	1960676	25 %	25 %	0 %	50 %	514060638
38485	NC_021521	TGT	2	6	1960802	1960807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060638
38486	NC_021521	ACG	2	6	1960834	1960839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060638
38487	NC_021521	CTT	2	6	1960842	1960847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060638
38488	NC_021521	TCA	2	6	1960859	1960864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060638
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38490	NC_021521	TCA	2	6	1960950	1960955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060638
38491	NC_021521	TCA	2	6	1960976	1960981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060638
38492	NC_021521	CAT	2	6	1960996	1961001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060638
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38499	NC_021521	CAA	2	6	1961545	1961550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060638
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