MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_021521	GTT	2	6	1834912	1834917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060516
36003	NC_021521	TTAG	2	8	1834937	1834944	25 %	50 %	25 %	0 %	514060516
36004	NC_021521	ATC	2	6	1834952	1834957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060516
36005	NC_021521	ACA	2	6	1834961	1834966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060516
36006	NC_021521	CAAAAG	2	12	1834971	1834982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	514060516
36007	NC_021521	CGT	2	6	1834988	1834993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060516
36008	NC_021521	ATTA	2	8	1835005	1835012	50 %	50 %	0 %	0 %	514060516
36009	NC_021521	TCG	2	6	1835041	1835046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060516
36010	NC_021521	ATT	2	6	1835089	1835094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060516
36011	NC_021521	GGT	2	6	1835129	1835134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060516
36012	NC_021521	AGTT	2	8	1835196	1835203	25 %	50 %	25 %	0 %	514060516
36013	NC_021521	AGC	2	6	1835230	1835235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060516
36014	NC_021521	AAT	2	6	1835238	1835243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060516
36015	NC_021521	T	6	6	1835287	1835292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36017	NC_021521	TTA	2	6	1835318	1835323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36018	NC_021521	T	6	6	1835327	1835332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36019	NC_021521	AAT	2	6	1835346	1835351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36020	NC_021521	ATT	2	6	1835358	1835363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36021	NC_021521	ATC	2	6	1835392	1835397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36022	NC_021521	CTA	2	6	1835492	1835497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060517
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36025	NC_021521	T	6	6	1835665	1835670	0 %	100 %	0 %	0 %	514060518
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36033	NC_021521	ATA	2	6	1835909	1835914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060518
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36040	NC_021521	AGT	2	6	1836104	1836109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060518
36041	NC_021521	TA	3	6	1836120	1836125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36042	NC_021521	ATA	2	6	1836219	1836224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36043	NC_021521	TAT	2	6	1836244	1836249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36044	NC_021521	AAC	2	6	1836258	1836263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36045	NC_021521	TGA	2	6	1836362	1836367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36046	NC_021521	CGTGAC	2	12	1836393	1836404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36059	NC_021521	TGAT	2	8	1837082	1837089	25 %	50 %	25 %	0 %	514060520
36060	NC_021521	TGA	2	6	1837092	1837097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060520
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36069	NC_021521	TGCG	2	8	1837753	1837760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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36072	NC_021521	CTG	2	6	1837852	1837857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060522
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36103	NC_021521	TC	3	6	1839356	1839361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36104	NC_021521	ACC	2	6	1839363	1839368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36115	NC_021521	CT	3	6	1839877	1839882	0 %	50 %	0 %	50 %	514060526
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36120	NC_021521	T	6	6	1840611	1840616	0 %	100 %	0 %	0 %	514060526
36121	NC_021521	AAC	2	6	1840639	1840644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060526
36122	NC_021521	TGG	2	6	1840700	1840705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060526
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36125	NC_021521	TCA	2	6	1841004	1841009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060527
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36129	NC_021521	T	7	7	1841132	1841138	0 %	100 %	0 %	0 %	514060528
36130	NC_021521	GTTTT	2	10	1841190	1841199	0 %	80 %	20 %	0 %	514060528
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36135	NC_021521	AG	3	6	1841375	1841380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36136	NC_021521	A	7	7	1841402	1841408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36137	NC_021521	ATA	2	6	1841456	1841461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36191	NC_021521	TAA	2	6	1844746	1844751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36237	NC_021521	CAAC	2	8	1846730	1846737	50 %	0 %	0 %	50 %	514060535
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36346	NC_021521	GCTCTG	2	12	1851603	1851614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
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36356	NC_021521	TCG	2	6	1851951	1851956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
36357	NC_021521	CTG	2	6	1851993	1851998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
36358	NC_021521	CTG	2	6	1852068	1852073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
36359	NC_021521	GCC	2	6	1852105	1852110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060541
36360	NC_021521	TGGT	2	8	1852137	1852144	0 %	50 %	50 %	0 %	514060541
36361	NC_021521	TGT	2	6	1852150	1852155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541
36362	NC_021521	ATT	2	6	1852246	1852251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060541
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36364	NC_021521	CTTCAC	2	12	1852377	1852388	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	514060541
36365	NC_021521	T	6	6	1852399	1852404	0 %	100 %	0 %	0 %	514060541
36366	NC_021521	CAC	2	6	1852428	1852433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060541
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36368	NC_021521	CAT	2	6	1852662	1852667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060541
36369	NC_021521	TTG	2	6	1852684	1852689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541
36370	NC_021521	TCT	2	6	1852742	1852747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060541
36371	NC_021521	CTGC	2	8	1852770	1852777	0 %	25 %	25 %	50 %	514060541
36372	NC_021521	GTT	2	6	1852801	1852806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541
36373	NC_021521	TCTT	2	8	1852814	1852821	0 %	75 %	0 %	25 %	514060541
36374	NC_021521	TAT	2	6	1852845	1852850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060541
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36377	NC_021521	T	6	6	1853001	1853006	0 %	100 %	0 %	0 %	514060541
36378	NC_021521	CTG	2	6	1853025	1853030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060541
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36384	NC_021521	ACA	2	6	1853417	1853422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060541
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36386	NC_021521	TAT	2	6	1853475	1853480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060541
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36388	NC_021521	GTA	2	6	1853522	1853527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060541
36389	NC_021521	TGT	2	6	1853587	1853592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060541
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36399	NC_021521	TTTG	2	8	1854048	1854055	0 %	75 %	25 %	0 %	514060541
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36411	NC_021521	GGT	2	6	1854657	1854662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36412	NC_021521	TATT	2	8	1854710	1854717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36413	NC_021521	T	7	7	1854751	1854757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36414	NC_021521	CTTCT	2	10	1854795	1854804	0 %	60 %	0 %	40 %	514060543
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36422	NC_021521	AGG	2	6	1855201	1855206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060543
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36426	NC_021521	ATCA	2	8	1855503	1855510	50 %	25 %	0 %	25 %	514060544
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36437	NC_021521	GTGA	2	8	1856286	1856293	25 %	25 %	50 %	0 %	514060544
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36443	NC_021521	CTA	2	6	1856905	1856910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36444	NC_021521	TTC	2	6	1856957	1856962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36445	NC_021521	AAGG	2	8	1857084	1857091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36446	NC_021521	CAA	2	6	1857138	1857143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060545
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36450	NC_021521	AAT	2	6	1857619	1857624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060545
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36455	NC_021521	ATC	2	6	1858008	1858013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060546
36456	NC_021521	ATG	2	6	1858029	1858034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060546
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36458	NC_021521	TAG	2	6	1858215	1858220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060546
36459	NC_021521	TGCCG	2	10	1858319	1858328	0 %	20 %	40 %	40 %	514060546
36460	NC_021521	CTG	2	6	1858336	1858341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060546
36461	NC_021521	AATC	2	8	1858373	1858380	50 %	25 %	0 %	25 %	514060546
36462	NC_021521	ATA	2	6	1858471	1858476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060546
36463	NC_021521	ACC	2	6	1858518	1858523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060546
36464	NC_021521	CCA	2	6	1858643	1858648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060546
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36466	NC_021521	TAAAA	2	10	1858766	1858775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36467	NC_021521	GTC	2	6	1858819	1858824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36468	NC_021521	C	6	6	1858878	1858883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36469	NC_021521	G	6	6	1858893	1858898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36470	NC_021521	G	6	6	1858903	1858908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36471	NC_021521	AATC	2	8	1858915	1858922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36472	NC_021521	ATTA	2	8	1858980	1858987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36473	NC_021521	CCA	2	6	1859065	1859070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060547
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36475	NC_021521	AAT	2	6	1859117	1859122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060547
36476	NC_021521	TCA	2	6	1859218	1859223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060547
36477	NC_021521	GACA	2	8	1859363	1859370	50 %	0 %	25 %	25 %	514060547
36478	NC_021521	ATC	2	6	1859421	1859426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060547
36479	NC_021521	TTAG	2	8	1859484	1859491	25 %	50 %	25 %	0 %	514060547
36480	NC_021521	GTT	2	6	1859565	1859570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060547
36481	NC_021521	GAA	2	6	1859705	1859710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060547
36482	NC_021521	AAT	2	6	1860041	1860046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060547
36483	NC_021521	GT	3	6	1860056	1860061	0 %	50 %	50 %	0 %	514060547
36484	NC_021521	A	6	6	1860063	1860068	100 %	0 %	0 %	0 %	514060547
36485	NC_021521	TAA	2	6	1860139	1860144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060547
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36488	NC_021521	CTA	2	6	1860334	1860339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060547
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36490	NC_021521	TCA	2	6	1860438	1860443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060547
36491	NC_021521	TTTG	2	8	1860450	1860457	0 %	75 %	25 %	0 %	514060547
36492	NC_021521	ACC	2	6	1860539	1860544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060547
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36494	NC_021521	ATA	2	6	1860591	1860596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36495	NC_021521	A	7	7	1860637	1860643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36496	NC_021521	A	6	6	1860656	1860661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36497	NC_021521	T	6	6	1860768	1860773	0 %	100 %	0 %	0 %	514060548
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36500	NC_021521	A	6	6	1861065	1861070	100 %	0 %	0 %	0 %	514060548

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