MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_021521	TGCT	2	8	1779094	1779101	0 %	50 %	25 %	25 %	514060436
35002	NC_021521	ATC	2	6	1779113	1779118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060436
35003	NC_021521	A	6	6	1779153	1779158	100 %	0 %	0 %	0 %	514060437
35004	NC_021521	TGT	2	6	1779167	1779172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060437
35005	NC_021521	GGA	2	6	1779195	1779200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514060437
35006	NC_021521	CTT	2	6	1779278	1779283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060437
35007	NC_021521	GAT	2	6	1779298	1779303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060437
35008	NC_021521	GAT	2	6	1779314	1779319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060437
35009	NC_021521	CAA	2	6	1779334	1779339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060437
35010	NC_021521	CAA	2	6	1779431	1779436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060437
35011	NC_021521	TCA	2	6	1779448	1779453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060437
35012	NC_021521	GAC	2	6	1779510	1779515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060437
35013	NC_021521	TCA	2	6	1779550	1779555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060437
35014	NC_021521	AAT	2	6	1779644	1779649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060438
35015	NC_021521	GCTT	2	8	1779725	1779732	0 %	50 %	25 %	25 %	514060438
35016	NC_021521	AATT	2	8	1779776	1779783	50 %	50 %	0 %	0 %	514060438
35017	NC_021521	CAC	2	6	1779886	1779891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060438
35018	NC_021521	T	7	7	1779920	1779926	0 %	100 %	0 %	0 %	514060438
35019	NC_021521	T	7	7	1779935	1779941	0 %	100 %	0 %	0 %	514060438
35020	NC_021521	T	6	6	1779950	1779955	0 %	100 %	0 %	0 %	514060438
35021	NC_021521	CCCCA	2	10	1780001	1780010	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
35022	NC_021521	ACT	2	6	1780016	1780021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060439
35023	NC_021521	CAA	2	6	1780022	1780027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060439
35024	NC_021521	CGG	2	6	1780128	1780133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060439
35025	NC_021521	CATC	2	8	1780208	1780215	25 %	25 %	0 %	50 %	514060439
35026	NC_021521	AAACCA	2	12	1780267	1780278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060439
35027	NC_021521	GCAC	2	8	1780291	1780298	25 %	0 %	25 %	50 %	514060439
35028	NC_021521	ATC	2	6	1780413	1780418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060439
35029	NC_021521	GTG	2	6	1780456	1780461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060439
35030	NC_021521	CGCCA	2	10	1780479	1780488	20 %	0 %	20 %	60 %	514060439
35031	NC_021521	GGT	2	6	1780514	1780519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060439
35032	NC_021521	A	6	6	1780527	1780532	100 %	0 %	0 %	0 %	514060439
35033	NC_021521	T	6	6	1780566	1780571	0 %	100 %	0 %	0 %	514060439
35034	NC_021521	ATC	2	6	1780590	1780595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060439
35035	NC_021521	CCG	2	6	1780604	1780609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060439
35036	NC_021521	TTG	2	6	1780623	1780628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060439
35037	NC_021521	AAT	2	6	1780642	1780647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060439
35038	NC_021521	AAT	2	6	1780699	1780704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060439
35039	NC_021521	TCT	2	6	1780736	1780741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060439
35040	NC_021521	CACC	2	8	1780754	1780761	25 %	0 %	0 %	75 %	514060439
35041	NC_021521	AACC	2	8	1780789	1780796	50 %	0 %	0 %	50 %	514060439
35042	NC_021521	TGA	2	6	1780815	1780820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060439
35043	NC_021521	TTAA	2	8	1780855	1780862	50 %	50 %	0 %	0 %	514060439
35044	NC_021521	T	6	6	1780923	1780928	0 %	100 %	0 %	0 %	514060439
35045	NC_021521	GTCTGC	2	12	1781034	1781045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060440
35046	NC_021521	AAT	2	6	1781110	1781115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060440
35047	NC_021521	CCA	2	6	1781125	1781130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060440
35048	NC_021521	CAA	2	6	1781174	1781179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060440
35049	NC_021521	CCA	2	6	1781332	1781337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060440
35050	NC_021521	AAC	2	6	1781466	1781471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060440
35051	NC_021521	GGTT	2	8	1781578	1781585	0 %	50 %	50 %	0 %	514060440
35052	NC_021521	GCC	2	6	1781679	1781684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060440
35053	NC_021521	AT	3	6	1781727	1781732	50 %	50 %	0 %	0 %	514060440
35054	NC_021521	AG	3	6	1781788	1781793	50 %	0 %	50 %	0 %	514060440
35055	NC_021521	AATC	2	8	1781806	1781813	50 %	25 %	0 %	25 %	514060440
35056	NC_021521	TGAT	2	8	1781832	1781839	25 %	50 %	25 %	0 %	514060440
35057	NC_021521	AACC	2	8	1781910	1781917	50 %	0 %	0 %	50 %	514060440
35058	NC_021521	AAT	2	6	1782021	1782026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35059	NC_021521	AAC	2	6	1782068	1782073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35060	NC_021521	A	7	7	1782105	1782111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35061	NC_021521	A	6	6	1782181	1782186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35062	NC_021521	CAA	2	6	1782207	1782212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35063	NC_021521	ATT	2	6	1782255	1782260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060441
35064	NC_021521	ACGG	2	8	1782333	1782340	25 %	0 %	50 %	25 %	514060441
35065	NC_021521	TCA	2	6	1782363	1782368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060441
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35067	NC_021521	CGC	2	6	1782423	1782428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060441
35068	NC_021521	TGA	2	6	1782434	1782439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060441
35069	NC_021521	TTATCA	2	12	1782476	1782487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514060441
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35071	NC_021521	GAC	2	6	1782570	1782575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060441
35072	NC_021521	GTT	2	6	1782697	1782702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060441
35073	NC_021521	CGA	2	6	1782766	1782771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35074	NC_021521	TG	3	6	1782805	1782810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35075	NC_021521	AAT	2	6	1782846	1782851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060442
35076	NC_021521	T	6	6	1782858	1782863	0 %	100 %	0 %	0 %	514060442
35077	NC_021521	T	6	6	1782937	1782942	0 %	100 %	0 %	0 %	514060442
35078	NC_021521	ATC	2	6	1783119	1783124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060442
35079	NC_021521	CTGT	2	8	1783171	1783178	0 %	50 %	25 %	25 %	514060442
35080	NC_021521	T	6	6	1783272	1783277	0 %	100 %	0 %	0 %	514060442
35081	NC_021521	TTG	2	6	1783286	1783291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060442
35082	NC_021521	TGA	2	6	1783354	1783359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060442
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35084	NC_021521	TCA	2	6	1783450	1783455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060442
35085	NC_021521	TTC	2	6	1783492	1783497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060442
35086	NC_021521	TGG	2	6	1783611	1783616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060442
35087	NC_021521	GTC	2	6	1783624	1783629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060442
35088	NC_021521	GTT	2	6	1783748	1783753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060442
35089	NC_021521	G	7	7	1783814	1783820	0 %	0 %	100 %	0 %	514060442
35090	NC_021521	AG	3	6	1784167	1784172	50 %	0 %	50 %	0 %	514060443
35091	NC_021521	AAT	2	6	1784190	1784195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060443
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35093	NC_021521	ATC	2	6	1784297	1784302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060443
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35099	NC_021521	G	6	6	1784454	1784459	0 %	0 %	100 %	0 %	514060443
35100	NC_021521	G	6	6	1784463	1784468	0 %	0 %	100 %	0 %	514060443
35101	NC_021521	CTT	2	6	1784538	1784543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060443
35102	NC_021521	CCA	2	6	1784604	1784609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060443
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35104	NC_021521	CAA	2	6	1784710	1784715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060443
35105	NC_021521	AAT	2	6	1784725	1784730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060443
35106	NC_021521	TCG	2	6	1784782	1784787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060443
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35109	NC_021521	TGCC	2	8	1784982	1784989	0 %	25 %	25 %	50 %	514060443
35110	NC_021521	ACGC	2	8	1785012	1785019	25 %	0 %	25 %	50 %	514060443
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35112	NC_021521	CGAG	2	8	1785184	1785191	25 %	0 %	50 %	25 %	514060443
35113	NC_021521	CAC	2	6	1785205	1785210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060443
35114	NC_021521	AAT	2	6	1785400	1785405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060443
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35119	NC_021521	ATAA	2	8	1785578	1785585	75 %	25 %	0 %	0 %	514060443
35120	NC_021521	CAT	2	6	1785618	1785623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060443
35121	NC_021521	GGT	2	6	1785666	1785671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060443
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35220	NC_021521	A	7	7	1791116	1791122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35222	NC_021521	CTGA	2	8	1791205	1791212	25 %	25 %	25 %	25 %	514060453
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35227	NC_021521	ACC	2	6	1791620	1791625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35228	NC_021521	A	7	7	1791690	1791696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35229	NC_021521	A	6	6	1791702	1791707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35230	NC_021521	ATC	2	6	1791778	1791783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35231	NC_021521	ATA	2	6	1791847	1791852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35232	NC_021521	TAT	2	6	1791872	1791877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060454
35233	NC_021521	AAC	2	6	1791886	1791891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060454
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35235	NC_021521	GACC	2	8	1792004	1792011	25 %	0 %	25 %	50 %	514060454
35236	NC_021521	TGA	2	6	1792088	1792093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060454
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35238	NC_021521	ATT	2	6	1792194	1792199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060454
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35251	NC_021521	TGAT	2	8	1793047	1793054	25 %	50 %	25 %	0 %	514060454
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35357	NC_021521	CGT	2	6	1798681	1798686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060466
35358	NC_021521	TTA	2	6	1798707	1798712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060466
35359	NC_021521	A	6	6	1798726	1798731	100 %	0 %	0 %	0 %	514060467
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35361	NC_021521	ATC	2	6	1798790	1798795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060467
35362	NC_021521	A	7	7	1798819	1798825	100 %	0 %	0 %	0 %	514060467
35363	NC_021521	GTTC	2	8	1798873	1798880	0 %	50 %	25 %	25 %	514060467
35364	NC_021521	GGC	2	6	1798899	1798904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060467
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35368	NC_021521	TGA	2	6	1799124	1799129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060467
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35371	NC_021521	TGA	2	6	1799436	1799441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060467
35372	NC_021521	TTG	2	6	1799662	1799667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060467
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35374	NC_021521	TGA	2	6	1799760	1799765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060467
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35390	NC_021521	GTG	2	6	1800584	1800589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060468
35391	NC_021521	GAT	2	6	1800645	1800650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060468
35392	NC_021521	CAA	2	6	1800681	1800686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060468
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35402	NC_021521	AAT	2	6	1801396	1801401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060468
35403	NC_021521	T	6	6	1801504	1801509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35404	NC_021521	AAT	2	6	1801523	1801528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060469
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35411	NC_021521	T	6	6	1802027	1802032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35412	NC_021521	TATTT	2	10	1802120	1802129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35413	NC_021521	T	6	6	1802170	1802175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35414	NC_021521	TGG	2	6	1802447	1802452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060470
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35457	NC_021521	TGA	2	6	1804613	1804618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060472
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35466	NC_021521	TGA	2	6	1805374	1805379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060474
35467	NC_021521	GT	3	6	1805391	1805396	0 %	50 %	50 %	0 %	514060474
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35472	NC_021521	ACG	2	6	1805819	1805824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060475
35473	NC_021521	CCG	2	6	1805946	1805951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060475
35474	NC_021521	CCAA	2	8	1806023	1806030	50 %	0 %	0 %	50 %	514060475
35475	NC_021521	ACAGGC	2	12	1806065	1806076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060475
35476	NC_021521	CAA	2	6	1806168	1806173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060475
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35478	NC_021521	TGA	2	6	1806487	1806492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060475
35479	NC_021521	ACG	2	6	1806533	1806538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060475
35480	NC_021521	TGA	2	6	1806652	1806657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060475
35481	NC_021521	TCG	2	6	1806664	1806669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060475
35482	NC_021521	TGA	2	6	1806700	1806705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060475
35483	NC_021521	TTG	2	6	1806765	1806770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060475
35484	NC_021521	TTAA	2	8	1806908	1806915	50 %	50 %	0 %	0 %	514060475
35485	NC_021521	TAAT	2	8	1806934	1806941	50 %	50 %	0 %	0 %	514060475
35486	NC_021521	ATT	2	6	1806949	1806954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060476
35487	NC_021521	CAAT	2	8	1807079	1807086	50 %	25 %	0 %	25 %	514060476
35488	NC_021521	CTA	2	6	1807134	1807139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060476
35489	NC_021521	TCA	3	9	1807250	1807258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060476
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35491	NC_021521	AAG	2	6	1807367	1807372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060476
35492	NC_021521	TGT	2	6	1807373	1807378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060476
35493	NC_021521	TGT	2	6	1807424	1807429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060476
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35495	NC_021521	TAA	2	6	1807496	1807501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35496	NC_021521	T	6	6	1807539	1807544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35497	NC_021521	CGT	2	6	1807644	1807649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060477
35498	NC_021521	A	7	7	1807684	1807690	100 %	0 %	0 %	0 %	514060477
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35500	NC_021521	AG	3	6	1808005	1808010	50 %	0 %	50 %	0 %	514060479

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