MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_021521	GGCA	2	8	1754184	1754191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34502	NC_021521	T	6	6	1754246	1754251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34503	NC_021521	A	6	6	1754282	1754287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34504	NC_021521	GAT	2	6	1754306	1754311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34505	NC_021521	A	7	7	1754353	1754359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34506	NC_021521	TGAT	2	8	1754406	1754413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34507	NC_021521	CTA	2	6	1754523	1754528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34508	NC_021521	TATT	2	8	1754563	1754570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34509	NC_021521	ATA	2	6	1754590	1754595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34510	NC_021521	ATCGC	2	10	1754612	1754621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34511	NC_021521	CAG	2	6	1754673	1754678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34512	NC_021521	CTT	2	6	1754862	1754867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34513	NC_021521	AAAT	2	8	1754955	1754962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34514	NC_021521	TTC	2	6	1755019	1755024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34515	NC_021521	GCT	2	6	1755029	1755034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34516	NC_021521	TAA	2	6	1755079	1755084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34517	NC_021521	ATC	2	6	1755109	1755114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34518	NC_021521	AAC	2	6	1755116	1755121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34519	NC_021521	TATT	2	8	1755195	1755202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34520	NC_021521	TGG	2	6	1755319	1755324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34521	NC_021521	CAT	2	6	1755334	1755339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060407
34522	NC_021521	CTTC	2	8	1755389	1755396	0 %	50 %	0 %	50 %	514060407
34523	NC_021521	ATG	2	6	1755400	1755405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060407
34524	NC_021521	TGA	2	6	1755406	1755411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060407
34525	NC_021521	T	6	6	1755453	1755458	0 %	100 %	0 %	0 %	514060407
34526	NC_021521	T	6	6	1755463	1755468	0 %	100 %	0 %	0 %	514060407
34527	NC_021521	AG	3	6	1755480	1755485	50 %	0 %	50 %	0 %	514060407
34528	NC_021521	TGC	2	6	1755585	1755590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34529	NC_021521	CTT	2	6	1755600	1755605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34530	NC_021521	TCA	2	6	1755629	1755634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34531	NC_021521	TTAT	2	8	1755670	1755677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34532	NC_021521	TGC	2	6	1755721	1755726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060408
34533	NC_021521	CGAT	2	8	1755770	1755777	25 %	25 %	25 %	25 %	514060408
34534	NC_021521	T	6	6	1755790	1755795	0 %	100 %	0 %	0 %	514060408
34535	NC_021521	TGA	2	6	1755804	1755809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060408
34536	NC_021521	GAC	2	6	1755891	1755896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060408
34537	NC_021521	ACT	2	6	1755926	1755931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060408
34538	NC_021521	ATA	2	6	1755970	1755975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060408
34539	NC_021521	AGC	2	6	1755982	1755987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060408
34540	NC_021521	ATT	2	6	1756043	1756048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060408
34541	NC_021521	CTA	2	6	1756056	1756061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34542	NC_021521	ATT	2	6	1756087	1756092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34543	NC_021521	CTA	3	9	1756155	1756163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060409
34544	NC_021521	ACGTTT	2	12	1756207	1756218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514060409
34545	NC_021521	GTT	2	6	1756220	1756225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060409
34546	NC_021521	T	7	7	1756284	1756290	0 %	100 %	0 %	0 %	514060409
34547	NC_021521	GCA	2	6	1756301	1756306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060409
34548	NC_021521	TTG	2	6	1756383	1756388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34549	NC_021521	CTA	2	6	1756497	1756502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060410
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34551	NC_021521	T	6	6	1756711	1756716	0 %	100 %	0 %	0 %	514060410
34552	NC_021521	CTTTCT	2	12	1756734	1756745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060410
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34555	NC_021521	CTT	2	6	1756848	1756853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060410
34556	NC_021521	GATAC	2	10	1756859	1756868	40 %	20 %	20 %	20 %	514060410
34557	NC_021521	CTT	2	6	1756902	1756907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060410
34558	NC_021521	TTC	2	6	1756918	1756923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34559	NC_021521	AGA	2	6	1757017	1757022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34560	NC_021521	AG	3	6	1757051	1757056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34561	NC_021521	TCATT	2	10	1757108	1757117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34562	NC_021521	TTG	2	6	1757133	1757138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34563	NC_021521	TAA	2	6	1757150	1757155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34564	NC_021521	CAATAA	2	12	1757178	1757189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	514060411
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34587	NC_021521	T	6	6	1758281	1758286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34590	NC_021521	CTT	2	6	1758381	1758386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34591	NC_021521	A	7	7	1758430	1758436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34592	NC_021521	TTA	2	6	1758474	1758479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34593	NC_021521	TAT	2	6	1758502	1758507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34594	NC_021521	GCC	2	6	1758534	1758539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060412
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34600	NC_021521	TGC	2	6	1758917	1758922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060412
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34602	NC_021521	CA	3	6	1758962	1758967	50 %	0 %	0 %	50 %	514060412
34603	NC_021521	AATT	2	8	1758995	1759002	50 %	50 %	0 %	0 %	514060412
34604	NC_021521	CTT	2	6	1759123	1759128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060412
34605	NC_021521	TGG	2	6	1759201	1759206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060412
34606	NC_021521	GAATA	2	10	1759342	1759351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34607	NC_021521	ACA	2	6	1759383	1759388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34608	NC_021521	A	6	6	1759400	1759405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34609	NC_021521	CTTT	2	8	1759430	1759437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34610	NC_021521	ATT	2	6	1759460	1759465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060413
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34612	NC_021521	GTGA	2	8	1759577	1759584	25 %	25 %	50 %	0 %	514060413
34613	NC_021521	T	6	6	1759698	1759703	0 %	100 %	0 %	0 %	514060413
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34616	NC_021521	TTTG	2	8	1759790	1759797	0 %	75 %	25 %	0 %	514060413
34617	NC_021521	ATG	2	6	1759798	1759803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060413
34618	NC_021521	TAA	2	6	1759814	1759819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34619	NC_021521	CAA	2	6	1759870	1759875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060414
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34621	NC_021521	GTCA	2	8	1759888	1759895	25 %	25 %	25 %	25 %	514060414
34622	NC_021521	GTG	2	6	1759978	1759983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060414
34623	NC_021521	C	7	7	1760157	1760163	0 %	0 %	0 %	100 %	514060414
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34650	NC_021521	A	6	6	1761473	1761478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34651	NC_021521	A	6	6	1761517	1761522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34652	NC_021521	GA	3	6	1761523	1761528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34653	NC_021521	T	6	6	1761551	1761556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34654	NC_021521	AGA	2	6	1761600	1761605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34655	NC_021521	CAAAA	2	10	1761611	1761620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34656	NC_021521	ATT	2	6	1761637	1761642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34658	NC_021521	TAA	2	6	1761692	1761697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34659	NC_021521	AAT	2	6	1761727	1761732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34731	NC_021521	ATC	2	6	1765256	1765261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060420
34732	NC_021521	CAT	2	6	1765393	1765398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060420
34733	NC_021521	AGT	2	6	1765413	1765418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060420
34734	NC_021521	T	6	6	1765444	1765449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34735	NC_021521	TGCT	11	44	1765495	1765538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34736	NC_021521	TTTA	2	8	1765581	1765588	25 %	75 %	0 %	0 %	514060421
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34739	NC_021521	CCAC	2	8	1766077	1766084	25 %	0 %	0 %	75 %	514060422
34740	NC_021521	AAT	2	6	1766088	1766093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060422
34741	NC_021521	CCA	2	6	1766121	1766126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060422
34742	NC_021521	ATC	2	6	1766213	1766218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060422
34743	NC_021521	GACA	2	8	1766284	1766291	50 %	0 %	25 %	25 %	514060422
34744	NC_021521	CCG	2	6	1766354	1766359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060422
34745	NC_021521	GTT	2	6	1766409	1766414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060422
34746	NC_021521	CGG	2	6	1766428	1766433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060422
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34748	NC_021521	CCG	2	6	1766555	1766560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060422
34749	NC_021521	GTT	2	6	1766566	1766571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060422
34750	NC_021521	A	6	6	1766589	1766594	100 %	0 %	0 %	0 %	514060422
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34752	NC_021521	TAA	2	6	1766687	1766692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060423
34753	NC_021521	ATA	2	6	1766717	1766722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060423
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34761	NC_021521	ATC	3	9	1767059	1767067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060423
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34765	NC_021521	ATT	2	6	1767331	1767336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060423
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34770	NC_021521	AATG	2	8	1767574	1767581	50 %	25 %	25 %	0 %	514060423
34771	NC_021521	T	6	6	1767618	1767623	0 %	100 %	0 %	0 %	514060423
34772	NC_021521	CCA	2	6	1767830	1767835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060423
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34781	NC_021521	GTTTT	2	10	1768245	1768254	0 %	80 %	20 %	0 %	514060423
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34785	NC_021521	TTCT	2	8	1768716	1768723	0 %	75 %	0 %	25 %	514060424
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34800	NC_021521	TGA	2	6	1769222	1769227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060425
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34822	NC_021521	AG	3	6	1770282	1770287	50 %	0 %	50 %	0 %	514060426
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34825	NC_021521	TA	3	6	1770363	1770368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34826	NC_021521	CGT	2	6	1770394	1770399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060427
34827	NC_021521	TGA	2	6	1770402	1770407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060427
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34836	NC_021521	AAT	3	9	1770767	1770775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060427
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34841	NC_021521	CGGAA	2	10	1770830	1770839	40 %	0 %	40 %	20 %	514060427
34842	NC_021521	TCAAC	2	10	1770859	1770868	40 %	20 %	0 %	40 %	514060427
34843	NC_021521	C	6	6	1770946	1770951	0 %	0 %	0 %	100 %	514060427
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34845	NC_021521	TGT	2	6	1771002	1771007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060427
34846	NC_021521	CTTACG	2	12	1771084	1771095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514060428
34847	NC_021521	ATCT	2	8	1771222	1771229	25 %	50 %	0 %	25 %	514060428
34848	NC_021521	ACAGTT	2	12	1771304	1771315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514060428
34849	NC_021521	T	6	6	1771363	1771368	0 %	100 %	0 %	0 %	514060428
34850	NC_021521	ACC	2	6	1771400	1771405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060428
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34852	NC_021521	TGG	2	6	1771603	1771608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060428
34853	NC_021521	AAT	2	6	1771614	1771619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060428
34854	NC_021521	CAC	2	6	1771623	1771628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060428
34855	NC_021521	CAA	2	6	1771658	1771663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060428
34856	NC_021521	CAG	2	6	1771671	1771676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060428
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