MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_021521	ATA	2	6	1675459	1675464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33005	NC_021521	T	7	7	1675538	1675544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_021521	GAA	2	6	1675614	1675619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33007	NC_021521	TAA	2	6	1675724	1675729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060333
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33014	NC_021521	GTTG	2	8	1676178	1676185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33015	NC_021521	TCAC	2	8	1676258	1676265	25 %	25 %	0 %	50 %	514060335
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33120	NC_021521	T	6	6	1681288	1681293	0 %	100 %	0 %	0 %	514060340
33121	NC_021521	GTACG	2	10	1681316	1681325	20 %	20 %	40 %	20 %	514060340
33122	NC_021521	ATAA	2	8	1681459	1681466	75 %	25 %	0 %	0 %	514060340
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33124	NC_021521	GAA	2	6	1681514	1681519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060340
33125	NC_021521	ACG	3	9	1681587	1681595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060340
33126	NC_021521	ATC	2	6	1681653	1681658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060340
33127	NC_021521	CAC	2	6	1681661	1681666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060340
33128	NC_021521	TCA	2	6	1681687	1681692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060340
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33131	NC_021521	CAT	2	6	1681805	1681810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060340
33132	NC_021521	CCGT	2	8	1681846	1681853	0 %	25 %	25 %	50 %	514060340
33133	NC_021521	TAA	2	6	1681929	1681934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060340
33134	NC_021521	TAT	2	6	1681994	1681999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33135	NC_021521	TCA	2	6	1682083	1682088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060341
33136	NC_021521	CAT	2	6	1682117	1682122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060341
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33143	NC_021521	TTA	2	6	1682386	1682391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33144	NC_021521	ATT	2	6	1682400	1682405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33145	NC_021521	TTG	2	6	1682409	1682414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33146	NC_021521	A	6	6	1682455	1682460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33147	NC_021521	TAA	2	6	1682480	1682485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33148	NC_021521	A	6	6	1682484	1682489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33149	NC_021521	A	6	6	1682531	1682536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33150	NC_021521	AAT	2	6	1682558	1682563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060342
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33152	NC_021521	ATT	2	6	1682633	1682638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060342
33153	NC_021521	ATC	2	6	1682660	1682665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060342
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33162	NC_021521	AAT	2	6	1683448	1683453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33163	NC_021521	ATT	2	6	1683465	1683470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33164	NC_021521	ATA	2	6	1683507	1683512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33165	NC_021521	A	6	6	1683518	1683523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33166	NC_021521	TAAG	2	8	1683549	1683556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33167	NC_021521	ATT	2	6	1683560	1683565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060343
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33186	NC_021521	CTCAA	2	10	1684037	1684046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33187	NC_021521	GAC	2	6	1684050	1684055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33189	NC_021521	CTTCT	2	10	1684162	1684171	0 %	60 %	0 %	40 %	514060345
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33193	NC_021521	GGT	2	6	1684302	1684307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060345
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33198	NC_021521	TCAT	2	8	1684814	1684821	25 %	50 %	0 %	25 %	514060345
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33200	NC_021521	TCT	2	6	1684864	1684869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33201	NC_021521	T	6	6	1684896	1684901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33202	NC_021521	TGAG	2	8	1684930	1684937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33203	NC_021521	CAT	2	6	1684971	1684976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33227	NC_021521	GAA	2	6	1686547	1686552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33228	NC_021521	CAA	2	6	1686622	1686627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060348
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33234	NC_021521	A	6	6	1687046	1687051	100 %	0 %	0 %	0 %	514060349
33235	NC_021521	CAA	2	6	1687070	1687075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060349
33236	NC_021521	GAA	2	6	1687109	1687114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060349
33237	NC_021521	TTGA	2	8	1687217	1687224	25 %	50 %	25 %	0 %	514060349
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33239	NC_021521	TGA	2	6	1687486	1687491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060349
33240	NC_021521	ATCAAC	2	12	1687569	1687580	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	514060349
33241	NC_021521	CTA	2	6	1687618	1687623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060349
33242	NC_021521	GAT	2	6	1687631	1687636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060350
33243	NC_021521	GAA	2	6	1687656	1687661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060350
33244	NC_021521	TA	3	6	1687669	1687674	50 %	50 %	0 %	0 %	514060350
33245	NC_021521	TTTTA	2	10	1687688	1687697	20 %	80 %	0 %	0 %	514060350
33246	NC_021521	TTA	2	6	1687755	1687760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060350
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33260	NC_021521	ATCAA	2	10	1688630	1688639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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33264	NC_021521	CT	3	6	1688723	1688728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33282	NC_021521	ATC	2	6	1689463	1689468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060354
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33299	NC_021521	GAA	2	6	1690587	1690592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33332	NC_021521	A	7	7	1692442	1692448	100 %	0 %	0 %	0 %	514060356
33333	NC_021521	AAAAGT	2	12	1692471	1692482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514060356
33334	NC_021521	GGCG	2	8	1692566	1692573	0 %	0 %	75 %	25 %	514060357
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33340	NC_021521	TGT	2	6	1692986	1692991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060357
33341	NC_021521	ATA	2	6	1693098	1693103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060357
33342	NC_021521	TG	3	6	1693108	1693113	0 %	50 %	50 %	0 %	514060357
33343	NC_021521	T	6	6	1693114	1693119	0 %	100 %	0 %	0 %	514060357
33344	NC_021521	AAT	2	6	1693153	1693158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33345	NC_021521	ATT	2	6	1693180	1693185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33346	NC_021521	T	6	6	1693315	1693320	0 %	100 %	0 %	0 %	514060358
33347	NC_021521	CT	3	6	1693328	1693333	0 %	50 %	0 %	50 %	514060358
33348	NC_021521	T	6	6	1693333	1693338	0 %	100 %	0 %	0 %	514060358
33349	NC_021521	CTT	2	6	1693341	1693346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060358
33350	NC_021521	T	6	6	1693372	1693377	0 %	100 %	0 %	0 %	514060358
33351	NC_021521	TCACC	2	10	1693389	1693398	20 %	20 %	0 %	60 %	514060358
33352	NC_021521	GTG	2	6	1693419	1693424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060358
33353	NC_021521	AAT	2	6	1693435	1693440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060358
33354	NC_021521	CAT	2	6	1693614	1693619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060358
33355	NC_021521	AGC	2	6	1693636	1693641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060358
33356	NC_021521	CCA	2	6	1693653	1693658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060358
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33358	NC_021521	CGA	2	6	1693793	1693798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060358
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